Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yfhO [H]

Identifier: 116491890

GI number: 116491890

Start: 78691

End: 81252

Strand: Direct

Name: yfhO [H]

Synonym: PEPE_0072

Alternate gene names: 116491890

Gene position: 78691-81252 (Clockwise)

Preceding gene: 116491889

Following gene: 116491891

Centisome position: 4.29

GC content: 33.8

Gene sequence:

>2562_bases
ATGGTAAAAAAGTTGAAAAATGGTAGTTGGTACTTAATGAGCTTTATTTTACCTATAACTATTGTCATCATAGCTTATGC
TTCAAACGGAATATATTGGGGTAGCGCACATAGTATTCTGGCAAGCGATGCTTTTACACAAGGCGCTAATTTTTTAGCCA
GTTTTCGAGAGGTTTTACATGGAAAAAATAGCTTGTGGTTTAATTGGCAAGCCGGTTTTGGATTGAATTATTTAGCATTA
TATAGTTACTATCTAGGAGGGATAGTAACGCCTTTAGTAGGACTATTTAGCAAAAATCAGATTCCAAATGCTTTTTATGC
AATCACAATATTTAAAATAGGATTAGCTGGTCTAAGCAGTTTTTCTTATCTAAAACATCAATTTAAAATCAAACGATATC
AACAATTATTACTCGCAATTAGTTACGCTACCATGTCTTTTGGATTAGTAAATGCAGAACAAATAATGTGGCTTGATGTT
CTCTATATACTACCACTAATAGTATGGGGAGTTGATCAATGGATAGAACAGCAAAGGTGGGGATTATTGTTCATTAGTTG
GTTCTTAATGTTAGTTACTAATTTTTATATTGCCTTTATGGTGGGATTATTTATCGGAATATATTATTTAATGAAGTTAA
TAACATTAAAAGTACAACAATGGTGGATTAATATCGGACAGTTTATTGGAATTATGCTCTGGTCGACAATTAGCAGTGGA
GTAATAATTTTACCTGTAATCTTAACTTTGAGCCGCAATAAAATGCCATTATCATCAATGAATGGTGTCTTCACAGATCG
CTCCGGATTATGGGATTTGCCAGTTAAATCTATGATAGGGGCTTATGATGGTACTAAATTTGGGACTACCCCTTATATTT
ATGTGGGTCTAATAGTCTTAATTTACGCAGTATCTTACTTTTTTAATCGGCAGATTGCACGACGTGTTAGGGTTGGATAC
GCAGTACTATTACTAAGTTTGGTTAGTGGATTCTATCTACAATTTTTCAATCTTACTTGGCAGGGATGGCATTTTCCAGC
GATGTTTCTATACCGTTATAGTTTTTTATGGTCATTTGTAATGATGCAATTAGCAGCGTATGAATTGGAAGTTATGGTAT
CTCGCCTTGAAGCGAAAATTGGTATTATTTTAGGCAGTGTGATGCTGGTGGCGACTGTGGGGAGTTTTAATCATTATCAC
TTTATTAGCATTTGGAATTTAGTAGCTACCTTATTATTTTTAATAGTAGAAGTACTACTAATCTTTAGCGGATTAAATAA
AAAAGTAGCCATAGGAAGTTTAGTTTTAGTTAGCATTTTAGAGCTAACGATCAATGCGGGTTTAATGTTTAAAGGGGTAG
CTACAGAATGGCATTATCCAAGTGCTTCACTATTTAATGAGCCAGCAAAAGCAATCAAAGAAGGGCTTCCAAAAATAAGG
AATGATAGACTGCGCCGAGTAGAAAACCTAGATTCTATCTCACGTGACGACGGTTTGAGGTTTAATTATGGGTCGGCTAA
TTTCTTTTCCTCTGTAACTAATCGACCATTTGAGCAAAGCTTAAATCAATTAGGTTTTCGTTCAACTGGAAGTAACCTAA
ACATGACATATGGAAATAATACTTTGGTAATGGACAGTATTCTAGGTATTCAGACGAACTTAGCGTTGCAACCTGTTGAT
AAATATGGTTTTCAGATGGCAACTCGTTCAGGAAAATTTTATGTAAGTAACAATCAAAATGCTTTAAAAAATGGAATTGT
AGTAGAGCAAAAGCTTGCGGAAAATAAAAAATTGAGTAAAACAGATAATTTAGGTAATCAAAACCAATTATTGTCCTTAG
TAGCTCATACATCCGTTACAAAGCGGTTATTCAAGAGCTTTCCGGTTCAATTGACCGGTTCTACAGGACAAACTGCTGAA
GCTGGACTTGAATTTAAAAATTTAGAAAATGGTAATCAATCTCTTAAATTATCAGTGACTGTCCCAAAAAATCAACAAGC
CTATTTGAGTTTATTTAAAATGCAAGGAAGTATAAGTCAAATATCAGTTTACAAGGGAAAACAATTAATTGAGAACTATA
ATCCAAATTTAGTTGGGCAGTATATTAATCTAGGATCTTTCAAACAAAGAACGAATCTCAATATTAGTGTTCGGCTAAGC
GGAACAGGGACAGCTCAATTTGCACGCCCAACTTTGATTACATTAAATGAAAAAATTTTCCAACGGCAAATAGAACTAGC
TCGGAAATATCAAGCCACAAATTTAAAATATGGGAAACGGACAATCAAAGGGAATATCACTACAAATAACGATAAACAAG
CTTTATTATTAACGATTCCAGCAGATCCTGGTTGGAAAGCAAAAATTAATGGCAAGCAAGTAGCAGTTAAAACAGTAGAT
AATTTATTTACACTAGTTCCCTTAAATTCAGGAAAAAATCAGTTAACTATGAAATATGTACCGACTGGTTTAGTGATTGG
AGCATGGTTAACAATACTTGGTCTATCAAGTTTTATTTTTGTACAGATCTGGAGACGATACGATAATGAAGATTTAGGTT
AA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGTAAGTTTTAGGTACTAAATTAATTGAAATGACACTAAGTTTAAAACCGAGCAGATAGCTCGGTTTTTTAGTAATAAAA
GAGGAAAAGGATTATAAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTATTGGTATTTTTATAGTAAGCTATTTAAAATAGTGAAAGTAAATTAAAAAAGTGACTTATTTTAGATTTATCTGAATA
GGTCGCTTTTTTAGTTGGAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 853; Mature: 853

Protein sequence:

>853_residues
MVKKLKNGSWYLMSFILPITIVIIAYASNGIYWGSAHSILASDAFTQGANFLASFREVLHGKNSLWFNWQAGFGLNYLAL
YSYYLGGIVTPLVGLFSKNQIPNAFYAITIFKIGLAGLSSFSYLKHQFKIKRYQQLLLAISYATMSFGLVNAEQIMWLDV
LYILPLIVWGVDQWIEQQRWGLLFISWFLMLVTNFYIAFMVGLFIGIYYLMKLITLKVQQWWINIGQFIGIMLWSTISSG
VIILPVILTLSRNKMPLSSMNGVFTDRSGLWDLPVKSMIGAYDGTKFGTTPYIYVGLIVLIYAVSYFFNRQIARRVRVGY
AVLLLSLVSGFYLQFFNLTWQGWHFPAMFLYRYSFLWSFVMMQLAAYELEVMVSRLEAKIGIILGSVMLVATVGSFNHYH
FISIWNLVATLLFLIVEVLLIFSGLNKKVAIGSLVLVSILELTINAGLMFKGVATEWHYPSASLFNEPAKAIKEGLPKIR
NDRLRRVENLDSISRDDGLRFNYGSANFFSSVTNRPFEQSLNQLGFRSTGSNLNMTYGNNTLVMDSILGIQTNLALQPVD
KYGFQMATRSGKFYVSNNQNALKNGIVVEQKLAENKKLSKTDNLGNQNQLLSLVAHTSVTKRLFKSFPVQLTGSTGQTAE
AGLEFKNLENGNQSLKLSVTVPKNQQAYLSLFKMQGSISQISVYKGKQLIENYNPNLVGQYINLGSFKQRTNLNISVRLS
GTGTAQFARPTLITLNEKIFQRQIELARKYQATNLKYGKRTIKGNITTNNDKQALLLTIPADPGWKAKINGKQVAVKTVD
NLFTLVPLNSGKNQLTMKYVPTGLVIGAWLTILGLSSFIFVQIWRRYDNEDLG

Sequences:

>Translated_853_residues
MVKKLKNGSWYLMSFILPITIVIIAYASNGIYWGSAHSILASDAFTQGANFLASFREVLHGKNSLWFNWQAGFGLNYLAL
YSYYLGGIVTPLVGLFSKNQIPNAFYAITIFKIGLAGLSSFSYLKHQFKIKRYQQLLLAISYATMSFGLVNAEQIMWLDV
LYILPLIVWGVDQWIEQQRWGLLFISWFLMLVTNFYIAFMVGLFIGIYYLMKLITLKVQQWWINIGQFIGIMLWSTISSG
VIILPVILTLSRNKMPLSSMNGVFTDRSGLWDLPVKSMIGAYDGTKFGTTPYIYVGLIVLIYAVSYFFNRQIARRVRVGY
AVLLLSLVSGFYLQFFNLTWQGWHFPAMFLYRYSFLWSFVMMQLAAYELEVMVSRLEAKIGIILGSVMLVATVGSFNHYH
FISIWNLVATLLFLIVEVLLIFSGLNKKVAIGSLVLVSILELTINAGLMFKGVATEWHYPSASLFNEPAKAIKEGLPKIR
NDRLRRVENLDSISRDDGLRFNYGSANFFSSVTNRPFEQSLNQLGFRSTGSNLNMTYGNNTLVMDSILGIQTNLALQPVD
KYGFQMATRSGKFYVSNNQNALKNGIVVEQKLAENKKLSKTDNLGNQNQLLSLVAHTSVTKRLFKSFPVQLTGSTGQTAE
AGLEFKNLENGNQSLKLSVTVPKNQQAYLSLFKMQGSISQISVYKGKQLIENYNPNLVGQYINLGSFKQRTNLNISVRLS
GTGTAQFARPTLITLNEKIFQRQIELARKYQATNLKYGKRTIKGNITTNNDKQALLLTIPADPGWKAKINGKQVAVKTVD
NLFTLVPLNSGKNQLTMKYVPTGLVIGAWLTILGLSSFIFVQIWRRYDNEDLG
>Mature_853_residues
MVKKLKNGSWYLMSFILPITIVIIAYASNGIYWGSAHSILASDAFTQGANFLASFREVLHGKNSLWFNWQAGFGLNYLAL
YSYYLGGIVTPLVGLFSKNQIPNAFYAITIFKIGLAGLSSFSYLKHQFKIKRYQQLLLAISYATMSFGLVNAEQIMWLDV
LYILPLIVWGVDQWIEQQRWGLLFISWFLMLVTNFYIAFMVGLFIGIYYLMKLITLKVQQWWINIGQFIGIMLWSTISSG
VIILPVILTLSRNKMPLSSMNGVFTDRSGLWDLPVKSMIGAYDGTKFGTTPYIYVGLIVLIYAVSYFFNRQIARRVRVGY
AVLLLSLVSGFYLQFFNLTWQGWHFPAMFLYRYSFLWSFVMMQLAAYELEVMVSRLEAKIGIILGSVMLVATVGSFNHYH
FISIWNLVATLLFLIVEVLLIFSGLNKKVAIGSLVLVSILELTINAGLMFKGVATEWHYPSASLFNEPAKAIKEGLPKIR
NDRLRRVENLDSISRDDGLRFNYGSANFFSSVTNRPFEQSLNQLGFRSTGSNLNMTYGNNTLVMDSILGIQTNLALQPVD
KYGFQMATRSGKFYVSNNQNALKNGIVVEQKLAENKKLSKTDNLGNQNQLLSLVAHTSVTKRLFKSFPVQLTGSTGQTAE
AGLEFKNLENGNQSLKLSVTVPKNQQAYLSLFKMQGSISQISVYKGKQLIENYNPNLVGQYINLGSFKQRTNLNISVRLS
GTGTAQFARPTLITLNEKIFQRQIELARKYQATNLKYGKRTIKGNITTNNDKQALLLTIPADPGWKAKINGKQVAVKTVD
NLFTLVPLNSGKNQLTMKYVPTGLVIGAWLTILGLSSFIFVQIWRRYDNEDLG

Specific function: Unknown

COG id: COG4485

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018580 [H]

Pfam domain/function: PF09586 YfhO [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 96221; Mature: 96221

Theoretical pI: Translated: 10.33; Mature: 10.33

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8946165; 9384377 [H]