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The map label for this gene is ktrB [H]

Identifier: 78778472

GI number: 78778472

Start: 91515

End: 92918

Strand: Direct

Name: ktrB [H]

Synonym: PMT9312_0087

Alternate gene names: 78778472

Gene position: 91515-92918 (Clockwise)

Preceding gene: 78778471

Following gene: 78778473

Centisome position: 5.35

GC content: 32.34

Gene sequence:

>1404_bases
GTGAAATTCACAAGTAATGTTTATAAGTTAAAAGATGCTTACAGAAAACTATCTGTACCTCAATTTACTATTGTTACGGG
ATTGTTTATTATTTTTTTTGGAACTTTGATTTTGAGTTCTCCATTATGTTCATCTTCAAATGTTGGTTTGTGGGAAGCAT
TTTTTACATCTACTTCTGCTATAACAGTTACTGGATTAACCATAATAGATATTGGTGTTGATTTAAATTTCTTTGGCCAA
GTATTCTTGGCTTTTATGCTTTTATCAGGTGGTCTAGGATTAATGGCTATTACGACATTTTTACAAGGTTTTGTTGTAAA
GGGCACAAAGTTAAAAACTAGATTAGATAAAGGAAAGACTCTAGATGAATTTGGAGTTGGAGGAATTGGTCGAACTTTTC
AAAGTATTGCTATCACTGCAACTTGTATCATATCTTTTGGCGCAATTGTCTTATATTCTTTTGGATTTGTAGATATTCAA
AATAATTGGGAAAGACTTTGGTCTTCTATCTTTCACAGCATATCTGCATATAACAATGCAGGTTTTTCTTTATGGTCTAA
TAGTCTCCAAGACTATAGAACAAATTTTTTGGTTAATATTGTGTTTATTTTTCTCATTGTCATGGGTGGACTGGGATGGA
GGGTTATTGATGATATTTGGAGTAATAAAAAAAATCTTTCATATAAAAAATTGAGCCTTCATTCCAGATTAGTTATTAGG
ACAACTTTGTCTCTAATATTATTCGGATCATTAGGATTCTTTCTCACTGAATCATTGCTAAATAGTCAATTTTTTAATGA
TTTGAATTTGTTTGAAAGGTTATTATCATCAATCTTTGAAACAGTGAGTGCAAGAACCGCAGGCTTTACAAATTATCCGA
TCTCCTTGAACTCTATCTCAGATACTGGTCTATTATTATTAATGACGCTTATGTTTATTGGAGCAAGCACTGGAGGTACT
GGTGGAGGGATAAAAACAACTACATTTATTGCTTTAATGGCTGCAACTAGATCAACTTTAAGAGGTCAGAAAGATGTAAT
TATTAGCAATAGATTAATTTCAGATAAAGTTATTCTAAAGGCAGTTGGAATCACTGTTGGTTCTTTGCTTTTCGTTCTTT
TAATGGCAATGCTGCTCAGTACAACTAATACGTTTGTTAAAAAAGAATCTTTCACATTCCTAGAAATTTTGTTCACTTGC
ATATCTGCATTTGCAACAGTTGGCTTTGATATTGGTTTAACTGCAAAATTAAATCATTTTGGCCAATTTATTCTTATTGT
CGGTATGTTTGTGGGCAGACTTGGTATCCTTTTGCTACTAAGTGCACTTTGGCAGGCTCTTTACAAGAGTAGAATAGATA
GACAAAAGAGAATTGGCTATCCTAGGGCTGATCTTTATGTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATATAGATTTTTTGACATCGCAAAATACGGAGCTGGATTAACACTTATAATGTCTTTTACAGTGCCAGCATTGATAATT
TTAAATTTCAGATAAATAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATTGACTGAGTTTTATTATGGCTGATTGGTGGCAGTGGTCTCAAAAGAAAGAAAATGAAGCCCTCACTTTTGCAGTTGT
TGGCGTTGGAAGATTTGGAA

Product: Trk family sodium transporter

Products: Proton [Cytoplasm]; K (I) [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: K(+)-uptake protein ktrB [H]

Number of amino acids: Translated: 467; Mature: 467

Protein sequence:

>467_residues
MKFTSNVYKLKDAYRKLSVPQFTIVTGLFIIFFGTLILSSPLCSSSNVGLWEAFFTSTSAITVTGLTIIDIGVDLNFFGQ
VFLAFMLLSGGLGLMAITTFLQGFVVKGTKLKTRLDKGKTLDEFGVGGIGRTFQSIAITATCIISFGAIVLYSFGFVDIQ
NNWERLWSSIFHSISAYNNAGFSLWSNSLQDYRTNFLVNIVFIFLIVMGGLGWRVIDDIWSNKKNLSYKKLSLHSRLVIR
TTLSLILFGSLGFFLTESLLNSQFFNDLNLFERLLSSIFETVSARTAGFTNYPISLNSISDTGLLLLMTLMFIGASTGGT
GGGIKTTTFIALMAATRSTLRGQKDVIISNRLISDKVILKAVGITVGSLLFVLLMAMLLSTTNTFVKKESFTFLEILFTC
ISAFATVGFDIGLTAKLNHFGQFILIVGMFVGRLGILLLLSALWQALYKSRIDRQKRIGYPRADLYV

Sequences:

>Translated_467_residues
MKFTSNVYKLKDAYRKLSVPQFTIVTGLFIIFFGTLILSSPLCSSSNVGLWEAFFTSTSAITVTGLTIIDIGVDLNFFGQ
VFLAFMLLSGGLGLMAITTFLQGFVVKGTKLKTRLDKGKTLDEFGVGGIGRTFQSIAITATCIISFGAIVLYSFGFVDIQ
NNWERLWSSIFHSISAYNNAGFSLWSNSLQDYRTNFLVNIVFIFLIVMGGLGWRVIDDIWSNKKNLSYKKLSLHSRLVIR
TTLSLILFGSLGFFLTESLLNSQFFNDLNLFERLLSSIFETVSARTAGFTNYPISLNSISDTGLLLLMTLMFIGASTGGT
GGGIKTTTFIALMAATRSTLRGQKDVIISNRLISDKVILKAVGITVGSLLFVLLMAMLLSTTNTFVKKESFTFLEILFTC
ISAFATVGFDIGLTAKLNHFGQFILIVGMFVGRLGILLLLSALWQALYKSRIDRQKRIGYPRADLYV
>Mature_467_residues
MKFTSNVYKLKDAYRKLSVPQFTIVTGLFIIFFGTLILSSPLCSSSNVGLWEAFFTSTSAITVTGLTIIDIGVDLNFFGQ
VFLAFMLLSGGLGLMAITTFLQGFVVKGTKLKTRLDKGKTLDEFGVGGIGRTFQSIAITATCIISFGAIVLYSFGFVDIQ
NNWERLWSSIFHSISAYNNAGFSLWSNSLQDYRTNFLVNIVFIFLIVMGGLGWRVIDDIWSNKKNLSYKKLSLHSRLVIR
TTLSLILFGSLGFFLTESLLNSQFFNDLNLFERLLSSIFETVSARTAGFTNYPISLNSISDTGLLLLMTLMFIGASTGGT
GGGIKTTTFIALMAATRSTLRGQKDVIISNRLISDKVILKAVGITVGSLLFVLLMAMLLSTTNTFVKKESFTFLEILFTC
ISAFATVGFDIGLTAKLNHFGQFILIVGMFVGRLGILLLLSALWQALYKSRIDRQKRIGYPRADLYV

Specific function: Integral membrane subunit of the KtrAB potassium uptake transporter. The 2 major potassium transporter complexes KtrAB and KtrCD confer resistance to both suddenly imposed and prolonged osmotic stress [H]

COG id: COG0168

COG function: function code P; Trk-type K+ transport systems, membrane components

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the trkH potassium transport family. Ktr (TC 2.A.38.4) subfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003445
- InterPro:   IPR004772 [H]

Pfam domain/function: PF02386 TrkH [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51542; Mature: 51542

Theoretical pI: Translated: 10.34; Mature: 10.34

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKFTSNVYKLKDAYRKLSVPQFTIVTGLFIIFFGTLILSSPLCSSSNVGLWEAFFTSTSA
CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCE
ITVTGLTIIDIGVDLNFFGQVFLAFMLLSGGLGLMAITTFLQGFVVKGTKLKTRLDKGKT
EEEECEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCC
LDEFGVGGIGRTFQSIAITATCIISFGAIVLYSFGFVDIQNNWERLWSSIFHSISAYNNA
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
GFSLWSNSLQDYRTNFLVNIVFIFLIVMGGLGWRVIDDIWSNKKNLSYKKLSLHSRLVIR
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
TTLSLILFGSLGFFLTESLLNSQFFNDLNLFERLLSSIFETVSARTAGFTNYPISLNSIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCC
DTGLLLLMTLMFIGASTGGTGGGIKTTTFIALMAATRSTLRGQKDVIISNRLISDKVILK
CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHH
AVGITVGSLLFVLLMAMLLSTTNTFVKKESFTFLEILFTCISAFATVGFDIGLTAKLNHF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH
GQFILIVGMFVGRLGILLLLSALWQALYKSRIDRQKRIGYPRADLYV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKFTSNVYKLKDAYRKLSVPQFTIVTGLFIIFFGTLILSSPLCSSSNVGLWEAFFTSTSA
CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCE
ITVTGLTIIDIGVDLNFFGQVFLAFMLLSGGLGLMAITTFLQGFVVKGTKLKTRLDKGKT
EEEECEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCC
LDEFGVGGIGRTFQSIAITATCIISFGAIVLYSFGFVDIQNNWERLWSSIFHSISAYNNA
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
GFSLWSNSLQDYRTNFLVNIVFIFLIVMGGLGWRVIDDIWSNKKNLSYKKLSLHSRLVIR
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
TTLSLILFGSLGFFLTESLLNSQFFNDLNLFERLLSSIFETVSARTAGFTNYPISLNSIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCC
DTGLLLLMTLMFIGASTGGTGGGIKTTTFIALMAATRSTLRGQKDVIISNRLISDKVILK
CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHH
AVGITVGSLLFVLLMAMLLSTTNTFVKKESFTFLEILFTCISAFATVGFDIGLTAKLNHF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH
GQFILIVGMFVGRLGILLLLSALWQALYKSRIDRQKRIGYPRADLYV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton [Periplasm]; K (I) [Periplasm] [C]

Specific reaction: Proton [Periplasm] + K (I) [Periplasm] = Proton [Cytoplasm] + K (I) [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]