Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 116491889

Identifier: 116491889

GI number: 116491889

Start: 75938

End: 78595

Strand: Direct

Name: 116491889

Synonym: PEPE_0071

Alternate gene names: NA

Gene position: 75938-78595 (Clockwise)

Preceding gene: 116491888

Following gene: 116491890

Centisome position: 4.14

GC content: 38.07

Gene sequence:

>2658_bases
ATGGGCAAAGCATTTCGATGGCTGTATCTGTTAAGTACCTTTTTGTTGATGATTGGACAGGCAATTTCACCTTCTATGGT
TTCTGCTAAGTCTTTAAAAGATAGCGGGATTGAAGTTGGAATTAGTATGACAGATCCAATTAGTTCTCAACAAAAAGTGA
CTACAGTGATTTCCATTCAAGGTTCTGAAGATGAAATGAGTATTGGCAGTAAGGTAATCGTTAATATTCCAGGAAGTACT
GTACAAAGTGGTGTTGAGGGCATTAATTTAGTGGGAGCTGGATTACAAGGTTTTGATGGTCCGACAATCACCAAAGTTGG
GGATAATTATCAATTAGTATATGTTAAAAATAGTGAATCGGTTGCTGGTGGTGAACAAGCGACTATTTCTTGGACTTCAC
CCGGATGGTATCCAGGAGATGAACCAGGAGAAGTAGAATCCACTATTAAATATGAAGATGCTCAAGATACTAGTAAAAAC
GCCTCAGATAGCACTCAGTCAAATACTAAGGGGACACTTAGTCCGGCTAAGCCAGATTTTGGTAAATGGACAATGATGGC
TAAGACTGATGATATTCCAAATTACAAAGGTGTAGCATTAATGAATCCTAGTAATTCGGCGGTAAATGTTTATGACCTAC
CTGTAAATTACGGTAACAAGAAAATGAGTAATGCAACAGTTAAAGACGTTTTGCCAGCAGATACTCATTTTGTATATCCA
GGTATATCAGTGCAAACAGATCTTAAAACTACCAATAATATTCGAATCTTAAAACTGAATGGCAGTGGTTTTACTAACGT
CACAGATCAATTTGCTGGTGGGATTAAAGTAAATGGAAGAACCTTATCAGTAGATTTTGGAAATGCCATGAATGATGGTT
CTGCATACGTCGTGGAATATGCGGTTGCACCGGATGATGGTCAGACACCAACAACCTATGGGGTGAAAGCAAATTCTGCA
GAATTGAATTATATGGATTCAGAAGGTGATTCTAAACAAGCCACCGCTTCGCTGAATCAAGCAATTGATGATAATAGCAA
TGGGTCCTTCAAGTTTACAAAAGAAGTAAAACAAACTGAATATTTGATGGGATCAAAATATTTAGATTACACAATCAAAT
TAACAAATAATCATAACTTTTTAATTCCTAGTGGGTCAATAATTGAAGATGTTTTACCAATGGGATTGGATTATGTTTCA
ACTGATAATAGTTCTACAGCAGTTGATGTAAAACCCAGTGTCGCAGGGCAAAATGTGCAATGGACTTTAAATCAAGACTT
AGATACGGGAGAGAGTGCAGTCGTTCATTTTCGTGTAAAAGTGGATGAATCACAATTCCAACCAGGAGAGAAGATTAATA
ATAAAGCCGTGTTACATCGGGTCGGGAGTAAGGACATTAATAGTAATACTACAACTATTTTAGTGTTTAATGGAAAAATT
AAGATCAGCAAGACAGATGCCGAAACTGAAACGGCATTAGCGGGGGCTGAATTTGATATCCTAGATCAAGATGGAAAAGT
AGTTGACCATGTAAAAACTAGTTCTGATGGGGCCATTATTAGTAAAACATTACCCACAGGGGATTACTCTGTTAAAGAAA
CTAAAGCTCCAGAAGGATACGAATTATCAGAGAAAGACTATACAGTACATCTAGATTATCAACATGCTAAAAATGGGATA
GTTGAAGTCAATGTTGAAGATATTCCAGATACCATAAGTACAACGGATACGAGTGATACGACAGATACCACAAGTACAAC
GGATACAAGTGATACGACAGATACCACAAGTACAACGGATACAAGTGATACGACAGATACCACAAGTACAACGGATACAA
GTGATACGACAGATACCACAAGTACAACGGATACAAGTGATACGACAGATACCACAAGTACAACGGATACGAGTGATACG
ACAGATACCACAAGTACGACGGATACAAGTGATACGACAGATACCACAAGTACAACAGATACAAGTGATACGACAGATAC
CACAAGTACGACGGATACAAGTGATACGACAGATACCACAAGTACAACAGATACAAGTGATACGACAGATACCACAAGTA
CAACAGATACGAGTGATATGACAGATACCACAAGTACAACAAATACAAGTGATACGACAGATACCACAAGTACGACGGAT
ACAAGTGATACGACAGATACCACAAGTACAACAGATACAAGTGATACGACAGATACCACAAGTACAACAGATACGAGTGA
TACGACAGATACCACAAGTACAACAAATACAAGTGATACGGCAGATACCACAAGTACAACGGATACAAGTGATACGACAG
ATACCACAAGTATAACGGATACAAGTGATACGACAGATAGCGCAAGTACAACGGATACAAGTAATACGACAGGTACCACA
AGTACAACGGATACCACAAGTACGTCTAATAGTACAAAGAATTCTGTTCCTAAGTTGCCAGGAAAAATAACTTCTGGTTC
TTCGGGAACAAGTACGTCGAAAAAAGGTAATTCTACAAGTAAAAAATCTAGTGGATTAAAATCACCTTTAGCTAGCCTGC
TACCACAAACGGGCGAAAAGGGTGGATGGATTTTAACGTTTGTAGGTGTTGTTATATTAGGAGTAGTTGGCTGGTTTGTA
TTTAAGAAAAAACGGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTATAAAAAATATTCTTGAATTTTTAAACATTTAGTTCTTAGTTTTTAGGGTGTACCCTAAAAACTTTATATATAAAAA
TGAAAAGGAGTGGGTAGATG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTTTTAGGTACTAAATTAATTGAAATGACACTAAGTTTAAAACCGAGCAGATAGCTCGGTTTTTTAGTAATAAAAGAGGA
AAAGGATTATAAAATATGGT

Product: outer membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: Cell Wall Anchor Domain-Containing Protein; Outer Membrane Protein; Lpxtg-Motif Cell Wall Anchor Domain Protein; LPXTG-Motif Cell Wall Anchor Domain Protein; B-Type Cna Protein

Number of amino acids: Translated: 885; Mature: 884

Protein sequence:

>885_residues
MGKAFRWLYLLSTFLLMIGQAISPSMVSAKSLKDSGIEVGISMTDPISSQQKVTTVISIQGSEDEMSIGSKVIVNIPGST
VQSGVEGINLVGAGLQGFDGPTITKVGDNYQLVYVKNSESVAGGEQATISWTSPGWYPGDEPGEVESTIKYEDAQDTSKN
ASDSTQSNTKGTLSPAKPDFGKWTMMAKTDDIPNYKGVALMNPSNSAVNVYDLPVNYGNKKMSNATVKDVLPADTHFVYP
GISVQTDLKTTNNIRILKLNGSGFTNVTDQFAGGIKVNGRTLSVDFGNAMNDGSAYVVEYAVAPDDGQTPTTYGVKANSA
ELNYMDSEGDSKQATASLNQAIDDNSNGSFKFTKEVKQTEYLMGSKYLDYTIKLTNNHNFLIPSGSIIEDVLPMGLDYVS
TDNSSTAVDVKPSVAGQNVQWTLNQDLDTGESAVVHFRVKVDESQFQPGEKINNKAVLHRVGSKDINSNTTTILVFNGKI
KISKTDAETETALAGAEFDILDQDGKVVDHVKTSSDGAIISKTLPTGDYSVKETKAPEGYELSEKDYTVHLDYQHAKNGI
VEVNVEDIPDTISTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDT
TDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDMTDTTSTTNTSDTTDTTSTTD
TSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTNTSDTADTTSTTDTSDTTDTTSITDTSDTTDSASTTDTSNTTGTT
STTDTTSTSNSTKNSVPKLPGKITSGSSGTSTSKKGNSTSKKSSGLKSPLASLLPQTGEKGGWILTFVGVVILGVVGWFV
FKKKR

Sequences:

>Translated_885_residues
MGKAFRWLYLLSTFLLMIGQAISPSMVSAKSLKDSGIEVGISMTDPISSQQKVTTVISIQGSEDEMSIGSKVIVNIPGST
VQSGVEGINLVGAGLQGFDGPTITKVGDNYQLVYVKNSESVAGGEQATISWTSPGWYPGDEPGEVESTIKYEDAQDTSKN
ASDSTQSNTKGTLSPAKPDFGKWTMMAKTDDIPNYKGVALMNPSNSAVNVYDLPVNYGNKKMSNATVKDVLPADTHFVYP
GISVQTDLKTTNNIRILKLNGSGFTNVTDQFAGGIKVNGRTLSVDFGNAMNDGSAYVVEYAVAPDDGQTPTTYGVKANSA
ELNYMDSEGDSKQATASLNQAIDDNSNGSFKFTKEVKQTEYLMGSKYLDYTIKLTNNHNFLIPSGSIIEDVLPMGLDYVS
TDNSSTAVDVKPSVAGQNVQWTLNQDLDTGESAVVHFRVKVDESQFQPGEKINNKAVLHRVGSKDINSNTTTILVFNGKI
KISKTDAETETALAGAEFDILDQDGKVVDHVKTSSDGAIISKTLPTGDYSVKETKAPEGYELSEKDYTVHLDYQHAKNGI
VEVNVEDIPDTISTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDT
TDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDMTDTTSTTNTSDTTDTTSTTD
TSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTNTSDTADTTSTTDTSDTTDTTSITDTSDTTDSASTTDTSNTTGTT
STTDTTSTSNSTKNSVPKLPGKITSGSSGTSTSKKGNSTSKKSSGLKSPLASLLPQTGEKGGWILTFVGVVILGVVGWFV
FKKKR
>Mature_884_residues
GKAFRWLYLLSTFLLMIGQAISPSMVSAKSLKDSGIEVGISMTDPISSQQKVTTVISIQGSEDEMSIGSKVIVNIPGSTV
QSGVEGINLVGAGLQGFDGPTITKVGDNYQLVYVKNSESVAGGEQATISWTSPGWYPGDEPGEVESTIKYEDAQDTSKNA
SDSTQSNTKGTLSPAKPDFGKWTMMAKTDDIPNYKGVALMNPSNSAVNVYDLPVNYGNKKMSNATVKDVLPADTHFVYPG
ISVQTDLKTTNNIRILKLNGSGFTNVTDQFAGGIKVNGRTLSVDFGNAMNDGSAYVVEYAVAPDDGQTPTTYGVKANSAE
LNYMDSEGDSKQATASLNQAIDDNSNGSFKFTKEVKQTEYLMGSKYLDYTIKLTNNHNFLIPSGSIIEDVLPMGLDYVST
DNSSTAVDVKPSVAGQNVQWTLNQDLDTGESAVVHFRVKVDESQFQPGEKINNKAVLHRVGSKDINSNTTTILVFNGKIK
ISKTDAETETALAGAEFDILDQDGKVVDHVKTSSDGAIISKTLPTGDYSVKETKAPEGYELSEKDYTVHLDYQHAKNGIV
EVNVEDIPDTISTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTT
DTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDMTDTTSTTNTSDTTDTTSTTDT
SDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTNTSDTADTTSTTDTSDTTDTTSITDTSDTTDSASTTDTSNTTGTTS
TTDTTSTSNSTKNSVPKLPGKITSGSSGTSTSKKGNSTSKKSSGLKSPLASLLPQTGEKGGWILTFVGVVILGVVGWFVF
KKKR

Specific function: Unknown

COG id: COG4932

COG function: function code M; Predicted outer membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Drosophila melanogaster, GI221472639, Length=293, Percent_Identity=25.5972696245734, Blast_Score=77, Evalue=5e-14,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 93479; Mature: 93348

Theoretical pI: Translated: 3.99; Mature: 3.99

Prosite motif: PS50847 GRAM_POS_ANCHORING

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGKAFRWLYLLSTFLLMIGQAISPSMVSAKSLKDSGIEVGISMTDPISSQQKVTTVISIQ
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEE
GSEDEMSIGSKVIVNIPGSTVQSGVEGINLVGAGLQGFDGPTITKVGDNYQLVYVKNSES
CCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEEECCCC
VAGGEQATISWTSPGWYPGDEPGEVESTIKYEDAQDTSKNASDSTQSNTKGTLSPAKPDF
CCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
GKWTMMAKTDDIPNYKGVALMNPSNSAVNVYDLPVNYGNKKMSNATVKDVLPADTHFVYP
CCEEEEEECCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCEEEEC
GISVQTDLKTTNNIRILKLNGSGFTNVTDQFAGGIKVNGRTLSVDFGNAMNDGSAYVVEY
CCEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHCCCEEECCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEE
AVAPDDGQTPTTYGVKANSAELNYMDSEGDSKQATASLNQAIDDNSNGSFKFTKEVKQTE
EECCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHH
YLMGSKYLDYTIKLTNNHNFLIPSGSIIEDVLPMGLDYVSTDNSSTAVDVKPSVAGQNVQ
HHHCCEEEEEEEEEECCCEEEECCCHHHHHHHHCCCEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCEE
WTLNQDLDTGESAVVHFRVKVDESQFQPGEKINNKAVLHRVGSKDINSNTTTILVFNGKI
EEECCCCCCCCCEEEEEEEEECHHHCCCCHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCEE
KISKTDAETETALAGAEFDILDQDGKVVDHVKTSSDGAIISKTLPTGDYSVKETKAPEGY
EEECCCCCHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCC
ELSEKDYTVHLDYQHAKNGIVEVNVEDIPDTISTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTD
EECCCCEEEEEEHHHCCCCEEEEEHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
TSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTD
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
TSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDMTDTTSTTNTSDTTDTTSTTD
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
TSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTNTSDTADTTSTTDTSDTTDTTSITD
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECC
TSDTTDSASTTDTSNTTGTTSTTDTTSTSNSTKNSVPKLPGKITSGSSGTSTSKKGNSTS
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCC
KKSSGLKSPLASLLPQTGEKGGWILTFVGVVILGVVGWFVFKKKR
HHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCC
>Mature Secondary Structure 
GKAFRWLYLLSTFLLMIGQAISPSMVSAKSLKDSGIEVGISMTDPISSQQKVTTVISIQ
CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEE
GSEDEMSIGSKVIVNIPGSTVQSGVEGINLVGAGLQGFDGPTITKVGDNYQLVYVKNSES
CCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEEECCCC
VAGGEQATISWTSPGWYPGDEPGEVESTIKYEDAQDTSKNASDSTQSNTKGTLSPAKPDF
CCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
GKWTMMAKTDDIPNYKGVALMNPSNSAVNVYDLPVNYGNKKMSNATVKDVLPADTHFVYP
CCEEEEEECCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCEEEEC
GISVQTDLKTTNNIRILKLNGSGFTNVTDQFAGGIKVNGRTLSVDFGNAMNDGSAYVVEY
CCEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHCCCEEECCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEE
AVAPDDGQTPTTYGVKANSAELNYMDSEGDSKQATASLNQAIDDNSNGSFKFTKEVKQTE
EECCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHH
YLMGSKYLDYTIKLTNNHNFLIPSGSIIEDVLPMGLDYVSTDNSSTAVDVKPSVAGQNVQ
HHHCCEEEEEEEEEECCCEEEECCCHHHHHHHHCCCEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCEE
WTLNQDLDTGESAVVHFRVKVDESQFQPGEKINNKAVLHRVGSKDINSNTTTILVFNGKI
EEECCCCCCCCCEEEEEEEEECHHHCCCCHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCEE
KISKTDAETETALAGAEFDILDQDGKVVDHVKTSSDGAIISKTLPTGDYSVKETKAPEGY
EEECCCCCHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCC
ELSEKDYTVHLDYQHAKNGIVEVNVEDIPDTISTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTD
EECCCCEEEEEEHHHCCCCEEEEEHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
TSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTD
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
TSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDMTDTTSTTNTSDTTDTTSTTD
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
TSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTDTSDTTDTTSTTNTSDTADTTSTTDTSDTTDTTSITD
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECC
TSDTTDSASTTDTSNTTGTTSTTDTTSTSNSTKNSVPKLPGKITSGSSGTSTSKKGNSTS
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCC
KKSSGLKSPLASLLPQTGEKGGWILTFVGVVILGVVGWFVFKKKR
HHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA