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The map label for this gene is ycaD [C]

Identifier: 119945498

GI number: 119945498

Start: 2186177

End: 2188318

Strand: Direct

Name: ycaD [C]

Synonym: Ping_1802

Alternate gene names: 119945498

Gene position: 2186177-2188318 (Clockwise)

Preceding gene: 119945496

Following gene: 119945499

Centisome position: 47.95

GC content: 39.78

Gene sequence:

>2142_bases
GTGTTAAAGACGTTAAAACCTTTCCCCTTATTGTTATTAAGTGGTTTTTTAATCATGCTTGGAAATGGATTAAGTAATAT
TCTATTACCTGTTCGTATGCAGCATGATGGTGTTGATATCAGTAATATTGGTATTGTTTTATCAATGTATTCCGTCGGTT
TTTTATTTGGTGCAATCTACTGCCGCCAGTTATTACAACGTGTTGGCCATATTCAAACTTTTGCAATTTGCGGTAGTTTG
ACCGCCGTCGCCATTTTATTATCAGGGCTCTATAGTGACCCCTTAGTACTTGGTGCAATGCGTATCATTACCGGTTTTTG
TATTGCTTGTACTAATGCAACACTCGATAGTTGGTTAGGCCATAGCGCCACAGAAAAAAACCGCGGAAGAATACTCGCAG
TTAACCAGATTATCATTATGAGCGCATTATTTTCCGGTCAATTTTTATTAAACTTAGCCCCCGTTGAAAGTACCACTTTA
TTTATTCTGGCAGGTATTCTCTTCAGTTTTTCAATCACCCCTATTGTTATCGGCAGACACAAAGGGCCTTTTATTGAAGA
TAGCCAGGGCATGTCATTTTTCACTATTATCAAACTCTCCCCCTTAGGTGTTGTATCTTGCTTTTTTTGTGGTGTTTTAT
ACTCCGGCCTATTAAATATGTTACCCATATTTGCCAGTAATAATGGTATTGAGGGTTTTGATTTATCTGTTTTTATGGGA
GCCGCCATTGCGGGAGCGATAATTTTACAATTTCCAATCGCGTATTTATCGGATCATTTTGACCGAAGAAAAGTGATGTT
TGGTATGGTGGCGACCTTTATTGTATTTAGTATATTGATACCCTTTTTAATTTATTTAGAATGGTTCAAACTGACCTTAA
TGGCGCTCGCAATAACAACGGGACTTGCTGCCTGTCTTTATCCTATGAGTATTTCTGAAGCCTTTGATAAAGTAATTAAA
GAACAGATATTAGCTGCAATGGGATCATTATTAGCAATCTATGCACTGGGCAGTATTTTAGGCCCCTACAGCGCTGCGAT
CGCAATGGAATCATTAGGCAATAATGCATTATTTGGATTTACCGTTGTTGCTGCATTTTTGTTGCTTATTTTCATCAGTA
TTCGTATGAAAAAATCTGAAGCTTTAGCAATTGATGATCAAGAAAGCTTTGTTATGCAGACACCAAGCGGGGCGGTTTCG
GTATTGGATCCGCGTACTGTTTACACTCAATCCGAATTATCAACAAATGCAGGTGTACAAATTGCAGTTAATCTGGCCTA
TGAAAACCCCGCTATTGCGCTCAATATGGTTAAAGCGTTAGCACGACGGGATATTAAAAATGCCAGCCGCTTGGTCGCTG
GATTAAGTCAAATAAAAGCCGTTAATATTGGTAAATTATATTCTGCTATCGTCCGTATAGCACCCTACAGGAGTATTCGA
ACTGCTCAAATATTGATCGATGCTGCGCCGGAAAGAGCGGAACAGCTTGTTGATTGGATTATTATGCAGGATGACGATGA
TATGTGTAAAATTATCGTTGCCATTGCCGCTATGATGCCGGATAACGGCATTAATATTCTGCAATATGCAGCCCAAAAAA
TGGTTGGCAAATATCCTCTGGCGATACTGGCGATGACCGAAGAATATATTAACATACTGTCCAGCTCGTTGGATGAGATG
AGACCGGTCGACAGGGTTGCAACAGATCCGCAGCAAACGGCAACAGAGCTCTATAACCGAATGCAGGATGTGTCTCCTGA
ACAGTCGGCTGACATAGCGATCACCATCTCTGAAGCTTTACCCGACGCTTCTTTCGATGTGGCAGAAGCTTACCTTCATA
ATTTATTGTTGAGTGAAGAACATCCATTTAAAAACAAAGAATCTATTCAAAAAATCCAAACTGCGATTAATTTATATATG
AAAGAAGTCGCTAAAAATATACCGGAACATGCTGTTGAGGTCGCTAATACCTTTATCGAGATTGTGCCGGATGTTGCCTC
AAGTGTTGTTGAAATTATACAAGATGCTGAGCAGTACTCCGACAGTTATCTCACCCAGACAATTACAGATAAACCGGTAG
AAAGCCAGATTAACGAAGCGCTTCAAAAAGCGGTGGAGCTACAAAACGTAGACGATACCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTGTATCTATAAAACATTTAGCTTTCCTTTTTATTCCTAGTTTAATGGAAACAGCAACTGCTAATCCTCGCTAAGCTAC
CTACTGTAAGAGATATTTCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATAACTACTGCGGTTTTACTTTAAAAAAATACAGCAGATACAATCTTAGCGGGTGAATATGGATATTAATTTGTTAAT
TGCGATGTTATTGATTTTTT

Product: major facilitator transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 713; Mature: 713

Protein sequence:

>713_residues
MLKTLKPFPLLLLSGFLIMLGNGLSNILLPVRMQHDGVDISNIGIVLSMYSVGFLFGAIYCRQLLQRVGHIQTFAICGSL
TAVAILLSGLYSDPLVLGAMRIITGFCIACTNATLDSWLGHSATEKNRGRILAVNQIIIMSALFSGQFLLNLAPVESTTL
FILAGILFSFSITPIVIGRHKGPFIEDSQGMSFFTIIKLSPLGVVSCFFCGVLYSGLLNMLPIFASNNGIEGFDLSVFMG
AAIAGAIILQFPIAYLSDHFDRRKVMFGMVATFIVFSILIPFLIYLEWFKLTLMALAITTGLAACLYPMSISEAFDKVIK
EQILAAMGSLLAIYALGSILGPYSAAIAMESLGNNALFGFTVVAAFLLLIFISIRMKKSEALAIDDQESFVMQTPSGAVS
VLDPRTVYTQSELSTNAGVQIAVNLAYENPAIALNMVKALARRDIKNASRLVAGLSQIKAVNIGKLYSAIVRIAPYRSIR
TAQILIDAAPERAEQLVDWIIMQDDDDMCKIIVAIAAMMPDNGINILQYAAQKMVGKYPLAILAMTEEYINILSSSLDEM
RPVDRVATDPQQTATELYNRMQDVSPEQSADIAITISEALPDASFDVAEAYLHNLLLSEEHPFKNKESIQKIQTAINLYM
KEVAKNIPEHAVEVANTFIEIVPDVASSVVEIIQDAEQYSDSYLTQTITDKPVESQINEALQKAVELQNVDDT

Sequences:

>Translated_713_residues
MLKTLKPFPLLLLSGFLIMLGNGLSNILLPVRMQHDGVDISNIGIVLSMYSVGFLFGAIYCRQLLQRVGHIQTFAICGSL
TAVAILLSGLYSDPLVLGAMRIITGFCIACTNATLDSWLGHSATEKNRGRILAVNQIIIMSALFSGQFLLNLAPVESTTL
FILAGILFSFSITPIVIGRHKGPFIEDSQGMSFFTIIKLSPLGVVSCFFCGVLYSGLLNMLPIFASNNGIEGFDLSVFMG
AAIAGAIILQFPIAYLSDHFDRRKVMFGMVATFIVFSILIPFLIYLEWFKLTLMALAITTGLAACLYPMSISEAFDKVIK
EQILAAMGSLLAIYALGSILGPYSAAIAMESLGNNALFGFTVVAAFLLLIFISIRMKKSEALAIDDQESFVMQTPSGAVS
VLDPRTVYTQSELSTNAGVQIAVNLAYENPAIALNMVKALARRDIKNASRLVAGLSQIKAVNIGKLYSAIVRIAPYRSIR
TAQILIDAAPERAEQLVDWIIMQDDDDMCKIIVAIAAMMPDNGINILQYAAQKMVGKYPLAILAMTEEYINILSSSLDEM
RPVDRVATDPQQTATELYNRMQDVSPEQSADIAITISEALPDASFDVAEAYLHNLLLSEEHPFKNKESIQKIQTAINLYM
KEVAKNIPEHAVEVANTFIEIVPDVASSVVEIIQDAEQYSDSYLTQTITDKPVESQINEALQKAVELQNVDDT
>Mature_713_residues
MLKTLKPFPLLLLSGFLIMLGNGLSNILLPVRMQHDGVDISNIGIVLSMYSVGFLFGAIYCRQLLQRVGHIQTFAICGSL
TAVAILLSGLYSDPLVLGAMRIITGFCIACTNATLDSWLGHSATEKNRGRILAVNQIIIMSALFSGQFLLNLAPVESTTL
FILAGILFSFSITPIVIGRHKGPFIEDSQGMSFFTIIKLSPLGVVSCFFCGVLYSGLLNMLPIFASNNGIEGFDLSVFMG
AAIAGAIILQFPIAYLSDHFDRRKVMFGMVATFIVFSILIPFLIYLEWFKLTLMALAITTGLAACLYPMSISEAFDKVIK
EQILAAMGSLLAIYALGSILGPYSAAIAMESLGNNALFGFTVVAAFLLLIFISIRMKKSEALAIDDQESFVMQTPSGAVS
VLDPRTVYTQSELSTNAGVQIAVNLAYENPAIALNMVKALARRDIKNASRLVAGLSQIKAVNIGKLYSAIVRIAPYRSIR
TAQILIDAAPERAEQLVDWIIMQDDDDMCKIIVAIAAMMPDNGINILQYAAQKMVGKYPLAILAMTEEYINILSSSLDEM
RPVDRVATDPQQTATELYNRMQDVSPEQSADIAITISEALPDASFDVAEAYLHNLLLSEEHPFKNKESIQKIQTAINLYM
KEVAKNIPEHAVEVANTFIEIVPDVASSVVEIIQDAEQYSDSYLTQTITDKPVESQINEALQKAVELQNVDDT

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. YcaD (TC 2.A.1.26) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787126, Length=359, Percent_Identity=26.4623955431755, Blast_Score=107, Evalue=3e-24,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 77806; Mature: 77806

Theoretical pI: Translated: 4.66; Mature: 4.66

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
4.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
4.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKTLKPFPLLLLSGFLIMLGNGLSNILLPVRMQHDGVDISNIGIVLSMYSVGFLFGAIY
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CRQLLQRVGHIQTFAICGSLTAVAILLSGLYSDPLVLGAMRIITGFCIACTNATLDSWLG
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHC
HSATEKNRGRILAVNQIIIMSALFSGQFLLNLAPVESTTLFILAGILFSFSITPIVIGRH
CCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECC
KGPFIEDSQGMSFFTIIKLSPLGVVSCFFCGVLYSGLLNMLPIFASNNGIEGFDLSVFMG
CCCCCCCCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH
AAIAGAIILQFPIAYLSDHFDRRKVMFGMVATFIVFSILIPFLIYLEWFKLTLMALAITT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLAACLYPMSISEAFDKVIKEQILAAMGSLLAIYALGSILGPYSAAIAMESLGNNALFGF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
TVVAAFLLLIFISIRMKKSEALAIDDQESFVMQTPSGAVSVLDPRTVYTQSELSTNAGVQ
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCEEEECCCCCEEECCCCHHEEHHHCCCCCCEE
IAVNLAYENPAIALNMVKALARRDIKNASRLVAGLSQIKAVNIGKLYSAIVRIAPYRSIR
EEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC
TAQILIDAAPERAEQLVDWIIMQDDDDMCKIIVAIAAMMPDNGINILQYAAQKMVGKYPL
HHHHEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCH
AILAMTEEYINILSSSLDEMRPVDRVATDPQQTATELYNRMQDVSPEQSADIAITISEAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHC
PDASFDVAEAYLHNLLLSEEHPFKNKESIQKIQTAINLYMKEVAKNIPEHAVEVANTFIE
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
IVPDVASSVVEIIQDAEQYSDSYLTQTITDKPVESQINEALQKAVELQNVDDT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLKTLKPFPLLLLSGFLIMLGNGLSNILLPVRMQHDGVDISNIGIVLSMYSVGFLFGAIY
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CRQLLQRVGHIQTFAICGSLTAVAILLSGLYSDPLVLGAMRIITGFCIACTNATLDSWLG
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHC
HSATEKNRGRILAVNQIIIMSALFSGQFLLNLAPVESTTLFILAGILFSFSITPIVIGRH
CCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECC
KGPFIEDSQGMSFFTIIKLSPLGVVSCFFCGVLYSGLLNMLPIFASNNGIEGFDLSVFMG
CCCCCCCCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH
AAIAGAIILQFPIAYLSDHFDRRKVMFGMVATFIVFSILIPFLIYLEWFKLTLMALAITT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLAACLYPMSISEAFDKVIKEQILAAMGSLLAIYALGSILGPYSAAIAMESLGNNALFGF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
TVVAAFLLLIFISIRMKKSEALAIDDQESFVMQTPSGAVSVLDPRTVYTQSELSTNAGVQ
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCEEEECCCCCEEECCCCHHEEHHHCCCCCCEE
IAVNLAYENPAIALNMVKALARRDIKNASRLVAGLSQIKAVNIGKLYSAIVRIAPYRSIR
EEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC
TAQILIDAAPERAEQLVDWIIMQDDDDMCKIIVAIAAMMPDNGINILQYAAQKMVGKYPL
HHHHEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCH
AILAMTEEYINILSSSLDEMRPVDRVATDPQQTATELYNRMQDVSPEQSADIAITISEAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHC
PDASFDVAEAYLHNLLLSEEHPFKNKESIQKIQTAINLYMKEVAKNIPEHAVEVANTFIE
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
IVPDVASSVVEIIQDAEQYSDSYLTQTITDKPVESQINEALQKAVELQNVDDT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA