Definition Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome.
Accession NC_008312
Length 7,750,108

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 113475454

Identifier: 113475454

GI number: 113475454

Start: 2721858

End: 2724755

Strand: Direct

Name: 113475454

Synonym: Tery_1783

Alternate gene names: NA

Gene position: 2721858-2724755 (Clockwise)

Preceding gene: 113475453

Following gene: 113475455

Centisome position: 35.12

GC content: 29.5

Gene sequence:

>2898_bases
ATGAGTAATTCAGAATTTATTTCTAACCCATATATTATTGGCATTCCCATTCGCCAAAAAGATAAATTTTATGGACGAAG
AGAAATATTTGATTTTCTTGAAACTCAGCTCAGGCAAAATGTAAAAATTATCTTATTACAAGGACAGCGACGAATTGGTA
AAACATCAGTTCTTGAGCAGATTAGTAATTTTATTGATTTGAATGATTTTGTTTTTATTCAACTTTCTCTAGAAGATAAA
AAATCTACAAATATAGAATATTTATTTGAGGAATTAGCAATAGAAATTCAAGATTACATCACAGATAATCTTGAGATAGA
AGAGAGTAGTGTCTCTTGTTATAATAGTTCTAAATTTCCTAATACATTAAATTGGTTTGAGAAAATATTTTTGCCGGAAG
TTTATGAAACTCTAGACGGTAAAAATGTTGTTTTAATGTTAGATGAATTTGATAGACTAGATAATATTAATCAAGAGACA
GAAAACAAATTTTACAAATATTTGAAGCAGATAGTTACAACAGATAAAAAACTTTTTCTACTGCCAGTTATAGGCAAACC
TGTTGAGGATCTTTCTGAATATTTTCAGGACTCTTTTCGGCAAGCAATTTTGCAAAAAATTGGATTACTAGATGATTCAT
ATGCTAAAGAGTTAATTATCAATCCAACGAAAAAACTAAAATATCAAGATGAAGCCATCGAGACAATTCTCAGATTATCA
GCTAATCATCCTTATTTTACTCAGGTTTTATGTTTTACTTTGTTTAATAGTGCTAAGGCTAGAGATAGATGGGAAGTAAC
TTCTCAAGATGTAGAAAGTATTGTTGAAAAAGCGATTACTCATTCTCAAACAGGATTAGCATCTTTAAGAAATTCATTAC
CAATATATGAAAAAGTTGTTTTTTTAGCAGTAGCAAAGTCTCAAGATATAGATGGTATAAAAGAGCAGTTATTAACTTTA
GAAGATTATGGTGTTTCTGTAACGGATGCCTTGAAAAAAGCGTTGAAAAATTTGGATAAATGGGGTTTTTTAGAAAAGCA
AAGTTCTAGTTCCCCACAGGATTTTTATCAATTAAAAGTAGAGTTTGTTCGACGTTGGTTAATTACAAATAATTTCATCA
AAATTTTTGGTGAGGCAATTCGTGAATTAGAAATTGCTGATTTAGAAGCTAATGAGCTTTATCAGGAAGCATGCAAAATA
GGAGCAAGCGATATTAATAGTGAGATTGAAAAGTATAAGGAAGTAATTATAAAAAATCCTAACCACTTTAGCGCTAAATT
GAAACTGGCTCAACTTTACTACGAGAATAAAAAATTCGACTCAGCAATTGAATTATATGAAAATATTGACAAACTATATC
AAAGAATTGATAGGTTTAGAGAGCATAAAAATATCCAGGAGTTTCTACCATTAAAAGTTGAAAATAATTTGCTTGAGGTT
CGATGGAAATATATTGATATTTTATTAGCAGATCCAGAGAATTTAGACTCTTTAAGATTTGCAGAGGAACAGCTCAAAAA
AATATCTGAACTAGAGCCAAATAACGAGAAAGTTAATAATAAGTTAAATGATATAAATCTGAAAATTCGTCGCCTGACAG
CAAATCCTTTTACGATCAAAAAATATGTTGAACCAGAAGATTTTGTTGGTCGTAGAGATATTATTAGTTATGCTTTCAAT
CAAATTAAATATAATAGTAATGGTCTTTTTTATGGTACCCCAGGGATAGGAAAATCTTCATTGCTCAGATATTTAGTTGA
ACCTGCATCTTGGGAGATAAAAAAATACAACGTTGATATTAATGATTACTATATATTGCAAATTGATTGTGAATCTATAG
AAAATTTATCTGTTACTAACTTTTGGAAAGAAGTTATAAGAGAACTAGATCTGGAAACTGCAGATGATACAAAGTTAAAA
GATAACATTCAAAAAATCTTAGCTCAGGAAACAATAACTAAAGTTGACATAGAGTCTTTATTTAGGTCAATTAGCTCTCA
AAAATCCTTGGTACTATTGATAGATAATTATGATGCTTTATTCAAAACCCAAAATAATTATTCCTCAAATGAAGCATTGA
AGCTTTTGAGACAGTTGAAAAGTATTAATAATCATAAACGTATAAAATGTTCCCTGATCATGACTTCCTCGGAAAAGGTA
GAGAAACTGCTTGGAGAGTTAAAAGAAGATACATCAATTTGCGAATATCTTGTTACTTTTCCTCTCGAACCATTTAATGA
TAATGAAATGGAAGAATTATGGGAAAGAATGCCAAAAGAATATAGAGATAGAAGAGTTCTACAAAAAAAAGTCAAAGATT
TGACTGGCGGCCATCCGGCGCTTTTTCAAATTATTTGTTATTATTTGTACGATTTGTGTAAAGTAAATATTGATAAACAG
ACACAGAAAAATAAATATGAAAACCTAAATAAGTGGTTTTATGATCAGGCAAAGTTAATATTAAAAGGAATATGGAAATC
ATTAACTTTGGCAGAACAAGGAATGTTACTTTTAGTTATTTTATCTGACTTAGAAGGGCGTATTAAAAGACATAGGAAGT
ATGACTTAAGTGGAATTAGAAGGTCGTTTAGAGAACAAGATCAAGTTTTAAATAGTCTAAAATACAGAAAAATAATCACA
AAAACTGGTACTGATAGAAACCACGAGGATATTTACGATTTAACGTCAGATGCTTTAAAGGAATGGGTAATTAATGAAAT
TATCATTAAGGATGTTGATGACGATGTTGCACAGCGGGAAAAAATCTTTTTATTTATCAAGCAAAAAGATGTCAATATGA
TTAACCAGCTATTTAAAGAATTATGGAGTAGCAAAGATGAAGTTAAAGAATCACTGGTTTGTCTTAAGGAAATATTATCC
TTATTTTTTGTGGCATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTTTAATTAATCAAAAAATCAAGAATAGTCAACTCAATTTTGGCAATTTTCTTTATACTTAAATAAAAAATTAAACCCT
AATATGAGGTAGTACTTCAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCAAGAGTTACGATTTAGTATATTAAATATTTTTAACTTTCAAGAAAGATGAACGATTACAAATACAGACCAAATCCTTA
TATTTTTGGCAAACCAATTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 965; Mature: 964

Protein sequence:

>965_residues
MSNSEFISNPYIIGIPIRQKDKFYGRREIFDFLETQLRQNVKIILLQGQRRIGKTSVLEQISNFIDLNDFVFIQLSLEDK
KSTNIEYLFEELAIEIQDYITDNLEIEESSVSCYNSSKFPNTLNWFEKIFLPEVYETLDGKNVVLMLDEFDRLDNINQET
ENKFYKYLKQIVTTDKKLFLLPVIGKPVEDLSEYFQDSFRQAILQKIGLLDDSYAKELIINPTKKLKYQDEAIETILRLS
ANHPYFTQVLCFTLFNSAKARDRWEVTSQDVESIVEKAITHSQTGLASLRNSLPIYEKVVFLAVAKSQDIDGIKEQLLTL
EDYGVSVTDALKKALKNLDKWGFLEKQSSSSPQDFYQLKVEFVRRWLITNNFIKIFGEAIRELEIADLEANELYQEACKI
GASDINSEIEKYKEVIIKNPNHFSAKLKLAQLYYENKKFDSAIELYENIDKLYQRIDRFREHKNIQEFLPLKVENNLLEV
RWKYIDILLADPENLDSLRFAEEQLKKISELEPNNEKVNNKLNDINLKIRRLTANPFTIKKYVEPEDFVGRRDIISYAFN
QIKYNSNGLFYGTPGIGKSSLLRYLVEPASWEIKKYNVDINDYYILQIDCESIENLSVTNFWKEVIRELDLETADDTKLK
DNIQKILAQETITKVDIESLFRSISSQKSLVLLIDNYDALFKTQNNYSSNEALKLLRQLKSINNHKRIKCSLIMTSSEKV
EKLLGELKEDTSICEYLVTFPLEPFNDNEMEELWERMPKEYRDRRVLQKKVKDLTGGHPALFQIICYYLYDLCKVNIDKQ
TQKNKYENLNKWFYDQAKLILKGIWKSLTLAEQGMLLLVILSDLEGRIKRHRKYDLSGIRRSFREQDQVLNSLKYRKIIT
KTGTDRNHEDIYDLTSDALKEWVINEIIIKDVDDDVAQREKIFLFIKQKDVNMINQLFKELWSSKDEVKESLVCLKEILS
LFFVA

Sequences:

>Translated_965_residues
MSNSEFISNPYIIGIPIRQKDKFYGRREIFDFLETQLRQNVKIILLQGQRRIGKTSVLEQISNFIDLNDFVFIQLSLEDK
KSTNIEYLFEELAIEIQDYITDNLEIEESSVSCYNSSKFPNTLNWFEKIFLPEVYETLDGKNVVLMLDEFDRLDNINQET
ENKFYKYLKQIVTTDKKLFLLPVIGKPVEDLSEYFQDSFRQAILQKIGLLDDSYAKELIINPTKKLKYQDEAIETILRLS
ANHPYFTQVLCFTLFNSAKARDRWEVTSQDVESIVEKAITHSQTGLASLRNSLPIYEKVVFLAVAKSQDIDGIKEQLLTL
EDYGVSVTDALKKALKNLDKWGFLEKQSSSSPQDFYQLKVEFVRRWLITNNFIKIFGEAIRELEIADLEANELYQEACKI
GASDINSEIEKYKEVIIKNPNHFSAKLKLAQLYYENKKFDSAIELYENIDKLYQRIDRFREHKNIQEFLPLKVENNLLEV
RWKYIDILLADPENLDSLRFAEEQLKKISELEPNNEKVNNKLNDINLKIRRLTANPFTIKKYVEPEDFVGRRDIISYAFN
QIKYNSNGLFYGTPGIGKSSLLRYLVEPASWEIKKYNVDINDYYILQIDCESIENLSVTNFWKEVIRELDLETADDTKLK
DNIQKILAQETITKVDIESLFRSISSQKSLVLLIDNYDALFKTQNNYSSNEALKLLRQLKSINNHKRIKCSLIMTSSEKV
EKLLGELKEDTSICEYLVTFPLEPFNDNEMEELWERMPKEYRDRRVLQKKVKDLTGGHPALFQIICYYLYDLCKVNIDKQ
TQKNKYENLNKWFYDQAKLILKGIWKSLTLAEQGMLLLVILSDLEGRIKRHRKYDLSGIRRSFREQDQVLNSLKYRKIIT
KTGTDRNHEDIYDLTSDALKEWVINEIIIKDVDDDVAQREKIFLFIKQKDVNMINQLFKELWSSKDEVKESLVCLKEILS
LFFVA
>Mature_964_residues
SNSEFISNPYIIGIPIRQKDKFYGRREIFDFLETQLRQNVKIILLQGQRRIGKTSVLEQISNFIDLNDFVFIQLSLEDKK
STNIEYLFEELAIEIQDYITDNLEIEESSVSCYNSSKFPNTLNWFEKIFLPEVYETLDGKNVVLMLDEFDRLDNINQETE
NKFYKYLKQIVTTDKKLFLLPVIGKPVEDLSEYFQDSFRQAILQKIGLLDDSYAKELIINPTKKLKYQDEAIETILRLSA
NHPYFTQVLCFTLFNSAKARDRWEVTSQDVESIVEKAITHSQTGLASLRNSLPIYEKVVFLAVAKSQDIDGIKEQLLTLE
DYGVSVTDALKKALKNLDKWGFLEKQSSSSPQDFYQLKVEFVRRWLITNNFIKIFGEAIRELEIADLEANELYQEACKIG
ASDINSEIEKYKEVIIKNPNHFSAKLKLAQLYYENKKFDSAIELYENIDKLYQRIDRFREHKNIQEFLPLKVENNLLEVR
WKYIDILLADPENLDSLRFAEEQLKKISELEPNNEKVNNKLNDINLKIRRLTANPFTIKKYVEPEDFVGRRDIISYAFNQ
IKYNSNGLFYGTPGIGKSSLLRYLVEPASWEIKKYNVDINDYYILQIDCESIENLSVTNFWKEVIRELDLETADDTKLKD
NIQKILAQETITKVDIESLFRSISSQKSLVLLIDNYDALFKTQNNYSSNEALKLLRQLKSINNHKRIKCSLIMTSSEKVE
KLLGELKEDTSICEYLVTFPLEPFNDNEMEELWERMPKEYRDRRVLQKKVKDLTGGHPALFQIICYYLYDLCKVNIDKQT
QKNKYENLNKWFYDQAKLILKGIWKSLTLAEQGMLLLVILSDLEGRIKRHRKYDLSGIRRSFREQDQVLNSLKYRKIITK
TGTDRNHEDIYDLTSDALKEWVINEIIIKDVDDDVAQREKIFLFIKQKDVNMINQLFKELWSSKDEVKESLVCLKEILSL
FFVA

Specific function: Unknown

COG id: COG1672

COG function: function code R; Predicted ATPase (AAA+ superfamily)

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 113433; Mature: 113302

Theoretical pI: Translated: 5.21; Mature: 5.21

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
0.7 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
0.6 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSNSEFISNPYIIGIPIRQKDKFYGRREIFDFLETQLRQNVKIILLQGQRRIGKTSVLEQ
CCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHH
ISNFIDLNDFVFIQLSLEDKKSTNIEYLFEELAIEIQDYITDNLEIEESSVSCYNSSKFP
HHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCCCC
NTLNWFEKIFLPEVYETLDGKNVVLMLDEFDRLDNINQETENKFYKYLKQIVTTDKKLFL
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
LPVIGKPVEDLSEYFQDSFRQAILQKIGLLDDSYAKELIINPTKKLKYQDEAIETILRLS
EECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHC
ANHPYFTQVLCFTLFNSAKARDRWEVTSQDVESIVEKAITHSQTGLASLRNSLPIYEKVV
CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCHHHHHH
FLAVAKSQDIDGIKEQLLTLEDYGVSVTDALKKALKNLDKWGFLEKQSSSSPQDFYQLKV
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
EFVRRWLITNNFIKIFGEAIRELEIADLEANELYQEACKIGASDINSEIEKYKEVIIKNP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NHFSAKLKLAQLYYENKKFDSAIELYENIDKLYQRIDRFREHKNIQEFLPLKVENNLLEV
CCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCHHHE
RWKYIDILLADPENLDSLRFAEEQLKKISELEPNNEKVNNKLNDINLKIRRLTANPFTIK
EEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCEEEE
KYVEPEDFVGRRDIISYAFNQIKYNSNGLFYGTPGIGKSSLLRYLVEPASWEIKKYNVDI
ECCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHEECCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECC
NDYYILQIDCESIENLSVTNFWKEVIRELDLETADDTKLKDNIQKILAQETITKVDIESL
CEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FRSISSQKSLVLLIDNYDALFKTQNNYSSNEALKLLRQLKSINNHKRIKCSLIMTSSEKV
HHHHCCCCCEEEEEECCHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCHHHH
EKLLGELKEDTSICEYLVTFPLEPFNDNEMEELWERMPKEYRDRRVLQKKVKDLTGGHPA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
LFQIICYYLYDLCKVNIDKQTQKNKYENLNKWFYDQAKLILKGIWKSLTLAEQGMLLLVI
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHH
LSDLEGRIKRHRKYDLSGIRRSFREQDQVLNSLKYRKIITKTGTDRNHEDIYDLTSDALK
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
EWVINEIIIKDVDDDVAQREKIFLFIKQKDVNMINQLFKELWSSKDEVKESLVCLKEILS
HHHHHHHHHHCCCHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LFFVA
HHHCC
>Mature Secondary Structure 
SNSEFISNPYIIGIPIRQKDKFYGRREIFDFLETQLRQNVKIILLQGQRRIGKTSVLEQ
CCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHH
ISNFIDLNDFVFIQLSLEDKKSTNIEYLFEELAIEIQDYITDNLEIEESSVSCYNSSKFP
HHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCCCC
NTLNWFEKIFLPEVYETLDGKNVVLMLDEFDRLDNINQETENKFYKYLKQIVTTDKKLFL
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
LPVIGKPVEDLSEYFQDSFRQAILQKIGLLDDSYAKELIINPTKKLKYQDEAIETILRLS
EECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHC
ANHPYFTQVLCFTLFNSAKARDRWEVTSQDVESIVEKAITHSQTGLASLRNSLPIYEKVV
CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCHHHHHH
FLAVAKSQDIDGIKEQLLTLEDYGVSVTDALKKALKNLDKWGFLEKQSSSSPQDFYQLKV
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
EFVRRWLITNNFIKIFGEAIRELEIADLEANELYQEACKIGASDINSEIEKYKEVIIKNP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NHFSAKLKLAQLYYENKKFDSAIELYENIDKLYQRIDRFREHKNIQEFLPLKVENNLLEV
CCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCHHHE
RWKYIDILLADPENLDSLRFAEEQLKKISELEPNNEKVNNKLNDINLKIRRLTANPFTIK
EEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCEEEE
KYVEPEDFVGRRDIISYAFNQIKYNSNGLFYGTPGIGKSSLLRYLVEPASWEIKKYNVDI
ECCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHEECCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECC
NDYYILQIDCESIENLSVTNFWKEVIRELDLETADDTKLKDNIQKILAQETITKVDIESL
CEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FRSISSQKSLVLLIDNYDALFKTQNNYSSNEALKLLRQLKSINNHKRIKCSLIMTSSEKV
HHHHCCCCCEEEEEECCHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCHHHH
EKLLGELKEDTSICEYLVTFPLEPFNDNEMEELWERMPKEYRDRRVLQKKVKDLTGGHPA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
LFQIICYYLYDLCKVNIDKQTQKNKYENLNKWFYDQAKLILKGIWKSLTLAEQGMLLLVI
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHH
LSDLEGRIKRHRKYDLSGIRRSFREQDQVLNSLKYRKIITKTGTDRNHEDIYDLTSDALK
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
EWVINEIIIKDVDDDVAQREKIFLFIKQKDVNMINQLFKELWSSKDEVKESLVCLKEILS
HHHHHHHHHHCCCHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LFFVA
HHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA