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The map label for this gene is 93006948

Identifier: 93006948

GI number: 93006948

Start: 2601316

End: 2602680

Strand: Direct

Name: 93006948

Synonym: Pcryo_2124

Alternate gene names: NA

Gene position: 2601316-2602680 (Clockwise)

Preceding gene: 93006947

Following gene: 93006950

Centisome position: 85.01

GC content: 45.27

Gene sequence:

>1365_bases
ATGGATTCCATCGACATCTCTAAAAAAATCGCTAAAACAAGTGCCGCCAGTGCTCGGCAAGGTGCAGGCTGTCATCAAGC
GCCTGTTTCTTATCAGCATCATGGACGCACCACTGCCATTGATGACCATAGTGATCTGCAAGTATTAAAACGCATTAAGC
GCTATCTACTGCCAAAAGACTTTGTCATCTCGCAAGATTTGTTAGAGGAAATAGTTGCAGGCTACGATATTGGCGATCCA
ATAGCAGATGATCTAGCCTCTGATGGCATTCGTTTTGCCAAGCCATTACAGCAGTTTATTATTGATAAGAAAGCGGACTC
TAACCTCAAGAATAATTCCTCATTCAACGCATTAACTGAACAATTTAGTCGCCATCCCGACTGGTTTGATCCCAAGCTTG
CCCAAATCGGCGCGGTTGCCTATCGCCGTTATCCACTGATGCTGATTTGGTTGTTGCGTAATGTAGCCCTCATGGCAGGC
TATAGTATCCCTGCCTTATCGCTACCGCTGATTCAGACTGGCGCACTGATGCATGACGCTTTACCAAGATTGATGCGTAC
CTACGCCTATATCTTGGCGGTCTCTGAGCACCCTCAATTGCATTTAGATTCAGAGCATAGCAAACCTAATATTGAACGAG
TATTGGCTATCGGCTCTGAAGGTTGGCAGCAATCCATTAAAGTACGTCAAATACATACCTCAGTACGACAGAACTTGCTC
AAAGGTAAAGGCAATGCTGCTAAAGGCGTCATACCAGATGCCAACCAACATCACAACCCAGATGGCAGCTGGAATACTGC
ATATTGGGGTATTCCTATCAATCAAACCGATATGATTGCTACTCATTTGCAGTTTTCACTGTTGATTATGCGTGGCTTAA
GATTGCTTGGCGCCCGTATTAGCACTGAGGAAGCAGAAGGCATTTTGCATTTATGGAATCTTGCCAGTTATTGGATGGGA
GTTGATTTGCAGCGACTGCCAAAAGATGAAGCCGCCTGTTGGGAATGGCTCTATACCTATTTGTCGATTCAGCAGCTTGA
TTTTAAAATGGGACGACCACTGGCAAAAGCCCTGCATGATTTGCCACGTCAGCTGATGGGTGAGGACAATCGCCGTGGGC
GTTTTGTTGAGATGGTCAATGCCAGTGTGACCCGTACCTTGGTTGGTGATGATATTGGCGATGGGCTAAACCTACCAAAA
TCCAAAATACGCTTTGGCGTATTGTCTTCCGTGCCGATTCTATTTGCCCTCGATACTGCCCGTCAACACAATAGTAGAGT
CGCCAACAAGCTAGAAGCATTTCGTGCTAAACGCCAAGACAATATGAACTGGTGGTTAAAGAAAAATGATGAGTATTATA
AATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGACTTAACGCGTCATTCTTAATGTACGATTGAGCTACTTTATCCCAAAGTAGCTCAATCAACTTCATAAAAAGCAGTTG
CTACAGAGTTGCTCATAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATGCATTCATTTATTATCACTAACGTTTATAATAACGATCCTCCTTCGCCAAAAACATGATTATTAGCGAGTATCTAAC
ACTTCTATGATCGAGTATCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 454; Mature: 454

Protein sequence:

>454_residues
MDSIDISKKIAKTSAASARQGAGCHQAPVSYQHHGRTTAIDDHSDLQVLKRIKRYLLPKDFVISQDLLEEIVAGYDIGDP
IADDLASDGIRFAKPLQQFIIDKKADSNLKNNSSFNALTEQFSRHPDWFDPKLAQIGAVAYRRYPLMLIWLLRNVALMAG
YSIPALSLPLIQTGALMHDALPRLMRTYAYILAVSEHPQLHLDSEHSKPNIERVLAIGSEGWQQSIKVRQIHTSVRQNLL
KGKGNAAKGVIPDANQHHNPDGSWNTAYWGIPINQTDMIATHLQFSLLIMRGLRLLGARISTEEAEGILHLWNLASYWMG
VDLQRLPKDEAACWEWLYTYLSIQQLDFKMGRPLAKALHDLPRQLMGEDNRRGRFVEMVNASVTRTLVGDDIGDGLNLPK
SKIRFGVLSSVPILFALDTARQHNSRVANKLEAFRAKRQDNMNWWLKKNDEYYK

Sequences:

>Translated_454_residues
MDSIDISKKIAKTSAASARQGAGCHQAPVSYQHHGRTTAIDDHSDLQVLKRIKRYLLPKDFVISQDLLEEIVAGYDIGDP
IADDLASDGIRFAKPLQQFIIDKKADSNLKNNSSFNALTEQFSRHPDWFDPKLAQIGAVAYRRYPLMLIWLLRNVALMAG
YSIPALSLPLIQTGALMHDALPRLMRTYAYILAVSEHPQLHLDSEHSKPNIERVLAIGSEGWQQSIKVRQIHTSVRQNLL
KGKGNAAKGVIPDANQHHNPDGSWNTAYWGIPINQTDMIATHLQFSLLIMRGLRLLGARISTEEAEGILHLWNLASYWMG
VDLQRLPKDEAACWEWLYTYLSIQQLDFKMGRPLAKALHDLPRQLMGEDNRRGRFVEMVNASVTRTLVGDDIGDGLNLPK
SKIRFGVLSSVPILFALDTARQHNSRVANKLEAFRAKRQDNMNWWLKKNDEYYK
>Mature_454_residues
MDSIDISKKIAKTSAASARQGAGCHQAPVSYQHHGRTTAIDDHSDLQVLKRIKRYLLPKDFVISQDLLEEIVAGYDIGDP
IADDLASDGIRFAKPLQQFIIDKKADSNLKNNSSFNALTEQFSRHPDWFDPKLAQIGAVAYRRYPLMLIWLLRNVALMAG
YSIPALSLPLIQTGALMHDALPRLMRTYAYILAVSEHPQLHLDSEHSKPNIERVLAIGSEGWQQSIKVRQIHTSVRQNLL
KGKGNAAKGVIPDANQHHNPDGSWNTAYWGIPINQTDMIATHLQFSLLIMRGLRLLGARISTEEAEGILHLWNLASYWMG
VDLQRLPKDEAACWEWLYTYLSIQQLDFKMGRPLAKALHDLPRQLMGEDNRRGRFVEMVNASVTRTLVGDDIGDGLNLPK
SKIRFGVLSSVPILFALDTARQHNSRVANKLEAFRAKRQDNMNWWLKKNDEYYK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51387; Mature: 51387

Theoretical pI: Translated: 9.53; Mature: 9.53

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDSIDISKKIAKTSAASARQGAGCHQAPVSYQHHGRTTAIDDHSDLQVLKRIKRYLLPKD
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCH
FVISQDLLEEIVAGYDIGDPIADDLASDGIRFAKPLQQFIIDKKADSNLKNNSSFNALTE
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHH
QFSRHPDWFDPKLAQIGAVAYRRYPLMLIWLLRNVALMAGYSIPALSLPLIQTGALMHDA
HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LPRLMRTYAYILAVSEHPQLHLDSEHSKPNIERVLAIGSEGWQQSIKVRQIHTSVRQNLL
HHHHHHHHHHHHEECCCCCEEECCCCCCCCHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KGKGNAAKGVIPDANQHHNPDGSWNTAYWGIPINQTDMIATHLQFSLLIMRGLRLLGARI
HCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
STEEAEGILHLWNLASYWMGVDLQRLPKDEAACWEWLYTYLSIQQLDFKMGRPLAKALHD
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
LPRQLMGEDNRRGRFVEMVNASVTRTLVGDDIGDGLNLPKSKIRFGVLSSVPILFALDTA
HHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHEEEHHH
RQHNSRVANKLEAFRAKRQDNMNWWLKKNDEYYK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MDSIDISKKIAKTSAASARQGAGCHQAPVSYQHHGRTTAIDDHSDLQVLKRIKRYLLPKD
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCH
FVISQDLLEEIVAGYDIGDPIADDLASDGIRFAKPLQQFIIDKKADSNLKNNSSFNALTE
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHH
QFSRHPDWFDPKLAQIGAVAYRRYPLMLIWLLRNVALMAGYSIPALSLPLIQTGALMHDA
HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LPRLMRTYAYILAVSEHPQLHLDSEHSKPNIERVLAIGSEGWQQSIKVRQIHTSVRQNLL
HHHHHHHHHHHHEECCCCCEEECCCCCCCCHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KGKGNAAKGVIPDANQHHNPDGSWNTAYWGIPINQTDMIATHLQFSLLIMRGLRLLGARI
HCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
STEEAEGILHLWNLASYWMGVDLQRLPKDEAACWEWLYTYLSIQQLDFKMGRPLAKALHD
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
LPRQLMGEDNRRGRFVEMVNASVTRTLVGDDIGDGLNLPKSKIRFGVLSSVPILFALDTA
HHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHEEEHHH
RQHNSRVANKLEAFRAKRQDNMNWWLKKNDEYYK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA