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The map label for this gene is yicO [C]

Identifier: 109947008

GI number: 109947008

Start: 346488

End: 347795

Strand: Direct

Name: yicO [C]

Synonym: Hac_0401

Alternate gene names: 109947008

Gene position: 346488-347795 (Clockwise)

Preceding gene: 109947007

Following gene: 109947009

Centisome position: 22.3

GC content: 43.58

Gene sequence:

>1308_bases
ATGGGGTTTTTTAAGCTTAAAGAACACAACACTAACATTGCTACCGAGTTTAGAGCAGGTTTAACGACCTTTATCACCAT
GGTCTATATCGTGCCTTTAAACGCTCTTATCCTTTCTCACGCCAACATGCCTTATGAAGCCCTTTTAAGTGCGATCGCTA
TCATCACTATCTTATCAAGCGTGTTTAATGGGCTATGGGCAAACACCCCCATCGCTATGAGCGTGGGATTAGGGTTGTCA
GCTTATTTTAGCTTTGGGCTAGTTCAAGGGTTAAAACTCCCTTGGCAGAGCGCTTTAGGCATCGTAGCGCTCTCTGGAGC
GATTTTTGTGGTTTTGTCTTTCACCAAATTTAGAAGTTGGGTCATGCGAAGCATTCCTAGCGATTTAAGGCGTGCGGTGA
GCGCGGGGATAGGTGCTTTTATCGCGTTTATTGGTCTTAAAGAAATGCATATTGTAGTCACCCATAAGACCACGCTTGTC
ACTCTAGGCGATTTTAGCGATCCGCATGTGCTATTAGGGGTTTTTGGGATCATTTTAACTTTTGCACTCTACACGCTAAA
AGTTAGAGGCTCTTTTATCCTAGCGGTGCTGATAGTCTCTGTTTTCGCATGGGTTTTTAAGATAGATCCTTACCCCACCG
AAATTTTTTCCATGCCCGCTAGTATTAGCCCTATCGCCTTGCAACTAGACATTAAAGGCGTTTTTTTTGATGCGAGCGGG
GCTTTCACTTTGGCGTTAGTGCCGGTTATTATCACTTTTTTTGTAACCGATTTGTTTGATTCTTTAGGCACGCTTGCAGG
GATTGGCCATAGGACTGGTTTCTTTAATGACAAAGAGACAAACAAGGATTTAGAAAAAACTTTAGAAGCGGACGCAGCGG
TTTCTTTAGCGAGTGCGGTGGTGGGCGTTTCTACCACGACAGCTTTTATAGAGAGCGCGAGTGGGGTTGAAGAAGGGGGG
CGCACAGGGCTTACCGCGGTTTTTACTGGGTTGTTTTTTGTCTCAACACTCTTTTGCTTACCTCTCTTAAAAGCCATTCC
TAGCAACGCGATTTATCCGGTGCTTGTGATAGTAGGGGTTTTGATGTTTAGTGCATTAGAGGGCGTGAATTTCAAAGACA
TGGCCGTTAGCGTTTCCACTTTTTTAACCGTGGTGATGATGCCTTTAACCTTCTCTATCACCGACGGATTAGCCTTTGGT
TTCTTGTCCTATGGCATCATTAAGTTAGTCCAAAAAGACTTTAAGGCTATCAATTTTGGCATCATCACTCTTTGTATCAT
TTCCTTTTCTGTATTCATTTTCCGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGTAAATACCTTAAGGCAATTTTTAAAATAAAAGTGGTAATATAACCCCAAAGCCCCTTATTAAATTAATCTATACCAA
ATAGTAAGGAGTTATCTAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCTCTTTTTAAGGGGCTTTGCTTTTTTTACCCACTTCTTGGCTCTTTTTCTCATTTTAAATCGTTTATTATCCTAAAACA
CTCACAATAGCATTATGATT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 435; Mature: 434

Protein sequence:

>435_residues
MGFFKLKEHNTNIATEFRAGLTTFITMVYIVPLNALILSHANMPYEALLSAIAIITILSSVFNGLWANTPIAMSVGLGLS
AYFSFGLVQGLKLPWQSALGIVALSGAIFVVLSFTKFRSWVMRSIPSDLRRAVSAGIGAFIAFIGLKEMHIVVTHKTTLV
TLGDFSDPHVLLGVFGIILTFALYTLKVRGSFILAVLIVSVFAWVFKIDPYPTEIFSMPASISPIALQLDIKGVFFDASG
AFTLALVPVIITFFVTDLFDSLGTLAGIGHRTGFFNDKETNKDLEKTLEADAAVSLASAVVGVSTTTAFIESASGVEEGG
RTGLTAVFTGLFFVSTLFCLPLLKAIPSNAIYPVLVIVGVLMFSALEGVNFKDMAVSVSTFLTVVMMPLTFSITDGLAFG
FLSYGIIKLVQKDFKAINFGIITLCIISFSVFIFR

Sequences:

>Translated_435_residues
MGFFKLKEHNTNIATEFRAGLTTFITMVYIVPLNALILSHANMPYEALLSAIAIITILSSVFNGLWANTPIAMSVGLGLS
AYFSFGLVQGLKLPWQSALGIVALSGAIFVVLSFTKFRSWVMRSIPSDLRRAVSAGIGAFIAFIGLKEMHIVVTHKTTLV
TLGDFSDPHVLLGVFGIILTFALYTLKVRGSFILAVLIVSVFAWVFKIDPYPTEIFSMPASISPIALQLDIKGVFFDASG
AFTLALVPVIITFFVTDLFDSLGTLAGIGHRTGFFNDKETNKDLEKTLEADAAVSLASAVVGVSTTTAFIESASGVEEGG
RTGLTAVFTGLFFVSTLFCLPLLKAIPSNAIYPVLVIVGVLMFSALEGVNFKDMAVSVSTFLTVVMMPLTFSITDGLAFG
FLSYGIIKLVQKDFKAINFGIITLCIISFSVFIFR
>Mature_434_residues
GFFKLKEHNTNIATEFRAGLTTFITMVYIVPLNALILSHANMPYEALLSAIAIITILSSVFNGLWANTPIAMSVGLGLSA
YFSFGLVQGLKLPWQSALGIVALSGAIFVVLSFTKFRSWVMRSIPSDLRRAVSAGIGAFIAFIGLKEMHIVVTHKTTLVT
LGDFSDPHVLLGVFGIILTFALYTLKVRGSFILAVLIVSVFAWVFKIDPYPTEIFSMPASISPIALQLDIKGVFFDASGA
FTLALVPVIITFFVTDLFDSLGTLAGIGHRTGFFNDKETNKDLEKTLEADAAVSLASAVVGVSTTTAFIESASGVEEGGR
TGLTAVFTGLFFVSTLFCLPLLKAIPSNAIYPVLVIVGVLMFSALEGVNFKDMAVSVSTFLTVVMMPLTFSITDGLAFGF
LSYGIIKLVQKDFKAINFGIITLCIISFSVFIFR

Specific function: Unknown

COG id: COG2252

COG function: function code R; Permeases

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the xanthine/uracil permease family. AzgA purine transporter (TC 2.A.1.40) subfamily [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87082309, Length=424, Percent_Identity=37.9716981132075, Blast_Score=284, Evalue=7e-78,
Organism=Escherichia coli, GI1790150, Length=406, Percent_Identity=38.1773399014778, Blast_Score=273, Evalue=1e-74,
Organism=Escherichia coli, GI1790499, Length=430, Percent_Identity=31.3953488372093, Blast_Score=209, Evalue=4e-55,
Organism=Escherichia coli, GI48994909, Length=433, Percent_Identity=29.7921478060046, Blast_Score=189, Evalue=3e-49,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006043 [H]

Pfam domain/function: PF00860 Xan_ur_permease [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46832; Mature: 46701

Theoretical pI: Translated: 7.66; Mature: 7.66

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGFFKLKEHNTNIATEFRAGLTTFITMVYIVPLNALILSHANMPYEALLSAIAIITILSS
CCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VFNGLWANTPIAMSVGLGLSAYFSFGLVQGLKLPWQSALGIVALSGAIFVVLSFTKFRSW
HHHHHCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VMRSIPSDLRRAVSAGIGAFIAFIGLKEMHIVVTHKTTLVTLGDFSDPHVLLGVFGIILT
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
FALYTLKVRGSFILAVLIVSVFAWVFKIDPYPTEIFSMPASISPIALQLDIKGVFFDASG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCC
AFTLALVPVIITFFVTDLFDSLGTLAGIGHRTGFFNDKETNKDLEKTLEADAAVSLASAV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGVSTTTAFIESASGVEEGGRTGLTAVFTGLFFVSTLFCLPLLKAIPSNAIYPVLVIVGV
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
LMFSALEGVNFKDMAVSVSTFLTVVMMPLTFSITDGLAFGFLSYGIIKLVQKDFKAINFG
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IITLCIISFSVFIFR
HHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
GFFKLKEHNTNIATEFRAGLTTFITMVYIVPLNALILSHANMPYEALLSAIAIITILSS
CCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VFNGLWANTPIAMSVGLGLSAYFSFGLVQGLKLPWQSALGIVALSGAIFVVLSFTKFRSW
HHHHHCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VMRSIPSDLRRAVSAGIGAFIAFIGLKEMHIVVTHKTTLVTLGDFSDPHVLLGVFGIILT
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
FALYTLKVRGSFILAVLIVSVFAWVFKIDPYPTEIFSMPASISPIALQLDIKGVFFDASG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCC
AFTLALVPVIITFFVTDLFDSLGTLAGIGHRTGFFNDKETNKDLEKTLEADAAVSLASAV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGVSTTTAFIESASGVEEGGRTGLTAVFTGLFFVSTLFCLPLLKAIPSNAIYPVLVIVGV
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
LMFSALEGVNFKDMAVSVSTFLTVVMMPLTFSITDGLAFGFLSYGIIKLVQKDFKAINFG
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IITLCIISFSVFIFR
HHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]