| Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002162 |
| Length | 751,719 |
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Identifier: 13357852
GI number: 13357852
Start: 327482
End: 332974
Strand: Direct
Name: Not Available
Synonym: UU292
Alternate gene names: NA
Gene position: 327482-332974 (Clockwise)
Preceding gene: 13357849
Following gene: 13357853
Centisome position: 43.56
GC content: 21.83
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TTAATTCTCTTTTAAAAGATAAACAATTACAAACAATTTTTAACGCCTTAATTGAACCTATTTTATCAATAACAATAATT TTGATAATGTTAAAACTTTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1830; Mature: 1830
Protein sequence:
>1830_residues MDKKSKKILGLSVASIIAALAIIAPSTYFGLQKQEEGKKDINLDNVTRKIPGETKDDIKVEDLNNINDQNTDLKLDFSKV SIKPQTKINYLAIGDSITAGFNSELGWEAPGRYDPITNKISGLSFPSFIAQYINKVEPNRLASYENLGITGSRIEDWLYM LGAGSDEYFKNQEYRFFDFSKQMDQQKDNPFKNRLSKFFKNFGYDSKLTPKNNHEVNINDFNGLKEQIKKANLMTITLGA NDFLRYLDIPKLVSLTNLKGNDLEIKVKEFENNLQKASLEITKNLKKLIALIRTLNSNVSITLVSYPLPLLRLQDVIDSS FKLTNKRRLSDEIINILNSAIKKTYDLNNNINYIDAFDENDWKENSFNFAKAIFDIHPTELGYKRMAQDIFLKMSLGQNY AQQKTASIANAIYDAWDSEYFNKDSDSFKQQIGFANNTNQDLVEKTLGSSKGAAFWAKTALENDEELRKSFSNFKNTSTI VKDWLISNKRRFGSFVNLITSNLTSLGLDKNGYISQFLSKKDADNTNNLYKLASALASTPYIDMVISGIQNDLDNLDLDK NNIIGTQNISKKILYDVFRKNIINDQNLYELIKGMFHSQLFNENKSQIKSLIKALLSDLVSSHKLLEIIFGEFATDNLKN NNEFLKNLLIIQNKLTQTKSLDNIINVFVDALFDNDNEYLLQGPLSNVLAKIVKTNKALLTTRIDNLFNDLFKDQTTLDA TYNILIRVLGQNIPDFIKTPQASLIIKKILSKGTNLKLINTLKLNTIDLLTDSKTYAGIFDSSETSIINLIQKSIDFTSK SFISDVLDLLTSDNVDLNEWKEFIKTILNSSTIKNIFNYGIVNLVSSNTTPLKTSHFDFNVLLKNLIAVLEEKDWTTNQK TKLKSLLRMSVDELLKNPQTQNFVTSIEDFIANKLGDLVISANNSLLKSNMSDIWKLIKEVVHDLIHSSESYDLIFSIIN DFIDHPQNYDNLNNINDLLPLILKSTNKELQDKVDILFKKLINNENIPNLVGTLTTNLIVKNFFVKELTVDQKQKINNFI TNILPTIPNLTLYKEIRKQAFEFLTNNINKILVDPKNTLLILNDGINKLLSNILPQLSTLIELIDNDKIKDQDFIDVIKI FIDNLDFNKLFVNIKSNNNQTTDSTTLNQFYFKFKLNLEPKKLIFDLIKNLLNSPILKVNDNKNNKIKIESNKAKIKSIL TTSVTNIFENSNLMNFFNNQLSQLFSSIDLFKNLNLSNQQRLNFAKAIVELLNKEKLLSNLINVLITNLIDHADEYAEAT DLATILSLTIKYNQNELKNAFDKLLIGTLKNDNLQDLILRIFVKLINPNKSYDSISVVSINKLKTFISKFATGISKLDLY QQLKNSIFTVFSNKTKMQQLLSNDVSVINKTLLEAFNIDTPEKVLKISSLLDINEIDARDYADIIEIILVEIGFNVTSIQ NNDVNNNLKTIDKKTNDFAFQILKKALNNGVSDQQLQKIKNVVNYLLDDIVKIHDSSSFLRIQLEQLSHVLVDKITAVLP KSLTIKHKYTKIFSSILNNQDFLQKAKTLLSTILNELIDHKDKYKDINSFSELISVFFKNKASDLKTQLKDLLNTILKNQ TLITNIGQVIIESFKLENKISILDSDLEQNTISFINKIFAHITELPIYTNLVDNFFNFFSEYTKSSDTKTLNFNKFKSSL FQAIIPKISDFASLLDLFKYNEISEQEWKSAITFFIDYLPINNLINSKILPTNSLLFVRNISISKTKPELNKIENIILDL FKALSQKAKTFDNNTLTKAKNIIEFTFNKLLTSNNIKNFINNLLSNLSPIRSFLKSINVQDKSKHNLLNM
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 206932; Mature: 206932
Theoretical pI: Translated: 9.39; Mature: 9.39
Prosite motif: PS01098 LIPASE_GDSL_SER
Important sites: NA
Signals:
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Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 0.7 %Met (Translated Protein) 0.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 0.7 %Met (Mature Protein) 0.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDKKSKKILGLSVASIIAALAIIAPSTYFGLQKQEEGKKDINLDNVTRKIPGETKDDIKV CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCEEE EDLNNINDQNTDLKLDFSKVSIKPQTKINYLAIGDSITAGFNSELGEAPGRYDPITNKIS CCCCCCCCCCCCEEEEHHHEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCHHHHHC GLSFPSFIAQYINKVEPNRLASYENLGITGSRIEDLYMLGAGSDEYFKNQEYRFFDFSKQ CCCCHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCCCHHHHHEEEECCCCHHHHCCCCCEEEEHHHH MDQQKDNPFKNRLSKFFKNFGYDSKLTPKNNHEVNINDFNGLKEQIKKANLMTITLGAND HHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHCCEEEEEECHHH FLRYLDIPKLVSLTNLKGNDLEIKVKEFENNLQKASLEITKNLKKLIALIRTLNSNVSIT HHHHHCCHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE LVSYPLPLLRLQDVIDSSFKLTNKRRLSDEIINILNSAIKKTYDLNNNINYIDAFDENDK EEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCC ENSFNFAKAIFDIHPTELGYKRMAQDIFLKMSLGQNYAQQKTASIANAIYDADSEYFNKD CCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCC SDSFKQQIGFANNTNQDLVEKTLGSSKGAAFAKTALENDEELRKSFSNFKNTSTIVKDLI 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