| Definition | Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007880 |
| Length | 1,895,994 |
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The map label for this gene is 89256001
Identifier: 89256001
GI number: 89256001
Start: 590791
End: 592278
Strand: Direct
Name: 89256001
Synonym: FTL_0603
Alternate gene names: NA
Gene position: 590791-592278 (Clockwise)
Preceding gene: 89256000
Following gene: 89256002
Centisome position: 31.16
GC content: 30.11
Gene sequence:
>1488_bases ATGAGCCTTAAAAAAAATACAATATCAAATTATATAACACAACTATATACTAGCTTAATTGGTATTGTTATACTTCCTTT GTATTTACAACATTTAAGTCATGATGCATTTGGTCTGATTGGTTTTTTTACAGTTTTTCAAACGTGGTTACGGTTGTTGG ATGTTGGTATAACACCAACTTTATCAAGAGAAGTGGCTCATGTTAGAGGTAGTACTGATGACTATCATTACTTACGCAAG TTGGTTAGATCGTTAGAGCTATTTTTCATTATTGTTGGTGTTCTGGTATTTATTGTAATTAGTACACATTCAAGGTATAT ATCCACCTCTTGGTTACATATAGGCTCGCTAGATGCTGATAGTGTAAGTGTATGTATTGCACTTATGGGTTTAATGTTTG CATTAAGATGGGTGTCTGATCTATATGGTGGTGGTTTGCGTGGCTTTGAAAGACAGGTTCTTTATAATAATTTAAGTATC ATACAAACGACACTACAGTTTATTGGTGGATTATTATTTATCTGCTATGTGTCTACTAATATTATGTATTATTTTGTATA TCAGACAATAATTGCGATACTATATCTAGTATGTATTGCAATTGCATTTTATAAAATACTACCATCATCATTTAGCGTGG GTTTAAGGTTTGATTTTAAAATAATTAGAAAAGTGCTTCCATTTGCACTAGGCATTGCATATTCTACAACAGTTTGGATT ATTGTCACTCAATCTGATAAATTAGTGTTCTCACATGTATTACCATTATCTGAGTATGGTTATTTATCTTTATTGATAGT GATATCTGGTGCTGTTACGATATTGTCCTCTCCGATTAGCATAGCTATTCAGCCTAGAATGACAATGCTATTAGCCCAAC AAAATGTAAAAGGAATGGAAAGCTTATATTTAAAATCATCCTTGATCTCAATTACTTTTTTATCTGCTGTAGTAACATGT GTTTTGATGTATTCTCATCAGCTGTTGCAGTCATGGACAGGAAGTATGGAAATTGCTAATTGGGGTAGTAATATCTTAAA TATATATGTTTTATCAGCATCTATTATTTGTATAATATCATTTCAATATTTTTTACAGTATGCTTATGGTAAGTTAAAGC TACATAATACATATAATACAATTAGTTTAGTATTTTTTGCTCCTATAGTTATATATACTGCTTATAATTATGGAGTGTAT ACTACAGCACTATTATGGCTTGGATATGCTATAGTGGGGCTGATAATCTGGATGCCTATTGTACACCATGTATTTGCTAA AGGTATCAATAGGTATTTTTTTATAAATTTAGCAGTTATTACTATAGTATGTTTTTTATTATCGTTAATATTTAAGGGTT GGTATATTTATCCAAGTAAAATTGGGTTGGTAGAATTAATATTGATTGGGTTTGCATTTTTATTTATACAAATTTGTATA GAGTATGTTTTGTTTCAGTACAAGGTTTTGAGGTGTATAGATGATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGGGCTATGACACACCCTCCATATAAAAATAGTTATTTCATTGATGAGCATGGAAATAAAGTATTTGTTGCTCTTGAACT TGAAAAGATAAGTTAGAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AGTTTCAGTATGTGTGATGACATACAATCAAGAAAAGTATATTGGTCAATGTTTAGAGTCTTTGGTTACTCAAGAGACTG ATTTTGACTTTGAGATAATC
Product: O-antigen flippase
Products: NA
Alternate protein names: Polysaccharide Biosynthesis Domain-Containing Protein; O-Antigen Exporter/Flippase; Polysaccharide Biosynthesis Domain Protein; O-Antigen Transporter; O-Antigen Transporter-Like; O-Antigen Flippase; O-Antigen Flippase Wzx
Number of amino acids: Translated: 495; Mature: 494
Protein sequence:
>495_residues MSLKKNTISNYITQLYTSLIGIVILPLYLQHLSHDAFGLIGFFTVFQTWLRLLDVGITPTLSREVAHVRGSTDDYHYLRK LVRSLELFFIIVGVLVFIVISTHSRYISTSWLHIGSLDADSVSVCIALMGLMFALRWVSDLYGGGLRGFERQVLYNNLSI IQTTLQFIGGLLFICYVSTNIMYYFVYQTIIAILYLVCIAIAFYKILPSSFSVGLRFDFKIIRKVLPFALGIAYSTTVWI IVTQSDKLVFSHVLPLSEYGYLSLLIVISGAVTILSSPISIAIQPRMTMLLAQQNVKGMESLYLKSSLISITFLSAVVTC VLMYSHQLLQSWTGSMEIANWGSNILNIYVLSASIICIISFQYFLQYAYGKLKLHNTYNTISLVFFAPIVIYTAYNYGVY TTALLWLGYAIVGLIIWMPIVHHVFAKGINRYFFINLAVITIVCFLLSLIFKGWYIYPSKIGLVELILIGFAFLFIQICI EYVLFQYKVLRCIDD
Sequences:
>Translated_495_residues MSLKKNTISNYITQLYTSLIGIVILPLYLQHLSHDAFGLIGFFTVFQTWLRLLDVGITPTLSREVAHVRGSTDDYHYLRK LVRSLELFFIIVGVLVFIVISTHSRYISTSWLHIGSLDADSVSVCIALMGLMFALRWVSDLYGGGLRGFERQVLYNNLSI IQTTLQFIGGLLFICYVSTNIMYYFVYQTIIAILYLVCIAIAFYKILPSSFSVGLRFDFKIIRKVLPFALGIAYSTTVWI IVTQSDKLVFSHVLPLSEYGYLSLLIVISGAVTILSSPISIAIQPRMTMLLAQQNVKGMESLYLKSSLISITFLSAVVTC VLMYSHQLLQSWTGSMEIANWGSNILNIYVLSASIICIISFQYFLQYAYGKLKLHNTYNTISLVFFAPIVIYTAYNYGVY TTALLWLGYAIVGLIIWMPIVHHVFAKGINRYFFINLAVITIVCFLLSLIFKGWYIYPSKIGLVELILIGFAFLFIQICI EYVLFQYKVLRCIDD >Mature_494_residues SLKKNTISNYITQLYTSLIGIVILPLYLQHLSHDAFGLIGFFTVFQTWLRLLDVGITPTLSREVAHVRGSTDDYHYLRKL VRSLELFFIIVGVLVFIVISTHSRYISTSWLHIGSLDADSVSVCIALMGLMFALRWVSDLYGGGLRGFERQVLYNNLSII QTTLQFIGGLLFICYVSTNIMYYFVYQTIIAILYLVCIAIAFYKILPSSFSVGLRFDFKIIRKVLPFALGIAYSTTVWII VTQSDKLVFSHVLPLSEYGYLSLLIVISGAVTILSSPISIAIQPRMTMLLAQQNVKGMESLYLKSSLISITFLSAVVTCV LMYSHQLLQSWTGSMEIANWGSNILNIYVLSASIICIISFQYFLQYAYGKLKLHNTYNTISLVFFAPIVIYTAYNYGVYT TALLWLGYAIVGLIIWMPIVHHVFAKGINRYFFINLAVITIVCFLLSLIFKGWYIYPSKIGLVELILIGFAFLFIQICIE YVLFQYKVLRCIDD
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 56230; Mature: 56099
Theoretical pI: Translated: 9.05; Mature: 9.05
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.6 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.6 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSLKKNTISNYITQLYTSLIGIVILPLYLQHLSHDAFGLIGFFTVFQTWLRLLDVGITPT CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC LSREVAHVRGSTDDYHYLRKLVRSLELFFIIVGVLVFIVISTHSRYISTSWLHIGSLDAD HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEECEEEECCCCCH SVSVCIALMGLMFALRWVSDLYGGGLRGFERQVLYNNLSIIQTTLQFIGGLLFICYVSTN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IMYYFVYQTIIAILYLVCIAIAFYKILPSSFSVGLRFDFKIIRKVLPFALGIAYSTTVWI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEE IVTQSDKLVFSHVLPLSEYGYLSLLIVISGAVTILSSPISIAIQPRMTMLLAQQNVKGME EEECCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHCCHHHH SLYLKSSLISITFLSAVVTCVLMYSHQLLQSWTGSMEIANWGSNILNIYVLSASIICIIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH FQYFLQYAYGKLKLHNTYNTISLVFFAPIVIYTAYNYGVYTTALLWLGYAIVGLIIWMPI HHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VHHVFAKGINRYFFINLAVITIVCFLLSLIFKGWYIYPSKIGLVELILIGFAFLFIQICI HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EYVLFQYKVLRCIDD HHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure SLKKNTISNYITQLYTSLIGIVILPLYLQHLSHDAFGLIGFFTVFQTWLRLLDVGITPT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC LSREVAHVRGSTDDYHYLRKLVRSLELFFIIVGVLVFIVISTHSRYISTSWLHIGSLDAD HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEECEEEECCCCCH SVSVCIALMGLMFALRWVSDLYGGGLRGFERQVLYNNLSIIQTTLQFIGGLLFICYVSTN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IMYYFVYQTIIAILYLVCIAIAFYKILPSSFSVGLRFDFKIIRKVLPFALGIAYSTTVWI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEE IVTQSDKLVFSHVLPLSEYGYLSLLIVISGAVTILSSPISIAIQPRMTMLLAQQNVKGME EEECCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHCCHHHH SLYLKSSLISITFLSAVVTCVLMYSHQLLQSWTGSMEIANWGSNILNIYVLSASIICIIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH FQYFLQYAYGKLKLHNTYNTISLVFFAPIVIYTAYNYGVYTTALLWLGYAIVGLIIWMPI HHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VHHVFAKGINRYFFINLAVITIVCFLLSLIFKGWYIYPSKIGLVELILIGFAFLFIQICI HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EYVLFQYKVLRCIDD HHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA