Definition Listeria welshimeri serovar 6b str. SLCC5334, complete genome.
Accession NC_008555
Length 2,814,130

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The map label for this gene is 116871659

Identifier: 116871659

GI number: 116871659

Start: 254418

End: 256304

Strand: Direct

Name: 116871659

Synonym: lwe0239

Alternate gene names: NA

Gene position: 254418-256304 (Clockwise)

Preceding gene: 116871658

Following gene: 116871661

Centisome position: 9.04

GC content: 38.37

Gene sequence:

>1887_bases
ATGAAAAGAATTGTCAAAATTTTTCTACATTATCTTTTAGGAATTTTAGGAATTATTTTAATCAGTTGTGTTCCCGCAAT
ATTTAGTAAAGTAACATCGTGGTCATCAAGCACTTATTTGGAAGCCCTCAAGTCTATTTTTACTGCGATTTTACATCCGA
CCAAATGGGAAATTAGTTACCAAGGAAGTGCAGAAGTTTTTCATATATCTTTGCGTGATTTTATTACAGGCCCCTATTTT
TACTCGATGAAAATAATTATCGCGAGCTTGCTTATATCTTTAATCATCGCATACATATTAGTTATAGCAACATTTCGTGG
ACCAAAGTGGTTGCGCCGTGGATTAAGCGGATTCCTATCAATACTTCAAGCATTTCCAGATTTTTCTTTTGTTTTTCTTA
TTCAAATGGCTGTTGTTTATATATACCAACAAACCGGAGTATTTACATTGAATTTTTACAGTTTAAACGGCGAGCAAATT
TATGCTGCTCCAATCGTTTGCTTATCAATCATACCAATCGTACTCTTTTACAAAATGATGATGCTCCTCATGGAAAATGA
ATGGCAGGCTGATTATGTTCAATTAGCGCGAGGGAAAGGTTTAACCGATAGAGCTATATTAATGCGTCACGCTACACCCA
ATATGATGCAAAGCCTATTTTACCAATCAAAAACCATCGTTTGGTTTATATTAAGCGCCTATCTCGTTGTAGAATTTTTA
TTTGGCATCGAAGGCGTGCTTTATTATTTGCTAGCAGGATTTAGTCCATTAAATATTTTCCTAGTATTAGTGCTTGTTTT
CACTCCATTTTACTTCTTTTACGCACTAATTGACCTATGGATTAGCCACGGGAAAAACACAGAAAGCGCAAATGTTACCA
GAATTCCGTTACACTGGAATAGTTTTGAGCGTACTTTTACGGAAAAAGTAGATCTTAAAAGCAAATGGCAAAACATTGTA
GTAACGACCGGGCAGCTCCTAAAACGCCCATCCTTCAGCATTCCGCTGGTAACGCTTAGCATCTTACTAATCGCAAGCCT
CATTTACGGACTCATGGGAGACAAAATCAATTCGCTTAAATTCATTAGTGATGCGACCGGAAGAGTAACCGATATGGCGC
CATTCAAGCCAAACGCACAAGTATGGTTAGGCACCGACCAAGCCGGCAACTCCATTCTCGACCAACTACTAGTCGGCATC
AAATACACGCTACTTATCGCCGTCATCATCGCCACGCTTCGTGTTGTTATTGGCTACATTTTGGCAGTGCCGCTTGCGTT
TTTCAGTAAGCCGCGAACCCGGAATTTTGTTCAAAGCATAGCTGACGGGATGCATTATTTACCACTTTCGCTACTTGTAT
TCATTATCATGGTCAATGAATTCATTAGCTACACAGGTGTTTTCGAAACCAGCTTATTTACTCGGATTAGTTTTCAAGTG
TTAATCATGGTTGTCATCGTTTTACCAATTACAATTAATCGAATTAGCAGTGAAATTTCCCAAGTATTGAAAAAAGAATT
CGTTCTGAGTGCGCTGGTTTTTGGTGGCAACGCACGCTGGATTTTATCGAAGCATATCAATCCGCAAATCTGGTCAAAAT
TAATTTTAATCTGGATTGAGCAACTCATTCAGACATTGCAGATGTTCGTGCACTTAGCTATCTTTGGGATTTTCATTGGT
GGGGCAATCATGGGCGCTGATGACGGTATGCTTAACCCAGTTATCCCCGAATTATCTGGCTTAATCGCAAATGCCAAATT
CGTTTTTGCTAACCACCAATTCTGGATAATTTTACCACCATTAATCGTATTTATGATTTTAATTCTCTGTTTCCAAGTGA
TGGCAAATTCGCTGTTGAAACGGGAAGAAGACAGTAAAAAAGCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGTCATTTAGACTTAAAATAAGTAATATCTTGGGCATATCTCATTTGGGGTATGTCCTAGATTTATAAGAGAGAGCTAGA
AAAAGGGAGAAATAATACAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTCTGAAAACGAATTAAGCTTTTTATTCATTCACATTCTTCAATGTATTGGTCTAAATATCTTTTCTTTTTAAAATGGTG
ATTTTGGATTCTATCTAGCT

Product: peptide transporter, putative

Products: NA

Alternate protein names: Oligopeptide Transport System Permease; Oligopeptide Transport System Permease Protein-Like Protein; Oligopeptide Transport System Permease Protein OppC

Number of amino acids: Translated: 628; Mature: 628

Protein sequence:

>628_residues
MKRIVKIFLHYLLGILGIILISCVPAIFSKVTSWSSSTYLEALKSIFTAILHPTKWEISYQGSAEVFHISLRDFITGPYF
YSMKIIIASLLISLIIAYILVIATFRGPKWLRRGLSGFLSILQAFPDFSFVFLIQMAVVYIYQQTGVFTLNFYSLNGEQI
YAAPIVCLSIIPIVLFYKMMMLLMENEWQADYVQLARGKGLTDRAILMRHATPNMMQSLFYQSKTIVWFILSAYLVVEFL
FGIEGVLYYLLAGFSPLNIFLVLVLVFTPFYFFYALIDLWISHGKNTESANVTRIPLHWNSFERTFTEKVDLKSKWQNIV
VTTGQLLKRPSFSIPLVTLSILLIASLIYGLMGDKINSLKFISDATGRVTDMAPFKPNAQVWLGTDQAGNSILDQLLVGI
KYTLLIAVIIATLRVVIGYILAVPLAFFSKPRTRNFVQSIADGMHYLPLSLLVFIIMVNEFISYTGVFETSLFTRISFQV
LIMVVIVLPITINRISSEISQVLKKEFVLSALVFGGNARWILSKHINPQIWSKLILIWIEQLIQTLQMFVHLAIFGIFIG
GAIMGADDGMLNPVIPELSGLIANAKFVFANHQFWIILPPLIVFMILILCFQVMANSLLKREEDSKKA

Sequences:

>Translated_628_residues
MKRIVKIFLHYLLGILGIILISCVPAIFSKVTSWSSSTYLEALKSIFTAILHPTKWEISYQGSAEVFHISLRDFITGPYF
YSMKIIIASLLISLIIAYILVIATFRGPKWLRRGLSGFLSILQAFPDFSFVFLIQMAVVYIYQQTGVFTLNFYSLNGEQI
YAAPIVCLSIIPIVLFYKMMMLLMENEWQADYVQLARGKGLTDRAILMRHATPNMMQSLFYQSKTIVWFILSAYLVVEFL
FGIEGVLYYLLAGFSPLNIFLVLVLVFTPFYFFYALIDLWISHGKNTESANVTRIPLHWNSFERTFTEKVDLKSKWQNIV
VTTGQLLKRPSFSIPLVTLSILLIASLIYGLMGDKINSLKFISDATGRVTDMAPFKPNAQVWLGTDQAGNSILDQLLVGI
KYTLLIAVIIATLRVVIGYILAVPLAFFSKPRTRNFVQSIADGMHYLPLSLLVFIIMVNEFISYTGVFETSLFTRISFQV
LIMVVIVLPITINRISSEISQVLKKEFVLSALVFGGNARWILSKHINPQIWSKLILIWIEQLIQTLQMFVHLAIFGIFIG
GAIMGADDGMLNPVIPELSGLIANAKFVFANHQFWIILPPLIVFMILILCFQVMANSLLKREEDSKKA
>Mature_628_residues
MKRIVKIFLHYLLGILGIILISCVPAIFSKVTSWSSSTYLEALKSIFTAILHPTKWEISYQGSAEVFHISLRDFITGPYF
YSMKIIIASLLISLIIAYILVIATFRGPKWLRRGLSGFLSILQAFPDFSFVFLIQMAVVYIYQQTGVFTLNFYSLNGEQI
YAAPIVCLSIIPIVLFYKMMMLLMENEWQADYVQLARGKGLTDRAILMRHATPNMMQSLFYQSKTIVWFILSAYLVVEFL
FGIEGVLYYLLAGFSPLNIFLVLVLVFTPFYFFYALIDLWISHGKNTESANVTRIPLHWNSFERTFTEKVDLKSKWQNIV
VTTGQLLKRPSFSIPLVTLSILLIASLIYGLMGDKINSLKFISDATGRVTDMAPFKPNAQVWLGTDQAGNSILDQLLVGI
KYTLLIAVIIATLRVVIGYILAVPLAFFSKPRTRNFVQSIADGMHYLPLSLLVFIIMVNEFISYTGVFETSLFTRISFQV
LIMVVIVLPITINRISSEISQVLKKEFVLSALVFGGNARWILSKHINPQIWSKLILIWIEQLIQTLQMFVHLAIFGIFIG
GAIMGADDGMLNPVIPELSGLIANAKFVFANHQFWIILPPLIVFMILILCFQVMANSLLKREEDSKKA

Specific function: Unknown

COG id: COG0601

COG function: function code EP; ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71185; Mature: 71185

Theoretical pI: Translated: 9.74; Mature: 9.74

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN ; PS50928 ABC_TM1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKRIVKIFLHYLLGILGIILISCVPAIFSKVTSWSSSTYLEALKSIFTAILHPTKWEISY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEE
QGSAEVFHISLRDFITGPYFYSMKIIIASLLISLIIAYILVIATFRGPKWLRRGLSGFLS
CCCCEEEEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
ILQAFPDFSFVFLIQMAVVYIYQQTGVFTLNFYSLNGEQIYAAPIVCLSIIPIVLFYKMM
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLLMENEWQADYVQLARGKGLTDRAILMRHATPNMMQSLFYQSKTIVWFILSAYLVVEFL
HHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGIEGVLYYLLAGFSPLNIFLVLVLVFTPFYFFYALIDLWISHGKNTESANVTRIPLHWN
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECC
SFERTFTEKVDLKSKWQNIVVTTGQLLKRPSFSIPLVTLSILLIASLIYGLMGDKINSLK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
FISDATGRVTDMAPFKPNAQVWLGTDQAGNSILDQLLVGIKYTLLIAVIIATLRVVIGYI
HHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAVPLAFFSKPRTRNFVQSIADGMHYLPLSLLVFIIMVNEFISYTGVFETSLFTRISFQV
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIMVVIVLPITINRISSEISQVLKKEFVLSALVFGGNARWILSKHINPQIWSKLILIWIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHH
QLIQTLQMFVHLAIFGIFIGGAIMGADDGMLNPVIPELSGLIANAKFVFANHQFWIILPP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEECCEEEEEHHH
LIVFMILILCFQVMANSLLKREEDSKKA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKRIVKIFLHYLLGILGIILISCVPAIFSKVTSWSSSTYLEALKSIFTAILHPTKWEISY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEE
QGSAEVFHISLRDFITGPYFYSMKIIIASLLISLIIAYILVIATFRGPKWLRRGLSGFLS
CCCCEEEEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
ILQAFPDFSFVFLIQMAVVYIYQQTGVFTLNFYSLNGEQIYAAPIVCLSIIPIVLFYKMM
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLLMENEWQADYVQLARGKGLTDRAILMRHATPNMMQSLFYQSKTIVWFILSAYLVVEFL
HHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGIEGVLYYLLAGFSPLNIFLVLVLVFTPFYFFYALIDLWISHGKNTESANVTRIPLHWN
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SFERTFTEKVDLKSKWQNIVVTTGQLLKRPSFSIPLVTLSILLIASLIYGLMGDKINSLK
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FISDATGRVTDMAPFKPNAQVWLGTDQAGNSILDQLLVGIKYTLLIAVIIATLRVVIGYI
HHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAVPLAFFSKPRTRNFVQSIADGMHYLPLSLLVFIIMVNEFISYTGVFETSLFTRISFQV
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIMVVIVLPITINRISSEISQVLKKEFVLSALVFGGNARWILSKHINPQIWSKLILIWIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHH
QLIQTLQMFVHLAIFGIFIGGAIMGADDGMLNPVIPELSGLIANAKFVFANHQFWIILPP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEECCEEEEEHHH
LIVFMILILCFQVMANSLLKREEDSKKA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA