Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome.
Accession NC_002162
Length 751,719

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Identifier: 13357853

GI number: 13357853

Start: 333303

End: 337646

Strand: Direct

Name: Not Available

Synonym: UU293

Alternate gene names: NA

Gene position: 333303-337646 (Clockwise)

Preceding gene: 13357852

Following gene: 13357854

Centisome position: 44.34

GC content: 22.12

Gene sequence:

>4344_bases
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TTTATCAATTGGAAGTATTTTAAAAGAAATTTTTAATATAAATCAACCATCACAACTAATAAAAGTTATTGATATTTTTA
GTATCAAAGACATTACTGCCCAAGATTATGTAAATGTTTTGAATGTTATCTTTAATGATATTGGTTTTAATAATCAACAA
ACAAAACAAAATATTACCAATGATCAAAAATACGATATTAATATTTACTTTGAATATTTAAAAGCTTTAGTTGAACATAA
TTTTAGTGAGTTAACTAAAACAAAATTAAAAGAAATCGTCAAATTATTCGTTAAAGATGTAATGAATGATGACCATCATA
ACCATTTATGAAAAAAAATGACATCGTTTATTAGTCATAAATTAAGTGATTTATTAATTAAAAAAATTCAAGTATTAACT
CCACAGAAAAATGAATATCAACAATTAGTTAACAATTTATTAAATGGTATTGATTTTAAAAATGTTGTCCAAAATTTAAT
TGTTGAAGGCTTTGCAAAAATAATTGATCATCAACAACAATTAAAGAACTCACAAAATTTTGGAGATTTAATTCAAAAAG
TTATCAATATAGATGATGTATGAATTAAAAAACAATTAAAACAACTCCTAAGTGCAATTACAAAAGACATAAATTTAACA
AAAGCTACATCAACTACTATTATTAATTCGTATTTAAATTATTTTGAAATTAAAAATCTAACAGAAGAAGATAAAAGAAA
TTTAATTAATATCTTTGACAAAATTTTAAAGCAAATTCCTAATTTATTATATTTACAAAATATTGTTGATCAATCAGTAG
ATTTTTTAAAAGTAAATATTGAAGCATTAATTAATCATCAACCACTTAAAAACACAACATGAAACGATTTTATTAACAAA
AATGTTACAGATATTAGTGCTTTAAGTAACTTATTAGAAATTTTTGAAACTAATGAAATTACAAATAATGAATGAAACCA
ATTAATTACGATTTTAATTAATCATGCACCTATTGATAAAATTGAAGAAATCATTAGAAACATAACATCAAATTCAATAA
TTAACAATAAAGCACAAAAACAAGATATTAAAAAACAAATTGATAAAATTTATCTACTTATTAAAAAAGTTTTACAAACA
CAAACCTTAAATAAAAGCCATGCCAAGACTAGTGTTGTAAAAATTAACGAAACAATTAAAACATTAATTGATTCTTTATT
TGCTAATCAAGAAATTAAAACTTTAATTAGTAATACATTATCAAATTGGATTTTCAGTTCGAATTTAGCAAAAATTTTAA
ATGTTGACGAAGATCAAAAAAATAGTTTAATTAAACCAGTAGTTGAATTTATTATTAGTAGTAATGATTTAAAAACAATT
TTAAAAACCATAACAAATAGCTTTATTTTACATGCTAGTGAATTAGCGAACACAAATTCTTTTGAAGAATTAATTGTTAA
ACTTATTAGTTTTGAGCAAACTAATTTAAAAAGTAATTTAAATAATTTTATTCAAAAAATACTTCAAAACGATAAAATTG
ATGAATTGTTAGCGCGTGTAATATTTAAACAAATTTCTCCACAAAAAAAATATGATCAAATTCAGCAAATAAATAAAGAC
AAAGTGGTCACTTTTATTAAGAAGCTTGGTGACAATCTGACAAAATTTGATTTATATAATAAATTACTCGATAATTTATT
TAGTTCAATTACAAATCAAACAAATTTAACAAAATTATTGAGTGAACAGCAAGATAGTGTAATTAATTTTATTAAAACGA
TTTTTGATTTTAGTGATCCTAAACAAATTATTTCACTAATTGATGTATTAAAAGTCAACGAGATTACAAGTAATGATTAT
ATTGAAGTTATTAAATCAATTTTAGATGAAATTGATTTTAATCATTTCTTTAATCAAGCTGTCAAAAACAGTAATCTTTC
AAATTATCCATTGAATAAACATGAAAATGATAATGATAGTAAATTAGATATAAATAAGTACTATATTTATGTAAAAACAT
TATTTGCGCATGAAATGGATTCTACATCAAAAGAAAAATTAAAAACAATTATTGATGAACTAACAAAAAAAATTGTTGAA
AATAATAATAAGGGCTTGTTGTACAATTTGGGCAATGGATTAGGTGAAAAACTAAGTAATTTAATTATTAATACATTCCC
TGGGTTAACTAATTTAAAACAAAACTATAAAACACTAGTACAAAAAGTATTTACTAATCAAAACTTGTTTGAGCAAGTTC
AAAATTTGATCACTTATGCAATCAATAGTTTGATTGATCATAAAAATGAATATCAAAATTGTAAAACTTTTGGTGAATTA
TTAACAACTTACATTAATAAGAATCAAACACAAATTATTGATAAATTAAAAGAAGCAATTAATAAAATAATCAGTGGTTC
ATCTTCATTAATTGATGAAATTTCAACATCATTTGCTAATACAATTAAAACATATTTTAAATTAGAAAATTTAACAGTAG
AAGATATCAATAAACTAAAGTCATTTATTAATTTTGTTATCAAAAATATTTTCAATCTTGAATATGTTAATGATGGTTTA
GTTAAATTAATTACGACTTTAAGTTCAAACGCCATAAAAATTGTTGATCAAAACACTAATTTTGTAACTGTTATGCAAAA
TGATGTTATTTCATATTTAACATCTCCGCAACAAATTGCAAAATTACTTCAAATTGTTGATTTGGATAAAAATGATGACA
TTTTAAATTTCTTAAAAGTTATTTTATCTCATTTGCCTCAAAACGCATATACTATTTTATTTGGTAATAAAATTAATCTT
ATAACAAAGAACACAAATCAAAAAACTAATAGAAGTGTAATTCAAAAATATACAATATTAGATTATGTAAAAACTATTTT
AAATTCTTCTTACTTAAAAAAACAAGATACAATTGTAAAAATTAAACATATTTTTAAAGATCTTTTAGTAACTATATCTA
AATCATCACAATTAAATAATTATATTGGTGAGTTGATTAGTAATACTTTCGCACAAAAACTTTCAAATCTTAGTGGTGTG
GATAAACAATATAGTGAATCATTTTTAAAAGAATCATATAAATTTATTATAAGTGATGAAAAATTAATCAAGATTATTGA
TGAAGTAGTTAATGATTTAGTTGATCATAAAGATGAATATTTAAAAGAAATTACAAACAATAATCAACCATCAATTAATA
TTATTTTAAATATGTTAATTAAACGAAATGTTGATCAACAAAAAGTTGATTTTGTACCTTTTATAAAACGTTATTTAGTT
ATTGATTCTTCAACACAATTTATGGCTCAATACCTTTTTAAAACTTTAAAATTAGAAAATACTAATGATCAAGATGTAAA
AATTGTTCAAACATTTGTAAAAGAATTAATTAATCAAATTGATCAATTAGATTTTGTAAATTTATTCATTGATAAAATAT
TTACTTTAATAAAAGAAAATGGACTTGATTTATTTACAAAAGAAGAGGGTATAAAAAAAGTAAATGAAGCTATGAAAACG
TTTGGTTTAACTGAAACAACTAATTTATTAAAAATTGCAAAACTTGTCGAACCAAATAAAATTAAACCCCAAACCATAGG
TGATCTAATTAATTTAGTATTTGAAAAATCACCATTAGCTGAAGATTTCGAAAGTATAACACAAGATAAAAATCCTTTAT
ATTATGGTTTAAAAAATCTTAAAGAAGATAGTTTAAATGCTGTTTTATTTGCTAGTGGCAAAAAGAAAATAGGAGAAGCA
GCAAAAGTTAGTGAAATTAATATGTTAGATGCTATCCAACATTTAATTAATAAATTATGATCAGCTCGTGCAGAATACGC
TAAAAATCATCCTAATTTAGAATATGAACAAGATAATCCATATATGCGTTCGCTAATTCATTTAGGAATTGTGATGCAAT
GATATGTTCATGAAACATATTTTAGAAATGTTTCAGGTGGGCTATGATGGACTGGTTCTGATTCATTATCGGGTGAAGGA
CGTGTCTATTTATTGCTAAAAGCAGATATGGGATCTGAAAGTGAAAAACGAGTACGCTCAATGATTATGGGGAATCGTGG
TGCAATGCTTTGAAATACACCAAAAGAGTGGAATTATAATAAAAATGATTTTTTATATATGATTACATATTGAAAATGAA
GAACAAATTCACGTTTTAACGATTCTAAAGAGAAAAATAAAGCAACTTATATTTTCAAAGCTTTAAAACGCGGTTATGGT
GAAAAAGTTAAAACAATGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATTAATACAACAAAAACATACGATAGTATTAATAATTCAGCTATTAATAAAATCAAAATTTTAATTACTAAGTTAGCAA
ATAATTTAGATAAGTTTAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATAAAAATATTAGAGATTTTAAACAATCTTTAATATTTTTTTATTTTATAAAAATAATTTTGATGATATTGTATCTAT
TAATTTATTTTGTTAAATGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1447; Mature: 1447

Protein sequence:

>1447_residues
MYNDLLDSLFTKLSDKSILNKLLNDDFLSIGSILKEIFNINQPSQLIKVIDIFSIKDITAQDYVNVLNVIFNDIGFNNQQ
TKQNITNDQKYDINIYFEYLKALVEHNFSELTKTKLKEIVKLFVKDVMNDDHHNHLWKKMTSFISHKLSDLLIKKIQVLT
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KATSTTIINSYLNYFEIKNLTEEDKRNLINIFDKILKQIPNLLYLQNIVDQSVDFLKVNIEALINHQPLKNTTWNDFINK
NVTDISALSNLLEIFETNEITNNEWNQLITILINHAPIDKIEEIIRNITSNSIINNKAQKQDIKKQIDKIYLLIKKVLQT
QTLNKSHAKTSVVKINETIKTLIDSLFANQEIKTLISNTLSNWIFSSNLAKILNVDEDQKNSLIKPVVEFIISSNDLKTI
LKTITNSFILHASELANTNSFEELIVKLISFEQTNLKSNLNNFIQKILQNDKIDELLARVIFKQISPQKKYDQIQQINKD
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RVYLLLKADMGSESEKRVRSMIMGNRGAMLWNTPKEWNYNKNDFLYMITYWKWRTNSRFNDSKEKNKATYIFKALKRGYG
EKVKTMK

Sequences:

>Translated_1447_residues
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TKQNITNDQKYDINIYFEYLKALVEHNFSELTKTKLKEIVKLFVKDVMNDDHHNHL*KKMTSFISHKLSDLLIKKIQVLT
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KATSTTIINSYLNYFEIKNLTEEDKRNLINIFDKILKQIPNLLYLQNIVDQSVDFLKVNIEALINHQPLKNTT*NDFINK
NVTDISALSNLLEIFETNEITNNE*NQLITILINHAPIDKIEEIIRNITSNSIINNKAQKQDIKKQIDKIYLLIKKVLQT
QTLNKSHAKTSVVKINETIKTLIDSLFANQEIKTLISNTLSNWIFSSNLAKILNVDEDQKNSLIKPVVEFIISSNDLKTI
LKTITNSFILHASELANTNSFEELIVKLISFEQTNLKSNLNNFIQKILQNDKIDELLARVIFKQISPQKKYDQIQQINKD
KVVTFIKKLGDNLTKFDLYNKLLDNLFSSITNQTNLTKLLSEQQDSVINFIKTIFDFSDPKQIISLIDVLKVNEITSNDY
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NNNKGLLYNLGNGLGEKLSNLIINTFPGLTNLKQNYKTLVQKVFTNQNLFEQVQNLITYAINSLIDHKNEYQNCKTFGEL
LTTYINKNQTQIIDKLKEAINKIISGSSSLIDEISTSFANTIKTYFKLENLTVEDINKLKSFINFVIKNIFNLEYVNDGL
VKLITTLSSNAIKIVDQNTNFVTVMQNDVISYLTSPQQIAKLLQIVDLDKNDDILNFLKVILSHLPQNAYTILFGNKINL
ITKNTNQKTNRSVIQKYTILDYVKTILNSSYLKKQDTIVKIKHIFKDLLVTISKSSQLNNYIGELISNTFAQKLSNLSGV
DKQYSESFLKESYKFIISDEKLIKIIDEVVNDLVDHKDEYLKEITNNNQPSINIILNMLIKRNVDQQKVDFVPFIKRYLV
IDSSTQFMAQYLFKTLKLENTNDQDVKIVQTFVKELINQIDQLDFVNLFIDKIFTLIKENGLDLFTKEEGIKKVNEAMKT
FGLTETTNLLKIAKLVEPNKIKPQTIGDLINLVFEKSPLAEDFESITQDKNPLYYGLKNLKEDSLNAVLFASGKKKIGEA
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EKVKTMK
>Mature_1447_residues
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NVTDISALSNLLEIFETNEITNNE*NQLITILINHAPIDKIEEIIRNITSNSIINNKAQKQDIKKQIDKIYLLIKKVLQT
QTLNKSHAKTSVVKINETIKTLIDSLFANQEIKTLISNTLSNWIFSSNLAKILNVDEDQKNSLIKPVVEFIISSNDLKTI
LKTITNSFILHASELANTNSFEELIVKLISFEQTNLKSNLNNFIQKILQNDKIDELLARVIFKQISPQKKYDQIQQINKD
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LTTYINKNQTQIIDKLKEAINKIISGSSSLIDEISTSFANTIKTYFKLENLTVEDINKLKSFINFVIKNIFNLEYVNDGL
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ITKNTNQKTNRSVIQKYTILDYVKTILNSSYLKKQDTIVKIKHIFKDLLVTISKSSQLNNYIGELISNTFAQKLSNLSGV
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EKVKTMK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 165406; Mature: 165406

Theoretical pI: Translated: 9.20; Mature: 9.20

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
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CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH
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IHLGIVMQYVHETYFRNVSGGLWTGSDSLSGEGRVYLLLKADMGSESEKRVRSMIMGNRG
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>Mature Secondary Structure
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CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH
LISNTFAQKLSNLSGVDKQYSESFLKESYKFIISDEKLIKIIDEVVNDLVDHKDEYLKEI
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HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCHHC
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CCEEEEECCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHH
IHLGIVMQYVHETYFRNVSGGLWTGSDSLSGEGRVYLLLKADMGSESEKRVRSMIMGNRG
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AMLNTPKEWNYNKNDFLYMITYKRTNSRFNDSKEKNKATYIFKALKRGYGEKVKTMK
CCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA