| Definition | Prochlorococcus marinus str. MIT 9515, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008817 |
| Length | 1,704,176 |
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The map label for this gene is 123966638
Identifier: 123966638
GI number: 123966638
Start: 1242852
End: 1244900
Strand: Direct
Name: 123966638
Synonym: P9515_14051
Alternate gene names: NA
Gene position: 1242852-1244900 (Clockwise)
Preceding gene: 123966637
Following gene: 123966639
Centisome position: 72.93
GC content: 23.96
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 682; Mature: 682
Protein sequence:
>682_residues MKILNTRNSIFTFFLVIKIFFIILVVPSIQDVWFIDFIKNSINNPSLDPWSSYLSNYGDSLGFPYGPIMFLIFIPLSFTF WFIGIPFGLEDYFLGIGFRFNLLIFDLISLLVLSKLLNNKKEIIIFYWLSPLIFYVTYIYGQLDIIPTTIVLIGYLKLYK NEFKNSGYFFGLAIATKLSFALIIPFPIIYLWQNKRLSFGFKPFIKSLSEILLVFVLTPVISSGYRQMVLSTPEKASLIS FNFSLNDDLKIFILPLIFILIIYSIWRLKRSNFTLLISITGLSFLISTLMMPPSPGWYLWALPFLIIYQIKTDINGKLLI SFFTFLPIIIIFPNNIFSKLSFLNSNYKYNTILINSLNADLIYTLFISLGILIAIRLYRESIQSSNYYKLNKRAFVIGIS GGPSSGKDILSKSIVDLLGDHSTLVFRERDYFKWNKNLSNTEKHNSINIKSNDLLKLNSDLDLISNKNVLNRKTINNSIT KFQSMKSFSKDFIVVNGYHIFLPDVLNKFFNIKIFLDPETELNKNWLKNKNDSQPNPTKISNFKDLKKYQDLYSEQKNCS DIIFSFSYINKEILSYKKVQNLPIKMDVFLKDGIYAENLSKALISICGVKLNSNISNTDFSAKLSIEGDIWPEDIKLAAT RLVPNLEEIIDYNAKWQSNILGLMQLIILMQIAYVFKYKIEN
Sequences:
>Translated_682_residues MKILNTRNSIFTFFLVIKIFFIILVVPSIQDVWFIDFIKNSINNPSLDPWSSYLSNYGDSLGFPYGPIMFLIFIPLSFTF WFIGIPFGLEDYFLGIGFRFNLLIFDLISLLVLSKLLNNKKEIIIFYWLSPLIFYVTYIYGQLDIIPTTIVLIGYLKLYK NEFKNSGYFFGLAIATKLSFALIIPFPIIYLWQNKRLSFGFKPFIKSLSEILLVFVLTPVISSGYRQMVLSTPEKASLIS FNFSLNDDLKIFILPLIFILIIYSIWRLKRSNFTLLISITGLSFLISTLMMPPSPGWYLWALPFLIIYQIKTDINGKLLI SFFTFLPIIIIFPNNIFSKLSFLNSNYKYNTILINSLNADLIYTLFISLGILIAIRLYRESIQSSNYYKLNKRAFVIGIS GGPSSGKDILSKSIVDLLGDHSTLVFRERDYFKWNKNLSNTEKHNSINIKSNDLLKLNSDLDLISNKNVLNRKTINNSIT KFQSMKSFSKDFIVVNGYHIFLPDVLNKFFNIKIFLDPETELNKNWLKNKNDSQPNPTKISNFKDLKKYQDLYSEQKNCS DIIFSFSYINKEILSYKKVQNLPIKMDVFLKDGIYAENLSKALISICGVKLNSNISNTDFSAKLSIEGDIWPEDIKLAAT RLVPNLEEIIDYNAKWQSNILGLMQLIILMQIAYVFKYKIEN >Mature_682_residues MKILNTRNSIFTFFLVIKIFFIILVVPSIQDVWFIDFIKNSINNPSLDPWSSYLSNYGDSLGFPYGPIMFLIFIPLSFTF WFIGIPFGLEDYFLGIGFRFNLLIFDLISLLVLSKLLNNKKEIIIFYWLSPLIFYVTYIYGQLDIIPTTIVLIGYLKLYK NEFKNSGYFFGLAIATKLSFALIIPFPIIYLWQNKRLSFGFKPFIKSLSEILLVFVLTPVISSGYRQMVLSTPEKASLIS FNFSLNDDLKIFILPLIFILIIYSIWRLKRSNFTLLISITGLSFLISTLMMPPSPGWYLWALPFLIIYQIKTDINGKLLI SFFTFLPIIIIFPNNIFSKLSFLNSNYKYNTILINSLNADLIYTLFISLGILIAIRLYRESIQSSNYYKLNKRAFVIGIS GGPSSGKDILSKSIVDLLGDHSTLVFRERDYFKWNKNLSNTEKHNSINIKSNDLLKLNSDLDLISNKNVLNRKTINNSIT KFQSMKSFSKDFIVVNGYHIFLPDVLNKFFNIKIFLDPETELNKNWLKNKNDSQPNPTKISNFKDLKKYQDLYSEQKNCS DIIFSFSYINKEILSYKKVQNLPIKMDVFLKDGIYAENLSKALISICGVKLNSNISNTDFSAKLSIEGDIWPEDIKLAAT RLVPNLEEIIDYNAKWQSNILGLMQLIILMQIAYVFKYKIEN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 78932; Mature: 78932
Theoretical pI: Translated: 9.85; Mature: 9.85
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 1.3 %Met (Translated Protein) 1.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKILNTRNSIFTFFLVIKIFFIILVVPSIQDVWFIDFIKNSINNPSLDPWSSYLSNYGDS CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCC LGFPYGPIMFLIFIPLSFTFWFIGIPFGLEDYFLGIGFRFNLLIFDLISLLVLSKLLNNK CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC KEIIIFYWLSPLIFYVTYIYGQLDIIPTTIVLIGYLKLYKNEFKNSGYFFGLAIATKLSF CCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHH ALIIPFPIIYLWQNKRLSFGFKPFIKSLSEILLVFVLTPVISSGYRQMVLSTPEKASLIS HEEECCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCEEEE FNFSLNDDLKIFILPLIFILIIYSIWRLKRSNFTLLISITGLSFLISTLMMPPSPGWYLW EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHCCCCCCCHHHH ALPFLIIYQIKTDINGKLLISFFTFLPIIIIFPNNIFSKLSFLNSNYKYNTILINSLNAD HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCHH LIYTLFISLGILIAIRLYRESIQSSNYYKLNKRAFVIGISGGPSSGKDILSKSIVDLLGD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCC HSTLVFRERDYFKWNKNLSNTEKHNSINIKSNDLLKLNSDLDLISNKNVLNRKTINNSIT CCEEEEECCCHHEECCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH KFQSMKSFSKDFIVVNGYHIFLPDVLNKFFNIKIFLDPETELNKNWLKNKNDSQPNPTKI HHHHHHHCCCCEEEEECEEEEHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCC SNFKDLKKYQDLYSEQKNCSDIIFSFSYINKEILSYKKVQNLPIKMDVFLKDGIYAENLS CCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCHHHHH KALISICGVKLNSNISNTDFSAKLSIEGDIWPEDIKLAATRLVPNLEEIIDYNAKWQSNI HHHHHHHCCEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHHHH LGLMQLIILMQIAYVFKYKIEN HHHHHHHHHHHHHHHHHEEECC >Mature Secondary Structure MKILNTRNSIFTFFLVIKIFFIILVVPSIQDVWFIDFIKNSINNPSLDPWSSYLSNYGDS CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCC LGFPYGPIMFLIFIPLSFTFWFIGIPFGLEDYFLGIGFRFNLLIFDLISLLVLSKLLNNK CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC KEIIIFYWLSPLIFYVTYIYGQLDIIPTTIVLIGYLKLYKNEFKNSGYFFGLAIATKLSF CCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHH ALIIPFPIIYLWQNKRLSFGFKPFIKSLSEILLVFVLTPVISSGYRQMVLSTPEKASLIS HEEECCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCEEEE FNFSLNDDLKIFILPLIFILIIYSIWRLKRSNFTLLISITGLSFLISTLMMPPSPGWYLW EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHCCCCCCCHHHH ALPFLIIYQIKTDINGKLLISFFTFLPIIIIFPNNIFSKLSFLNSNYKYNTILINSLNAD HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCHH LIYTLFISLGILIAIRLYRESIQSSNYYKLNKRAFVIGISGGPSSGKDILSKSIVDLLGD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCC HSTLVFRERDYFKWNKNLSNTEKHNSINIKSNDLLKLNSDLDLISNKNVLNRKTINNSIT CCEEEEECCCHHEECCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH KFQSMKSFSKDFIVVNGYHIFLPDVLNKFFNIKIFLDPETELNKNWLKNKNDSQPNPTKI HHHHHHHCCCCEEEEECEEEEHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCC SNFKDLKKYQDLYSEQKNCSDIIFSFSYINKEILSYKKVQNLPIKMDVFLKDGIYAENLS CCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCHHHHH KALISICGVKLNSNISNTDFSAKLSIEGDIWPEDIKLAATRLVPNLEEIIDYNAKWQSNI HHHHHHHCCEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHHHH LGLMQLIILMQIAYVFKYKIEN HHHHHHHHHHHHHHHHHEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA