Definition Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome.
Accession NC_008312
Length 7,750,108

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The map label for this gene is 113475384

Identifier: 113475384

GI number: 113475384

Start: 2596502

End: 2599774

Strand: Reverse

Name: 113475384

Synonym: Tery_1707

Alternate gene names: NA

Gene position: 2599774-2596502 (Counterclockwise)

Preceding gene: 113475385

Following gene: 113475383

Centisome position: 33.55

GC content: 32.54

Gene sequence:

>3273_bases
ATGATTCAATCAACTAGTCAAGAACGCCAGTCTAGAGGAATTAATCGTACTATTTGTATCGGAATAGGAGGTACTGGTAG
AGATATTTTGATGCGAATTCGTAGATTAATTGTAGATAGTTATGGGGATTTAGAAAAACTGCCAATTGTGAGTTTTGTTC
ATATTGATACTGACAAGTCAGCTAGTCAAATATCTGGTTTAAGAACTGGCAGTACATATCATGGAGTTGACCTTAGTTTT
AAGGAAGCTGAGAAAGTTAGTGCCACAATGAGTAGCAGAGATGTGGATAATTTTACTCAAGAATTAGAAAAACATTCCAC
TTCTGAAAGAACAGGACCTTACGACCATATTCGTCAATGGTTTCCTCCTCAACTTAATCGGAATATTAAGGCAATAGAAG
AGGGTGCAAAAGGAATTAGACCAGTAGGAAGATTAGCTTTTTTTCATAACTATCGTAAGATTCAAAAAGCAATTGAAATA
GCGGAAAAAAAAACTAGAGGAAATGAGGGTATTTTACTAAAAATGGGGTTAAGGGTAGATGGGGGAGTAAATATTTTTAT
TGTGGGTTCTCTTTGTGGAGGTACTGGCAGTGGAATGTTTTTAGATGTTGCTTATAGTTTGAGACATTCTTATGGTCAGC
AAAACACTAAAATTGTTGGTTATTTAGTAATTAGTCCTGAGTTATATGGAAATAATACTAATATGAAAGCTAATACTTAT
GCAGCCTTAAAAGAACTAAATCATTACACTACTCCTGGTACAAAATTTGAAGCTTGTTACGATATACAAGACTTAGTAAT
TGTTCAATCAGAACGACCTCCTTATGATTATGCTTATTTGGTTTCTAATGAGACAACAGGAGGATATAAAATTCTTGAGC
AACGTAAATTATGTAATGTTATTGCTCATAAAATTGCTTTGGATTTTTCTGGAGAATTAGCGCCTATAGTTAAAGGTATG
AGAGATAATTTTTTACAAGATTTAATCCAATATGATAATCACCCTCGTCCTAATATTCAACGCTACTTAACTTTTGGTAT
GGCGGCTATTTATTTTCCACGGGATAAAATTGTTCAAATAGCTTTAAATCGTATTAGTTTAAATTTAGTTAATTTCTGGT
TAAATGGTGAAGGTCAAAGCCCAGATTCGGTTTTATTACTGGAAAGATTTTTACTTCAATATCGCTGGCATGATGACTTG
CAAAAACGAGATGGATTAAGTAGAAGATTAGCCGAATCTGTGGAAGAGTCTAATAAGAATTTTCAAAGTACAATTAATGC
TTGGAGAAATAAATTAGATAGGGCAATTTCTGAGTCTCAAAATAAGGATGACCGGATAGCATTACAGCAACGATTACCGA
GAGATTTTCGAGAGCAATTTAGAAAGGTTATTCCCGGAACAACTGATAGTAGTAGAGGGGTTTGGTTGACAAGGTTGCAA
CAAATTTGTCCGAAAATTACAGTGGAATTTCAACAAAATATTAATAGTTTTATTGTGGATTTGCTAAGTCCGAGTAATGA
TAATTTTTCTATTAGAAGTAGTCGGGAATGGCTAGAAGCAATGAAAAATGAACTGAATAATTATCAAAGGGATATTGAAG
AAAAAATTGTAGATTTTAATGGTAGTAAGATATTAGAGGATGTAGACAGAAAATGGCAAGATGGCGAACAGATAATTGCA
GATATTGAGAATAAATTTGAACTGCCTTTATTGGGAGGTAAGAATAGAGAATTTCAAGCTGAAGCTAAAAGAATAGTCAG
ACAAATTTGCGATTTAATTAGACATAATTTTGACTTAATAGTTTTCCAAGAAACTCTTGAAATAGTAAGAAATTTACAAA
ATCATGTTGAAAATATTGCTGCCCAACTAAGAGAATTTACAAACTTACTTAATAACCTTAAAAATGACTATGAAAAAGAA
CAAGCAAATTTAAAACAACTAGACTTTGATGAAATGAGTGGAGAAGCTATTTTTGCGGAGGAAGATATCAATAACTGTTC
TCAAATTTTACTCCCTCTCGAAGAGCTAAAGTCACAATTGGTACAACTAAGTTCGGAAATTACTAAATCGTCTGAAGACG
GGCAATCAATTGCAATTTTTATCAGAGAAAAAGTCAGGGAAGAAGAGCAAGTAAAAGAAGAAGTTAATCTCACAGTAGAT
AGGTTATTTGGAGTTCGGAGTACTAATATTGTTAATTCTGTAATTAAGCGTTTTCTACAGAACTATTCTAGGGTTGAAAG
GAGCACTCGTTTGGGACAAATTATGCAGGAGGCTGAACCACTTTTACCTTTAGATTTTAATGCTATTTACTTCAGAGATA
GGGATTCTAAACACAGTCAATTAATAGGATTTAAAGATACTGATGATGAAGGAGTTAAACAATTTAAAGATATTTTGGTG
GGAGATTTAGGAGTTGACAATAATACTCTTAAACCAACTCAAGCGGAAGACCAAATTTTAATCGTTAAAGAATATGCAGC
TTTTCCTTTGAGACTAATTACTAATCTTGAGCAAATGAGAAATTCTTACATTCGAGAAATGAATTATTCTACTTCTTTTC
TCCATAATAACAATCGGATTTTCTTTGCTGATATTATTCCTCCAGATGCAGCAAAAATAGAAGAGTTAGAAGATATTTTT
TATCCTTGTTTGGCTTTAGAATTAATTCAAAAAAATGGGGATGAGTTATTAGAATTTATGTATTACAATGATATGCGAGA
TAGTTATTACACTGCGGAGCTTAGTTCAGTTTGGAATCAAGCTTTAGAGGAATTAGCTAATCGGCAGGATATGACAGAGG
CTTTGAAAAATATTCTGGATAAAGAAGTAGAAAAAATAGATAAAGAACCTCTGCTCTGGGAAAACTATTATTTACCGAAG
TTGCAAAAGTTTGTTAAACAAATTGATAATTTACCGGAAGATGATCTTAATTATCCTTATAAAGATACGGTAGTTGGAAC
ACCACCAACAACTGAAAATTCTGGAAAGGAAGGAATTATTAATCGCTTTCGCCGTCGTATACAAAAAAAAGTAAAAAATA
TACAATTACTTCAGTCAAAATCTACTGTAACAGAGGAAAATAAGGAGGTAATAAAGGATGAAATTATTGACGTTGATATT
GATTTAGATAATTCTCCAAATTATCGCGATAAGCAACATAATTCAGGAGATGACCGGATGAAACAATTGAAGGATTTAGT
AAGGATGAAAGAACAGGGATTTTTGACAGATGCAGAATTTCAGGCAGCTAAGAAAAATATATTAGGTATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTGTAATAGAATGTGGTAGAAATGAAAATGTAGAACTATGTGGTTTTATTCAAATTGCTAGTAAGCATTTAGTGGTCAA
TATTAAAGGAGGTAAAAACC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTAAGATAAAGGAGCTTTAATTATGGTTGAATTATTTTAAATAATTACAAAAAAAAAGAGTCGAAAAGTTATTGCAGAAT
CTACTCAAAAAACATAGGAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1090; Mature: 1090

Protein sequence:

>1090_residues
MIQSTSQERQSRGINRTICIGIGGTGRDILMRIRRLIVDSYGDLEKLPIVSFVHIDTDKSASQISGLRTGSTYHGVDLSF
KEAEKVSATMSSRDVDNFTQELEKHSTSERTGPYDHIRQWFPPQLNRNIKAIEEGAKGIRPVGRLAFFHNYRKIQKAIEI
AEKKTRGNEGILLKMGLRVDGGVNIFIVGSLCGGTGSGMFLDVAYSLRHSYGQQNTKIVGYLVISPELYGNNTNMKANTY
AALKELNHYTTPGTKFEACYDIQDLVIVQSERPPYDYAYLVSNETTGGYKILEQRKLCNVIAHKIALDFSGELAPIVKGM
RDNFLQDLIQYDNHPRPNIQRYLTFGMAAIYFPRDKIVQIALNRISLNLVNFWLNGEGQSPDSVLLLERFLLQYRWHDDL
QKRDGLSRRLAESVEESNKNFQSTINAWRNKLDRAISESQNKDDRIALQQRLPRDFREQFRKVIPGTTDSSRGVWLTRLQ
QICPKITVEFQQNINSFIVDLLSPSNDNFSIRSSREWLEAMKNELNNYQRDIEEKIVDFNGSKILEDVDRKWQDGEQIIA
DIENKFELPLLGGKNREFQAEAKRIVRQICDLIRHNFDLIVFQETLEIVRNLQNHVENIAAQLREFTNLLNNLKNDYEKE
QANLKQLDFDEMSGEAIFAEEDINNCSQILLPLEELKSQLVQLSSEITKSSEDGQSIAIFIREKVREEEQVKEEVNLTVD
RLFGVRSTNIVNSVIKRFLQNYSRVERSTRLGQIMQEAEPLLPLDFNAIYFRDRDSKHSQLIGFKDTDDEGVKQFKDILV
GDLGVDNNTLKPTQAEDQILIVKEYAAFPLRLITNLEQMRNSYIREMNYSTSFLHNNNRIFFADIIPPDAAKIEELEDIF
YPCLALELIQKNGDELLEFMYYNDMRDSYYTAELSSVWNQALEELANRQDMTEALKNILDKEVEKIDKEPLLWENYYLPK
LQKFVKQIDNLPEDDLNYPYKDTVVGTPPTTENSGKEGIINRFRRRIQKKVKNIQLLQSKSTVTEENKEVIKDEIIDVDI
DLDNSPNYRDKQHNSGDDRMKQLKDLVRMKEQGFLTDAEFQAAKKNILGI

Sequences:

>Translated_1090_residues
MIQSTSQERQSRGINRTICIGIGGTGRDILMRIRRLIVDSYGDLEKLPIVSFVHIDTDKSASQISGLRTGSTYHGVDLSF
KEAEKVSATMSSRDVDNFTQELEKHSTSERTGPYDHIRQWFPPQLNRNIKAIEEGAKGIRPVGRLAFFHNYRKIQKAIEI
AEKKTRGNEGILLKMGLRVDGGVNIFIVGSLCGGTGSGMFLDVAYSLRHSYGQQNTKIVGYLVISPELYGNNTNMKANTY
AALKELNHYTTPGTKFEACYDIQDLVIVQSERPPYDYAYLVSNETTGGYKILEQRKLCNVIAHKIALDFSGELAPIVKGM
RDNFLQDLIQYDNHPRPNIQRYLTFGMAAIYFPRDKIVQIALNRISLNLVNFWLNGEGQSPDSVLLLERFLLQYRWHDDL
QKRDGLSRRLAESVEESNKNFQSTINAWRNKLDRAISESQNKDDRIALQQRLPRDFREQFRKVIPGTTDSSRGVWLTRLQ
QICPKITVEFQQNINSFIVDLLSPSNDNFSIRSSREWLEAMKNELNNYQRDIEEKIVDFNGSKILEDVDRKWQDGEQIIA
DIENKFELPLLGGKNREFQAEAKRIVRQICDLIRHNFDLIVFQETLEIVRNLQNHVENIAAQLREFTNLLNNLKNDYEKE
QANLKQLDFDEMSGEAIFAEEDINNCSQILLPLEELKSQLVQLSSEITKSSEDGQSIAIFIREKVREEEQVKEEVNLTVD
RLFGVRSTNIVNSVIKRFLQNYSRVERSTRLGQIMQEAEPLLPLDFNAIYFRDRDSKHSQLIGFKDTDDEGVKQFKDILV
GDLGVDNNTLKPTQAEDQILIVKEYAAFPLRLITNLEQMRNSYIREMNYSTSFLHNNNRIFFADIIPPDAAKIEELEDIF
YPCLALELIQKNGDELLEFMYYNDMRDSYYTAELSSVWNQALEELANRQDMTEALKNILDKEVEKIDKEPLLWENYYLPK
LQKFVKQIDNLPEDDLNYPYKDTVVGTPPTTENSGKEGIINRFRRRIQKKVKNIQLLQSKSTVTEENKEVIKDEIIDVDI
DLDNSPNYRDKQHNSGDDRMKQLKDLVRMKEQGFLTDAEFQAAKKNILGI
>Mature_1090_residues
MIQSTSQERQSRGINRTICIGIGGTGRDILMRIRRLIVDSYGDLEKLPIVSFVHIDTDKSASQISGLRTGSTYHGVDLSF
KEAEKVSATMSSRDVDNFTQELEKHSTSERTGPYDHIRQWFPPQLNRNIKAIEEGAKGIRPVGRLAFFHNYRKIQKAIEI
AEKKTRGNEGILLKMGLRVDGGVNIFIVGSLCGGTGSGMFLDVAYSLRHSYGQQNTKIVGYLVISPELYGNNTNMKANTY
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QKRDGLSRRLAESVEESNKNFQSTINAWRNKLDRAISESQNKDDRIALQQRLPRDFREQFRKVIPGTTDSSRGVWLTRLQ
QICPKITVEFQQNINSFIVDLLSPSNDNFSIRSSREWLEAMKNELNNYQRDIEEKIVDFNGSKILEDVDRKWQDGEQIIA
DIENKFELPLLGGKNREFQAEAKRIVRQICDLIRHNFDLIVFQETLEIVRNLQNHVENIAAQLREFTNLLNNLKNDYEKE
QANLKQLDFDEMSGEAIFAEEDINNCSQILLPLEELKSQLVQLSSEITKSSEDGQSIAIFIREKVREEEQVKEEVNLTVD
RLFGVRSTNIVNSVIKRFLQNYSRVERSTRLGQIMQEAEPLLPLDFNAIYFRDRDSKHSQLIGFKDTDDEGVKQFKDILV
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YPCLALELIQKNGDELLEFMYYNDMRDSYYTAELSSVWNQALEELANRQDMTEALKNILDKEVEKIDKEPLLWENYYLPK
LQKFVKQIDNLPEDDLNYPYKDTVVGTPPTTENSGKEGIINRFRRRIQKKVKNIQLLQSKSTVTEENKEVIKDEIIDVDI
DLDNSPNYRDKQHNSGDDRMKQLKDLVRMKEQGFLTDAEFQAAKKNILGI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 125915; Mature: 125915

Theoretical pI: Translated: 5.27; Mature: 5.27

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIQSTSQERQSRGINRTICIGIGGTGRDILMRIRRLIVDSYGDLEKLPIVSFVHIDTDKS
CCCCCCHHHHHCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCEEEEEEECCCCC
ASQISGLRTGSTYHGVDLSFKEAEKVSATMSSRDVDNFTQELEKHSTSERTGPYDHIRQW
HHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHC
FPPQLNRNIKAIEEGAKGIRPVGRLAFFHNYRKIQKAIEIAEKKTRGNEGILLKMGLRVD
CCHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCEEC
GGVNIFIVGSLCGGTGSGMFLDVAYSLRHSYGQQNTKIVGYLVISPELYGNNTNMKANTY
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AALKELNHYTTPGTKFEACYDIQDLVIVQSERPPYDYAYLVSNETTGGYKILEQRKLCNV
HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCHHHEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHH
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HHHHHHEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GSKILEDVDRKWQDGEQIIADIENKFELPLLGGKNREFQAEAKRIVRQICDLIRHNFDLI
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EDINNCSQILLPLEELKSQLVQLSSEITKSSEDGQSIAIFIREKVREEEQVKEEVNLTVD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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EECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
NSYIREMNYSTSFLHNNNRIFFADIIPPDAAKIEELEDIFYPCLALELIQKNGDELLEFM
HHHHHHCCCCHHEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
YYNDMRDSYYTAELSSVWNQALEELANRQDMTEALKNILDKEVEKIDKEPLLWENYYLPK
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHH
LQKFVKQIDNLPEDDLNYPYKDTVVGTPPTTENSGKEGIINRFRRRIQKKVKNIQLLQSK
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
STVTEENKEVIKDEIIDVDIDLDNSPNYRDKQHNSGDDRMKQLKDLVRMKEQGFLTDAEF
CHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
QAAKKNILGI
HHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MIQSTSQERQSRGINRTICIGIGGTGRDILMRIRRLIVDSYGDLEKLPIVSFVHIDTDKS
CCCCCCHHHHHCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCEEEEEEECCCCC
ASQISGLRTGSTYHGVDLSFKEAEKVSATMSSRDVDNFTQELEKHSTSERTGPYDHIRQW
HHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHC
FPPQLNRNIKAIEEGAKGIRPVGRLAFFHNYRKIQKAIEIAEKKTRGNEGILLKMGLRVD
CCHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCEEC
GGVNIFIVGSLCGGTGSGMFLDVAYSLRHSYGQQNTKIVGYLVISPELYGNNTNMKANTY
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HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCHHHEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHH
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HHHHHHEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GSKILEDVDRKWQDGEQIIADIENKFELPLLGGKNREFQAEAKRIVRQICDLIRHNFDLI
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VFQETLEIVRNLQNHVENIAAQLREFTNLLNNLKNDYEKEQANLKQLDFDEMSGEAIFAE
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCEEEEH
EDINNCSQILLPLEELKSQLVQLSSEITKSSEDGQSIAIFIREKVREEEQVKEEVNLTVD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RLFGVRSTNIVNSVIKRFLQNYSRVERSTRLGQIMQEAEPLLPLDFNAIYFRDRDSKHSQ
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCC
LIGFKDTDDEGVKQFKDILVGDLGVDNNTLKPTQAEDQILIVKEYAAFPLRLITNLEQMR
EECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
NSYIREMNYSTSFLHNNNRIFFADIIPPDAAKIEELEDIFYPCLALELIQKNGDELLEFM
HHHHHHCCCCHHEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
YYNDMRDSYYTAELSSVWNQALEELANRQDMTEALKNILDKEVEKIDKEPLLWENYYLPK
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHH
LQKFVKQIDNLPEDDLNYPYKDTVVGTPPTTENSGKEGIINRFRRRIQKKVKNIQLLQSK
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
STVTEENKEVIKDEIIDVDIDLDNSPNYRDKQHNSGDDRMKQLKDLVRMKEQGFLTDAEF
CHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
QAAKKNILGI
HHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA