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The map label for this gene is tuaB [H]

Identifier: 120598289

GI number: 120598289

Start: 1657627

End: 1659057

Strand: Direct

Name: tuaB [H]

Synonym: Sputw3181_1467

Alternate gene names: 120598289

Gene position: 1657627-1659057 (Clockwise)

Preceding gene: 120598288

Following gene: 120598290

Centisome position: 35.21

GC content: 43.54

Gene sequence:

>1431_bases
ATGTCGGATTTGGCTACTAAAACCAAAAAAGGTCTCCAATGGAGCGCCATCGAGCGTCTTTTAACCCAAGGTATGCAGTT
AGGGATAACTCTGCTACTGGCACGCCTGCTTGGGCCAACTGCCTTTGGCTTGGTGGGGATGTTAACGGTGTTCATTGCCA
TCGCCAATGTGTTTGTCGATAGCGGCTTTACCTCGGCGTTAATCCGCAAATCCGATCGAAGTGAAAGTGATTTGGTCACT
GCTTTTTATTACAACATAGGTATGGCGGCTGTGTGTTATTTGGCGCTCTATATAAGTGCACCCGCTATTGCCGAGTTTTA
TCAGCAAAGCGAGTTGCAATCCCTGCTGCGGGTATTAGGAATAACGGTGTTGATCAATGCCTTTACCTTGATCCCACGGG
TTAAACTTAATGTGGTTATGGATTTTAAAACTCAGGCTAAGATATCGATCATCAGTGTATTAATTAGCGGCTCAATCTCC
ATGACATTGGCCATAAACGGTTTAGGTGTATGGGCTTTGGTTATACAAACTTTGATTAATTCCAGTTGTACCACCCTGTT
ATTTAATCTGTTTGTTCCTTGGTTGCCGCGTGGCAATCTTACTAAGGCATCATTTAGTTACTTATTTGGTTATGGTAGCA
AAATCTTAATTTCTAGTTTATTAGAGGTTATTTACAGCAATATTTATCAAATTATTATCGGTAAAAAATTCAGCCCTGCC
GTGGTGGGACAATTTACTCAAGCTAATCAATTGGCCAGTGTGCCAGCTATGACCTTGACTGCCATTATTCAACGGGTGAC
CTTTCCGCTGTTTAGCCAGTTGCAAGATAACCCTGAAAAGATGGAAAGTGCATATCGACTGACGTTAAAGACGGCGGCCA
TGGTAATCTTTCCGCTGATTGTTGGGTTAGGGCTAATTGCTCAACCGTTGTTAACTGAATTATTGGGGGCCCAGTGGCAG
GACGCAGCAGGTTTGCTCAGTGTGTTGTGTTTGGGCTATATGCTTTATCCAATTCATGCAATAAATTTAAATCTACTGCA
AATAACGGGCCGCAGCGATCTCTTTTTAAAACTTGAAGTGTTTAAGAAAATCATCGGAGTGGTGATCTTGCTGAACACCA
TTCGCTATGGTGTGCTGGGCATGTGCATTGGCCTTAGCGTCACCTCTTATGTTGCATTGTTGTTAAATACCTATTACACC
GCCAAACTTACCCGCATCAGTCAATGGCAGCAGTGTAAAGATTTAACTCCTATCTGGTTAGCGGTGATGTTATCTGCCGT
TCTAGCCTATGCCACTGGACTATCTTGGCAAGCGCTACCTTGGTTACAGATTTTAATCAACATAAGCGTTGCCTTGCTTA
GTTATTCACTTTATCTGGTCTTGGCCCAAAGGCCGTTGTTGCTGCAATTGCAAAGCGCCCTGCGTCGCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGAAAAACTGGCGGTAGCATGGCCAATTGAAGGTTTGATATTGACCTTATCTGATAAAGACAAACGACAGCCCATTTTT
GAAAAGGCTGAATATTTGTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTAGTCGCATTATTACCAATATTTTTTGGAAGCAAACATGAGTAATAAAAATATCCCTGTCACCCAGCCGTTTTTGCCAG
AGTTAAATGAGTTTATCCCC

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 476; Mature: 475

Protein sequence:

>476_residues
MSDLATKTKKGLQWSAIERLLTQGMQLGITLLLARLLGPTAFGLVGMLTVFIAIANVFVDSGFTSALIRKSDRSESDLVT
AFYYNIGMAAVCYLALYISAPAIAEFYQQSELQSLLRVLGITVLINAFTLIPRVKLNVVMDFKTQAKISIISVLISGSIS
MTLAINGLGVWALVIQTLINSSCTTLLFNLFVPWLPRGNLTKASFSYLFGYGSKILISSLLEVIYSNIYQIIIGKKFSPA
VVGQFTQANQLASVPAMTLTAIIQRVTFPLFSQLQDNPEKMESAYRLTLKTAAMVIFPLIVGLGLIAQPLLTELLGAQWQ
DAAGLLSVLCLGYMLYPIHAINLNLLQITGRSDLFLKLEVFKKIIGVVILLNTIRYGVLGMCIGLSVTSYVALLLNTYYT
AKLTRISQWQQCKDLTPIWLAVMLSAVLAYATGLSWQALPWLQILINISVALLSYSLYLVLAQRPLLLQLQSALRR

Sequences:

>Translated_476_residues
MSDLATKTKKGLQWSAIERLLTQGMQLGITLLLARLLGPTAFGLVGMLTVFIAIANVFVDSGFTSALIRKSDRSESDLVT
AFYYNIGMAAVCYLALYISAPAIAEFYQQSELQSLLRVLGITVLINAFTLIPRVKLNVVMDFKTQAKISIISVLISGSIS
MTLAINGLGVWALVIQTLINSSCTTLLFNLFVPWLPRGNLTKASFSYLFGYGSKILISSLLEVIYSNIYQIIIGKKFSPA
VVGQFTQANQLASVPAMTLTAIIQRVTFPLFSQLQDNPEKMESAYRLTLKTAAMVIFPLIVGLGLIAQPLLTELLGAQWQ
DAAGLLSVLCLGYMLYPIHAINLNLLQITGRSDLFLKLEVFKKIIGVVILLNTIRYGVLGMCIGLSVTSYVALLLNTYYT
AKLTRISQWQQCKDLTPIWLAVMLSAVLAYATGLSWQALPWLQILINISVALLSYSLYLVLAQRPLLLQLQSALRR
>Mature_475_residues
SDLATKTKKGLQWSAIERLLTQGMQLGITLLLARLLGPTAFGLVGMLTVFIAIANVFVDSGFTSALIRKSDRSESDLVTA
FYYNIGMAAVCYLALYISAPAIAEFYQQSELQSLLRVLGITVLINAFTLIPRVKLNVVMDFKTQAKISIISVLISGSISM
TLAINGLGVWALVIQTLINSSCTTLLFNLFVPWLPRGNLTKASFSYLFGYGSKILISSLLEVIYSNIYQIIIGKKFSPAV
VGQFTQANQLASVPAMTLTAIIQRVTFPLFSQLQDNPEKMESAYRLTLKTAAMVIFPLIVGLGLIAQPLLTELLGAQWQD
AAGLLSVLCLGYMLYPIHAINLNLLQITGRSDLFLKLEVFKKIIGVVILLNTIRYGVLGMCIGLSVTSYVALLLNTYYTA
KLTRISQWQQCKDLTPIWLAVMLSAVLAYATGLSWQALPWLQILINISVALLSYSLYLVLAQRPLLLQLQSALRR

Specific function: Might be involved in the translocation of teichuronic acid repeating units from the inner to the outer surface of the membrane [H]

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788359, Length=491, Percent_Identity=25.050916496945, Blast_Score=149, Evalue=5e-37,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52343; Mature: 52212

Theoretical pI: Translated: 9.89; Mature: 9.89

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSDLATKTKKGLQWSAIERLLTQGMQLGITLLLARLLGPTAFGLVGMLTVFIAIANVFVD
CCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGFTSALIRKSDRSESDLVTAFYYNIGMAAVCYLALYISAPAIAEFYQQSELQSLLRVLG
CCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITVLINAFTLIPRVKLNVVMDFKTQAKISIISVLISGSISMTLAINGLGVWALVIQTLIN
HHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHC
SSCTTLLFNLFVPWLPRGNLTKASFSYLFGYGSKILISSLLEVIYSNIYQIIIGKKFSPA
CHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
VVGQFTQANQLASVPAMTLTAIIQRVTFPLFSQLQDNPEKMESAYRLTLKTAAMVIFPLI
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGLGLIAQPLLTELLGAQWQDAAGLLSVLCLGYMLYPIHAINLNLLQITGRSDLFLKLEV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCEEEHHH
FKKIIGVVILLNTIRYGVLGMCIGLSVTSYVALLLNTYYTAKLTRISQWQQCKDLTPIWL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
AVMLSAVLAYATGLSWQALPWLQILINISVALLSYSLYLVLAQRPLLLQLQSALRR
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SDLATKTKKGLQWSAIERLLTQGMQLGITLLLARLLGPTAFGLVGMLTVFIAIANVFVD
CCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGFTSALIRKSDRSESDLVTAFYYNIGMAAVCYLALYISAPAIAEFYQQSELQSLLRVLG
CCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITVLINAFTLIPRVKLNVVMDFKTQAKISIISVLISGSISMTLAINGLGVWALVIQTLIN
HHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHC
SSCTTLLFNLFVPWLPRGNLTKASFSYLFGYGSKILISSLLEVIYSNIYQIIIGKKFSPA
CHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
VVGQFTQANQLASVPAMTLTAIIQRVTFPLFSQLQDNPEKMESAYRLTLKTAAMVIFPLI
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGLGLIAQPLLTELLGAQWQDAAGLLSVLCLGYMLYPIHAINLNLLQITGRSDLFLKLEV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCEEEHHH
FKKIIGVVILLNTIRYGVLGMCIGLSVTSYVALLLNTYYTAKLTRISQWQQCKDLTPIWL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
AVMLSAVLAYATGLSWQALPWLQILINISVALLSYSLYLVLAQRPLLLQLQSALRR
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 10048024; 9384377 [H]