Definition Clostridium difficile 630 chromosome, complete genome.
Accession NC_009089
Length 4,290,252

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is sigK

Identifier: 126698826

GI number: 126698826

Start: 1429412

End: 1429681

Strand: Direct

Name: sigK

Synonym: CD1230

Alternate gene names: NA

Gene position: 1429412-1429681 (Clockwise)

Preceding gene: 126698825

Following gene: 126698829

Centisome position: 33.32

GC content: 31.11

Gene sequence:

>15328_bases
TTGGCAGCTCTTAAATCTTTTGAAAAACCCTTAACCCCTGAAGAAGAGATTGAGTATTTAACTAAATTTAAAATAGAAAA
CGATAAAAGTGCAAAAGATACATTAATTGAAAGAAACATGAGATTAGTAGCTTATATAGCAAAGAAATATAATAATTCAA
CGGAAGATCAGGATGATTTAATATCCATAGGTACAATAGGATTAATTAAAGCTATAGAAACTTATAACATAGATAAAGGA
ACTCGATTAGCAACATATGCTTCTAGATGTATTGAAAATGAGATTTTAATGAATATTAGATCTAACAAAAAAAATAAAAC
TCAAGTATCTCTACAAGACCCTATCGGAACAGATAAAGAAGGTAATGAAATAAACACTATTCTTTATATGTAATTTTCTA
CTATTATATATTTATTTACTCTATAAAATAATCCCCATTCAAAACACTTTTCTTAAATCACTCAAACTAAAATACATATA
AGATTATCATTAGTCAGTAAGTATATATTTTTCTAATTTCTAAAAATACATCCAAATCATCAAACGTTTTTAGCAATTAC
TTTATTATTATACAGTGTTAAAGTAAAGTTCCTAAATAAATTGTTATTCATATAGCAAACAAATACTTGGTATCAATTTT
TTAATATCTATTTAAATAGTATTTTTTATTTTGTCATTTTATAGATATTAATGTGTATTTAATACTGCTAAAAAATAATA
AAATTTTATAATCTATTCAATAATATACTTTTTTCTATAAATATTTTACCTATAACCTTTATTTTTTTATTAAAATGCAT
TATAATAAAAAGTAAATCTAAATTTGACACAGTTTTAACAATCATTATTTTCAGAAAAGTGATATTATTGAATATATTAA
GAATAATTAGAGATGGAGGAACTAAGATATGAGCGTAATTGTAATGTGTAGTCGTTGTGGAAAAGAAATAGATAAATATA
GAAATAAATATATAACTTATTATGAGAAAAATACCAATGCAGAAATTAAAGTTTGTATAAATTGTGCGTTAGATTTATTA
GAAAAAACAAGAGAAAATCAAGAATTGAACATACAAGAGTTTCAAGATACAATAATTCTTTAATAATTTAGGAAAGCACC
TGTATAGGTGCTTTTTATGTGTAAATAATTTTATATGTAACTGTATCTTACGTTCTATTTTAAGCTAAACATATATACTT
ATTTCTATAAGTTTGCAAAAATAACTAATCCTAAAAATAATACAACAATAATTGTCACAATCAATGCCAATACATTGATA
ATTTTTATGGTATTATTCTTAAATATTTTCGATAATAGCATAAAAACAGCTATTCCTATGATTCCTCCTAGTGTGTTTCC
TATCAAATCCGTTATATCACTTGCACCTAGTGCAAATATATATTGAAGTGTTTCAAATGCCAAACTAGTTATAAAAATAG
GTATAACTTTTTTTATAAAGCTCCATTCTTCTTTTAGCATACACACATATATCCCAAATGGTACAAATATAGCCACATTT
AATATAATCTCTGATATATCTACTCTATTATTAATTATAAGTGACCCAGCAAAAGGTACTAAGTTTATGCTTCTAAGATT
CATGGTTTCAAGGGATGAGATATCAAATTGCAACTTAAATAGTATTATCCATGTTAAAATAATTATGTAAACTATAAATA
ATCCTTTTGTAATATTATGTTTTCTAGATTTCATTTATTACCTCCTTACTATATTATTGTATTATTTTATTAATACAATA
ATATAGTAAGGTAATTTATCTGTCAACTATTTCTTATAAAATTATATTCCTTTTATAATTTCAATTTCTTTATCATATTT
ACATGATTTAAGCTATTGTAGTATTTCATATCTTTCTTTAAATTTTAATCGGTATTATTTTCTATATTTTTTTTTACTAT
CAGATACTAAGGAAATAAGCACTTTTCTTTATATAATGTTCTACCATCACATAACACTAACATTAAATCAAACCGCTACT
CTCAATTGTCTCAAACTAAAAAGATACTGATAACTTTATTAGTCATCAATATCTCCTTCTTTCAAATTTTTAAAGTATTC
TTCTAACTTGTCCAAGCTCTTACTATCTAAAACTTCATCATCATGTAGTGCTGAAATAAAACTCTTAAATGAATTGTTAT
GCATAAAACTAAAAAAACTCTTTGTCTCAACTTTTAAGTAATCTTTCTCTTTTATAGCTATAGTATAATGCATACATCTA
TCTACCTTATCAGTAGTTAAAAAACCCTTATCTACTAAATTTTTTAAAAATGTCAATGTTGTGCTCTTTTTCCAATCGTA
TTTCAACTTCATGTCTTCTATGATATCTCTTGAGGCTAATACATCATCTACTCCCCAAATATACTTCATTAGTTTTAGTT
CTGCATGTGGTAATTTATTAATCTTCATTAGTTTACACCTCTTACCAATTTATGTATAACTAAACTTTATAACAATAAGT
GTATGTAATCAATTAGATTGGAATAAATATAAATTCCAATTTATTCTATATAAAAATAATTAATAAAAAAGAAGTACTCT
ATTTTAGAGAGTACTTTTGGATTATATATTCAAAAATTTATCTAACATGATTAGAGTATGTTTTATGCTTTAGTGTGATA
ATTTTAGTTCGTTTTATTATTATAATATGTATTATATTTCATTATAATCTATAAGCTTAAATACAGGATATTTATTTCAT
ATACTTAATTTATATTAAGTTTTATTGTATGTATTATTAAGTTTTACTATATTTTTTATTAATATTTAATATAGTTAATT
TTTAATAATTATATTATACAATAACAATATATAAGCTAATTAAAAACCTTAAGAAGAACGATATTGACACTACTTGAATT
ATATTATAGAAAAGCTGAAATAAATAAAATGGTTTGGGCTAGAATAGGTTTTAATTTATATCTTTCTAAAGGAGTTGCAT
TAACTTTAACTGATGCTGGTATAGGAATTTCAGGACTTTTGGCTGGTGCTATTCCTGGTATAGGAAAGTACTTGCCACTG
TTATAGTTAGAGTAATTACAATGTACCTTGAGTCAAATATAACATCTGGAAAAATCTTTAAATTTAAAAAATACGTTATA
ATAAAGGAGGTGCTTGTGTAACCAAATACTACTTACAATCTGTAGAAATCAATAGGTGATAAAATGATTATAAAATATAT
ACTTTTTGCAATTGTTTCAGCATTAATTTTATTATTTTGTAATAAAGCATTCCAACTAAGTAAATTACACAAGTTCATTA
TATTGTTTGTTTCATTTTTTATACTAACTTTTGTAGCATCATTCATTAGTAGATAAAAAATAAGATGGTGGGGTTAACTT
ACCATCTTTTTCTCATTTAATATTTGTAATATTTTAGATACTCTTTATACTTGTGTTACTGTTATACTTTGATTAGGAAA
ATTAATACAACATGAGTTGATGATTATAATATAAAGGAGGTATCTTCTATGAATTTTAGGAACATTTATCTTATACTTAT
GGGATTGGGAATTATAATATTAACTACAATAATATCTTTAATTGAAATTAAAATTGGTTTTTGTAATGAAAAATATTTTA
ATAAATTAGAATCAAAATATGGAAATATAGATAGAAAAAGAACTATTAAACTAGAAGTACTTTATCGATATGTAACAGGT
TTTGAATATATAGCAATAGGCTTATTTACAAAAAGATTAGATATTACAATAATAGCAATAATATTAGTAGCTACTATAAC
AGTAATATTATATTACTTAGTTAGAAAGAGATATATAACTATATAAAATCTAATAGAATTAATATCAAAAGAAGGTAGCA
ACTAATCACCAGTAATGTAAAATAATTTGTTTTTCAAAGTTAATAAAAGTCTTCTTTATGGCAATGATTTAAATATAATC
AAATATCGTAACGGAGATTTTTTTATGAATAATTTAAGAAAACAATTAATCAAAGAAATTATATAAGATGGAGAACTTAT
AAAATCTACAGATATAAGTAGTTTTAGGAGTAAACACAGATGACTTATTTCAAAGAGACAATAGCTACAAGTTATCCTCA
TTCTGTAATACAAAAATGTTTAATACATTAGATAAGAAATACTTTAAATATGTTTCATACAAGGACTCAAAAGAATTAAT
AAGTGATTTTAAATCTGTATATAGGTCAGTTAATGAATAAAAAGCCTTATCGACTTTAGATAAAATAGATTAAAAATAAT
GTAAACAGTATACTTCAGAAATTAAAACGTTTGGAAATAACTGGAATGTTGTAGCATCAGCCTTTAGTTTTACTAAAATA
AGTAATATCTATAATATATATTACAAGTATAATCGAAAGATTTAATAAATATTTCAAAAATGTCTCAAAAACAAAGTCCA
GATTTACATCAAACGCTTCACTCTTAAAGATATTATTCTTGACAAGCGAAAATGTGATGAAAAAATGGACTATGAAATAT
AAAAATTGATATAATATATACAATCATTTATTCATATCTTTTGATAGTAGAATATAATTTTAAAAATTATACCCTAAAAA
TTTGCTATAATTGTTATAATATATATAATTTCCAAAAATATTTAAAAACATCTCAATATACATTTTTTATAATTTGTTAA
AATAAAATTCATATATTAAGAAATATTAATAGTAAATAAGCAATTGTTACTATAACGTAGGAATTATCTTTAAAAACACA
AATTAATTTACATTTTCTAATTTTAAAGTATATGTATATCTTTGATTTTAATAAAATTCACTTAAAATATTTTAAGGTTG
AACAATGAAATTGAATGCCCAAGAACTTCCTTCTCTTACTAATGTTGCAATTAATTCAAACCCACAATTGTATTGAACTG
AATCTCTACCTACTGGTTTCCAACTAGAAGGTGCATTATATGAGAAAGAATTTGATGTTGGCTCTTTCTTTTGTTGCTGC
TTAATTCCTAGCCCATTAGAAATAAATCCAGTTTGATTTATATGCACCCTTCTATTTGTTACACGAATCTGGCCGTCTGC
AATAGACCAGTTTCCAGAAACTTTACTAACGGAAATATATTGAAATGCTCCATCTCCTTTTGATATTGTATATGTAACTG
TACCAGATGCTTTTACACCACCAGTTTTATCCCATCCATCTTCTGATATACTTGCTTTTCTAAGAGGCTTTATTGTATTA
GTATCAAAAAAACTGTCTTAGAATATATCTTTGATGTTAAATTTTTAGATTGTTTAACTTCTAATAATTGAGTTGTTGAT
ATAGAATCAACGTATATGGACTCTCCTGTTCTTGCATTTTTGATTATACCTTTTTCATTGGAACTTTTAACATCAGTAAT
TCCATTTTTAGCCATATCGTATAATTTGTCCATGTCTGTTACTTGTTTCTCTGAATACATTACTTTCATAGATGAATCTT
CTACCTTACTAGCACTTGCATTTGTTGGTAATAGTATTGTCATTATGAGTAAAGATAAAATAGTTGTTACAGATTTTTTT
AACCTATAATTCATATTAATCCTTACTTTTTATTTGTTATAACAGTCATTCTATTGTAATAGAATATAAATCCACAATAT
TTTTAAAATTAGTATTGAATAACTATTCTCATGTTATAATTATTCAAAGGAGGGATTGATATGAGGAAAAAATTCTTTAT
AGGTATTCTTATAGTTTTAATAATCTCTGTGATCGCTATACTTAATATAAAAAATGATAAAAATGTCTTTATTGGAGAAT
CAGAAAATTGGAAAGCTAAATTTGTAACTACTGAAGGACACTCAAAATTAGAAATAAAATATAAAAATAGTAAAGATGTA
GTTGAACAAAAATTTAATTATTCCTATCAATTTATAGATGGTGAAGATGCAGTTGTAGTTGTAAAAAATGAAATTTTAGA
AGTAGGTCAAGAAAAAGCAATAAAAATACAAAGACCAGGTCTTTATTCAAATAGAGAATCTAGTTACAAGCTAATTATAT
CTTGGAATGGAAATGAGGAAACTATAAACTTGAAAAAGAAATAACCATATTATCAATTTTTAAAAAATTATTATTCAAAT
TCTTATAAAAAGAGTGTTTAGAAAAATGAAACACTCTTTTTTGTATAAGTTTTTGAAAACTATAAATGAAATATATCAAA
ATCGTTCGAAAAATTACTGAAATAAACTCTTAAATATATTATAAATTAAGGTATATTATACATGAATTTATTGGGAGTTT
ATGAGTTTTAAAATTGGAAACCAAACAATAAGAACGAAAAATACTTTAAGGAAAATATATAAAGTTCTATAAATTATCAA
AAATATTTCGCAAAAATTGATAATTATTACAAATAAATTGATAATATTAATAATATTAGAAATATCGAAATTGAACAAAC
TAGGATTAAATCTCAATTAGAAAAATCCACTAATCCTGAAAATACTTTGTTATTCTCATTTATTACTGTTGTTTTTTCAT
TATTTGCTAATTTATTTTTCAGTTCATTAAATGTTAAATATAACTCTGTAAATTTAACATTTATAGTTAATATGTATTAT
AGTTCTTATATTTATATATATTAATACATTTTTATATCGCCTCTTCAATTTGAGCCCCATCATTATATAAAATTAACCTA
CTTGATATCTTAATTTAATATATGTACACTATTCATATCTTAATAGTCAATATTATTCATTTTTAATAGCTCTTTTTAGA
TGTCATAATTATTATATTTTGAAATTTATTAAATTTTTGCATTAAAAAAACTAGAAATTAATTTAAGTCTTGAATTACTT
ATAACTTTCTACATATCTACCTTTATATTCTTACTCTGATTTTATATCTAATATTAACTCTTCATCAAAGCTATTAAATA
TACCTCTAATTGAGTCAATTATTTCACTTACTTCACCTTTAATTTTTATATTAACTTCAACCATTTCAAATCTCATCTTT
TTATCTTATAATTTCTATAAGTTTTTTTATTTATTGTGTTGCTTATTTTTACCAGCACTTTTTTATTTAATAGTCTAAAT
GATATTTTTTACCAGTTTTAATATCCTTAAATACTATATTTACTAAAAACTTATAATTTCTTTTAATACATAGTTAATAC
ATTCTTATTACTAATAACAATACTCAACAATTTTATCGCCTTTTTTCAAATATGATTTAACTTTTTTACTCCTAATTATT
TAAAAATAGTTGTCCAATTTTCTTCTATGAGAAAGTGCTAAGTATTAGCAACTTCTCTATTCTCTTAACTTTCTACTGTC
TCAACTTTCTTCATAGCTATATTAATAGCTACTTCTTTAGCTACTTCATTGAACTCTTCCCATCTTCTCCTATTTTCTTC
ATCAGATATACGTGGATATACTATATAAACTTCTGTGTTTTGATTAGCTATAATTTTTTCATCATATTCTATATTTTTTT
CTTTATCATATTTGTATGGTTTAAATTGTTGTAGTATTTTCATAACATCACCCCTTGTTATAAAATATGAACTCATAAAC
TTGTCTTATACTTATTTAATTGTTACAATTTTTACTTAAAATCACTTTATATTCTATATTTTAAAGCTAAATCCTTTACA
AAAGTAACATATTCTTCTATAAGTTTCTTATCCTCTTATATAGTATCTAGTTTGTTTAACTTATCTCTTTTAAACTTACA
TACGCCTTCTTCTGCCATTCGTCTTTTATTAATTGTTAACCTTGTTTCAAGAGACACACCAAAACTCTTGTTAAGAAGCT
CTTAGCTCTCATTAGCAAAATATTTTACATAACTTAAATCACCTTGACTTCTAGCTATTTTAACTGTTAATAGACTTGTT
TCTTTTTTCCAATGTGTTATATTTAATATAACAACATCTTTTATTATTTTAACTTCTATTTTTACATCTAATGCCATATT
ATTGCTTGATTAATTTGTATCCTTAAATATTAAATTTTCTATTAATACATCTTCTATACAGCTTAGTTTCTCTCGCTTAA
CCTTGAAATATGTTTTTTCTAAATTGTCAGATTGTTCTCAAGTTTTATCAGTATCTAATACTTTGTAGTGTATATTTGAA
CATCTTTCGGTCCAAAGGTATAATTGACTAGAATGTTTTGAAATCAACTGACTATTAATATATTAGTTCTTAAATTCTTT
CAAATACTCGAATTGTAATAAAACATAATTTACATTCTCTTTATTTCTATTGAAGTTAGTTTATATATTGTTTACATCAT
TTTCATATATATCTGCTAGTTGCTATGTATTTAAAATTCTCTTATTATTTCTTTATATTACTTGTAAATTATTCATCCTT
ATCATCCTCTTAATTAAATTTTCTATATCATAATCAAGTATCTTAGATAGTTTATAGGTAATATATCAACTCTAATTGAA
TATTACCCTTTCCTGTACTTAAAATAAGTTGATGCATTTTTAAAACCTAACTCTTTTGCAACACTTTGTAAGTATAAATT
TTATGTATGTCTTCTTTTTTATAAAATCATAGTGTATCTTTTTCATATATTCACATTAATTTCTATATTTCAATAACAAT
ATTTCCAAAGCAGAAACTTTTCGAGATAATTATGTATGGATGTAAATCAAAGGATTAAATATACTAGGGAAAATATGAAT
AGTTCTCAAAAAGAATTGCTTGAAAAAACAAATATAAATACAAGTGTTATGAATAGAATCTGGTGAAATACCAACAAGAG
ACGATGGGTTAATAATATTTGCTAAAATTTTTGGTTTATATACTGATTATATTCTTGGTTTATCAGATACAGAAAAACTA
AATATTGGCAATTAAAACTGAATTGATTGTATTATATGTGTGATGAATATAAATAGAGAATTTTTTGAAAAGCTTGAAAT
AACTTAGAAAAAATAAGAGGTTCACTCAAGAACAAGTTGCTAAAGATTAAAAAACAACAAAGGTATCTACTAAAAGATAT
GAAAATAGTTTAAGAGAGTTGAGTCTGGAAATATTTATGTGTATTCTTTAAATAAAAATTTATTTTTAAATGATAATTAA
ATTTTTACTGATATGGCTATGCTTTTAAAAGTCCTAACCTTATTTTGACATTATATCTGTCTTTACATACCACTTAATTA
ATATAAAACAGTATAAAAATTAGTTACAGATGTATCTTTTTTGTTCTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAATCAA
AAGACTTTGAATAATCTTTAATAAGATTTTTCTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAACACTCTATAATAAAAAA
CTGCCCATGTAATCAAACTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAAACGCTTTTACAATAGTTTTTCCTAGATTTTT
CGCTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTACCTCTTAGGCGTGTAAAAAAAATAGCACGAGTCACTTTACATACCAC
TTAGTTAATATAAAACTTTGAAAAATAACTTATTTTCTTAAACCACTCTTATCTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAA
CGATATATTAGAAATAAGTGTACTCGCAAATTTTGTTACTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTATACTGGGCAAG
GAAAGTTTATCCTACACTTGTTTGTCTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATGACATGTCTAAAAAATTCACATTA
GTTAATTCTTACTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTACAGTGACAAAAAAATTAGATGATGTTGATAATGTCTTT
ACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAGTAGACGCTTAGAAGGCTATTTAAAGATTTATAATACTTTACATACCACTTAG
TTAATATAAAACTTTATGGGGAAGGTGGTATGTATGAGTTAACTTACTACTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAG
TGATGAATGTTCAGAAGAGGATGCTATGAAAGCTTCTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCCCAAAATAAATTGAG
TATTTCCAACACTTACATCTATACAATTCTCTCAAATTTGCAGTGAACCACGAGTAGTGCAAATGATAATATTTATCATA
TACCCTCAATGCCTTATGTTTCAACTGTTAAGCCCTATTTTATCAAAAATATCGCTCACTGCAAAACTATTTATAATATT
ATGAATATATTATTTTTAAATATCTGTACCAATTTGTAGTATAATAAAATCAAGAAAATAATTTACTCCTATAAAGAGTG
ATTATTTTTAAGTGAAAATATTATTTTTTTAAATCATTCTTATTGGCGTTTGGGAGATTTTTATTTTATCATAAATATAA
ACTGATATAACACCAGCTGACATGCTTGCCACTTTAGATTATTATTCTTGCTACAACTATTATAACATATAAAACTTACT
TATTTTTACCAAATATTTTATGTAAACAATAAATATTAACTTATGAAATATCTGCTCATTTACAGATATTTCATAAGTTA
ATAGCTCTATAATAAAATTTTTATCATTGTTTATAAAAAATTTTACTTTGCATTTTTTTATAAACAACAGTTTTATTTAT
AATGTTTTGTGGTATAATAAAAGCAAGAAGAACTACAATCTATTTTGCGTTAGAGTGGAGTTCATCATAAACAGAGTTTA
TTTTTTGGATTTAAATATAAATTTAAATTCAACTCGTAAGTCACTCTTTGTGCGAGAGTGGCTTTTTGCTTTTTTGAATA
GTTTACTGATTAAGTAAACTACCACACTAGCTGTTAAACTAGCTAAAACATTAAACAAAAAGTTATCCATGAACTCACCT
CCCTTCGAATCGTTGGGAGGATAATCTTTTGTACATGAACTCCACTCTATAGATTGTAAGTTAAATCTTCTTGCTAAAAA
TATTATAACATATTATGGCAAATTATATAATTAAAAACACTTGTTTAAAAGTTCTAATTTTAATTATAAATTTTCCCAGT
TTCTATATCTATAAAAAACCAACCAAAAGTACCATTACTATTTTTTGAATTGATTTTAACAGCATAGACATTACCACTAT
ATATATCATCTCTAAAATCTATCATATCAACTACTAAGTTATTGATACTGACTTTATGTCTCTTAGCACATTCTTTTAAT
GCTATCTGTTTTGCTTGTTCTTCTGTTATACTTCCTTTATTTTTATAATCATCTGGATTACATACTTTCATATTACCATT
AACATCATATGTATAAACTTTGCTCATATCATTTTTAGCTACACAGTATCTAACATCACCCTCTGCACCCTGTTTAATGT
AAGCAAATACATAGTACTCTTTTCCTGAAAAATCAAAATTTTTATCTAGTAGAAATATTAAATCTTCATCTTCTGAATAA
TTAGGTTCGTAATAAAATTTCTTCACACCTAATAGTTTTTTCACTGCATTAGCAGCATCTTCTACTGTATATTCTCTTCC
AGTATTAGAATCGCCTATATTTTTTGTTACATTTAAACACTGCTGTAATATACTATCACTCAAATTTCCTATAGCAGTTA
ATTTAGTTGTACTTTTCAATACACTTTTATTACTATCATTATCAACTAACACAATAGCATTATTTTTAGCAACAGTAGAA
CCAACAAGAGCATACACTAAATCAGTACCACTTGCTATATAAAATTCTTTTACTCCACTATAAAATTTATTTATTATCTT
TTTGTTAGTATCATATCTATCTGTCCCACCTAATCTAGTTGAATTAGTATCCTTAACTATTTTGTCATTCATTGATGAAG
TACCACCTATTACATAACTTTCTACACCAGTTGTATTAAATGGAACACTTTTTCCATCAGTTAATACTATAGCTGCTTTA
TCTCTAACTGCTACAGGTGCAGCACTCATTGCATCAGGCTCTCCTTTAAATGCATTAGTCAATATGACTTTATTTACTTT
GTTAATTGAATTTATTTCTTTTGCGACATTATAGCTTGTCTTAATTCTATCACTACCTTGAAGTCTTTTAATCTCTATTC
CTTTGCCTTTTAGAACAGTTTCAGTATATTTATCAATAGAGTTTTCTCCTCCAATTATATATACTTTTTTTGCCTTTTCT
AATCTTTTAAGTGTAGCATTTGGTATGTTATTTTTCTTAGTCAAAAGAATTGGAGCGTTTATAGCTCCTGCAAGTCCACT
TGCACTTAATCCATCAGCCATTGTACTGTCTGCATTAATTAATATAGCTGTAGTATAGTTTTGTTTGTCTGCAATTATAC
CAGCAGTTTCGTATTTATCTGCACCTTTAATTGATTCAATTTTATCAAGAGCATTTGCAGATATAGGGCAACTAGCAATA
AATATAGATAAAGATAACCCTATTGTTAATAATTTTTTAATTTTCATAATATCTCCTTCTCTTAAATATTTTCACCTAAA
TTATATAATACTTTTCAGGAAAACATTACCATAAATTTAAAAAGTTATTATTACTTAATATAATATTAATGAAAAATATC
ACTCTTAAATTAATGACTTTGGTAGAATATGGTGATAAAATAAAATTAATGAGAGACAATATAAGGGGGATTATATTATG
ATAATCAGTAAAAAAATAACAGCAATATTAGTATCATTTTTAATTATGATATCAATGGTTGGATGTGCTCCAAAAGAAAG
TGCTACAGAAGTAGCTAAAAAGTACCTTGATAGTATAGAAATCAAAGACTACGAAGTAGCATATAATTTATTAAGTAAAG
ACAGTAAGGAAAGTGTCAGTCTAGAAAAATTTGAAGAATATCAAGATACTTTATTTAAACTTCAAACCCTAAAAGATTAT
AAACTTGGTGAAGAAAATAAAGTAGAGAAATACAAATATTCTAATAAAGAGTACACAAATCTTGTTAAAATAAAAGAAAC
TGATACTATAAAGTATATCACTGAAAATAAAGAAGATACTGCAAATTTTGATAGATATTTTATAATTGAAGATAATGAAT
ATAAATTATTATGGCATAAAGACTTTAAAAGAGCTCTTAGCTCTAATTATGTCAAAATCGCTAGGTCAGAAACAGAAAAA
GATGAAGATAAGGATTATAATAAAGCTGCTATTGATATCAAAAAAGCTATAGAAATTGATGATAAAAATCCACTTGCATA
TTATACACAATCATATATTTATATAGAGTTACAACGATATGATGAGGCTTTAAAGTCAATTGATAAATACTTAGAATATC
TAGATAAAAATAATGAAGCTTATAAAATAGACGCTAGTGATGCTTACAATTTAAGAGGTGTTATTTTTATGAGTAAATCA
GAATTTAATAAAGCTAGAGAATCTTACAATAAGGCGCTTGAACTTAACCCGGATAATGAATATGCAAAAACTAATCTAAA
TGATATTAAAGGATTATAAGGCATTAATATTATAGAAAATAAGTATGTTGAAAGTTAAATTAACTTTTGACATGCTTATT
TTCTATATTTTAAACTCTATTGATTTACTATATAATAGTGCATAAGGAGTGTGATTACTTATTATGAGTGTTGCCATATA
CTTAAGAAAATCCCGTGCTGATGAAGAGGCAGAAAAACAAGGCGAATTTGAAACTTTAAGTAGACATAAATCAACCCTAC
TAAAACTAGCAAAAGAACAAAACTTAGATGTAATTGAGATAAAAGAAGAATTAGTTTCTGGTGAAAGTATAATACATAGA
CCCAAAATGCTTGAACTTCTAAAAGAAGTTGAAGAAAATAAATATGATGCAGTCTTAGTAATGGACTTAGACAGACTTGG
TCGTGGAGACATGAAAGACCAAGGTATCATATTAGAAACATTCAAAGAAAGTAAGACCAAAATCATCACACCTAGAAAAA
CATACGACCTAACAGATGAATTTGATGAGGAGTATTCAGAATTTGAAGCATTTATGGCAAGAAAAGAATTAAAACTTATA
TCAAGAAGAATGCAAAGAGGTAGAATAAAATCAGTTGAAGAAGGGAATTTCATAGGAACCTCTGCTCCATTTGGATATGA
TGCTGTAACAACTGGTAGAAAAGAAAGAATACTTGTACCAAATAAAGATGCTGATGTAGTTAGGACTATCTTTGACTTAT
ATATTAATGAAGATATGGGTTGTAGTAAAATATCAAAATACCTAAATAACTTAGGCATTAAAACTGCTACAGGTGCTAAT
TGGTACAATTCTGCAATTACAAATATAATAAAAAATAAGGTATATTGTGGCTACATTCAGTGGCAAAAAAAGGACTACAA
AAAATCTAAAAATCCAAATAAAATAAAAACAGTTAAACTAAGACCTAAAGATGAATGGATTGAGGCAAAAGGAAAGCATG
AACCTTTAATAAGTGAAATAACATGGAAAAAAGCTCAAAATATACTCAAAAAAAATGGTCATGTCAGCTATGGTAATCAA
ATAAAAAATCCACTTGCAGGAATAGTGATTTGCAAAAATTGTGGTAGACCATTAGTATATAGACCATATGCAGACCACGA
CTATATAATTTGTTATCATCCTGGTTGCAATAAAAGTTCTCGATTTGAATTTATTGAAGCTGCCATTTTAAAATCTTTGG
AAGACACTGTAAAAAAATATCAATTAAAAGCATCTGATATAGACTTAGATAAAAATAATAAAGATAGTAATATAGAATTT
CAAAAACGAGTCTTAAAGGGCTTAGAAACTGAGTTAAAAGAATTAGGCAAGCAAAAAAATAAGTTATATGATTTACTAGA
ACGAGGAATATATGATGAAGATACATTTATTGAAAGGTCCAACAATATAAGTTCAAGAACTGAAGAAATTAAAGATTCAA
TTAAGACAGTAAAAAATAGATTGAGTACTGTTAAAAAAGACAATTCTAAAATAATAGAAGATATTAAAACTGTGTTATCA
CTTTACCATGATTCAGATTCCCTTGGAAAAAATAAACTCCTAAAATCTGTAATTAATAAAGCAGTTTATTATAAGTCTAA
AGAACAAAAACTAGATTCTTTTGAATTAATGGTCCATTTGAAATTACATGAAGACCAGTAATACCAATAACATATAAAGA
GTAGTGTGTAATGAAATAAGTCTTTTAGATATACTTGGTACAGAGGCTAACTATGTTCTTGATGAAGTTGAACTAAAAGT
TCAAGTTGGAAAACTTTACGAACAACTAAACAAAATTCTTACTCCTAGAGAAAGAGAAATTGTCCAGTTAAGATATGGGT
TAACTCCTTATGGCTATAAGACACAAAGAGAAATTGCACAAAAACTCGATATATCAAGGTCATATGTATCTAGAATCGAA
AAAAAAGCTCTTAAAAAACTAGAAAAAGAGCTTGTTCAAGAAAGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAATTCTAAAAATATGCATATTATTTTATTAGATAACAGTCAACTTGGATAAGTCTCCTTCATATAATTTAAAGTGACC
GTTGAAAAGGGGGTGACCTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TACTATATTTTAAAAGGATATATCGTACATCATTAGACAAAATTTTCTATCTAAAATCAAAGTTACGATATATCCTTAAA
TTTTATAGTACATAATTTAT

Product: sporulation sigma factor SigK

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 90; Mature: 90

Protein sequence:

>213_residues
MAALKSFEKPLTPEEEIEYLTKFKIENDKSAKDTLIERNMRLVAYIAKKYNNSTEDQDDLISIGTIGLIKAIETYNIDKG
TRLATYASRCIENEILMNIRSNKKNKTQVSLQDPIGTDKEGNEISLLDILGTEANYVLDEVELKVQVGKLYEQLNKILTP
REREIVQLRYGLTPYGYKTQREIAQKLDISRSYVSRIEKKALKKLEKELVQES

Sequences:

>Translated_90_residues
LTFLNKLFF*FFKSFFFDSRYI*P*YIEFLCNFSLCLIAIRS*PIS*LDNFSFSRSKNFV*LFVKFSNLNF*FNFIKNIV
SLCTKYI*KT
>Mature_90_residues
LTFLNKLFF*FFKSFFFDSRYI*P*YIEFLCNFSLCLIAIRS*PIS*LDNFSFSRSKNFV*LFVKFSNLNF*FNFIKNIV
SLCTKYI*KT

Specific function: Unknown

COG id: COG1191

COG function: function code K; DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 9734; Mature: 9734

Theoretical pI: Translated: 10.20; Mature: 10.20

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

3.3 %Cys     (Translated Protein)
0.0 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
3.3 %Cys     (Mature Protein)
0.0 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
LTFLNKLFFFFKSFFFDSRYIPYIEFLCNFSLCLIAIRSPISLDNFSFSRSKNFVLFVKF
CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEE
SNLNFFNFIKNIVSLCTKYIKT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 10.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA