Definition Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome, complete genome.
Accession NC_007880
Length 1,895,994

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The map label for this gene is 89256001

Identifier: 89256001

GI number: 89256001

Start: 590791

End: 592278

Strand: Direct

Name: 89256001

Synonym: FTL_0603

Alternate gene names: NA

Gene position: 590791-592278 (Clockwise)

Preceding gene: 89256000

Following gene: 89256002

Centisome position: 31.16

GC content: 30.11

Gene sequence:

>1488_bases
ATGAGCCTTAAAAAAAATACAATATCAAATTATATAACACAACTATATACTAGCTTAATTGGTATTGTTATACTTCCTTT
GTATTTACAACATTTAAGTCATGATGCATTTGGTCTGATTGGTTTTTTTACAGTTTTTCAAACGTGGTTACGGTTGTTGG
ATGTTGGTATAACACCAACTTTATCAAGAGAAGTGGCTCATGTTAGAGGTAGTACTGATGACTATCATTACTTACGCAAG
TTGGTTAGATCGTTAGAGCTATTTTTCATTATTGTTGGTGTTCTGGTATTTATTGTAATTAGTACACATTCAAGGTATAT
ATCCACCTCTTGGTTACATATAGGCTCGCTAGATGCTGATAGTGTAAGTGTATGTATTGCACTTATGGGTTTAATGTTTG
CATTAAGATGGGTGTCTGATCTATATGGTGGTGGTTTGCGTGGCTTTGAAAGACAGGTTCTTTATAATAATTTAAGTATC
ATACAAACGACACTACAGTTTATTGGTGGATTATTATTTATCTGCTATGTGTCTACTAATATTATGTATTATTTTGTATA
TCAGACAATAATTGCGATACTATATCTAGTATGTATTGCAATTGCATTTTATAAAATACTACCATCATCATTTAGCGTGG
GTTTAAGGTTTGATTTTAAAATAATTAGAAAAGTGCTTCCATTTGCACTAGGCATTGCATATTCTACAACAGTTTGGATT
ATTGTCACTCAATCTGATAAATTAGTGTTCTCACATGTATTACCATTATCTGAGTATGGTTATTTATCTTTATTGATAGT
GATATCTGGTGCTGTTACGATATTGTCCTCTCCGATTAGCATAGCTATTCAGCCTAGAATGACAATGCTATTAGCCCAAC
AAAATGTAAAAGGAATGGAAAGCTTATATTTAAAATCATCCTTGATCTCAATTACTTTTTTATCTGCTGTAGTAACATGT
GTTTTGATGTATTCTCATCAGCTGTTGCAGTCATGGACAGGAAGTATGGAAATTGCTAATTGGGGTAGTAATATCTTAAA
TATATATGTTTTATCAGCATCTATTATTTGTATAATATCATTTCAATATTTTTTACAGTATGCTTATGGTAAGTTAAAGC
TACATAATACATATAATACAATTAGTTTAGTATTTTTTGCTCCTATAGTTATATATACTGCTTATAATTATGGAGTGTAT
ACTACAGCACTATTATGGCTTGGATATGCTATAGTGGGGCTGATAATCTGGATGCCTATTGTACACCATGTATTTGCTAA
AGGTATCAATAGGTATTTTTTTATAAATTTAGCAGTTATTACTATAGTATGTTTTTTATTATCGTTAATATTTAAGGGTT
GGTATATTTATCCAAGTAAAATTGGGTTGGTAGAATTAATATTGATTGGGTTTGCATTTTTATTTATACAAATTTGTATA
GAGTATGTTTTGTTTCAGTACAAGGTTTTGAGGTGTATAGATGATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGGGCTATGACACACCCTCCATATAAAAATAGTTATTTCATTGATGAGCATGGAAATAAAGTATTTGTTGCTCTTGAACT
TGAAAAGATAAGTTAGAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGTTTCAGTATGTGTGATGACATACAATCAAGAAAAGTATATTGGTCAATGTTTAGAGTCTTTGGTTACTCAAGAGACTG
ATTTTGACTTTGAGATAATC

Product: O-antigen flippase

Products: NA

Alternate protein names: Polysaccharide Biosynthesis Domain-Containing Protein; O-Antigen Exporter/Flippase; Polysaccharide Biosynthesis Domain Protein; O-Antigen Transporter; O-Antigen Transporter-Like; O-Antigen Flippase; O-Antigen Flippase Wzx

Number of amino acids: Translated: 495; Mature: 494

Protein sequence:

>495_residues
MSLKKNTISNYITQLYTSLIGIVILPLYLQHLSHDAFGLIGFFTVFQTWLRLLDVGITPTLSREVAHVRGSTDDYHYLRK
LVRSLELFFIIVGVLVFIVISTHSRYISTSWLHIGSLDADSVSVCIALMGLMFALRWVSDLYGGGLRGFERQVLYNNLSI
IQTTLQFIGGLLFICYVSTNIMYYFVYQTIIAILYLVCIAIAFYKILPSSFSVGLRFDFKIIRKVLPFALGIAYSTTVWI
IVTQSDKLVFSHVLPLSEYGYLSLLIVISGAVTILSSPISIAIQPRMTMLLAQQNVKGMESLYLKSSLISITFLSAVVTC
VLMYSHQLLQSWTGSMEIANWGSNILNIYVLSASIICIISFQYFLQYAYGKLKLHNTYNTISLVFFAPIVIYTAYNYGVY
TTALLWLGYAIVGLIIWMPIVHHVFAKGINRYFFINLAVITIVCFLLSLIFKGWYIYPSKIGLVELILIGFAFLFIQICI
EYVLFQYKVLRCIDD

Sequences:

>Translated_495_residues
MSLKKNTISNYITQLYTSLIGIVILPLYLQHLSHDAFGLIGFFTVFQTWLRLLDVGITPTLSREVAHVRGSTDDYHYLRK
LVRSLELFFIIVGVLVFIVISTHSRYISTSWLHIGSLDADSVSVCIALMGLMFALRWVSDLYGGGLRGFERQVLYNNLSI
IQTTLQFIGGLLFICYVSTNIMYYFVYQTIIAILYLVCIAIAFYKILPSSFSVGLRFDFKIIRKVLPFALGIAYSTTVWI
IVTQSDKLVFSHVLPLSEYGYLSLLIVISGAVTILSSPISIAIQPRMTMLLAQQNVKGMESLYLKSSLISITFLSAVVTC
VLMYSHQLLQSWTGSMEIANWGSNILNIYVLSASIICIISFQYFLQYAYGKLKLHNTYNTISLVFFAPIVIYTAYNYGVY
TTALLWLGYAIVGLIIWMPIVHHVFAKGINRYFFINLAVITIVCFLLSLIFKGWYIYPSKIGLVELILIGFAFLFIQICI
EYVLFQYKVLRCIDD
>Mature_494_residues
SLKKNTISNYITQLYTSLIGIVILPLYLQHLSHDAFGLIGFFTVFQTWLRLLDVGITPTLSREVAHVRGSTDDYHYLRKL
VRSLELFFIIVGVLVFIVISTHSRYISTSWLHIGSLDADSVSVCIALMGLMFALRWVSDLYGGGLRGFERQVLYNNLSII
QTTLQFIGGLLFICYVSTNIMYYFVYQTIIAILYLVCIAIAFYKILPSSFSVGLRFDFKIIRKVLPFALGIAYSTTVWII
VTQSDKLVFSHVLPLSEYGYLSLLIVISGAVTILSSPISIAIQPRMTMLLAQQNVKGMESLYLKSSLISITFLSAVVTCV
LMYSHQLLQSWTGSMEIANWGSNILNIYVLSASIICIISFQYFLQYAYGKLKLHNTYNTISLVFFAPIVIYTAYNYGVYT
TALLWLGYAIVGLIIWMPIVHHVFAKGINRYFFINLAVITIVCFLLSLIFKGWYIYPSKIGLVELILIGFAFLFIQICIE
YVLFQYKVLRCIDD

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56230; Mature: 56099

Theoretical pI: Translated: 9.05; Mature: 9.05

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SLKKNTISNYITQLYTSLIGIVILPLYLQHLSHDAFGLIGFFTVFQTWLRLLDVGITPT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
LSREVAHVRGSTDDYHYLRKLVRSLELFFIIVGVLVFIVISTHSRYISTSWLHIGSLDAD
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEECEEEECCCCCH
SVSVCIALMGLMFALRWVSDLYGGGLRGFERQVLYNNLSIIQTTLQFIGGLLFICYVSTN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IMYYFVYQTIIAILYLVCIAIAFYKILPSSFSVGLRFDFKIIRKVLPFALGIAYSTTVWI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEE
IVTQSDKLVFSHVLPLSEYGYLSLLIVISGAVTILSSPISIAIQPRMTMLLAQQNVKGME
EEECCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHCCHHHH
SLYLKSSLISITFLSAVVTCVLMYSHQLLQSWTGSMEIANWGSNILNIYVLSASIICIIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
FQYFLQYAYGKLKLHNTYNTISLVFFAPIVIYTAYNYGVYTTALLWLGYAIVGLIIWMPI
HHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VHHVFAKGINRYFFINLAVITIVCFLLSLIFKGWYIYPSKIGLVELILIGFAFLFIQICI
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EYVLFQYKVLRCIDD
HHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA