Definition Prochlorococcus marinus str. AS9601, complete genome.
Accession NC_008816
Length 1,669,886

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 123969018

Identifier: 123969018

GI number: 123969018

Start: 1266344

End: 1268449

Strand: Reverse

Name: 123969018

Synonym: A9601_14861

Alternate gene names: NA

Gene position: 1268449-1266344 (Counterclockwise)

Preceding gene: 123969020

Following gene: 123969017

Centisome position: 75.96

GC content: 30.67

Gene sequence:

>2106_bases
TTGGAACTTCCTTTAGACCATTTTCGTTTAATTGGCGTAAGCCCCTCTGCAACTTCTGAGGAAATATTAAGGGCGTTTCA
ATTGCGGTTAGATAAAACACCTGATGAAGGTTTTACTTATGAAGTTTTAACCCAAAGATCTGAGCTACTTCGCCTCACTG
CCGATCTACTTACAGATCCAGAAAGCAGAAGAGAATACGAAAATTTGTTATTAAATGGGAATTCTGGATTGGATTTTTCC
TCAAATAGAGAAGTAGCAGGATTAATACTTCTTTGGGAATCAGGTTCACCAAAAGAAGCTTTTAAAATAACGAGAAAAGC
ATTGCAACCCCCTCAAACCCCAGCTTTAGGAAGTAGTAGAGAAGCTGATTTAACATTATTGGCTGCTTTAACAGCTAGAG
ATTCTGCAATACAAGAACAACAGCTTAGATCCTATTCGAGCGCGTCAGACTTTTTACATGAAGGTATAAAACTTCTACAA
AGAATGGGAAAGCTTGGAGAAAAAAGAAAAGAACTTGAAGAAGATTTGGCTGCTTTGCTTCCTTACAGAATACTAGATCT
ACTTAGTAGAGATCTAAATGATCAAGACTCTCATAAAAAAGGTTTAAGTATGTTGGAAAATTTAATAATCAAAAGAGGTG
GTTTGGAAGGTAATAATAAATCTGAATATAAAGATTATTTAAATCAGCAAGAGTTTGAAGCTTTTTTTCAACAAATAAAG
CCATTTTTGACAGTGCAAGAACAGATTGATTTGTTTCTTGAATTACAAAAAAGAGGATCATTAGAAGCAGGATTTTTAGC
GTTTCTATCTTTAACAGCTATTGGTTTCTCTAGAAGAAAGCCAGAAAAATTATTTGAAGCGAGAAGAATTTTAAAAAAAT
TAAATTTATCAGGTCTTGATTCAATGCCTCTAGTTGGTTGTTTAGATTTACTTTTAGCTGACATTGACCAAGCCTCTGCA
AGGTTTTCAAGTAGTTCTGATGAAAATTTACGAGATTGGCTCAATAATTATCCTGGAAATAAGTTAGAAGCTATATGTAT
TTTCTGTAAAAATTGGTTAGAAAATGATGTTTTAGTTGGGTATAGAGACATTAACTCAAAAGAGGTGGATTTAGATTCTT
GGTTTGAAGATAGGGAAATTCAAGAATTTATTGAAAAATTAGAAAAGAAAACAAAAAAAATTGCAATTAGATCAAATCTT
CAAAACCAACAAACTGAGAAGGAATCCTCCACAAAAACGACTGAAGATTTTGATAATGTATTGGGGAATATTGATGAAAG
AAGATTACCTTGGCCTGGTGGCATAAAACAAGGCTATGAGAAGGTTGAGACCAAAAAAACAGAATTCAATGAGGAATACT
TTAAGAAAAAACCAATTGAGTTTTATAATTTTTTAATTGAAAAAATTGCTGAATTTAAGTTTAGTTTTGGGGAATTCTTA
AAGGATAAAGAGATAATTAATCGGTCTCCGTATTTAATTTATATCTATGCATTTTTGATCTTATTTGCATTTGGTATTGG
TATTGGATTTTTAAGAAATAATTTTAAAAAATCAATTCAGGACGAATCTATTGCTGAAAAACCATTAATTGCAAAAGATA
AAAATCAAAAGATTAGTGAGATAGATATTATTCAAGAAATAAAAAAAAATCCTTCAAATAAATTGAATTCTATTTCTGAG
AAATCTACTTCAATTATTTCTTATGAATTCAAAGAACTTAATACTGCTTCACCTACTTTGGAAGATATAAAGAATTTAAT
TAATAGATGGCTTCTTAATAAAAGTAATTACTTAGAGGGAAAGGGTGAAATTAATCTTTCTAAGATTGTTAGTAAAGGTC
TAATTGATCGAACAATCGAAGAAAGACAGAACGATATCAAGAAAGGAATTTATAAGGAGATTAATTCCCAAATACTTAAA
ATTGATTTGGAATCGCAAACTTCATCTAGGATAGTTGTTTTAGTAGAATTGAATTATTTAGAGAGGTTAGTAAAGAATTC
GGGAGAATTTATTAATGAAACATCTTTAAATCCCCTTAAAGTTAAATATATTTTGGGCTTTTCAAATAAATCGTGGAAAT
TGGTTGATTTCGTGAGCGGCTTGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGGCGATTTTCATGATTTTTTTTAATAACTCTGTAAGACCTTGTGAAAAAATTTTTTAACTTGATAAAATTTGTCTAAGA
ATTTTCAATAGGATATTTGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTACAAACTTCAAGATCATCTATAATAATTAAAATTACTTTTTAATAATGTTTGATGAACTCTCGTCACGCTTTGAAGAC
GCAGTAAAGGGTTTAAGAGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 701; Mature: 701

Protein sequence:

>701_residues
MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDPESRREYENLLLNGNSGLDFS
SNREVAGLILLWESGSPKEAFKITRKALQPPQTPALGSSREADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSSASDFLHEGIKLLQ
RMGKLGEKRKELEEDLAALLPYRILDLLSRDLNDQDSHKKGLSMLENLIIKRGGLEGNNKSEYKDYLNQQEFEAFFQQIK
PFLTVQEQIDLFLELQKRGSLEAGFLAFLSLTAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLDSMPLVGCLDLLLADIDQASA
RFSSSSDENLRDWLNNYPGNKLEAICIFCKNWLENDVLVGYRDINSKEVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKTKKIAIRSNL
QNQQTEKESSTKTTEDFDNVLGNIDERRLPWPGGIKQGYEKVETKKTEFNEEYFKKKPIEFYNFLIEKIAEFKFSFGEFL
KDKEIINRSPYLIYIYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKKSIQDESIAEKPLIAKDKNQKISEIDIIQEIKKNPSNKLNSISE
KSTSIISYEFKELNTASPTLEDIKNLINRWLLNKSNYLEGKGEINLSKIVSKGLIDRTIEERQNDIKKGIYKEINSQILK
IDLESQTSSRIVVLVELNYLERLVKNSGEFINETSLNPLKVKYILGFSNKSWKLVDFVSGL

Sequences:

>Translated_701_residues
MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDPESRREYENLLLNGNSGLDFS
SNREVAGLILLWESGSPKEAFKITRKALQPPQTPALGSSREADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSSASDFLHEGIKLLQ
RMGKLGEKRKELEEDLAALLPYRILDLLSRDLNDQDSHKKGLSMLENLIIKRGGLEGNNKSEYKDYLNQQEFEAFFQQIK
PFLTVQEQIDLFLELQKRGSLEAGFLAFLSLTAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLDSMPLVGCLDLLLADIDQASA
RFSSSSDENLRDWLNNYPGNKLEAICIFCKNWLENDVLVGYRDINSKEVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKTKKIAIRSNL
QNQQTEKESSTKTTEDFDNVLGNIDERRLPWPGGIKQGYEKVETKKTEFNEEYFKKKPIEFYNFLIEKIAEFKFSFGEFL
KDKEIINRSPYLIYIYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKKSIQDESIAEKPLIAKDKNQKISEIDIIQEIKKNPSNKLNSISE
KSTSIISYEFKELNTASPTLEDIKNLINRWLLNKSNYLEGKGEINLSKIVSKGLIDRTIEERQNDIKKGIYKEINSQILK
IDLESQTSSRIVVLVELNYLERLVKNSGEFINETSLNPLKVKYILGFSNKSWKLVDFVSGL
>Mature_701_residues
MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDPESRREYENLLLNGNSGLDFS
SNREVAGLILLWESGSPKEAFKITRKALQPPQTPALGSSREADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSSASDFLHEGIKLLQ
RMGKLGEKRKELEEDLAALLPYRILDLLSRDLNDQDSHKKGLSMLENLIIKRGGLEGNNKSEYKDYLNQQEFEAFFQQIK
PFLTVQEQIDLFLELQKRGSLEAGFLAFLSLTAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLDSMPLVGCLDLLLADIDQASA
RFSSSSDENLRDWLNNYPGNKLEAICIFCKNWLENDVLVGYRDINSKEVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKTKKIAIRSNL
QNQQTEKESSTKTTEDFDNVLGNIDERRLPWPGGIKQGYEKVETKKTEFNEEYFKKKPIEFYNFLIEKIAEFKFSFGEFL
KDKEIINRSPYLIYIYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKKSIQDESIAEKPLIAKDKNQKISEIDIIQEIKKNPSNKLNSISE
KSTSIISYEFKELNTASPTLEDIKNLINRWLLNKSNYLEGKGEINLSKIVSKGLIDRTIEERQNDIKKGIYKEINSQILK
IDLESQTSSRIVVLVELNYLERLVKNSGEFINETSLNPLKVKYILGFSNKSWKLVDFVSGL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 80575; Mature: 80575

Theoretical pI: Translated: 5.34; Mature: 5.34

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
0.6 %Met     (Translated Protein)
1.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
0.6 %Met     (Mature Protein)
1.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDP
CCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ESRREYENLLLNGNSGLDFSSNREVAGLILLWESGSPKEAFKITRKALQPPQTPALGSSR
HHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
EADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSSASDFLHEGIKLLQRMGKLGEKRKELEEDLAALL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PYRILDLLSRDLNDQDSHKKGLSMLENLIIKRGGLEGNNKSEYKDYLNQQEFEAFFQQIK
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PFLTVQEQIDLFLELQKRGSLEAGFLAFLSLTAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLD
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
SMPLVGCLDLLLADIDQASARFSSSSDENLRDWLNNYPGNKLEAICIFCKNWLENDVLVG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
YRDINSKEVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKTKKIAIRSNLQNQQTEKESSTKTTEDFDNV
EECCCCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
LGNIDERRLPWPGGIKQGYEKVETKKTEFNEEYFKKKPIEFYNFLIEKIAEFKFSFGEFL
HCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KDKEIINRSPYLIYIYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKKSIQDESIAEKPLIAKDKNQKISE
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHH
IDIIQEIKKNPSNKLNSISEKSTSIISYEFKELNTASPTLEDIKNLINRWLLNKSNYLEG
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
KGEINLSKIVSKGLIDRTIEERQNDIKKGIYKEINSQILKIDLESQTSSRIVVLVELNYL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEHHHH
ERLVKNSGEFINETSLNPLKVKYILGFSNKSWKLVDFVSGL
HHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MELPLDHFRLIGVSPSATSEEILRAFQLRLDKTPDEGFTYEVLTQRSELLRLTADLLTDP
CCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ESRREYENLLLNGNSGLDFSSNREVAGLILLWESGSPKEAFKITRKALQPPQTPALGSSR
HHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
EADLTLLAALTARDSAIQEQQLRSYSSASDFLHEGIKLLQRMGKLGEKRKELEEDLAALL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PYRILDLLSRDLNDQDSHKKGLSMLENLIIKRGGLEGNNKSEYKDYLNQQEFEAFFQQIK
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PFLTVQEQIDLFLELQKRGSLEAGFLAFLSLTAIGFSRRKPEKLFEARRILKKLNLSGLD
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
SMPLVGCLDLLLADIDQASARFSSSSDENLRDWLNNYPGNKLEAICIFCKNWLENDVLVG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
YRDINSKEVDLDSWFEDREIQEFIEKLEKKTKKIAIRSNLQNQQTEKESSTKTTEDFDNV
EECCCCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
LGNIDERRLPWPGGIKQGYEKVETKKTEFNEEYFKKKPIEFYNFLIEKIAEFKFSFGEFL
HCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KDKEIINRSPYLIYIYAFLILFAFGIGIGFLRNNFKKSIQDESIAEKPLIAKDKNQKISE
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHH
IDIIQEIKKNPSNKLNSISEKSTSIISYEFKELNTASPTLEDIKNLINRWLLNKSNYLEG
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
KGEINLSKIVSKGLIDRTIEERQNDIKKGIYKEINSQILKIDLESQTSSRIVVLVELNYL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEHHHH
ERLVKNSGEFINETSLNPLKVKYILGFSNKSWKLVDFVSGL
HHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA