Definition | Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_007880 |
Length | 1,895,994 |
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The map label for this gene is 89256124
Identifier: 89256124
GI number: 89256124
Start: 726087
End: 727457
Strand: Reverse
Name: 89256124
Synonym: FTL_0737
Alternate gene names: NA
Gene position: 727457-726087 (Counterclockwise)
Preceding gene: 89256125
Following gene: 89256123
Centisome position: 38.37
GC content: 27.21
Gene sequence:
>1371_bases ATGAACATCAAACAAACTTCAACACCTCTAGTTACAGGTCTTGTTTCTGCCTCGATTTGCTTTAGTTTTGGCTTTTTTAC AAATGTTTTTAAATACAATGGTCTTGAATTTTTTTATGCTTATATAGCTTTTCTTATACTACTCTGTTATCCGATGAATA TAGCTGCGCTATATTTCCAAAAAGCTTTTCCTAACTTAAACTCACACAGTAAACTAGTCTATAAAATTACTGGAAGCTCT AAGTTCAGACCAATAAGTATTTTATTAACTGGTTGTATGGTAATTTTAGTAGCATTGATAATGTTTGACATAGCGACTTA TGTTTTAGATTTTTTTGACAACATTCCAGCTATTGATCGCTTAAGCGATGAAAGCCTTAAATTTAATAGTAATCTACCTA TATATGTTTCACTACTTGTGGTATTTATTGTAATTCTTCTAATGTTTATTCTAGCTGATAAGAGAAAGCTGAATTTAAAT GAAACTCTAAAGACTAGTGCTCATGTATCTTTATATTTAGTTACTATCTTAATGCTAATAGTTATATATTCACCACAAGA CATGTTAGGCATAAAAGACTTCCTCTTAGACTTAAATTACCAAAAAATTAGTCAACTAAGACAAATGTTTGCTTTAGCGC TAATGTATGCAATTTTAAGTAATTTTATATCGATAGCATTTTATAAAAATATAATAAATATAGGCGATGATAATTACAGT AAACTTAAGACTAGCGCTTTTAAGAGTATTTTCTACAATATAATTTTCTCATTTATTATTTGCGTGACTATATACGCTAT TTTAGGCAATTACAGAAGCTATTTACAACCAACTGAAGGTATACAAATAACAACAGTTTTCAAAATTATTAAATTCAATT CACCAATGTATTATTTACTTCTTGAAGTAATATTTACAACTCTTAATTTAGTTGTTTTTGTTGCTGCCTTAAAATACATT TTTGAAATTGGATCTAAACTTTATACAAAGCTTTTAGTTCTACTTATACCATTTATTATGGCTATCACATTTATAGAATC GGGTATAGCTAATATAGACTTCTCTAAAATGTTTGGTCTACATTTAGTGATTATTTTTATCTTTTTATTTGATGTATTTA TAGTTGGCTGGATCTATGATGCTCAAAAGCTTAGTTATGAAATACTCAAAAACACAAATACTAGACTTTCACTGATCTTT AACATTATGCTGAGAATAATAATACCTTTTATCTGTATTCTTGTTACAATTGGATATATATTCTTACCTATGCCAATAAT ATGGCAATTTATTGCTACTTTAGCATGTATGATTATCTATATTGTCAAAGGAAGTATTTTTAGTAACATATTTAGTAAGA GAAAGTTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGTACAACTTGGGTGTCTATAGATAAAAATACTAAGATTATTAAAAATATAACTTTCCGCGGTAATTACTGCGCAACTAG TAACTAAATAGGAACTCTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AATGTTTTTTAATAAAAAAAATAACCAAGATGAGTTAAAAAAGCTTGCCGCAACTGAAGCTGCAAAAAGTATTACTACAG AAATTACTTTAGGAGTCGGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 456; Mature: 456
Protein sequence:
>456_residues MNIKQTSTPLVTGLVSASICFSFGFFTNVFKYNGLEFFYAYIAFLILLCYPMNIAALYFQKAFPNLNSHSKLVYKITGSS KFRPISILLTGCMVILVALIMFDIATYVLDFFDNIPAIDRLSDESLKFNSNLPIYVSLLVVFIVILLMFILADKRKLNLN ETLKTSAHVSLYLVTILMLIVIYSPQDMLGIKDFLLDLNYQKISQLRQMFALALMYAILSNFISIAFYKNIINIGDDNYS KLKTSAFKSIFYNIIFSFIICVTIYAILGNYRSYLQPTEGIQITTVFKIIKFNSPMYYLLLEVIFTTLNLVVFVAALKYI FEIGSKLYTKLLVLLIPFIMAITFIESGIANIDFSKMFGLHLVIIFIFLFDVFIVGWIYDAQKLSYEILKNTNTRLSLIF NIMLRIIIPFICILVTIGYIFLPMPIIWQFIATLACMIIYIVKGSIFSNIFSKRKF
Sequences:
>Translated_456_residues MNIKQTSTPLVTGLVSASICFSFGFFTNVFKYNGLEFFYAYIAFLILLCYPMNIAALYFQKAFPNLNSHSKLVYKITGSS KFRPISILLTGCMVILVALIMFDIATYVLDFFDNIPAIDRLSDESLKFNSNLPIYVSLLVVFIVILLMFILADKRKLNLN ETLKTSAHVSLYLVTILMLIVIYSPQDMLGIKDFLLDLNYQKISQLRQMFALALMYAILSNFISIAFYKNIINIGDDNYS KLKTSAFKSIFYNIIFSFIICVTIYAILGNYRSYLQPTEGIQITTVFKIIKFNSPMYYLLLEVIFTTLNLVVFVAALKYI FEIGSKLYTKLLVLLIPFIMAITFIESGIANIDFSKMFGLHLVIIFIFLFDVFIVGWIYDAQKLSYEILKNTNTRLSLIF NIMLRIIIPFICILVTIGYIFLPMPIIWQFIATLACMIIYIVKGSIFSNIFSKRKF >Mature_456_residues MNIKQTSTPLVTGLVSASICFSFGFFTNVFKYNGLEFFYAYIAFLILLCYPMNIAALYFQKAFPNLNSHSKLVYKITGSS KFRPISILLTGCMVILVALIMFDIATYVLDFFDNIPAIDRLSDESLKFNSNLPIYVSLLVVFIVILLMFILADKRKLNLN ETLKTSAHVSLYLVTILMLIVIYSPQDMLGIKDFLLDLNYQKISQLRQMFALALMYAILSNFISIAFYKNIINIGDDNYS KLKTSAFKSIFYNIIFSFIICVTIYAILGNYRSYLQPTEGIQITTVFKIIKFNSPMYYLLLEVIFTTLNLVVFVAALKYI FEIGSKLYTKLLVLLIPFIMAITFIESGIANIDFSKMFGLHLVIIFIFLFDVFIVGWIYDAQKLSYEILKNTNTRLSLIF NIMLRIIIPFICILVTIGYIFLPMPIIWQFIATLACMIIYIVKGSIFSNIFSKRKF
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 52394; Mature: 52394
Theoretical pI: Translated: 9.51; Mature: 9.51
Prosite motif: PS50267 NA_NEUROTRAN_SYMP_3
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 3.3 %Met (Translated Protein) 4.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 3.3 %Met (Mature Protein) 4.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNIKQTSTPLVTGLVSASICFSFGFFTNVFKYNGLEFFYAYIAFLILLCYPMNIAALYFQ CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KAFPNLNSHSKLVYKITGSSKFRPISILLTGCMVILVALIMFDIATYVLDFFDNIPAIDR HHCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHC LSDESLKFNSNLPIYVSLLVVFIVILLMFILADKRKLNLNETLKTSAHVSLYLVTILMLI CCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VIYSPQDMLGIKDFLLDLNYQKISQLRQMFALALMYAILSNFISIAFYKNIINIGDDNYS HHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH KLKTSAFKSIFYNIIFSFIICVTIYAILGNYRSYLQPTEGIQITTVFKIIKFNSPMYYLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCCHHHHH LEVIFTTLNLVVFVAALKYIFEIGSKLYTKLLVLLIPFIMAITFIESGIANIDFSKMFGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH HLVIIFIFLFDVFIVGWIYDAQKLSYEILKNTNTRLSLIFNIMLRIIIPFICILVTIGYI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLPMPIIWQFIATLACMIIYIVKGSIFSNIFSKRKF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MNIKQTSTPLVTGLVSASICFSFGFFTNVFKYNGLEFFYAYIAFLILLCYPMNIAALYFQ CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KAFPNLNSHSKLVYKITGSSKFRPISILLTGCMVILVALIMFDIATYVLDFFDNIPAIDR HHCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHC LSDESLKFNSNLPIYVSLLVVFIVILLMFILADKRKLNLNETLKTSAHVSLYLVTILMLI CCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VIYSPQDMLGIKDFLLDLNYQKISQLRQMFALALMYAILSNFISIAFYKNIINIGDDNYS HHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH KLKTSAFKSIFYNIIFSFIICVTIYAILGNYRSYLQPTEGIQITTVFKIIKFNSPMYYLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCCHHHHH LEVIFTTLNLVVFVAALKYIFEIGSKLYTKLLVLLIPFIMAITFIESGIANIDFSKMFGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH HLVIIFIFLFDVFIVGWIYDAQKLSYEILKNTNTRLSLIFNIMLRIIIPFICILVTIGYI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLPMPIIWQFIATLACMIIYIVKGSIFSNIFSKRKF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA