Definition Prochlorococcus marinus str. MIT 9515, complete genome.
Accession NC_008817
Length 1,704,176

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The map label for this gene is 123965964

Identifier: 123965964

GI number: 123965964

Start: 660026

End: 661324

Strand: Direct

Name: 123965964

Synonym: P9515_07291

Alternate gene names: NA

Gene position: 660026-661324 (Clockwise)

Preceding gene: 123965960

Following gene: 123965966

Centisome position: 38.73

GC content: 28.18

Gene sequence:

>1299_bases
ATGAAAAGTTTACTTAAATATCCAGATAAATTCTTTTTTAAAAGATGTGATAATTTAATTTTAAAAATATTTTCTGATAC
AGAAATTGGCTGGAAAATAGACTTGAAAATAGCACTTATTGCATTTGGAACAACCATCTTTTTTGCGTTTCCTTCTTTAT
GGATTTATTTCAGGCCAGACAAAGCAGGACGCTTGTTTTATCAAATGCTTCAATCTGAAAACCCTCTAAATAGGGATCTT
CCACTCACTGCTCAAATATTAAGCTATAGATTTTTTGTCCCAACGTTGAATTATTTTTTAGGATTAAGAGGCTATAGTGT
CGTTGTTATACCGGTTATATCCTCTTTTATTAATTTATATTTTATTAGTCGAATCATTAGGAAAAGTACAAGAGATATTT
TGTTCAGTGCTATTTGTGTAATTGGAATTTCATTAACTTGGTTTATTACAGAAGGAACTGCTTTTTGGAATACTACAGAT
TCTGTATCACATTTATTACTTTTACTACCTGCTGCATTTAGGCTTAATCCTACTTATTTTATTTTCGCACTTCCATCTGC
ATTATTTGTAGATGAAAGATCTATTTTTGCCTGTGCTTTTCTTTGGTTATTTCTTTTGAGAAGAGATCTAATGTGTGGCG
ATTATTTAAATGAAATTGGTAGTAATTTTTTTAATTTGAAAATAACGAGAAATATACTACTTACTACCTATTCAATGTTT
ATTGGCTTTGTTTTTTGGATAATTGGTCGTTACCTAATTGATTCTGGAATAATTGCTCCTGCCCCTGACATAAGTTTAGT
TACTAACCAGATAACTGATTTTTGGGAATTCTTTGGAAAACATTGGCCCCCACAGATTTTAAATTATTTAAGCTCCTTTA
GGTGGGTTTACTTTTTCCCTTTAGTATTGATTTTTAAATTATTGAAAAAAAGCTCAAACAGTTTCAGGAAAAGATATGGT
TTTAACTTTAAGAGTTATTTTGGAATACATCTTTTACTTTTTATTTTTTATAGCTCAATAGTAATGATTAATGGAGATGT
TTGGCGATCAATGTCCTTTTCCTATTTTTTTATATTGGAATCTATTTTGATTCTATATACTTTAAATAAAAAATTAATTT
CGGTATTGAATTATTGGATAACATTTCTAATGTTACTAACTCCTGTTACTTTCTTTGGATTGAATTTAACCCCTCAAATA
TCTTTTCCTATGCCTATTGTTTTATTAAGAACTTATTTTGGATTTGGAGATTCTTATATGATATTTTTTAAAAAACTATT
TATATTCGTACCTAGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTATTTACTGCTAATAGTAGAATGAATGTTAATAATAAAATTATTTATTTCTATTTTAATAAAAATATTTAATTCAATA
ATTCTCGATTTATAAATGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCATTTAATTAATGAAAGGTTAAAAACCATTACCTGTATAAGGATCTCGTAAAAGCAAACTTCCTTTTTTAAGTAAAGAT
CTATATCACCTTTTTATTTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 432; Mature: 432

Protein sequence:

>432_residues
MKSLLKYPDKFFFKRCDNLILKIFSDTEIGWKIDLKIALIAFGTTIFFAFPSLWIYFRPDKAGRLFYQMLQSENPLNRDL
PLTAQILSYRFFVPTLNYFLGLRGYSVVVIPVISSFINLYFISRIIRKSTRDILFSAICVIGISLTWFITEGTAFWNTTD
SVSHLLLLLPAAFRLNPTYFIFALPSALFVDERSIFACAFLWLFLLRRDLMCGDYLNEIGSNFFNLKITRNILLTTYSMF
IGFVFWIIGRYLIDSGIIAPAPDISLVTNQITDFWEFFGKHWPPQILNYLSSFRWVYFFPLVLIFKLLKKSSNSFRKRYG
FNFKSYFGIHLLLFIFYSSIVMINGDVWRSMSFSYFFILESILILYTLNKKLISVLNYWITFLMLLTPVTFFGLNLTPQI
SFPMPIVLLRTYFGFGDSYMIFFKKLFIFVPS

Sequences:

>Translated_432_residues
MKSLLKYPDKFFFKRCDNLILKIFSDTEIGWKIDLKIALIAFGTTIFFAFPSLWIYFRPDKAGRLFYQMLQSENPLNRDL
PLTAQILSYRFFVPTLNYFLGLRGYSVVVIPVISSFINLYFISRIIRKSTRDILFSAICVIGISLTWFITEGTAFWNTTD
SVSHLLLLLPAAFRLNPTYFIFALPSALFVDERSIFACAFLWLFLLRRDLMCGDYLNEIGSNFFNLKITRNILLTTYSMF
IGFVFWIIGRYLIDSGIIAPAPDISLVTNQITDFWEFFGKHWPPQILNYLSSFRWVYFFPLVLIFKLLKKSSNSFRKRYG
FNFKSYFGIHLLLFIFYSSIVMINGDVWRSMSFSYFFILESILILYTLNKKLISVLNYWITFLMLLTPVTFFGLNLTPQI
SFPMPIVLLRTYFGFGDSYMIFFKKLFIFVPS
>Mature_432_residues
MKSLLKYPDKFFFKRCDNLILKIFSDTEIGWKIDLKIALIAFGTTIFFAFPSLWIYFRPDKAGRLFYQMLQSENPLNRDL
PLTAQILSYRFFVPTLNYFLGLRGYSVVVIPVISSFINLYFISRIIRKSTRDILFSAICVIGISLTWFITEGTAFWNTTD
SVSHLLLLLPAAFRLNPTYFIFALPSALFVDERSIFACAFLWLFLLRRDLMCGDYLNEIGSNFFNLKITRNILLTTYSMF
IGFVFWIIGRYLIDSGIIAPAPDISLVTNQITDFWEFFGKHWPPQILNYLSSFRWVYFFPLVLIFKLLKKSSNSFRKRYG
FNFKSYFGIHLLLFIFYSSIVMINGDVWRSMSFSYFFILESILILYTLNKKLISVLNYWITFLMLLTPVTFFGLNLTPQI
SFPMPIVLLRTYFGFGDSYMIFFKKLFIFVPS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50781; Mature: 50781

Theoretical pI: Translated: 10.00; Mature: 10.00

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKSLLKYPDKFFFKRCDNLILKIFSDTEIGWKIDLKIALIAFGTTIFFAFPSLWIYFRPD
CCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHCEEEEECCC
KAGRLFYQMLQSENPLNRDLPLTAQILSYRFFVPTLNYFLGLRGYSVVVIPVISSFINLY
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
FISRIIRKSTRDILFSAICVIGISLTWFITEGTAFWNTTDSVSHLLLLLPAAFRLNPTYF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
IFALPSALFVDERSIFACAFLWLFLLRRDLMCGDYLNEIGSNFFNLKITRNILLTTYSMF
EEECCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHH
IGFVFWIIGRYLIDSGIIAPAPDISLVTNQITDFWEFFGKHWPPQILNYLSSFRWVYFFP
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVLIFKLLKKSSNSFRKRYGFNFKSYFGIHLLLFIFYSSIVMINGDVWRSMSFSYFFILE
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHCCHHHHHHHH
SILILYTLNKKLISVLNYWITFLMLLTPVTFFGLNLTPQISFPMPIVLLRTYFGFGDSYM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHH
IFFKKLFIFVPS
HHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKSLLKYPDKFFFKRCDNLILKIFSDTEIGWKIDLKIALIAFGTTIFFAFPSLWIYFRPD
CCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHCEEEEECCC
KAGRLFYQMLQSENPLNRDLPLTAQILSYRFFVPTLNYFLGLRGYSVVVIPVISSFINLY
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
FISRIIRKSTRDILFSAICVIGISLTWFITEGTAFWNTTDSVSHLLLLLPAAFRLNPTYF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
IFALPSALFVDERSIFACAFLWLFLLRRDLMCGDYLNEIGSNFFNLKITRNILLTTYSMF
EEECCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHH
IGFVFWIIGRYLIDSGIIAPAPDISLVTNQITDFWEFFGKHWPPQILNYLSSFRWVYFFP
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVLIFKLLKKSSNSFRKRYGFNFKSYFGIHLLLFIFYSSIVMINGDVWRSMSFSYFFILE
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHCCHHHHHHHH
SILILYTLNKKLISVLNYWITFLMLLTPVTFFGLNLTPQISFPMPIVLLRTYFGFGDSYM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHH
IFFKKLFIFVPS
HHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA