Definition Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 chromosome, complete genome.
Accession NC_009053
Length 2,274,482

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The map label for this gene is 126208184

Identifier: 126208184

GI number: 126208184

Start: 809425

End: 812742

Strand: Reverse

Name: 126208184

Synonym: APL_0704

Alternate gene names: NA

Gene position: 812742-809425 (Counterclockwise)

Preceding gene: 126208185

Following gene: 126208183

Centisome position: 35.73

GC content: 38.58

Gene sequence:

>3318_bases
ATGTTAAAAGGACAAAAAATGAAACGCACTTTCCACGATAACCTAATTTTAAACCGCTATTTGTTGTCATTATTCAATCA
AGATAACCTTGAAAAATTCAAACAGCGTTTGGGCGATGACCGTTTTGAAGGCATTGATAATGACGGGCAGACAAAAGTTT
TCCACGAACTGACAGGTGGGCAGTTATTTCAAACGGATTTAATTTCGGCAAACGATTTACGCCGTTATGATTTGAATATT
GTTAAACATTGGCAACAAATTACTGAAAATCGCAATAAAGCTGAAGGGCATATCTTAAACCTTAAATACTTCCAATATCT
TTCGCTGTTATTTACCGAAATTCATTTGGATTTTTATTTTAATCGCCAGAATGAATTATTAAATCAATTAAATGAACAGC
TGGTTTTACTTAAAGAGAACGATAGCACTTTTCCTGATTTTGATTTGTATGAATTGGGCGATTTGAATAAATTGGCATTT
TGGAATGCCACAGGTAGCGGTAAAACTTTGTTAATGCACGTTAATATTTTGCAATATCAGCATTATCAAAAAAATAAAGA
TTTAACCGTATTTGTGATTACACCGAACGATGGGCTTTCACAGCAACATTTGGCGGAATTTAGTGCGTCAAATTTGCCAG
CCAATTTGTTTGATAAAAATAAACCGTTCCAAGGCACGGGCTTGTTTAATGATATTCAAATTATGGATATCAACAAACTG
GCAGATAAAGATGGCGAATTGACGGTGGCGGTCGATCGCTTTTTGGATTTAAACAAATTGGTATTGGTGGACGAAGGACA
TCGTGGTTCTTCGGGCGATCAGTGGTTAGCTCGACGTCAAAAATTGATTGGCGATGGTTTTGCCTTTGAGTATTCGGCAA
CGTTCGGGCAGGCGGTGAAAGATGGCAAAACGGTAAAAGATTGCCTGTTTGATATTCAGAAAAAAATCGGTAAAGCAAAT
GGCATAAGCAAAAAAGCTGATGTGCAAAAAATCCCAACTAGCTTTACCGATAAACAAGAAGCTAAGCAAAAAGCCGTGTT
TGAAACCTATGCCAAATGCGTGCTGTTTGACTATTCCTATAAGTTTTTCTATGCCGATGGTTATGGTAAAGAGTTTTCCA
TTTTGAATATGAAAGCGGACGATTATGGTGTTGCCGATAATGACCGCAAGTATTTTGTGGCAAGTTTGCTATCGTTTTAT
CAGCAGTTATATCTCTTTGCAAAAAATCAGGAAAAATTGACCGCTTACAATCTGCATAAGCCGTTATGGGTGTTTGTGGG
TAATACGGTAAATAAGGAAGACAGTGATATTTGGGCGGTGGTGGAGCAGTTAGCCTATTTCTTAGATGGTAAAAATCGTC
CGCAAATTTTGGCGTGGCTCAATGATTTGCTTTGTGATGAACCATTACTTTTGGATAGTAAAGGTAATGCGATTTTCCGT
CACCGCTTTTTGCCATTGGCAAGTTTTAAAGGCGATTTAGACAGACTTTATAAAGATATCTTGCAGAGGTTGTTTAATTC
AGGCAGTTCACAGCATTTGTATCTGTATGATTTGAAAAAAGCCAGTGGTGAAATTGCCTTAAGTATTGATAATGATCTAA
AAAAGAGCTTTGCACTGATTAATGTGGGAGACAGCAATGAATTACTCAAAAGTGCGGTGAAATTAGATAATGTTTCGGTG
CAACAAGACGAGTTTTCAGAAGGCTTGTTTGGCACGATCAATCAAGACAGCTCAACACTTAACTTGCTTATCGGCTCTCG
CAAATTTACCGAAGGTTGGTCAAGTTGGCGAGTTTCGACAATGGGGTTGCTTAATATGGGCAGAGGAGAGGGTTCGCAAA
TTATTCAGCTTTTTGGACGAGGTGTGCGTTTGAAAGGGCGTGATTTTTCGTTGCGAAGAACGCCTATCAATCAAATGCCA
AAAGGCTTGGGGTTGGATAAATTAGAAACGCTCAATATTTTTGGTATCAAAGCCGATTATATGGCGAAATTCCGTGAATA
CTTGGAAGATGAGGGGATTCAATCGCCTGATGAGGTGTTGCAGTTGGATTTCCCTGTGCAGAAAAAACTGCCGACCAATG
TGGCGTTGAAAACCTTGCGTTTAAAAGATGGTTATAAAGATAACCAAAAAATGGGTTTTAAACGCCAAGAAATGGTACAG
CTTTATGAATTGCCTGAATTTGCACAAGGCAAAATTAAGCCGATTTTGGCAGTGTTGGATCTGTATCCAAGATTGGAAGC
ATTGAGTTCTAAGGCGGTTCGCCAAAGCGAGAGTGATGAACGCCAAAGCAATAAATTTAAGCGAGAAATTTTTGCTTTAT
TCGATTGGGACAAGCTCTATTTGGATTTACAGCAATACAAAATGGAACGCACTTGGTCGAATTTGCGTGTTAGCCGTGAT
GGGTTACGTAAATTTGTGGAAAGTCGAGATGATTGGTATTTGCTCTATGTGCCAAATTCAGCAATGGAAGTTCGCAGTTT
TGGCGATATTCAAACGCAACAGGATATTTTGTTTCAGTTGTTAAAAGAATATACCGACCAATTTTACCGCCGTTTGAAAA
ACGCCTATGAACAGCAATTTATGGAAACAGCGATAATTACCGAAGAAAACGGTTCGTTCTTTGAAACTTACAAAATGCTG
TTTGGCGAGGAAGAAAACTTGCCTTATGAGCGTGAACAAGCGGTCAAAAAAATTGAAGAATTAGCGGATCTGATTCGAGA
TAAAAAAATTGAGCAGGCGATGAATTGGCAGTCGCCACTTTCTGAATTTAAGGCGATTTGTTTTAACAGCCACTTGTTTT
ATCCGCTACTTTCCTTTGATAAATCAACAGGTTTGCCGATAAAAATTTCCCCGTTACCACTTGCCGCAGAAAGTGAAATG
CAGTTTATCGATGACTTAATGCAAGCGGAAAAATCAGGCGAATTAGCAAAATGGCTAGGGGGAAAATCGCTCTATTTAAT
GCGTAATGCTGACCGAAAAGATAAAGGCTTGGGCTTTGCTTTGGCAGGTAATTTCTATCCTGACTTTTTGCTGTGGGTAG
TGGATCACGCAAATGGCAAACAATGGCTGAATTTTGTTGATCCGAAAGGCATTCGTAATATGGATTTGCACGATCCAAAA
TTCGGGTTGTATCAAGAAGTGAAAGCGTTAGAAGCGAAAATTGCTGATCCGAATTTGGTACTCAATAGCTTTATTCTATC
GATCACGAAATTGCAAGATTGGGTAAATATGACCTTAACGGTAGAAGAACTTGCCGAGCGACATATTTTGTTTATGGAAA
ACAACTATTTACAGCAAATGTTTGAGAAAATGCAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACTAAAGAGTGAAATAGTTTTGTGAAAAGTTGGAGATCTCTATTCTTTATCAAGATCGCCCCCCTCTTTAGTAAAGAGGG
GCGGGGGGAGATTTGTAACG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAAGATTACCCCTTATCACGCCCGTTATTTTGCCAACGAAATCACTTGTCGCCGTACGGACGACAACCGTTTGTCGCAA
TCGCTGTTTGATGCCAAAGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Type III Restriction R Protein; DEAD/DEAH Box Helicase Domain-Containing Protein; Dead/Deah Box Helicase Domain Protein; Type III Restriction Res Subunit; Type III Restriction- System Restriction Subunit; Type III Restriction

Number of amino acids: Translated: 1105; Mature: 1105

Protein sequence:

>1105_residues
MLKGQKMKRTFHDNLILNRYLLSLFNQDNLEKFKQRLGDDRFEGIDNDGQTKVFHELTGGQLFQTDLISANDLRRYDLNI
VKHWQQITENRNKAEGHILNLKYFQYLSLLFTEIHLDFYFNRQNELLNQLNEQLVLLKENDSTFPDFDLYELGDLNKLAF
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QQLYLFAKNQEKLTAYNLHKPLWVFVGNTVNKEDSDIWAVVEQLAYFLDGKNRPQILAWLNDLLCDEPLLLDSKGNAIFR
HRFLPLASFKGDLDRLYKDILQRLFNSGSSQHLYLYDLKKASGEIALSIDNDLKKSFALINVGDSNELLKSAVKLDNVSV
QQDEFSEGLFGTINQDSSTLNLLIGSRKFTEGWSSWRVSTMGLLNMGRGEGSQIIQLFGRGVRLKGRDFSLRRTPINQMP
KGLGLDKLETLNIFGIKADYMAKFREYLEDEGIQSPDEVLQLDFPVQKKLPTNVALKTLRLKDGYKDNQKMGFKRQEMVQ
LYELPEFAQGKIKPILAVLDLYPRLEALSSKAVRQSESDERQSNKFKREIFALFDWDKLYLDLQQYKMERTWSNLRVSRD
GLRKFVESRDDWYLLYVPNSAMEVRSFGDIQTQQDILFQLLKEYTDQFYRRLKNAYEQQFMETAIITEENGSFFETYKML
FGEEENLPYEREQAVKKIEELADLIRDKKIEQAMNWQSPLSEFKAICFNSHLFYPLLSFDKSTGLPIKISPLPLAAESEM
QFIDDLMQAEKSGELAKWLGGKSLYLMRNADRKDKGLGFALAGNFYPDFLLWVVDHANGKQWLNFVDPKGIRNMDLHDPK
FGLYQEVKALEAKIADPNLVLNSFILSITKLQDWVNMTLTVEELAERHILFMENNYLQQMFEKMQ

Sequences:

>Translated_1105_residues
MLKGQKMKRTFHDNLILNRYLLSLFNQDNLEKFKQRLGDDRFEGIDNDGQTKVFHELTGGQLFQTDLISANDLRRYDLNI
VKHWQQITENRNKAEGHILNLKYFQYLSLLFTEIHLDFYFNRQNELLNQLNEQLVLLKENDSTFPDFDLYELGDLNKLAF
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QQLYLFAKNQEKLTAYNLHKPLWVFVGNTVNKEDSDIWAVVEQLAYFLDGKNRPQILAWLNDLLCDEPLLLDSKGNAIFR
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LYELPEFAQGKIKPILAVLDLYPRLEALSSKAVRQSESDERQSNKFKREIFALFDWDKLYLDLQQYKMERTWSNLRVSRD
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FGEEENLPYEREQAVKKIEELADLIRDKKIEQAMNWQSPLSEFKAICFNSHLFYPLLSFDKSTGLPIKISPLPLAAESEM
QFIDDLMQAEKSGELAKWLGGKSLYLMRNADRKDKGLGFALAGNFYPDFLLWVVDHANGKQWLNFVDPKGIRNMDLHDPK
FGLYQEVKALEAKIADPNLVLNSFILSITKLQDWVNMTLTVEELAERHILFMENNYLQQMFEKMQ
>Mature_1105_residues
MLKGQKMKRTFHDNLILNRYLLSLFNQDNLEKFKQRLGDDRFEGIDNDGQTKVFHELTGGQLFQTDLISANDLRRYDLNI
VKHWQQITENRNKAEGHILNLKYFQYLSLLFTEIHLDFYFNRQNELLNQLNEQLVLLKENDSTFPDFDLYELGDLNKLAF
WNATGSGKTLLMHVNILQYQHYQKNKDLTVFVITPNDGLSQQHLAEFSASNLPANLFDKNKPFQGTGLFNDIQIMDINKL
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QQLYLFAKNQEKLTAYNLHKPLWVFVGNTVNKEDSDIWAVVEQLAYFLDGKNRPQILAWLNDLLCDEPLLLDSKGNAIFR
HRFLPLASFKGDLDRLYKDILQRLFNSGSSQHLYLYDLKKASGEIALSIDNDLKKSFALINVGDSNELLKSAVKLDNVSV
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GLRKFVESRDDWYLLYVPNSAMEVRSFGDIQTQQDILFQLLKEYTDQFYRRLKNAYEQQFMETAIITEENGSFFETYKML
FGEEENLPYEREQAVKKIEELADLIRDKKIEQAMNWQSPLSEFKAICFNSHLFYPLLSFDKSTGLPIKISPLPLAAESEM
QFIDDLMQAEKSGELAKWLGGKSLYLMRNADRKDKGLGFALAGNFYPDFLLWVVDHANGKQWLNFVDPKGIRNMDLHDPK
FGLYQEVKALEAKIADPNLVLNSFILSITKLQDWVNMTLTVEELAERHILFMENNYLQQMFEKMQ

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 128040; Mature: 128040

Theoretical pI: Translated: 6.06; Mature: 6.06

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKGQKMKRTFHDNLILNRYLLSLFNQDNLEKFKQRLGDDRFEGIDNDGQTKVFHELTGG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCCCHHHHCCCC
QLFQTDLISANDLRRYDLNIVKHWQQITENRNKAEGHILNLKYFQYLSLLFTEIHLDFYF
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HYQKNKDLTVFVITPNDGLSQQHLAEFSASNLPANLFDKNKPFQGTGLFNDIQIMDINKL
HHCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEHHH
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HHCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
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VEELAERHILFMENNYLQQMFEKMQ
HHHHHHCCEEEEECHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MLKGQKMKRTFHDNLILNRYLLSLFNQDNLEKFKQRLGDDRFEGIDNDGQTKVFHELTGG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCCCHHHHCCCC
QLFQTDLISANDLRRYDLNIVKHWQQITENRNKAEGHILNLKYFQYLSLLFTEIHLDFYF
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CCCCCCEEEEEHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHH
DGKTVKDCLFDIQKKIGKANGISKKADVQKIPTSFTDKQEAKQKAVFETYAKCVLFDYSY
CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECE
KFFYADGYGKEFSILNMKADDYGVADNDRKYFVASLLSFYQQLYLFAKNQEKLTAYNLHK
EEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCC
PLWVFVGNTVNKEDSDIWAVVEQLAYFLDGKNRPQILAWLNDLLCDEPLLLDSKGNAIFR
CEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEEEH
HRFLPLASFKGDLDRLYKDILQRLFNSGSSQHLYLYDLKKASGEIALSIDNDLKKSFALI
HHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEECCHHCCCEEEE
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ECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCEEECCCCCEEEEEECCCHHHCCCCCCEEHH
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HHCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
LDLQQYKMERTWSNLRVSRDGLRKFVESRDDWYLLYVPNSAMEVRSFGDIQTQQDILFQL
HHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
LKEYTDQFYRRLKNAYEQQFMETAIITEENGSFFETYKMLFGEEENLPYEREQAVKKIEE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCH
QWLNFVDPKGIRNMDLHDPKFGLYQEVKALEAKIADPNLVLNSFILSITKLQDWVNMTLT
HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE
VEELAERHILFMENNYLQQMFEKMQ
HHHHHHCCEEEEECHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA