Definition Shewanella baltica OS155 chromosome, complete genome.
Accession NC_009052
Length 5,127,376

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The map label for this gene is 126176417

Identifier: 126176417

GI number: 126176417

Start: 4959520

End: 4961175

Strand: Direct

Name: 126176417

Synonym: Sbal_4232

Alternate gene names: NA

Gene position: 4959520-4961175 (Clockwise)

Preceding gene: 126176414

Following gene: 126176418

Centisome position: 96.73

GC content: 50.36

Gene sequence:

>1656_bases
ATGCTCTATCTTCTTGCTAGCTGTATCGCACTCTTAATTGGGCCACTGTTTTATCGCTACTTTTCATCGGGCAGCGGATT
ACAGAAGGGGCTCGATGGCTTTATATTCGTCTCATTAGGCGGACTAGTGCTGATCCACATCTTGCCAGAGCTACTGCAGC
ATGGCGGTTTGCTAGCCGTAGTCTTTGTATTCCTAGGTATCTGGGGACCGACCGCTAGCGAACGCCTTTTCCACCGTTAT
TCAGAAATCACCCATAATCTCACCTTATCCCTAGGGATTGGCGGCTTGCTACTGCACACCATCACCGACGGTGGCGCTAT
GGTATTGGCGCAGCAAGACGGCAGTTCGATCTTACTTGCCCTCGGGGTCATTATGCATCGCCTCCCCGTCGGCCTCGCCA
TTTGGTGGTTACTCAAACCTCAAGTCGGCACCCGCTGGGCTAGCTTAGTGCTGGTCGCTATGATGCTACTTACGGGTGTT
GGTTACTTTGCAGGCGAGCAATTAATCACTCAGCTCAGTTTAGAAAATACCGTTTATTTACAAGCCTTTGTTACCGGTTC
GATTTTGCATGTGGTGCTACATCAACCCCACGGTCAGCACGATACCGACAAGCAAGGCAAATACGAGTACCAAGCGGGTA
TCGGCAGTTTGCTCGGCATAGGCTTGCTCGTGATGCTGCTCTTGATGGATTCTGGCGGCCACGAACATGCCCACCATGAT
CACAGCACAGAACAATTAATGACTTGGCTACTGACACTCGCGCCCATATTACTGCTGAGCTATGGTGCGGCGGCGCTGCG
CTTTAAATTAGGTCTGACACCGCAGGATAGCAGCTTAGCCCGTCGCTGGTTCCAACGCTTAGCGGGGCCAGAAGCTCTCG
TCATCACCGCCCTGTTACTCGGCCCTTGGCTAGCGTTATTCCAGTTACTTGTGGTTTTTATTCTTAGCGCTTATTTAAGC
CACGCTAACGTTACTATTACCGATCCGCATACTAAATTACCCAGTAATTCCCTACGTTTCGGCTTTGCACATTTAGTCGA
TCGCAGCGCACCGTGGATTTTACTCAGCCTAGTACTAGTGAATTTAATCGGCCATCCTTCAGTGCCATTAAGCAATCCGC
TGCTGCAGGTTATAGTGCTGTTGCTCGTGTTTTTACCTATGCGTTTCTGCAACTTAGGCGCTGCGGTACTGGCTCTTGCA
CTGGCCTACAGTGGCTGGAGCCCTATCGCAATTATGATGCCGCTGATTGCCGCACCTGTGCTTAACATATCGCAGCTTAA
GTTAATGACATGGCCGCAAAGGGCAATATTACTGAGTATTATTGCGCTGAGTTTAGTCGCAGCACTACGTTTGCCACTGT
GGTTCTCTCTATTCACTTTGCCAGAAGTGGTGAACTTAGTCGCGCTACTGATCCTGTCGGGATTATTTGCCGCCAGCTTA
CTGCGCTTAGGCCCACGTAAATTTCTACGCCGCTTAATGCTGAGCAAACCGGCAGCTCATGCGCATAGTCATTCGCACAG
CCACGAACATGCAACCCATGAACCTAGCACTTCGCACACATCTGTGCAGAGCACTGCTGAAACGCCTAGTGCCCATGATC
ATTCCGATGAGCATACACACGATAAAGCAAAAGCAAATAAGCACACGCACCACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGCAAAATGTCAGTTTGGTAAATTGCCAGCAAGTCACTGCTCACTTTGCCTTACAGCTGGTATACTATGGCGTTTTTTCA
GCAAATTTTCCGTGGAATCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CACTGTTCATTTGTGAGCAGACAGGCTAAGTTAATCTACCTTTGGATTAATTTAGCCTGCTATGTGCATACTCTTTGTCG
CCATTAATGCCCATCCTAAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 551; Mature: 551

Protein sequence:

>551_residues
MLYLLASCIALLIGPLFYRYFSSGSGLQKGLDGFIFVSLGGLVLIHILPELLQHGGLLAVVFVFLGIWGPTASERLFHRY
SEITHNLTLSLGIGGLLLHTITDGGAMVLAQQDGSSILLALGVIMHRLPVGLAIWWLLKPQVGTRWASLVLVAMMLLTGV
GYFAGEQLITQLSLENTVYLQAFVTGSILHVVLHQPHGQHDTDKQGKYEYQAGIGSLLGIGLLVMLLLMDSGGHEHAHHD
HSTEQLMTWLLTLAPILLLSYGAAALRFKLGLTPQDSSLARRWFQRLAGPEALVITALLLGPWLALFQLLVVFILSAYLS
HANVTITDPHTKLPSNSLRFGFAHLVDRSAPWILLSLVLVNLIGHPSVPLSNPLLQVIVLLLVFLPMRFCNLGAAVLALA
LAYSGWSPIAIMMPLIAAPVLNISQLKLMTWPQRAILLSIIALSLVAALRLPLWFSLFTLPEVVNLVALLILSGLFAASL
LRLGPRKFLRRLMLSKPAAHAHSHSHSHEHATHEPSTSHTSVQSTAETPSAHDHSDEHTHDKAKANKHTHH

Sequences:

>Translated_551_residues
MLYLLASCIALLIGPLFYRYFSSGSGLQKGLDGFIFVSLGGLVLIHILPELLQHGGLLAVVFVFLGIWGPTASERLFHRY
SEITHNLTLSLGIGGLLLHTITDGGAMVLAQQDGSSILLALGVIMHRLPVGLAIWWLLKPQVGTRWASLVLVAMMLLTGV
GYFAGEQLITQLSLENTVYLQAFVTGSILHVVLHQPHGQHDTDKQGKYEYQAGIGSLLGIGLLVMLLLMDSGGHEHAHHD
HSTEQLMTWLLTLAPILLLSYGAAALRFKLGLTPQDSSLARRWFQRLAGPEALVITALLLGPWLALFQLLVVFILSAYLS
HANVTITDPHTKLPSNSLRFGFAHLVDRSAPWILLSLVLVNLIGHPSVPLSNPLLQVIVLLLVFLPMRFCNLGAAVLALA
LAYSGWSPIAIMMPLIAAPVLNISQLKLMTWPQRAILLSIIALSLVAALRLPLWFSLFTLPEVVNLVALLILSGLFAASL
LRLGPRKFLRRLMLSKPAAHAHSHSHSHEHATHEPSTSHTSVQSTAETPSAHDHSDEHTHDKAKANKHTHH
>Mature_551_residues
MLYLLASCIALLIGPLFYRYFSSGSGLQKGLDGFIFVSLGGLVLIHILPELLQHGGLLAVVFVFLGIWGPTASERLFHRY
SEITHNLTLSLGIGGLLLHTITDGGAMVLAQQDGSSILLALGVIMHRLPVGLAIWWLLKPQVGTRWASLVLVAMMLLTGV
GYFAGEQLITQLSLENTVYLQAFVTGSILHVVLHQPHGQHDTDKQGKYEYQAGIGSLLGIGLLVMLLLMDSGGHEHAHHD
HSTEQLMTWLLTLAPILLLSYGAAALRFKLGLTPQDSSLARRWFQRLAGPEALVITALLLGPWLALFQLLVVFILSAYLS
HANVTITDPHTKLPSNSLRFGFAHLVDRSAPWILLSLVLVNLIGHPSVPLSNPLLQVIVLLLVFLPMRFCNLGAAVLALA
LAYSGWSPIAIMMPLIAAPVLNISQLKLMTWPQRAILLSIIALSLVAALRLPLWFSLFTLPEVVNLVALLILSGLFAASL
LRLGPRKFLRRLMLSKPAAHAHSHSHSHEHATHEPSTSHTSVQSTAETPSAHDHSDEHTHDKAKANKHTHH

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 60084; Mature: 60084

Theoretical pI: Translated: 8.96; Mature: 8.96

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLYLLASCIALLIGPLFYRYFSSGSGLQKGLDGFIFVSLGGLVLIHILPELLQHGGLLAV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
VFVFLGIWGPTASERLFHRYSEITHNLTLSLGIGGLLLHTITDGGAMVLAQQDGSSILLA
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHH
LGVIMHRLPVGLAIWWLLKPQVGTRWASLVLVAMMLLTGVGYFAGEQLITQLSLENTVYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEH
QAFVTGSILHVVLHQPHGQHDTDKQGKYEYQAGIGSLLGIGLLVMLLLMDSGGHEHAHHD
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
HSTEQLMTWLLTLAPILLLSYGAAALRFKLGLTPQDSSLARRWFQRLAGPEALVITALLL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
GPWLALFQLLVVFILSAYLSHANVTITDPHTKLPSNSLRFGFAHLVDRSAPWILLSLVLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
NLIGHPSVPLSNPLLQVIVLLLVFLPMRFCNLGAAVLALALAYSGWSPIAIMMPLIAAPV
HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCC
LNISQLKLMTWPQRAILLSIIALSLVAALRLPLWFSLFTLPEVVNLVALLILSGLFAASL
CCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LRLGPRKFLRRLMLSKPAAHAHSHSHSHEHATHEPSTSHTSVQSTAETPSAHDHSDEHTH
HHHCHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHH
DKAKANKHTHH
HHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLYLLASCIALLIGPLFYRYFSSGSGLQKGLDGFIFVSLGGLVLIHILPELLQHGGLLAV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
VFVFLGIWGPTASERLFHRYSEITHNLTLSLGIGGLLLHTITDGGAMVLAQQDGSSILLA
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHH
LGVIMHRLPVGLAIWWLLKPQVGTRWASLVLVAMMLLTGVGYFAGEQLITQLSLENTVYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEH
QAFVTGSILHVVLHQPHGQHDTDKQGKYEYQAGIGSLLGIGLLVMLLLMDSGGHEHAHHD
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
HSTEQLMTWLLTLAPILLLSYGAAALRFKLGLTPQDSSLARRWFQRLAGPEALVITALLL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
GPWLALFQLLVVFILSAYLSHANVTITDPHTKLPSNSLRFGFAHLVDRSAPWILLSLVLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
NLIGHPSVPLSNPLLQVIVLLLVFLPMRFCNLGAAVLALALAYSGWSPIAIMMPLIAAPV
HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCC
LNISQLKLMTWPQRAILLSIIALSLVAALRLPLWFSLFTLPEVVNLVALLILSGLFAASL
CCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LRLGPRKFLRRLMLSKPAAHAHSHSHSHEHATHEPSTSHTSVQSTAETPSAHDHSDEHTH
HHHCHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHH
DKAKANKHTHH
HHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA