| Definition | Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008312 |
| Length | 7,750,108 |
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The map label for this gene is 113475384
Identifier: 113475384
GI number: 113475384
Start: 2596502
End: 2599774
Strand: Reverse
Name: 113475384
Synonym: Tery_1707
Alternate gene names: NA
Gene position: 2599774-2596502 (Counterclockwise)
Preceding gene: 113475385
Following gene: 113475383
Centisome position: 33.55
GC content: 32.54
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1090; Mature: 1090
Protein sequence:
>1090_residues MIQSTSQERQSRGINRTICIGIGGTGRDILMRIRRLIVDSYGDLEKLPIVSFVHIDTDKSASQISGLRTGSTYHGVDLSF KEAEKVSATMSSRDVDNFTQELEKHSTSERTGPYDHIRQWFPPQLNRNIKAIEEGAKGIRPVGRLAFFHNYRKIQKAIEI AEKKTRGNEGILLKMGLRVDGGVNIFIVGSLCGGTGSGMFLDVAYSLRHSYGQQNTKIVGYLVISPELYGNNTNMKANTY AALKELNHYTTPGTKFEACYDIQDLVIVQSERPPYDYAYLVSNETTGGYKILEQRKLCNVIAHKIALDFSGELAPIVKGM RDNFLQDLIQYDNHPRPNIQRYLTFGMAAIYFPRDKIVQIALNRISLNLVNFWLNGEGQSPDSVLLLERFLLQYRWHDDL QKRDGLSRRLAESVEESNKNFQSTINAWRNKLDRAISESQNKDDRIALQQRLPRDFREQFRKVIPGTTDSSRGVWLTRLQ QICPKITVEFQQNINSFIVDLLSPSNDNFSIRSSREWLEAMKNELNNYQRDIEEKIVDFNGSKILEDVDRKWQDGEQIIA DIENKFELPLLGGKNREFQAEAKRIVRQICDLIRHNFDLIVFQETLEIVRNLQNHVENIAAQLREFTNLLNNLKNDYEKE QANLKQLDFDEMSGEAIFAEEDINNCSQILLPLEELKSQLVQLSSEITKSSEDGQSIAIFIREKVREEEQVKEEVNLTVD RLFGVRSTNIVNSVIKRFLQNYSRVERSTRLGQIMQEAEPLLPLDFNAIYFRDRDSKHSQLIGFKDTDDEGVKQFKDILV GDLGVDNNTLKPTQAEDQILIVKEYAAFPLRLITNLEQMRNSYIREMNYSTSFLHNNNRIFFADIIPPDAAKIEELEDIF YPCLALELIQKNGDELLEFMYYNDMRDSYYTAELSSVWNQALEELANRQDMTEALKNILDKEVEKIDKEPLLWENYYLPK LQKFVKQIDNLPEDDLNYPYKDTVVGTPPTTENSGKEGIINRFRRRIQKKVKNIQLLQSKSTVTEENKEVIKDEIIDVDI DLDNSPNYRDKQHNSGDDRMKQLKDLVRMKEQGFLTDAEFQAAKKNILGI
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 125915; Mature: 125915
Theoretical pI: Translated: 5.27; Mature: 5.27
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIQSTSQERQSRGINRTICIGIGGTGRDILMRIRRLIVDSYGDLEKLPIVSFVHIDTDKS CCCCCCHHHHHCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCEEEEEEECCCCC ASQISGLRTGSTYHGVDLSFKEAEKVSATMSSRDVDNFTQELEKHSTSERTGPYDHIRQW HHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHC FPPQLNRNIKAIEEGAKGIRPVGRLAFFHNYRKIQKAIEIAEKKTRGNEGILLKMGLRVD CCHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCEEC GGVNIFIVGSLCGGTGSGMFLDVAYSLRHSYGQQNTKIVGYLVISPELYGNNTNMKANTY CCEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCEEECCCCCCCHHHH AALKELNHYTTPGTKFEACYDIQDLVIVQSERPPYDYAYLVSNETTGGYKILEQRKLCNV HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCHHHEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHH IAHKIALDFSGELAPIVKGMRDNFLQDLIQYDNHPRPNIQRYLTFGMAAIYFPRDKIVQI HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHH ALNRISLNLVNFWLNGEGQSPDSVLLLERFLLQYRWHDDLQKRDGLSRRLAESVEESNKN HHHHHHEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCH FQSTINAWRNKLDRAISESQNKDDRIALQQRLPRDFREQFRKVIPGTTDSSRGVWLTRLQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHH QICPKITVEFQQNINSFIVDLLSPSNDNFSIRSSREWLEAMKNELNNYQRDIEEKIVDFN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC GSKILEDVDRKWQDGEQIIADIENKFELPLLGGKNREFQAEAKRIVRQICDLIRHNFDLI CHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE VFQETLEIVRNLQNHVENIAAQLREFTNLLNNLKNDYEKEQANLKQLDFDEMSGEAIFAE EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCEEEEH EDINNCSQILLPLEELKSQLVQLSSEITKSSEDGQSIAIFIREKVREEEQVKEEVNLTVD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RLFGVRSTNIVNSVIKRFLQNYSRVERSTRLGQIMQEAEPLLPLDFNAIYFRDRDSKHSQ HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCC LIGFKDTDDEGVKQFKDILVGDLGVDNNTLKPTQAEDQILIVKEYAAFPLRLITNLEQMR EECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH NSYIREMNYSTSFLHNNNRIFFADIIPPDAAKIEELEDIFYPCLALELIQKNGDELLEFM HHHHHHCCCCHHEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH YYNDMRDSYYTAELSSVWNQALEELANRQDMTEALKNILDKEVEKIDKEPLLWENYYLPK HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHH LQKFVKQIDNLPEDDLNYPYKDTVVGTPPTTENSGKEGIINRFRRRIQKKVKNIQLLQSK HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC STVTEENKEVIKDEIIDVDIDLDNSPNYRDKQHNSGDDRMKQLKDLVRMKEQGFLTDAEF CHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH QAAKKNILGI HHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MIQSTSQERQSRGINRTICIGIGGTGRDILMRIRRLIVDSYGDLEKLPIVSFVHIDTDKS CCCCCCHHHHHCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCEEEEEEECCCCC ASQISGLRTGSTYHGVDLSFKEAEKVSATMSSRDVDNFTQELEKHSTSERTGPYDHIRQW HHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHC FPPQLNRNIKAIEEGAKGIRPVGRLAFFHNYRKIQKAIEIAEKKTRGNEGILLKMGLRVD CCHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCEEC GGVNIFIVGSLCGGTGSGMFLDVAYSLRHSYGQQNTKIVGYLVISPELYGNNTNMKANTY CCEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCEEECCCCCCCHHHH AALKELNHYTTPGTKFEACYDIQDLVIVQSERPPYDYAYLVSNETTGGYKILEQRKLCNV HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCHHHEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHH IAHKIALDFSGELAPIVKGMRDNFLQDLIQYDNHPRPNIQRYLTFGMAAIYFPRDKIVQI HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHH ALNRISLNLVNFWLNGEGQSPDSVLLLERFLLQYRWHDDLQKRDGLSRRLAESVEESNKN HHHHHHEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCH FQSTINAWRNKLDRAISESQNKDDRIALQQRLPRDFREQFRKVIPGTTDSSRGVWLTRLQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHH QICPKITVEFQQNINSFIVDLLSPSNDNFSIRSSREWLEAMKNELNNYQRDIEEKIVDFN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC GSKILEDVDRKWQDGEQIIADIENKFELPLLGGKNREFQAEAKRIVRQICDLIRHNFDLI CHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE VFQETLEIVRNLQNHVENIAAQLREFTNLLNNLKNDYEKEQANLKQLDFDEMSGEAIFAE EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCEEEEH EDINNCSQILLPLEELKSQLVQLSSEITKSSEDGQSIAIFIREKVREEEQVKEEVNLTVD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RLFGVRSTNIVNSVIKRFLQNYSRVERSTRLGQIMQEAEPLLPLDFNAIYFRDRDSKHSQ HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCC LIGFKDTDDEGVKQFKDILVGDLGVDNNTLKPTQAEDQILIVKEYAAFPLRLITNLEQMR EECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH NSYIREMNYSTSFLHNNNRIFFADIIPPDAAKIEELEDIFYPCLALELIQKNGDELLEFM HHHHHHCCCCHHEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH YYNDMRDSYYTAELSSVWNQALEELANRQDMTEALKNILDKEVEKIDKEPLLWENYYLPK HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHH LQKFVKQIDNLPEDDLNYPYKDTVVGTPPTTENSGKEGIINRFRRRIQKKVKNIQLLQSK HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC STVTEENKEVIKDEIIDVDIDLDNSPNYRDKQHNSGDDRMKQLKDLVRMKEQGFLTDAEF CHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH QAAKKNILGI HHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA