Definition | Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas, complete genome. |
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Accession | NC_007799 |
Length | 1,176,248 |
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The map label for this gene is 88658250
Identifier: 88658250
GI number: 88658250
Start: 1064550
End: 1070441
Strand: Reverse
Name: 88658250
Synonym: ECH_1038
Alternate gene names: NA
Gene position: 1070441-1064550 (Counterclockwise)
Preceding gene: 88657597
Following gene: 88657949
Centisome position: 91.0
GC content: 31.4
Gene sequence:
>5892_bases ATGAAGGTATGGTGTTACAAAAATATAGGCTTATACTTAATTGTTTTATTATCTTTCGTTTATCCACGTGCACTTTTACA TGCTAAGATCAATATACATGTTCTCAGAGATTATGCTAATGTACATTATAACACTTACTATGGTCTTCATTTTGATAACT ATTATAAACCTGTCGATAATACGGAAGGTAATCTTGATAGTGTTATGATAAGATTTGCTTCACATGATAGTTATAGATAT ATGTCTTTTATGCAATATGTAAAAGGGCAATATCAGGATGTAGAAAATCTAAATGTTTCTGGGTTAGATATACCTTTTAA TAGGGAAGATCGTACATTTGATGACCATGATGTAATGTTTATGCAGCTGTCTTCTTATTGGGGAAAGGTGACATTTCATA GTTTACCTATAGGTGGTTGTAAAGTTCTATATGCTGGTAGTATAATTTATGATCCTGTCAGTGCTATAGCATTTTTAGAA AATGAAAACGCTAGTTCAAAGGTCTGTATATGTTTTGTAGGAAAGTGTAATGTTAAACCTGAAAGAAATTCATGTGATAA AAAAAGTATACGTTGTAAAAAGGTAACCGTAGCAATTAATCCTCCACCATTCTGTAGCATATTGGACGCATCTAGTATAG TCTCTATTACTCCTTTAAGATTTTCTCAGCAAACTTTTTTTAGACCTGGTGTTAGAATACATATTTATTCAGGATCTGGT AACCCTTATACAAAGGAGTTATATGTGAAATCTCATAAGATAGGTGATAAAACTTCTTATAATATTTCACATGCTGGAAT TCCTTATGAATTTCAAGTTTATAAAGCTGGTTATGATACAGTATGTGCGGAATATAGTAATAATGGTGAAAAAGGGAAAA AAGTATGTGTTCCTTCTCCAGGATTGATGCGTCCTAAAGTAACTTCTAATGCTAATGGTGTTAATATACAATATCAAGAT 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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AATATTAGAAAATTACCCTACTTGTTAAAACAATGAATGGAATTTTATAGATAAAAACATATACTAAAATTTCATAAGAG TATGGATAAGTTTAGTGAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1963; Mature: 1963
Protein sequence:
>1963_residues MKVWCYKNIGLYLIVLLSFVYPRALLHAKINIHVLRDYANVHYNTYYGLHFDNYYKPVDNTEGNLDSVMIRFASHDSYRY MSFMQYVKGQYQDVENLNVSGLDIPFNREDRTFDDHDVMFMQLSSYWGKVTFHSLPIGGCKVLYAGSIIYDPVSAIAFLE NENASSKVCICFVGKCNVKPERNSCDKKSIRCKKVTVAINPPPFCSILDASSIVSITPLRFSQQTFFRPGVRIHIYSGSG NPYTKELYVKSHKIGDKTSYNISHAGIPYEFQVYKAGYDTVCAEYSNNGEKGKKVCVPSPGLMRPKVTSNANGVNIQYQD CQGLSSCSVDMLPGTQDLDMYFSVIKPKIDFNNYTLLSRYECEDGKIVENENQCVNGIGQRLGYVHDNNSNVTCVVDMPF VPMKYSIKKNHRDLWLSMHDKMLLGYGVVVGKTDTGKDVERYVQCDQKFAIDIKSMTQEQLNKITRIRQDAFFDIGGHYN PKNAPCQDSMLYRYENNRLYEKGGQVSCKNMVELDYGTKKIKGCSSLYMSDDDFTYFFHENDELEKIVPLNPILQGMCVS NFPSYEYKKRVLVRKILPDSYKLGIDQKNTECDFLKIEAWGGGASGISRSGRSGKAGNYVMGLLRFDKNVVNKKLIIDIG DGGKGANSLSNSGGDTTVKLCDDDDKNCLVKIIAHGGDEGGNYLQDSSEGIDNLVHYRFAPGLQNSGESEILVPYQSPDM PYGKLRKGDKECLCDSNILEKNSNKYWGAGGCSSVYNCAQEGANGMVRITCEKWSGNVGKISLIDENACSDFLVTLIEKM HKSTSGIPNVVKEFLQKISKVSFCRQSKSFPNLISSMSKYFIAIDKILVGGDILGHNLSGLRKELFTELNNTEVKAMLAK LGINESPETLLLYLDVLNFNFGVNISNPPSGLLNYYVSDNEFDYDLSKHDEDYDKLSDNEAMMFNVTTEKPEQWFSVELK DPEFVRRYRNFINMIHRSVITDEEGHKKNNIVVSWMYTFFKSDRQLFELYAAPFVELMLGMDLNKFMKWGNCSDTHIRLF ESIGKYSERLPSQIQDFIKKIATGDFCNTFSKMELLNSYGVELSNYAIDCALKNTDKRCLESKWRSSLGSMAKKLQDAVD LNYEVFTDIGIASNRKEIALLIDAVMLNYVMSDLNVGNSDITSTLSLLDPISSQALDNFPYDTIVELRQDASNMKYGKYG DHRANIVTLWSYMAYNSFEWNIEDFKSFVKLLLAEDLTSVKIRKCNDNLRYLFDKLNKYKSKLPAVLQDFLDKISKESVC KKISRFAALETSLVKYEENLLNELRGGNLFYFSSLYDLNYAHRGKLSNIEKVYSHAANIWSDVGELSSNITNLLNNPEIY KIFTDAGITSSKEEISLAFDAVIFNSLVSEIKIDQKKLKNLLLLIYDNSLALNNIRLERSKGSGQIQQVTIDQNRYPGNG ILMLQQNANNMEYGNYGVHRADIIALWSYISYMSSESGWSIKKCESFVKLLLGIDLKFIDLKGCDNDVVDLFNKLNTYGD KLPLSLRDFLKKISEKNFCEKMSLFPELGIALMNYTNELRNVLRVGSVFQVDSVANIVNGRVSNINDVYSYLGNLLSNVR QLSSNIADLLNNPDIYKIFTDVGITSSQEAIFLSIDAVIFNLLVSEIKIDNSQLKELLSLVGGHRNASSNNANNGRSLSQ GIRYKITFKISFAQNYFPVDEIIKLQQDANNMEYGVHGVHRTDIIALWSYISYASSKSKWLFKRYQSFAGLLFEIGAWGK CTSAERVFFTSMNRYSEKLPLKVYNFIRKITTGDFARKFSGMQSLYTYKQRVYDYVMHCVLRGGLGGECSDMTLREISNE LHKLKQEIYSNYDVFRDLGITNGQQEVLLLINVMMLNYAMSDLLVSTTQVNSMLADVRSSLSRTAHCLPYGTVSQLQRSV SHMKYGEYSNYRASVVALWACISCLASFNDDMEPLIKLMLEGD
Sequences:
>Translated_1963_residues MKVWCYKNIGLYLIVLLSFVYPRALLHAKINIHVLRDYANVHYNTYYGLHFDNYYKPVDNTEGNLDSVMIRFASHDSYRY MSFMQYVKGQYQDVENLNVSGLDIPFNREDRTFDDHDVMFMQLSSYWGKVTFHSLPIGGCKVLYAGSIIYDPVSAIAFLE NENASSKVCICFVGKCNVKPERNSCDKKSIRCKKVTVAINPPPFCSILDASSIVSITPLRFSQQTFFRPGVRIHIYSGSG NPYTKELYVKSHKIGDKTSYNISHAGIPYEFQVYKAGYDTVCAEYSNNGEKGKKVCVPSPGLMRPKVTSNANGVNIQYQD CQGLSSCSVDMLPGTQDLDMYFSVIKPKIDFNNYTLLSRYECEDGKIVENENQCVNGIGQRLGYVHDNNSNVTCVVDMPF VPMKYSIKKNHRDLWLSMHDKMLLGYGVVVGKTDTGKDVERYVQCDQKFAIDIKSMTQEQLNKITRIRQDAFFDIGGHYN PKNAPCQDSMLYRYENNRLYEKGGQVSCKNMVELDYGTKKIKGCSSLYMSDDDFTYFFHENDELEKIVPLNPILQGMCVS NFPSYEYKKRVLVRKILPDSYKLGIDQKNTECDFLKIEAWGGGASGISRSGRSGKAGNYVMGLLRFDKNVVNKKLIIDIG DGGKGANSLSNSGGDTTVKLCDDDDKNCLVKIIAHGGDEGGNYLQDSSEGIDNLVHYRFAPGLQNSGESEILVPYQSPDM PYGKLRKGDKECLCDSNILEKNSNKYWGAGGCSSVYNCAQEGANGMVRITCEKWSGNVGKISLIDENACSDFLVTLIEKM HKSTSGIPNVVKEFLQKISKVSFCRQSKSFPNLISSMSKYFIAIDKILVGGDILGHNLSGLRKELFTELNNTEVKAMLAK LGINESPETLLLYLDVLNFNFGVNISNPPSGLLNYYVSDNEFDYDLSKHDEDYDKLSDNEAMMFNVTTEKPEQWFSVELK DPEFVRRYRNFINMIHRSVITDEEGHKKNNIVVSWMYTFFKSDRQLFELYAAPFVELMLGMDLNKFMKWGNCSDTHIRLF ESIGKYSERLPSQIQDFIKKIATGDFCNTFSKMELLNSYGVELSNYAIDCALKNTDKRCLESKWRSSLGSMAKKLQDAVD LNYEVFTDIGIASNRKEIALLIDAVMLNYVMSDLNVGNSDITSTLSLLDPISSQALDNFPYDTIVELRQDASNMKYGKYG DHRANIVTLWSYMAYNSFEWNIEDFKSFVKLLLAEDLTSVKIRKCNDNLRYLFDKLNKYKSKLPAVLQDFLDKISKESVC KKISRFAALETSLVKYEENLLNELRGGNLFYFSSLYDLNYAHRGKLSNIEKVYSHAANIWSDVGELSSNITNLLNNPEIY KIFTDAGITSSKEEISLAFDAVIFNSLVSEIKIDQKKLKNLLLLIYDNSLALNNIRLERSKGSGQIQQVTIDQNRYPGNG ILMLQQNANNMEYGNYGVHRADIIALWSYISYMSSESGWSIKKCESFVKLLLGIDLKFIDLKGCDNDVVDLFNKLNTYGD KLPLSLRDFLKKISEKNFCEKMSLFPELGIALMNYTNELRNVLRVGSVFQVDSVANIVNGRVSNINDVYSYLGNLLSNVR QLSSNIADLLNNPDIYKIFTDVGITSSQEAIFLSIDAVIFNLLVSEIKIDNSQLKELLSLVGGHRNASSNNANNGRSLSQ GIRYKITFKISFAQNYFPVDEIIKLQQDANNMEYGVHGVHRTDIIALWSYISYASSKSKWLFKRYQSFAGLLFEIGAWGK CTSAERVFFTSMNRYSEKLPLKVYNFIRKITTGDFARKFSGMQSLYTYKQRVYDYVMHCVLRGGLGGECSDMTLREISNE LHKLKQEIYSNYDVFRDLGITNGQQEVLLLINVMMLNYAMSDLLVSTTQVNSMLADVRSSLSRTAHCLPYGTVSQLQRSV SHMKYGEYSNYRASVVALWACISCLASFNDDMEPLIKLMLEGD >Mature_1963_residues MKVWCYKNIGLYLIVLLSFVYPRALLHAKINIHVLRDYANVHYNTYYGLHFDNYYKPVDNTEGNLDSVMIRFASHDSYRY MSFMQYVKGQYQDVENLNVSGLDIPFNREDRTFDDHDVMFMQLSSYWGKVTFHSLPIGGCKVLYAGSIIYDPVSAIAFLE NENASSKVCICFVGKCNVKPERNSCDKKSIRCKKVTVAINPPPFCSILDASSIVSITPLRFSQQTFFRPGVRIHIYSGSG NPYTKELYVKSHKIGDKTSYNISHAGIPYEFQVYKAGYDTVCAEYSNNGEKGKKVCVPSPGLMRPKVTSNANGVNIQYQD CQGLSSCSVDMLPGTQDLDMYFSVIKPKIDFNNYTLLSRYECEDGKIVENENQCVNGIGQRLGYVHDNNSNVTCVVDMPF VPMKYSIKKNHRDLWLSMHDKMLLGYGVVVGKTDTGKDVERYVQCDQKFAIDIKSMTQEQLNKITRIRQDAFFDIGGHYN PKNAPCQDSMLYRYENNRLYEKGGQVSCKNMVELDYGTKKIKGCSSLYMSDDDFTYFFHENDELEKIVPLNPILQGMCVS NFPSYEYKKRVLVRKILPDSYKLGIDQKNTECDFLKIEAWGGGASGISRSGRSGKAGNYVMGLLRFDKNVVNKKLIIDIG DGGKGANSLSNSGGDTTVKLCDDDDKNCLVKIIAHGGDEGGNYLQDSSEGIDNLVHYRFAPGLQNSGESEILVPYQSPDM PYGKLRKGDKECLCDSNILEKNSNKYWGAGGCSSVYNCAQEGANGMVRITCEKWSGNVGKISLIDENACSDFLVTLIEKM HKSTSGIPNVVKEFLQKISKVSFCRQSKSFPNLISSMSKYFIAIDKILVGGDILGHNLSGLRKELFTELNNTEVKAMLAK LGINESPETLLLYLDVLNFNFGVNISNPPSGLLNYYVSDNEFDYDLSKHDEDYDKLSDNEAMMFNVTTEKPEQWFSVELK DPEFVRRYRNFINMIHRSVITDEEGHKKNNIVVSWMYTFFKSDRQLFELYAAPFVELMLGMDLNKFMKWGNCSDTHIRLF ESIGKYSERLPSQIQDFIKKIATGDFCNTFSKMELLNSYGVELSNYAIDCALKNTDKRCLESKWRSSLGSMAKKLQDAVD LNYEVFTDIGIASNRKEIALLIDAVMLNYVMSDLNVGNSDITSTLSLLDPISSQALDNFPYDTIVELRQDASNMKYGKYG DHRANIVTLWSYMAYNSFEWNIEDFKSFVKLLLAEDLTSVKIRKCNDNLRYLFDKLNKYKSKLPAVLQDFLDKISKESVC KKISRFAALETSLVKYEENLLNELRGGNLFYFSSLYDLNYAHRGKLSNIEKVYSHAANIWSDVGELSSNITNLLNNPEIY KIFTDAGITSSKEEISLAFDAVIFNSLVSEIKIDQKKLKNLLLLIYDNSLALNNIRLERSKGSGQIQQVTIDQNRYPGNG ILMLQQNANNMEYGNYGVHRADIIALWSYISYMSSESGWSIKKCESFVKLLLGIDLKFIDLKGCDNDVVDLFNKLNTYGD KLPLSLRDFLKKISEKNFCEKMSLFPELGIALMNYTNELRNVLRVGSVFQVDSVANIVNGRVSNINDVYSYLGNLLSNVR QLSSNIADLLNNPDIYKIFTDVGITSSQEAIFLSIDAVIFNLLVSEIKIDNSQLKELLSLVGGHRNASSNNANNGRSLSQ GIRYKITFKISFAQNYFPVDEIIKLQQDANNMEYGVHGVHRTDIIALWSYISYASSKSKWLFKRYQSFAGLLFEIGAWGK CTSAERVFFTSMNRYSEKLPLKVYNFIRKITTGDFARKFSGMQSLYTYKQRVYDYVMHCVLRGGLGGECSDMTLREISNE LHKLKQEIYSNYDVFRDLGITNGQQEVLLLINVMMLNYAMSDLLVSTTQVNSMLADVRSSLSRTAHCLPYGTVSQLQRSV SHMKYGEYSNYRASVVALWACISCLASFNDDMEPLIKLMLEGD
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 222641; Mature: 222641
Theoretical pI: Translated: 7.05; Mature: 7.05
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.3 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 5.0 %Cys+Met (Translated Protein) 2.3 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 5.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKVWCYKNIGLYLIVLLSFVYPRALLHAKINIHVLRDYANVHYNTYYGLHFDNYYKPVDN CEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEHHCCEEEEEEEEEECCCCCCCCC TEGNLDSVMIRFASHDSYRYMSFMQYVKGQYQDVENLNVSGLDIPFNREDRTFDDHDVMF CCCCHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHH MQLSSYWGKVTFHSLPIGGCKVLYAGSIIYDPVSAIAFLENENASSKVCICFVGKCNVKP HHHHHHCCEEEEEECCCCCEEEEEECCHHHCCHHHHEEEECCCCCCEEEEEEEECCCCCC ERNSCDKKSIRCKKVTVAINPPPFCSILDASSIVSITPLRFSQQTFFRPGVRIHIYSGSG CCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCEECCCCCCEEEECCCCCCCHHHCCCCEEEEEECCCC NPYTKELYVKSHKIGDKTSYNISHAGIPYEFQVYKAGYDTVCAEYSNNGEKGKKVCVPSP CCEEHEEEEEECCCCCCCCCCEEECCCCEEEEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCC GLMRPKVTSNANGVNIQYQDCQGLSSCSVDMLPGTQDLDMYFSVIKPKIDFNNYTLLSRY CCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEE ECEDGKIVENENQCVNGIGQRLGYVHDNNSNVTCVVDMPFVPMKYSIKKNHRDLWLSMHD ECCCCCEECCCHHHHHHHHHHCCEEEECCCCEEEEEECCCCCCEEEECCCCCCEEHHHHC KMLLGYGVVVGKTDTGKDVERYVQCDQKFAIDIKSMTQEQLNKITRIRQDAFFDIGGHYN 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