| Definition | Listeria welshimeri serovar 6b str. SLCC5334, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008555 |
| Length | 2,814,130 |
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The map label for this gene is 116872474
Identifier: 116872474
GI number: 116872474
Start: 1076951
End: 1079047
Strand: Direct
Name: 116872474
Synonym: lwe1058
Alternate gene names: NA
Gene position: 1076951-1079047 (Clockwise)
Preceding gene: 116872473
Following gene: 116872476
Centisome position: 38.27
GC content: 26.9
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 698; Mature: 698
Protein sequence:
>698_residues MKKNLGFVFYGVFIFIFGYLLVRSIINPLNVDYSNFFILLLFSITILFIMLAFFQLFSRLNRRSDILVTAILIITLVSIQ VYLMFALQMDAFADSFGIKGQAVQMLQNGGMFTGDSYFLVYPNNVLTTIIRYGLYNFGAGIGITNTYLLECGFVILCMNI TFFTLFYIIRKEVGIKYSNIYLLIILFCVPFYGYLSYFYSDTLVLPFAALILLFYYFYTKNNKWFYFIIIGVLFAIGYHI KPNLIIMLPAIIIHLCFIRNWRKTLLNSAIILIVFAGVNTLYNPLTERYGFERDNSLEFPQSHWVMMGLKGPAGRYNSSE FLYTKQFDTKEKKQEANKKIIKERITSYGPVKLLKLYNMKMLSTWTDGTRAYSWYVNSAKEYPAAYDFLFGDKKVFADAF SQIFHIINLILIILGALRFYKKQEFDLSFLINITLIGVWLFHLLWEANQRYILFVTPLMIMSAMYGFKFLVELLYTKDKI PVIKQTTRKPFLIVCFVVFILSIVTIIYGVKPIAVDKQNTNHYLVNQSYAYLQVPVDSKNAVSQTFKADEKFNNVGIYVL KAPNKNNKYKIRITNKDENKIISEKVYSSSSFKSGKYFPIEVNEKPKKNTEYSIQILATNGNKGEALMLGKYQQKGFDLY SDGAMYINGKNQVNEDIGFVVSENTKSPLIPWYSYSLIIIIFVGVLSLSFLTFKQRND
Sequences:
>Translated_698_residues MKKNLGFVFYGVFIFIFGYLLVRSIINPLNVDYSNFFILLLFSITILFIMLAFFQLFSRLNRRSDILVTAILIITLVSIQ VYLMFALQMDAFADSFGIKGQAVQMLQNGGMFTGDSYFLVYPNNVLTTIIRYGLYNFGAGIGITNTYLLECGFVILCMNI TFFTLFYIIRKEVGIKYSNIYLLIILFCVPFYGYLSYFYSDTLVLPFAALILLFYYFYTKNNKWFYFIIIGVLFAIGYHI KPNLIIMLPAIIIHLCFIRNWRKTLLNSAIILIVFAGVNTLYNPLTERYGFERDNSLEFPQSHWVMMGLKGPAGRYNSSE FLYTKQFDTKEKKQEANKKIIKERITSYGPVKLLKLYNMKMLSTWTDGTRAYSWYVNSAKEYPAAYDFLFGDKKVFADAF SQIFHIINLILIILGALRFYKKQEFDLSFLINITLIGVWLFHLLWEANQRYILFVTPLMIMSAMYGFKFLVELLYTKDKI PVIKQTTRKPFLIVCFVVFILSIVTIIYGVKPIAVDKQNTNHYLVNQSYAYLQVPVDSKNAVSQTFKADEKFNNVGIYVL KAPNKNNKYKIRITNKDENKIISEKVYSSSSFKSGKYFPIEVNEKPKKNTEYSIQILATNGNKGEALMLGKYQQKGFDLY SDGAMYINGKNQVNEDIGFVVSENTKSPLIPWYSYSLIIIIFVGVLSLSFLTFKQRND >Mature_698_residues MKKNLGFVFYGVFIFIFGYLLVRSIINPLNVDYSNFFILLLFSITILFIMLAFFQLFSRLNRRSDILVTAILIITLVSIQ VYLMFALQMDAFADSFGIKGQAVQMLQNGGMFTGDSYFLVYPNNVLTTIIRYGLYNFGAGIGITNTYLLECGFVILCMNI TFFTLFYIIRKEVGIKYSNIYLLIILFCVPFYGYLSYFYSDTLVLPFAALILLFYYFYTKNNKWFYFIIIGVLFAIGYHI KPNLIIMLPAIIIHLCFIRNWRKTLLNSAIILIVFAGVNTLYNPLTERYGFERDNSLEFPQSHWVMMGLKGPAGRYNSSE FLYTKQFDTKEKKQEANKKIIKERITSYGPVKLLKLYNMKMLSTWTDGTRAYSWYVNSAKEYPAAYDFLFGDKKVFADAF SQIFHIINLILIILGALRFYKKQEFDLSFLINITLIGVWLFHLLWEANQRYILFVTPLMIMSAMYGFKFLVELLYTKDKI PVIKQTTRKPFLIVCFVVFILSIVTIIYGVKPIAVDKQNTNHYLVNQSYAYLQVPVDSKNAVSQTFKADEKFNNVGIYVL KAPNKNNKYKIRITNKDENKIISEKVYSSSSFKSGKYFPIEVNEKPKKNTEYSIQILATNGNKGEALMLGKYQQKGFDLY SDGAMYINGKNQVNEDIGFVVSENTKSPLIPWYSYSLIIIIFVGVLSLSFLTFKQRND
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 80884; Mature: 80884
Theoretical pI: Translated: 9.80; Mature: 9.80
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKNLGFVFYGVFIFIFGYLLVRSIINPLNVDYSNFFILLLFSITILFIMLAFFQLFSRL CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NRRSDILVTAILIITLVSIQVYLMFALQMDAFADSFGIKGQAVQMLQNGGMFTGDSYFLV CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCEEECCCEEEE YPNNVLTTIIRYGLYNFGAGIGITNTYLLECGFVILCMNITFFTLFYIIRKEVGIKYSNI ECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEHHH YLLIILFCVPFYGYLSYFYSDTLVLPFAALILLFYYFYTKNNKWFYFIIIGVLFAIGYHI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCC KPNLIIMLPAIIIHLCFIRNWRKTLLNSAIILIVFAGVNTLYNPLTERYGFERDNSLEFP CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC QSHWVMMGLKGPAGRYNSSEFLYTKQFDTKEKKQEANKKIIKERITSYGPVKLLKLYNMK CCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCH MLSTWTDGTRAYSWYVNSAKEYPAAYDFLFGDKKVFADAFSQIFHIINLILIILGALRFY HEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKQEFDLSFLINITLIGVWLFHLLWEANQRYILFVTPLMIMSAMYGFKFLVELLYTKDKI HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC PVIKQTTRKPFLIVCFVVFILSIVTIIYGVKPIAVDKQNTNHYLVNQSYAYLQVPVDSKN CHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCEEEEECCEEEEEEECCCCH AVSQTFKADEKFNNVGIYVLKAPNKNNKYKIRITNKDENKIISEKVYSSSSFKSGKYFPI HHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEE EVNEKPKKNTEYSIQILATNGNKGEALMLGKYQQKGFDLYSDGAMYINGKNQVNEDIGFV ECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEECHHHCCCCEECCCEEEECCCCCCCCCCCEE VSENTKSPLIPWYSYSLIIIIFVGVLSLSFLTFKQRND EECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MKKNLGFVFYGVFIFIFGYLLVRSIINPLNVDYSNFFILLLFSITILFIMLAFFQLFSRL CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NRRSDILVTAILIITLVSIQVYLMFALQMDAFADSFGIKGQAVQMLQNGGMFTGDSYFLV CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCEEECCCEEEE YPNNVLTTIIRYGLYNFGAGIGITNTYLLECGFVILCMNITFFTLFYIIRKEVGIKYSNI ECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEHHH YLLIILFCVPFYGYLSYFYSDTLVLPFAALILLFYYFYTKNNKWFYFIIIGVLFAIGYHI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCC KPNLIIMLPAIIIHLCFIRNWRKTLLNSAIILIVFAGVNTLYNPLTERYGFERDNSLEFP CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC QSHWVMMGLKGPAGRYNSSEFLYTKQFDTKEKKQEANKKIIKERITSYGPVKLLKLYNMK CCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCH MLSTWTDGTRAYSWYVNSAKEYPAAYDFLFGDKKVFADAFSQIFHIINLILIILGALRFY HEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKQEFDLSFLINITLIGVWLFHLLWEANQRYILFVTPLMIMSAMYGFKFLVELLYTKDKI HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC PVIKQTTRKPFLIVCFVVFILSIVTIIYGVKPIAVDKQNTNHYLVNQSYAYLQVPVDSKN CHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCEEEEECCEEEEEEECCCCH AVSQTFKADEKFNNVGIYVLKAPNKNNKYKIRITNKDENKIISEKVYSSSSFKSGKYFPI HHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEE EVNEKPKKNTEYSIQILATNGNKGEALMLGKYQQKGFDLYSDGAMYINGKNQVNEDIGFV ECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEECHHHCCCCEECCCEEEECCCCCCCCCCCEE VSENTKSPLIPWYSYSLIIIIFVGVLSLSFLTFKQRND EECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA