| Definition | Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009441 |
| Length | 6,096,872 |
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The map label for this gene is 146299659
Identifier: 146299659
GI number: 146299659
Start: 2190954
End: 2196053
Strand: Direct
Name: 146299659
Synonym: Fjoh_1899
Alternate gene names: NA
Gene position: 2190954-2196053 (Clockwise)
Preceding gene: 146299658
Following gene: 146299660
Centisome position: 35.94
GC content: 33.31
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases AATAATTATGTAAATTGTTAAAGGTTTAAAATTTACATTTTTGTAAGATGTATAACCCTGCTTTTTTCAGAAGTAATTAA ATCCTGTATTTTATTGACCT
Downstream 100 bases:
>100_bases TCATATAAATAATCATTTTGCAAAGTATTTTGTACTGCTATCCCTGTTTTTTGTTTTTGGATGCAGCAATACAAAATATC TTCCAGAAGGCGATTTGCTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1699; Mature: 1699
Protein sequence:
>1699_residues MNKKPIHYLKKTLRVLVWCVVSVVALLLLLIILIQVPSVQNFVKNKAVTYLQDKIKTKVSLDYISIKFPKDVVLEGFCFE DQKKDTLLAGKRLEVDVDLFKLVSSELEINSVSLKNVKANISRNKNGVFNFDYIIKAFESKEPKVEDPNAKPFKISVVKV NLDDIKFNFKDDYAKNDIRVNLTHFDTKFKEFDLDNMKFNIPNINLDGLKLVLDQDVVEKIAEVSVETVDTISKRPDFNL NLRKISLSKIDILYDNKDSKLDSGIKLGNLNLSVNEIDLNKQFLDFDTFELKNLSGNLRLGAKDKQINAPNLDTTAIKQA GWKARLNKINIQNVAFKFDDMQSKPTTKGIDYSHLDLSKFNFEAEKLYYGNDTISGNIKKLTVNEKRGLQIQALKTDFFY GPKNASLDNLYLKTPQTLVQDKIKAEYKSLASLQKELGNLAIDANLKQSKIGFRDILLFVPDLQKTNPFKSNPNAVLYVD SRVSGKVKDLNIAKFEMSGIGTTKVSLSGKITGLPDAEKAYYDLNIKKISSTSKDINMFVPAGTIPKNIQLPSQLSLQGK FKGSVQNFKTNLALNSSFGNAKIDALFDQRIKKKEKYDAEVYLLDFDLGRLIKNDSIGKITLKAKVKGNGLDPKTANAVI DGLVKKAAFNGYTYRDLALKGNIANGSFAVKSGMKDPNLNFDLTASGDTKDKYPTVKLKLNLDIADLEKLNLHAGPMKLR GNIDADIANSNPDFLNGKVFLSNVQILQDAEPIVLDSVRVIAFSDNTRNNIKISSQFLKAEVDGKYKLTTLADAVKKSLS KYIDLKTPKAKAESDKQRLAFTLTVDNDPILFKLIPKLTGLEPIKITGKYNNATDSLEVRGTIPRITYGDNTISDGKINI EAKENALEYSVSIATIEGGSLKIPFTTLKGDVQNNTLTYALEVQDAKQKQQYYIAGEFKTEDSKNIVKLDAENFVLNYDK WNLDPENAIEFGEKRLYVNKFNLNNNGNELKVQSQGTQDNAPLQVDFVNFKIETIMNMVKKDEVLMQGLINGNALVENVM TNPTFTSDLKIDDFAFKGEKVGDLEIKVDNKTANTLAANVTLSDEGNDLKLTGDYKLDAGNFDFDIDINKLNIKSIQGFT MGNVTEGTGYLSGNFKVTGNTSQPKINGELNFNDTGFRVTQLNSYFKTKNEKITFSNETITFDKFSLFDENDNELYVNGN IKSPDFRKYNFDLVVEADDFRAINSKAKDNDLFYGDLFLDTKLNIKGNLDSPVVDGTLKINKETKFTVVLPQSDPSIADR EGIVEFVNEDNMYLKQTVDLQNKLDQSELKGMDVNVAISIDKEAELTLLIDKANGDYLNLKGEAELVGGIDQSGKTTLTG KYEFSDGAYEMNFNGIKRKFDIQKGSYITWNGEPTMANLNITAIYKVNAAPIDLLGNQLAGMEQAVQNTYKQKLPFQTLL KMNGELMKPEISFGIVLPEGNYNVSTDVVTTTQNKLKQLEQDPAELNKQVFALLLLNRFVGENPFASQSGGISAETMARQ SVSKILSQQLNNLAGELITGFEVNFDLESSEDYTSGTMQNRTDLNVEVSKKLLDDRLKVTVGSSFGVEGAERANEESTNI AGDVALDYQLTKDGRYMVRAYRKNQYQVAVEGQVVETGVAFIITMSYNKFRELFHRSEKEKELIREEKLRKEKEKQKKKE DKEKEKLQENQIEGNEQKT
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 190404; Mature: 190404
Theoretical pI: Translated: 6.54; Mature: 6.54
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 1.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 1.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNKKPIHYLKKTLRVLVWCVVSVVALLLLLIILIQVPSVQNFVKNKAVTYLQDKIKTKVS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEE LDYISIKFPKDVVLEGFCFEDQKKDTLLAGKRLEVDVDLFKLVSSELEINSVSLKNVKAN EEEEEEECCHHHEEEEEECCCCCCCEEEECCEEEECHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEEE ISRNKNGVFNFDYIIKAFESKEPKVEDPNAKPFKISVVKVNLDDIKFNFKDDYAKNDIRV CCCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEHHHEEEECCCCCCCCCEEE NLTHFDTKFKEFDLDNMKFNIPNINLDGLKLVLDQDVVEKIAEVSVETVDTISKRPDFNL EEEECCCCHHHCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCE NLRKISLSKIDILYDNKDSKLDSGIKLGNLNLSVNEIDLNKQFLDFDTFELKNLSGNLRL EEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEECCCEEECCCCEEEECCCCCEEE GAKDKQINAPNLDTTAIKQAGWKARLNKINIQNVAFKFDDMQSKPTTKGIDYSHLDLSKF CCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCHHHCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHC NFEAEKLYYGNDTISGNIKKLTVNEKRGLQIQALKTDFFYGPKNASLDNLYLKTPQTLVQ CCEEEEEEECCCEECCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEECCHHHHH DKIKAEYKSLASLQKELGNLAIDANLKQSKIGFRDILLFVPDLQKTNPFKSNPNAVLYVD 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EEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCEEEEECCCEEEECCC WNLDPENAIEFGEKRLYVNKFNLNNNGNELKVQSQGTQDNAPLQVDFVNFKIETIMNMVK CCCCHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHH KDEVLMQGLINGNALVENVMTNPTFTSDLKIDDFAFKGEKVGDLEIKVDNKTANTLAANV HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEE TLSDEGNDLKLTGDYKLDAGNFDFDIDINKLNIKSIQGFTMGNVTEGTGYLSGNFKVTGN EECCCCCEEEEEECEEECCCCEEEEEEEEEEEEEEECCEECCCEECCCEEEECEEEEECC TSQPKINGELNFNDTGFRVTQLNSYFKTKNEKITFSNETITFDKFSLFDENDNELYVNGN CCCCEECCEEECCCCCEEEEEEHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEEEEEECCCCCEEEEECC IKSPDFRKYNFDLVVEADDFRAINSKAKDNDLFYGDLFLDTKLNIKGNLDSPVVDGTLKI CCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEEECCCCCCEECCEEEE NKETKFTVVLPQSDPSIADREGIVEFVNEDNMYLKQTVDLQNKLDQSELKGMDVNVAISI CCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEEECHHHCCCHHHHCCCEEEEEEEE DKEAELTLLIDKANGDYLNLKGEAELVGGIDQSGKTTLTGKYEFSDGAYEMNFNGIKRKF CCCCEEEEEEECCCCCEEEECCCEEEEECCCCCCCEEEEEEEEECCCEEEEECCCCEEEE DIQKGSYITWNGEPTMANLNITAIYKVNAAPIDLLGNQLAGMEQAVQNTYKQKLPFQTLL 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