Definition Prochlorococcus marinus str. MIT 9312, complete genome.
Accession NC_007577
Length 1,709,204

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The map label for this gene is 78779013

Identifier: 78779013

GI number: 78779013

Start: 592523

End: 593908

Strand: Direct

Name: 78779013

Synonym: PMT9312_0628

Alternate gene names: NA

Gene position: 592523-593908 (Clockwise)

Preceding gene: 78779012

Following gene: 78779014

Centisome position: 34.67

GC content: 31.75

Gene sequence:

>1386_bases
ATGTTTTTGAAGTCATTGAATATTTTTTCTATACAGTATAAAGATGTTTCTTCAAATTCTCTCTTAATAAGTTGTGTTGG
AATTTTAATTATATTTTTTTTCTTAATTTTTGGGAGGAGATTTAAGCTTGCAGTTCAACTTGAGAGGTTTGGATTGCCAA
TTGCAGTTATATCAGGAATTTTAGGTATATCTGTAGGTCCATTCGGAGCGATTCACTTTCTGCCAAAAGAAACAATCAAT
GTTTGGAGTAATTTTCCTACTCCTCTTTTATCATTGGTCTTCGCAACTTTAATGATGGGCAGACCCATCCCAAATGTAAA
TGGTTTGGTTAAACCAATATTTAATCAGTTTTTGCTTGCTCTTTCTCTAGGTTTCGGACAATTTTTCGTTGGTGGTCTAG
TTGTTAAATATTTTTTGCCTCCAACTATGGATACTAATCCTCTAATGGGATGTTTGATTGAGGTTGGTTTTGAAGGAGGT
CATGGAGCTGCATCTATCATCGGTGAGAGTTTTAACAGACTAGGTTTCCCAGATGGTTTAGATCTTGGTCTGGCTATGGC
AACAATGGGTCTTTTATCATCTTCAATATTGGGCAGCATATTTATTTTTCTTGGGAGAACTTTAGGTCTTTCAGATACTG
AGGAAATTCTTGAAAAAAAAGATAATCTAAACGTTAATACTAAAATAGGAATGTTTGCGGATCTAAGAATTTTGATAATA
AATCTTGGATTCTCCGGTCTGGCAATTTCTTTTGGTGTTTTGTTACTTAAATCTTTAAGATATATCTCAAGTTCTTTTGG
AGACTTTTCTAAAGAAATTATCTTTTCACTCCCAGTATTCCCATTTATTCTTATAGGCTCACTCGTTATTAGATATATCT
TAGAAAAAACTAAGAATACAGAATTTATTTCAAATATTTTGCAAAGAGAGATTGGTATTTTATCTACAGATCTATTGATT
TTTACAGCCATGGCAAGTTTAGATATTGCTGTTGTTTTTGAAAATTGGATAATAATTATAGTTTTTACTATCTTCGGGTT
ATTTTGGAATTTGATTTGTATTGCTTATTTTGCATACTTTATATTTGACGATTACTGGTTTGAAAAAAGTTTGATAGAGT
TTGGCAATTCTACAGGTGTAGTAGCTTCTGGATTACTTCTTTTAAGGCTTGCAGATCCCAAAAATATATCTAGGACTTTA
CCAATTTTTACATCAAAACAGCTATTCGCACAGTTAATTCTATCAGGGGGATTATTTACAGTTCTGGCACCATTAATGAT
TTCTAAAATCGGAATAGATTATTGGACAGAAATTTGTGGTGTAACTACATTCGTAATTCTTCTTATCGCATTGATTTTTA
ATAAAGGAGAGATGAAAAAAATCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAATATTATTATATTTAGCAACTAAATATAAAGGTCTCAATTTTATTGAGGCCTTTTTTATTTGAAAAAATTTGGTTAT
TAATTTAGATTTATAATTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAATATACTTAGAATGGGTTTAGTTTAATTTTATTTTAATGTCATTTACTCCCTACGATATTCCACCTCAAGAAAATAAA
GGGAAGTGGTTCAGGAGTCA

Product: sodium/solute symporter family protein

Products: NA

Alternate protein names: Na+/Glutamate Symporter; Sodium/Solute Symporter Family Protein; Sodium/Glutamate Symporter Superfamily; SodiumSolute Symporter ESS Family; Sodium/Glutamate Symport Carrier Protein

Number of amino acids: Translated: 461; Mature: 461

Protein sequence:

>461_residues
MFLKSLNIFSIQYKDVSSNSLLISCVGILIIFFFLIFGRRFKLAVQLERFGLPIAVISGILGISVGPFGAIHFLPKETIN
VWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNVNGLVKPIFNQFLLALSLGFGQFFVGGLVVKYFLPPTMDTNPLMGCLIEVGFEGG
HGAASIIGESFNRLGFPDGLDLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFLGRTLGLSDTEEILEKKDNLNVNTKIGMFADLRILII
NLGFSGLAISFGVLLLKSLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLVIRYILEKTKNTEFISNILQREIGILSTDLLI
FTAMASLDIAVVFENWIIIIVFTIFGLFWNLICIAYFAYFIFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISRTL
PIFTSKQLFAQLILSGGLFTVLAPLMISKIGIDYWTEICGVTTFVILLIALIFNKGEMKKI

Sequences:

>Translated_461_residues
MFLKSLNIFSIQYKDVSSNSLLISCVGILIIFFFLIFGRRFKLAVQLERFGLPIAVISGILGISVGPFGAIHFLPKETIN
VWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNVNGLVKPIFNQFLLALSLGFGQFFVGGLVVKYFLPPTMDTNPLMGCLIEVGFEGG
HGAASIIGESFNRLGFPDGLDLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFLGRTLGLSDTEEILEKKDNLNVNTKIGMFADLRILII
NLGFSGLAISFGVLLLKSLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLVIRYILEKTKNTEFISNILQREIGILSTDLLI
FTAMASLDIAVVFENWIIIIVFTIFGLFWNLICIAYFAYFIFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISRTL
PIFTSKQLFAQLILSGGLFTVLAPLMISKIGIDYWTEICGVTTFVILLIALIFNKGEMKKI
>Mature_461_residues
MFLKSLNIFSIQYKDVSSNSLLISCVGILIIFFFLIFGRRFKLAVQLERFGLPIAVISGILGISVGPFGAIHFLPKETIN
VWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNVNGLVKPIFNQFLLALSLGFGQFFVGGLVVKYFLPPTMDTNPLMGCLIEVGFEGG
HGAASIIGESFNRLGFPDGLDLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFLGRTLGLSDTEEILEKKDNLNVNTKIGMFADLRILII
NLGFSGLAISFGVLLLKSLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLVIRYILEKTKNTEFISNILQREIGILSTDLLI
FTAMASLDIAVVFENWIIIIVFTIFGLFWNLICIAYFAYFIFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISRTL
PIFTSKQLFAQLILSGGLFTVLAPLMISKIGIDYWTEICGVTTFVILLIALIFNKGEMKKI

Specific function: Unknown

COG id: COG0786

COG function: function code E; Na+/glutamate symporter

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50913; Mature: 50913

Theoretical pI: Translated: 7.92; Mature: 7.92

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFLKSLNIFSIQYKDVSSNSLLISCVGILIIFFFLIFGRRFKLAVQLERFGLPIAVISGI
CCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEEHHHHCCCHHHHHHH
LGISVGPFGAIHFLPKETINVWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNVNGLVKPIFNQFLLA
HHCCCCCCHHEEECCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LSLGFGQFFVGGLVVKYFLPPTMDTNPLMGCLIEVGFEGGHGAASIIGESFNRLGFPDGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
DLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFLGRTLGLSDTEEILEKKDNLNVNTKIGMFADLRILII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEECCHHHHEEEEEE
NLGFSGLAISFGVLLLKSLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLVIRYILEKTKNT
ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
EFISNILQREIGILSTDLLIFTAMASLDIAVVFENWIIIIVFTIFGLFWNLICIAYFAYF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISRTLPIFTSKQLFAQLILSGGLFT
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHH
VLAPLMISKIGIDYWTEICGVTTFVILLIALIFNKGEMKKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFLKSLNIFSIQYKDVSSNSLLISCVGILIIFFFLIFGRRFKLAVQLERFGLPIAVISGI
CCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEEHHHHCCCHHHHHHH
LGISVGPFGAIHFLPKETINVWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNVNGLVKPIFNQFLLA
HHCCCCCCHHEEECCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LSLGFGQFFVGGLVVKYFLPPTMDTNPLMGCLIEVGFEGGHGAASIIGESFNRLGFPDGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
DLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFLGRTLGLSDTEEILEKKDNLNVNTKIGMFADLRILII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEECCHHHHEEEEEE
NLGFSGLAISFGVLLLKSLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLVIRYILEKTKNT
ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
EFISNILQREIGILSTDLLIFTAMASLDIAVVFENWIIIIVFTIFGLFWNLICIAYFAYF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISRTLPIFTSKQLFAQLILSGGLFT
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHH
VLAPLMISKIGIDYWTEICGVTTFVILLIALIFNKGEMKKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA