| Definition | Prochlorococcus marinus str. MIT 9303, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008820 |
| Length | 2,682,675 |
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The map label for this gene is 124024514
Identifier: 124024514
GI number: 124024514
Start: 2487256
End: 2489403
Strand: Reverse
Name: 124024514
Synonym: P9303_28261
Alternate gene names: NA
Gene position: 2489403-2487256 (Counterclockwise)
Preceding gene: 124024516
Following gene: 124024513
Centisome position: 92.8
GC content: 41.67
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases GGTTTTTCATTGACTCTTTTGCATTGACTTAATCTTGCATATGATGAAATAATTGTCTCTTACTCCTTCCCCTGTCGCAA AGTCAACTTGAGATCTAGAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 715; Mature: 715
Protein sequence:
>715_residues MQRKMAIIYQLTFLLSVIIVAYIIGWSLTGYAFKASRDLSSKPFLVIATGLAWIVIASAWALLLSRLFPFYIYLQYTIVF IPVFVGILLRKRIQVYSTIKQHVARLLKVSWLFFVPTLILVALGIISSMHHKVQFGVDSALYIQLAHHLLRSPTNPTEVS NLVETGHLAWAGFVQSHRWGLPLLVQFFSSSIFSDLAKNSYALCSVFIVLPAGLIVENLPTVEDSKNCISTLRLYVLFPC VGLNWFLFSLLLEGQWPNLVALTFYFLASIFILDSLYDTLSLNSKKLISLWKILLSALFFSAACTIYGEFFLLHWMSVSI LIAVYVGLSIRSVYSIGCKVGVDLLRFLLVIIGCSIFLCLPYLQSAFSHTSTIKLTTVGYPQPRPLLLPDLLGIDSPWLL DDWRSQMNSFTEVGESVYSLVDSSDIKYYVLLAFVGLCALAALCIRCAFSELDLSSRQGKLFYTFALLVPIYSLVAILYT FKSASGAGVNEDYIWLKLCSYLFLFVQYILLSALSISLANKQDVARAPLDQFFYGSSLSYLFVSLYSVMVAFTCFFYLNS FSEHSARARILSEQTKNVLASDYSDCIILLPPRGVSRRERRWADRTKEFIATSTSPNATSSSRALRFLGSWSLQVRHLGV PPHPLSMTGNICLMVDTSRDSYDRRFIKDIHRLSDSQRTLPDDWTLYVTDYTFGDLEKIGSVNLYSKLYSGIENQ
Sequences:
>Translated_715_residues MQRKMAIIYQLTFLLSVIIVAYIIGWSLTGYAFKASRDLSSKPFLVIATGLAWIVIASAWALLLSRLFPFYIYLQYTIVF IPVFVGILLRKRIQVYSTIKQHVARLLKVSWLFFVPTLILVALGIISSMHHKVQFGVDSALYIQLAHHLLRSPTNPTEVS NLVETGHLAWAGFVQSHRWGLPLLVQFFSSSIFSDLAKNSYALCSVFIVLPAGLIVENLPTVEDSKNCISTLRLYVLFPC VGLNWFLFSLLLEGQWPNLVALTFYFLASIFILDSLYDTLSLNSKKLISLWKILLSALFFSAACTIYGEFFLLHWMSVSI LIAVYVGLSIRSVYSIGCKVGVDLLRFLLVIIGCSIFLCLPYLQSAFSHTSTIKLTTVGYPQPRPLLLPDLLGIDSPWLL DDWRSQMNSFTEVGESVYSLVDSSDIKYYVLLAFVGLCALAALCIRCAFSELDLSSRQGKLFYTFALLVPIYSLVAILYT FKSASGAGVNEDYIWLKLCSYLFLFVQYILLSALSISLANKQDVARAPLDQFFYGSSLSYLFVSLYSVMVAFTCFFYLNS FSEHSARARILSEQTKNVLASDYSDCIILLPPRGVSRRERRWADRTKEFIATSTSPNATSSSRALRFLGSWSLQVRHLGV PPHPLSMTGNICLMVDTSRDSYDRRFIKDIHRLSDSQRTLPDDWTLYVTDYTFGDLEKIGSVNLYSKLYSGIENQ >Mature_715_residues MQRKMAIIYQLTFLLSVIIVAYIIGWSLTGYAFKASRDLSSKPFLVIATGLAWIVIASAWALLLSRLFPFYIYLQYTIVF IPVFVGILLRKRIQVYSTIKQHVARLLKVSWLFFVPTLILVALGIISSMHHKVQFGVDSALYIQLAHHLLRSPTNPTEVS NLVETGHLAWAGFVQSHRWGLPLLVQFFSSSIFSDLAKNSYALCSVFIVLPAGLIVENLPTVEDSKNCISTLRLYVLFPC VGLNWFLFSLLLEGQWPNLVALTFYFLASIFILDSLYDTLSLNSKKLISLWKILLSALFFSAACTIYGEFFLLHWMSVSI LIAVYVGLSIRSVYSIGCKVGVDLLRFLLVIIGCSIFLCLPYLQSAFSHTSTIKLTTVGYPQPRPLLLPDLLGIDSPWLL DDWRSQMNSFTEVGESVYSLVDSSDIKYYVLLAFVGLCALAALCIRCAFSELDLSSRQGKLFYTFALLVPIYSLVAILYT FKSASGAGVNEDYIWLKLCSYLFLFVQYILLSALSISLANKQDVARAPLDQFFYGSSLSYLFVSLYSVMVAFTCFFYLNS FSEHSARARILSEQTKNVLASDYSDCIILLPPRGVSRRERRWADRTKEFIATSTSPNATSSSRALRFLGSWSLQVRHLGV PPHPLSMTGNICLMVDTSRDSYDRRFIKDIHRLSDSQRTLPDDWTLYVTDYTFGDLEKIGSVNLYSKLYSGIENQ
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 80710; Mature: 80710
Theoretical pI: Translated: 8.73; Mature: 8.73
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.0 %Cys (Translated Protein) 1.1 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 2.0 %Cys (Mature Protein) 1.1 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MQRKMAIIYQLTFLLSVIIVAYIIGWSLTGYAFKASRDLSSKPFLVIATGLAWIVIASAW CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHH ALLLSRLFPFYIYLQYTIVFIPVFVGILLRKRIQVYSTIKQHVARLLKVSWLFFVPTLIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VALGIISSMHHKVQFGVDSALYIQLAHHLLRSPTNPTEVSNLVETGHLAWAGFVQSHRWG HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCC LPLLVQFFSSSIFSDLAKNSYALCSVFIVLPAGLIVENLPTVEDSKNCISTLRLYVLFPC HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH VGLNWFLFSLLLEGQWPNLVALTFYFLASIFILDSLYDTLSLNSKKLISLWKILLSALFF HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH SAACTIYGEFFLLHWMSVSILIAVYVGLSIRSVYSIGCKVGVDLLRFLLVIIGCSIFLCL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PYLQSAFSHTSTIKLTTVGYPQPRPLLLPDLLGIDSPWLLDDWRSQMNSFTEVGESVYSL HHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VDSSDIKYYVLLAFVGLCALAALCIRCAFSELDLSSRQGKLFYTFALLVPIYSLVAILYT HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FKSASGAGVNEDYIWLKLCSYLFLFVQYILLSALSISLANKQDVARAPLDQFFYGSSLSY HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHCCCHHHH LFVSLYSVMVAFTCFFYLNSFSEHSARARILSEQTKNVLASDYSDCIILLPPRGVSRRER HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCHHHH RWADRTKEFIATSTSPNATSSSRALRFLGSWSLQVRHLGVPPHPLSMTGNICLMVDTSRD HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCC SYDRRFIKDIHRLSDSQRTLPDDWTLYVTDYTFGDLEKIGSVNLYSKLYSGIENQ HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MQRKMAIIYQLTFLLSVIIVAYIIGWSLTGYAFKASRDLSSKPFLVIATGLAWIVIASAW CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHH ALLLSRLFPFYIYLQYTIVFIPVFVGILLRKRIQVYSTIKQHVARLLKVSWLFFVPTLIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VALGIISSMHHKVQFGVDSALYIQLAHHLLRSPTNPTEVSNLVETGHLAWAGFVQSHRWG HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCC LPLLVQFFSSSIFSDLAKNSYALCSVFIVLPAGLIVENLPTVEDSKNCISTLRLYVLFPC HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH VGLNWFLFSLLLEGQWPNLVALTFYFLASIFILDSLYDTLSLNSKKLISLWKILLSALFF HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH SAACTIYGEFFLLHWMSVSILIAVYVGLSIRSVYSIGCKVGVDLLRFLLVIIGCSIFLCL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PYLQSAFSHTSTIKLTTVGYPQPRPLLLPDLLGIDSPWLLDDWRSQMNSFTEVGESVYSL HHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VDSSDIKYYVLLAFVGLCALAALCIRCAFSELDLSSRQGKLFYTFALLVPIYSLVAILYT HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FKSASGAGVNEDYIWLKLCSYLFLFVQYILLSALSISLANKQDVARAPLDQFFYGSSLSY HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHCCCHHHH LFVSLYSVMVAFTCFFYLNSFSEHSARARILSEQTKNVLASDYSDCIILLPPRGVSRRER HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCHHHH RWADRTKEFIATSTSPNATSSSRALRFLGSWSLQVRHLGVPPHPLSMTGNICLMVDTSRD HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCC SYDRRFIKDIHRLSDSQRTLPDDWTLYVTDYTFGDLEKIGSVNLYSKLYSGIENQ HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA