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The map label for this gene is 119775389

Identifier: 119775389

GI number: 119775389

Start: 2717169

End: 2718371

Strand: Reverse

Name: 119775389

Synonym: Sama_2254

Alternate gene names: NA

Gene position: 2718371-2717169 (Counterclockwise)

Preceding gene: 119775390

Following gene: 119775388

Centisome position: 63.13

GC content: 28.35

Gene sequence:

>1203_bases
TTGAATAACATCTTTTATTACTCATCAACCCTTGTTAAAGCACTATCCTCATATCTTTTGGTCTTTATTATATCGAATAA
CTATACATCTGAAGAATTGGGAGTATATTTTTATTATTTGGCTATAGCCAGTTTTCTCTCTGTAGCAATACCACTAGGTA
TCAATTCATATATTGAAAGATTGTCATATAGCAATAAGAAAGCGAAATACATTTTTTCTTTTGCTTTTAGTCTTGTATTT
CTTAGTACAGTTATTTTTACTTTAATTTTATCGATTTTTTCCATCTTTTATGAATCTGGTGACATCCGACTGATAATTTT
TGTTGTAGGACTACTATCGTTTTATAAAGCCATCGAAATTTTATTAGAGGCTGTTCTCATAGTCTTACAAAAATATAAAG
CAATATTCGTATATTGGATAGTCGTATTATCGCTCTATTTTGTTTTAATGTGTATTTTCTGGACTCAAGACTTAATAATG
AAAATTGAAACTTTAATCACTATCATTTCAATTTTTATGGTTGTAGTTTGCATACTAATATCAAGGTCTACAGGTGCGCT
AATCTTTCTTGATGTTAGTCAGTCACTATTTAATAAGTTTAAATATGTCAACCTAAGCTTTACATGGAATATGTTTTTTG
TGTCACTACTTAACACGGGTATTGCTGTTGTAGACAGAATCATATTAGGAGCAATGCAATCTAAAGAAGTCTTAGCGATC
TATTCAGTATGTTACATGATTGTTTTTTCAATACATCGATTCTTTTCAACACCTTTTTGTTTGAAGATTGCTCAAAGTTT
GTATCGTTCACATGACTATCGTTCATATAGGCAAAACGTATTAAGTGGATTGTTCTATTTATTGCTTTTTCTGTCCTTAA
TTATACTAACATTCTACGCATATTTTTTTAAAATATTCAGCATAGATAGACCATCTATCTTCTTTCTTTTGGTATTGGCT
TTATCAGTTATAGTTTTTTTTATTTATACATCTTTGGTAACAATACTAAAATTGAAATATATGCAAGATACGATTCTTAA
AGTAAATATATTCGTTTTTTTATCAAACATAATATTAAATTTATCTCTTGTCCCCTATTTTTCTTTGCTCGGTGCTGCAT
TCTCTACATTAATAACCTATAGTTTGGGCTTGATATATTATTCTTTAGTTATTTTCAAATTGGAGAAATGTTTTGGAGAA
TAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATTCTGGATAGTTGGATTTGCTATTGTTCAGAATGTTGTTTATGTAGATGCATTTTTGTTAATGATGATTTTATTTCA
ATTATTAAATAGGAAGAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAGTACACAGATATATGTTGTCGTTCATTCATATTATACTGAAGACACCCGGGTAAGAAAGCAATGTGAATTTTTAG
CTTCAGAGGGATATGATGTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 400; Mature: 400

Protein sequence:

>400_residues
MNNIFYYSSTLVKALSSYLLVFIISNNYTSEELGVYFYYLAIASFLSVAIPLGINSYIERLSYSNKKAKYIFSFAFSLVF
LSTVIFTLILSIFSIFYESGDIRLIIFVVGLLSFYKAIEILLEAVLIVLQKYKAIFVYWIVVLSLYFVLMCIFWTQDLIM
KIETLITIISIFMVVVCILISRSTGALIFLDVSQSLFNKFKYVNLSFTWNMFFVSLLNTGIAVVDRIILGAMQSKEVLAI
YSVCYMIVFSIHRFFSTPFCLKIAQSLYRSHDYRSYRQNVLSGLFYLLLFLSLIILTFYAYFFKIFSIDRPSIFFLLVLA
LSVIVFFIYTSLVTILKLKYMQDTILKVNIFVFLSNIILNLSLVPYFSLLGAAFSTLITYSLGLIYYSLVIFKLEKCFGE

Sequences:

>Translated_400_residues
MNNIFYYSSTLVKALSSYLLVFIISNNYTSEELGVYFYYLAIASFLSVAIPLGINSYIERLSYSNKKAKYIFSFAFSLVF
LSTVIFTLILSIFSIFYESGDIRLIIFVVGLLSFYKAIEILLEAVLIVLQKYKAIFVYWIVVLSLYFVLMCIFWTQDLIM
KIETLITIISIFMVVVCILISRSTGALIFLDVSQSLFNKFKYVNLSFTWNMFFVSLLNTGIAVVDRIILGAMQSKEVLAI
YSVCYMIVFSIHRFFSTPFCLKIAQSLYRSHDYRSYRQNVLSGLFYLLLFLSLIILTFYAYFFKIFSIDRPSIFFLLVLA
LSVIVFFIYTSLVTILKLKYMQDTILKVNIFVFLSNIILNLSLVPYFSLLGAAFSTLITYSLGLIYYSLVIFKLEKCFGE
>Mature_400_residues
MNNIFYYSSTLVKALSSYLLVFIISNNYTSEELGVYFYYLAIASFLSVAIPLGINSYIERLSYSNKKAKYIFSFAFSLVF
LSTVIFTLILSIFSIFYESGDIRLIIFVVGLLSFYKAIEILLEAVLIVLQKYKAIFVYWIVVLSLYFVLMCIFWTQDLIM
KIETLITIISIFMVVVCILISRSTGALIFLDVSQSLFNKFKYVNLSFTWNMFFVSLLNTGIAVVDRIILGAMQSKEVLAI
YSVCYMIVFSIHRFFSTPFCLKIAQSLYRSHDYRSYRQNVLSGLFYLLLFLSLIILTFYAYFFKIFSIDRPSIFFLLVLA
LSVIVFFIYTSLVTILKLKYMQDTILKVNIFVFLSNIILNLSLVPYFSLLGAAFSTLITYSLGLIYYSLVIFKLEKCFGE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46261; Mature: 46261

Theoretical pI: Translated: 9.32; Mature: 9.32

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNNIFYYSSTLVKALSSYLLVFIISNNYTSEELGVYFYYLAIASFLSVAIPLGINSYIER
CCCEEEHHHHHHHHHHHHHEEHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
LSYSNKKAKYIFSFAFSLVFLSTVIFTLILSIFSIFYESGDIRLIIFVVGLLSFYKAIEI
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLEAVLIVLQKYKAIFVYWIVVLSLYFVLMCIFWTQDLIMKIETLITIISIFMVVVCILI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SRSTGALIFLDVSQSLFNKFKYVNLSFTWNMFFVSLLNTGIAVVDRIILGAMQSKEVLAI
CCCCCCEEEEECHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
YSVCYMIVFSIHRFFSTPFCLKIAQSLYRSHDYRSYRQNVLSGLFYLLLFLSLIILTFYA
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFFKIFSIDRPSIFFLLVLALSVIVFFIYTSLVTILKLKYMQDTILKVNIFVFLSNIILN
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSLVPYFSLLGAAFSTLITYSLGLIYYSLVIFKLEKCFGE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNNIFYYSSTLVKALSSYLLVFIISNNYTSEELGVYFYYLAIASFLSVAIPLGINSYIER
CCCEEEHHHHHHHHHHHHHEEHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
LSYSNKKAKYIFSFAFSLVFLSTVIFTLILSIFSIFYESGDIRLIIFVVGLLSFYKAIEI
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLEAVLIVLQKYKAIFVYWIVVLSLYFVLMCIFWTQDLIMKIETLITIISIFMVVVCILI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SRSTGALIFLDVSQSLFNKFKYVNLSFTWNMFFVSLLNTGIAVVDRIILGAMQSKEVLAI
CCCCCCEEEEECHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
YSVCYMIVFSIHRFFSTPFCLKIAQSLYRSHDYRSYRQNVLSGLFYLLLFLSLIILTFYA
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFFKIFSIDRPSIFFLLVLALSVIVFFIYTSLVTILKLKYMQDTILKVNIFVFLSNIILN
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSLVPYFSLLGAAFSTLITYSLGLIYYSLVIFKLEKCFGE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA