| Definition | Prochlorococcus marinus str. MIT 9312, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007577 |
| Length | 1,709,204 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 78779013
Identifier: 78779013
GI number: 78779013
Start: 592523
End: 593908
Strand: Direct
Name: 78779013
Synonym: PMT9312_0628
Alternate gene names: NA
Gene position: 592523-593908 (Clockwise)
Preceding gene: 78779012
Following gene: 78779014
Centisome position: 34.67
GC content: 31.75
Gene sequence:
>1386_bases ATGTTTTTGAAGTCATTGAATATTTTTTCTATACAGTATAAAGATGTTTCTTCAAATTCTCTCTTAATAAGTTGTGTTGG AATTTTAATTATATTTTTTTTCTTAATTTTTGGGAGGAGATTTAAGCTTGCAGTTCAACTTGAGAGGTTTGGATTGCCAA TTGCAGTTATATCAGGAATTTTAGGTATATCTGTAGGTCCATTCGGAGCGATTCACTTTCTGCCAAAAGAAACAATCAAT GTTTGGAGTAATTTTCCTACTCCTCTTTTATCATTGGTCTTCGCAACTTTAATGATGGGCAGACCCATCCCAAATGTAAA TGGTTTGGTTAAACCAATATTTAATCAGTTTTTGCTTGCTCTTTCTCTAGGTTTCGGACAATTTTTCGTTGGTGGTCTAG TTGTTAAATATTTTTTGCCTCCAACTATGGATACTAATCCTCTAATGGGATGTTTGATTGAGGTTGGTTTTGAAGGAGGT CATGGAGCTGCATCTATCATCGGTGAGAGTTTTAACAGACTAGGTTTCCCAGATGGTTTAGATCTTGGTCTGGCTATGGC AACAATGGGTCTTTTATCATCTTCAATATTGGGCAGCATATTTATTTTTCTTGGGAGAACTTTAGGTCTTTCAGATACTG AGGAAATTCTTGAAAAAAAAGATAATCTAAACGTTAATACTAAAATAGGAATGTTTGCGGATCTAAGAATTTTGATAATA AATCTTGGATTCTCCGGTCTGGCAATTTCTTTTGGTGTTTTGTTACTTAAATCTTTAAGATATATCTCAAGTTCTTTTGG AGACTTTTCTAAAGAAATTATCTTTTCACTCCCAGTATTCCCATTTATTCTTATAGGCTCACTCGTTATTAGATATATCT TAGAAAAAACTAAGAATACAGAATTTATTTCAAATATTTTGCAAAGAGAGATTGGTATTTTATCTACAGATCTATTGATT TTTACAGCCATGGCAAGTTTAGATATTGCTGTTGTTTTTGAAAATTGGATAATAATTATAGTTTTTACTATCTTCGGGTT ATTTTGGAATTTGATTTGTATTGCTTATTTTGCATACTTTATATTTGACGATTACTGGTTTGAAAAAAGTTTGATAGAGT TTGGCAATTCTACAGGTGTAGTAGCTTCTGGATTACTTCTTTTAAGGCTTGCAGATCCCAAAAATATATCTAGGACTTTA CCAATTTTTACATCAAAACAGCTATTCGCACAGTTAATTCTATCAGGGGGATTATTTACAGTTCTGGCACCATTAATGAT TTCTAAAATCGGAATAGATTATTGGACAGAAATTTGTGGTGTAACTACATTCGTAATTCTTCTTATCGCATTGATTTTTA ATAAAGGAGAGATGAAAAAAATCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAAATATTATTATATTTAGCAACTAAATATAAAGGTCTCAATTTTATTGAGGCCTTTTTTATTTGAAAAAATTTGGTTAT TAATTTAGATTTATAATTAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TAATATACTTAGAATGGGTTTAGTTTAATTTTATTTTAATGTCATTTACTCCCTACGATATTCCACCTCAAGAAAATAAA GGGAAGTGGTTCAGGAGTCA
Product: sodium/solute symporter family protein
Products: NA
Alternate protein names: Na+/Glutamate Symporter; Sodium/Solute Symporter Family Protein; Sodium/Glutamate Symporter Superfamily; SodiumSolute Symporter ESS Family; Sodium/Glutamate Symport Carrier Protein
Number of amino acids: Translated: 461; Mature: 461
Protein sequence:
>461_residues MFLKSLNIFSIQYKDVSSNSLLISCVGILIIFFFLIFGRRFKLAVQLERFGLPIAVISGILGISVGPFGAIHFLPKETIN VWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNVNGLVKPIFNQFLLALSLGFGQFFVGGLVVKYFLPPTMDTNPLMGCLIEVGFEGG HGAASIIGESFNRLGFPDGLDLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFLGRTLGLSDTEEILEKKDNLNVNTKIGMFADLRILII NLGFSGLAISFGVLLLKSLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLVIRYILEKTKNTEFISNILQREIGILSTDLLI FTAMASLDIAVVFENWIIIIVFTIFGLFWNLICIAYFAYFIFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISRTL PIFTSKQLFAQLILSGGLFTVLAPLMISKIGIDYWTEICGVTTFVILLIALIFNKGEMKKI
Sequences:
>Translated_461_residues MFLKSLNIFSIQYKDVSSNSLLISCVGILIIFFFLIFGRRFKLAVQLERFGLPIAVISGILGISVGPFGAIHFLPKETIN VWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNVNGLVKPIFNQFLLALSLGFGQFFVGGLVVKYFLPPTMDTNPLMGCLIEVGFEGG HGAASIIGESFNRLGFPDGLDLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFLGRTLGLSDTEEILEKKDNLNVNTKIGMFADLRILII NLGFSGLAISFGVLLLKSLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLVIRYILEKTKNTEFISNILQREIGILSTDLLI FTAMASLDIAVVFENWIIIIVFTIFGLFWNLICIAYFAYFIFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISRTL PIFTSKQLFAQLILSGGLFTVLAPLMISKIGIDYWTEICGVTTFVILLIALIFNKGEMKKI >Mature_461_residues MFLKSLNIFSIQYKDVSSNSLLISCVGILIIFFFLIFGRRFKLAVQLERFGLPIAVISGILGISVGPFGAIHFLPKETIN VWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNVNGLVKPIFNQFLLALSLGFGQFFVGGLVVKYFLPPTMDTNPLMGCLIEVGFEGG HGAASIIGESFNRLGFPDGLDLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFLGRTLGLSDTEEILEKKDNLNVNTKIGMFADLRILII NLGFSGLAISFGVLLLKSLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLVIRYILEKTKNTEFISNILQREIGILSTDLLI FTAMASLDIAVVFENWIIIIVFTIFGLFWNLICIAYFAYFIFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISRTL PIFTSKQLFAQLILSGGLFTVLAPLMISKIGIDYWTEICGVTTFVILLIALIFNKGEMKKI
Specific function: Unknown
COG id: COG0786
COG function: function code E; Na+/glutamate symporter
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 50913; Mature: 50913
Theoretical pI: Translated: 7.92; Mature: 7.92
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFLKSLNIFSIQYKDVSSNSLLISCVGILIIFFFLIFGRRFKLAVQLERFGLPIAVISGI CCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEEHHHHCCCHHHHHHH LGISVGPFGAIHFLPKETINVWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNVNGLVKPIFNQFLLA HHCCCCCCHHEEECCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH LSLGFGQFFVGGLVVKYFLPPTMDTNPLMGCLIEVGFEGGHGAASIIGESFNRLGFPDGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC DLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFLGRTLGLSDTEEILEKKDNLNVNTKIGMFADLRILII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEECCHHHHEEEEEE NLGFSGLAISFGVLLLKSLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLVIRYILEKTKNT ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH EFISNILQREIGILSTDLLIFTAMASLDIAVVFENWIIIIVFTIFGLFWNLICIAYFAYF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISRTLPIFTSKQLFAQLILSGGLFT HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHH VLAPLMISKIGIDYWTEICGVTTFVILLIALIFNKGEMKKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MFLKSLNIFSIQYKDVSSNSLLISCVGILIIFFFLIFGRRFKLAVQLERFGLPIAVISGI CCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEEHHHHCCCHHHHHHH LGISVGPFGAIHFLPKETINVWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNVNGLVKPIFNQFLLA HHCCCCCCHHEEECCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH LSLGFGQFFVGGLVVKYFLPPTMDTNPLMGCLIEVGFEGGHGAASIIGESFNRLGFPDGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC DLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFLGRTLGLSDTEEILEKKDNLNVNTKIGMFADLRILII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEECCHHHHEEEEEE NLGFSGLAISFGVLLLKSLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLVIRYILEKTKNT ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH EFISNILQREIGILSTDLLIFTAMASLDIAVVFENWIIIIVFTIFGLFWNLICIAYFAYF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISRTLPIFTSKQLFAQLILSGGLFT HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHH VLAPLMISKIGIDYWTEICGVTTFVILLIALIFNKGEMKKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA