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The map label for this gene is rmuC [H]

Identifier: 78779075

GI number: 78779075

Start: 649863

End: 651461

Strand: Direct

Name: rmuC [H]

Synonym: PMT9312_0691

Alternate gene names: 78779075

Gene position: 649863-651461 (Clockwise)

Preceding gene: 78779073

Following gene: 78779077

Centisome position: 38.02

GC content: 32.4

Gene sequence:

>1599_bases
TTGGATAATATTCTTTTATTTATAACAGGTGTTTTGTCAGGAATTATTGCAGGGTTTATTCTTGGACGTTTATATACAAA
AAGTAATAGAAACAATGATGGAAGTAGAGAAAGTTTACTCGAAGAAAGATTATTAAAGGCAGATAAATCTATAGAAGATT
TTTCATTGGCATATGACAATCTAAGGGAAGAATTAAAAAATGTTCAAAAAGAGGCTCGAGAAAATAGCGAGAAGGCAAAA
GTTAAGGAAGTTGAACTCCAGAAAACTTTTGAAGAAAAAGTCAACCTAGATAATAATTACAAAGAAATTTCTGAAAAGTT
GGATTTAATAAGAATCCAAAAGGAAAAACTAAGTATAGAGAATGGAGAATTGACGGAACAATTGAAATCTCAGGAAGATG
AATCTTTGCGTTTAGATAAAGAAAAAAATAAATTAGAAGAGATACAAGAAATTAATATTGAAGAGAAAGAGAGATTGCGA
GTTGAGAGAGAAAATCTCAGCAATAAATTTGCTGAAATTAAGGAGCAATTGAGATCACAAGAAAGCCAAAATAAATTTTT
AGAACAAGCCAAAGCAGATCTCCTTACTCAGTTTCAAGCACTTAGTGGAAAAATGCTGGATGGATCAAGAAATGCTTTGC
TAAAGACGACAAAAGAAACAGTAACAGAGCCTTTTACAAAGCAAGTTGAGACACTCAGAAAACAAGTTGAAGAGCTTTCA
AAAGATTCTTCAGAAAAACTTGGTGTTTTAGCTCAAACTACATCTGAGTTAAAAGAAAAAAGTGAAGATGTTAGAGGTGC
TGCTCAACAATTAACAAGTGCCTTAAGATCTCCGAATGTTAAAGGTAGATGGGGAGAAGTTAACCTTAAACGGATTTTAG
AATTTGTAGGATTAATCAACTACTGTGATTTTGATGAGCAACTTAATATTCAAACTGAGGGAGGCGGTAGTCTCAAACCT
GATTGTGTGATTACTATTCCTGGCTCAAGAAAACTAATAGTTGATTCAAAAGCTCCAATTGAAAGCTATTTAGATGCTAT
ACAAGCGACCGATAGTAATATTCAGGAAAAACTCTTAACTGAGCATCTTAGGAAAGTCAGAAGTCATATTGACCAACTTT
CTAAAAAAGATTATGCAAATAATTTAAGTGAAATAGGACAGGTCGTTGATGGAGTAATTCTCTACATCCCAGTTGAGGGT
GCATTATCTATGGCATTAGAGAGAGATCCATCTCTTCTAGAGTATGCTTTTGAAAAAAATATTATTCTTACTTTCCCTAC
AAGTCTCCTTGCAATATTAAAAGGCTTGTCAATGACGATTCAACAGGCGGAAATTACGAAGAATATTAATGAAATTCAGA
AGAACGCTATTGAACTCTCTAAGAGATTCTCAAATTTTATTGAAAAGTTTAATTCAATAGGTTCAAATATTACTAGGTTA
AATAAATCATTTAATGAGGCTGTTGGTTCTTTCGAAAGAAGACTAATGCCACAAGGTAAACGTTTTGCAGAAATGTCAGG
GCAAAATGCTGAATTGAATCTTACTGAAGAAGTTGATATCCTCGTAAAGGAATTAAAAACTTCAGATCAAAATAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAGAAACAGATCTCTTCTAATAAAAAATTTAATTTAAGTAAAAAATTATACTCTAAAAAATAATTACCACTATTATCTTA
TTTAATAGCTTTAAAGTATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATTAAAAAGTTTAATCTTTAATAACTTTTTCCTTTAAGCTAATTCTTCATCCACATATAGCACATTAGCAAAGGCAGCT
TGAAGTCCTGAATAATCATT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 532; Mature: 532

Protein sequence:

>532_residues
MDNILLFITGVLSGIIAGFILGRLYTKSNRNNDGSRESLLEERLLKADKSIEDFSLAYDNLREELKNVQKEARENSEKAK
VKEVELQKTFEEKVNLDNNYKEISEKLDLIRIQKEKLSIENGELTEQLKSQEDESLRLDKEKNKLEEIQEINIEEKERLR
VERENLSNKFAEIKEQLRSQESQNKFLEQAKADLLTQFQALSGKMLDGSRNALLKTTKETVTEPFTKQVETLRKQVEELS
KDSSEKLGVLAQTTSELKEKSEDVRGAAQQLTSALRSPNVKGRWGEVNLKRILEFVGLINYCDFDEQLNIQTEGGGSLKP
DCVITIPGSRKLIVDSKAPIESYLDAIQATDSNIQEKLLTEHLRKVRSHIDQLSKKDYANNLSEIGQVVDGVILYIPVEG
ALSMALERDPSLLEYAFEKNIILTFPTSLLAILKGLSMTIQQAEITKNINEIQKNAIELSKRFSNFIEKFNSIGSNITRL
NKSFNEAVGSFERRLMPQGKRFAEMSGQNAELNLTEEVDILVKELKTSDQNK

Sequences:

>Translated_532_residues
MDNILLFITGVLSGIIAGFILGRLYTKSNRNNDGSRESLLEERLLKADKSIEDFSLAYDNLREELKNVQKEARENSEKAK
VKEVELQKTFEEKVNLDNNYKEISEKLDLIRIQKEKLSIENGELTEQLKSQEDESLRLDKEKNKLEEIQEINIEEKERLR
VERENLSNKFAEIKEQLRSQESQNKFLEQAKADLLTQFQALSGKMLDGSRNALLKTTKETVTEPFTKQVETLRKQVEELS
KDSSEKLGVLAQTTSELKEKSEDVRGAAQQLTSALRSPNVKGRWGEVNLKRILEFVGLINYCDFDEQLNIQTEGGGSLKP
DCVITIPGSRKLIVDSKAPIESYLDAIQATDSNIQEKLLTEHLRKVRSHIDQLSKKDYANNLSEIGQVVDGVILYIPVEG
ALSMALERDPSLLEYAFEKNIILTFPTSLLAILKGLSMTIQQAEITKNINEIQKNAIELSKRFSNFIEKFNSIGSNITRL
NKSFNEAVGSFERRLMPQGKRFAEMSGQNAELNLTEEVDILVKELKTSDQNK
>Mature_532_residues
MDNILLFITGVLSGIIAGFILGRLYTKSNRNNDGSRESLLEERLLKADKSIEDFSLAYDNLREELKNVQKEARENSEKAK
VKEVELQKTFEEKVNLDNNYKEISEKLDLIRIQKEKLSIENGELTEQLKSQEDESLRLDKEKNKLEEIQEINIEEKERLR
VERENLSNKFAEIKEQLRSQESQNKFLEQAKADLLTQFQALSGKMLDGSRNALLKTTKETVTEPFTKQVETLRKQVEELS
KDSSEKLGVLAQTTSELKEKSEDVRGAAQQLTSALRSPNVKGRWGEVNLKRILEFVGLINYCDFDEQLNIQTEGGGSLKP
DCVITIPGSRKLIVDSKAPIESYLDAIQATDSNIQEKLLTEHLRKVRSHIDQLSKKDYANNLSEIGQVVDGVILYIPVEG
ALSMALERDPSLLEYAFEKNIILTFPTSLLAILKGLSMTIQQAEITKNINEIQKNAIELSKRFSNFIEKFNSIGSNITRL
NKSFNEAVGSFERRLMPQGKRFAEMSGQNAELNLTEEVDILVKELKTSDQNK

Specific function: Involved in DNA recombination [H]

COG id: COG1322

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the rmuC family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790266, Length=296, Percent_Identity=27.3648648648649, Blast_Score=141, Evalue=8e-35,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003798 [H]

Pfam domain/function: PF02646 RmuC [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 60511; Mature: 60511

Theoretical pI: Translated: 4.96; Mature: 4.96

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
1.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDNILLFITGVLSGIIAGFILGRLYTKSNRNNDGSRESLLEERLLKADKSIEDFSLAYDN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
LREELKNVQKEARENSEKAKVKEVELQKTFEEKVNLDNNYKEISEKLDLIRIQKEKLSIE
HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NGELTEQLKSQEDESLRLDKEKNKLEEIQEINIEEKERLRVERENLSNKFAEIKEQLRSQ
CCHHHHHHHCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ESQNKFLEQAKADLLTQFQALSGKMLDGSRNALLKTTKETVTEPFTKQVETLRKQVEELS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KDSSEKLGVLAQTTSELKEKSEDVRGAAQQLTSALRSPNVKGRWGEVNLKRILEFVGLIN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
YCDFDEQLNIQTEGGGSLKPDCVITIPGSRKLIVDSKAPIESYLDAIQATDSNIQEKLLT
HCCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEEECCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
EHLRKVRSHIDQLSKKDYANNLSEIGQVVDGVILYIPVEGALSMALERDPSLLEYAFEKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCC
IILTFPTSLLAILKGLSMTIQQAEITKNINEIQKNAIELSKRFSNFIEKFNSIGSNITRL
EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NKSFNEAVGSFERRLMPQGKRFAEMSGQNAELNLTEEVDILVKELKTSDQNK
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MDNILLFITGVLSGIIAGFILGRLYTKSNRNNDGSRESLLEERLLKADKSIEDFSLAYDN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
LREELKNVQKEARENSEKAKVKEVELQKTFEEKVNLDNNYKEISEKLDLIRIQKEKLSIE
HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NGELTEQLKSQEDESLRLDKEKNKLEEIQEINIEEKERLRVERENLSNKFAEIKEQLRSQ
CCHHHHHHHCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ESQNKFLEQAKADLLTQFQALSGKMLDGSRNALLKTTKETVTEPFTKQVETLRKQVEELS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KDSSEKLGVLAQTTSELKEKSEDVRGAAQQLTSALRSPNVKGRWGEVNLKRILEFVGLIN
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
YCDFDEQLNIQTEGGGSLKPDCVITIPGSRKLIVDSKAPIESYLDAIQATDSNIQEKLLT
HCCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEEECCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
EHLRKVRSHIDQLSKKDYANNLSEIGQVVDGVILYIPVEGALSMALERDPSLLEYAFEKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCC
IILTFPTSLLAILKGLSMTIQQAEITKNINEIQKNAIELSKRFSNFIEKFNSIGSNITRL
EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NKSFNEAVGSFERRLMPQGKRFAEMSGQNAELNLTEEVDILVKELKTSDQNK
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA