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The map label for this gene is proB

Identifier: 71911185

GI number: 71911185

Start: 1342071

End: 1343699

Strand: Reverse

Name: proB

Synonym: M5005_Spy_1372

Alternate gene names: NA

Gene position: 1343699-1342071 (Counterclockwise)

Preceding gene: 71911186

Following gene: 71911184

Centisome position: 73.08

GC content: 37.45

Gene sequence:

>1629_bases
ATGAATTGGTCTACTATTTGGGAACTTATCAAGATAAACATTCTTTATTCCAATCCACAAAGTTTAGCTAACCTCAAAAA
GCGTCAGGAAAAACACCCGAAAGAAAACTTCAAAGCCTATAAAAGCATGATAAGGCAACAGGCCTTAATGATTGCCATGT
TTTTGGTGATTTACCTTTTTATGTTTATTGGTGTCGATTTCAGTCATTATCCAGGACTTTTCTCCTTTGACGTTGCTATG
TTTTTTATCATGTCAACCTTGACAGCCTTTAGCTCTCTTTACACCATTTTTTATGAAAGTAATGACCTAAAACTTTATAT
TCACTTACCAGTAACGTCAGAAGAACTCTATATTGCAAAAATTGTCTCGTCGCTAGGGATGGGTGCTGTCTTTTTGATGC
CTCTTATCTCTCTTCTCTTAATTGCCTATTGGCAACTCTTGGGAAATCCTTTGTCTATTTTAGTAGCTATCGTGCTCTTT
TTAGTGTTACTAGTGAGTTCTATGGTATTAGCTATTTATATCAATGCTTGGGTAGGCAAAATCATTGTAAGAAGTCGCAA
ACGAAAACTCATTTCAACTATCATGATGTTTGTCTCAACTTTTGGCGCTTTCGTCTTAATTTTTGCGATTAATATTAGTA
ACAACAAGCGTACGATGACGGATGGCGTATTTACTGATTACCCAACTATTCCCTATTTCAAAGGATTCTATGATGTTGTT
CAGGCACCGTTTTCTACTGCGGCCCTCCTTAACTTTTGGTTGCCATTGTTACTTATCCTAGCTATGGTATATGGTATTGT
CACAAAAGTGATGCCAACTTATTATCGTGAGGCTTTTTATATTAGTAACGAGAACAAAGTCAAGCAAACTAAAAAACCAG
TTAATCGTCCTCATCAGAATCAATCACTGGCGCAGTTGTTGCGAAAACATCACCTATTAACGTTACAAAATGCAACTTTA
CTGACACAAACCTATCTCATGCCCCTGATGTATGTGATGCTTTTTATCGGTCCAAGTTTGTCACGTGGCACAGGTTTCTT
TAAGCATATTTCCCCAGATTACTTTGGGGTAGCCTTATTATTTGGGGTTAGTTTGGGTGTCATGTGTGCAACACCAACCA
GCTTTATTGGAGTAGGTATTTCACTTGAAAAGGATAACTTTACCTTTATTAAAAGCTTACCAATAACGTTAAAAAAATTC
TTGATGGATAAATTTTGCTTGCTTGTAGGTCTGCAGCTGATTGTGCCTATGGTGATTTATCTTGTGTTTGGTCTCTTTGT
GTTGCACCTGCATCCTCTTCTAACGATTGCTTTTTGTCTTGGCTACGCCCTATCACTGATTGTGCAAGGGGAATTGATGT
ATCGTCGTGACTACCGGCTTCTGGATTTAAAATGGCAAGACATGACGCAACTCTTTACCAGAGGAGATGGGCAATGGTTA
ACAATGGGACTTATCTTTGGTAATTTAATAGTTGCAGGTGTGCTAGGTTTTGGAGCTGTTATCATTGCCAATATTATCCA
ACAACCTCTGTTGATTAGTATTCTATTGAGTTGTCTAATACTAATGGTTTTAGGTCTTGCGCAATTATGGATTCAAAAAA
CCTTCTGGAAAAGCTTAGAGAGGCTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGAACGATTGATGAGTTGAAAGAACACCATCCTGACAAAGACTTGGAGAGCATCTACCTTGAACTCGCTGGGCGTAAGGC
GCAAGAAGAGGGGTGATGGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGAAGAGGGATCATTATTCGGAAAAACAGTCCTCTGGGGCTGTTTTTTATGCTATAATTTGGGTATGATGAAACGACAAT
TTGAAGATGTAACACGTATC

Product: ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: ABC Transporter Permease; ABC Transporter Permease Protein; Permease; Ypothetical Protein SMU.

Number of amino acids: Translated: 542; Mature: 542

Protein sequence:

>542_residues
MNWSTIWELIKINILYSNPQSLANLKKRQEKHPKENFKAYKSMIRQQALMIAMFLVIYLFMFIGVDFSHYPGLFSFDVAM
FFIMSTLTAFSSLYTIFYESNDLKLYIHLPVTSEELYIAKIVSSLGMGAVFLMPLISLLLIAYWQLLGNPLSILVAIVLF
LVLLVSSMVLAIYINAWVGKIIVRSRKRKLISTIMMFVSTFGAFVLIFAINISNNKRTMTDGVFTDYPTIPYFKGFYDVV
QAPFSTAALLNFWLPLLLILAMVYGIVTKVMPTYYREAFYISNENKVKQTKKPVNRPHQNQSLAQLLRKHHLLTLQNATL
LTQTYLMPLMYVMLFIGPSLSRGTGFFKHISPDYFGVALLFGVSLGVMCATPTSFIGVGISLEKDNFTFIKSLPITLKKF
LMDKFCLLVGLQLIVPMVIYLVFGLFVLHLHPLLTIAFCLGYALSLIVQGELMYRRDYRLLDLKWQDMTQLFTRGDGQWL
TMGLIFGNLIVAGVLGFGAVIIANIIQQPLLISILLSCLILMVLGLAQLWIQKTFWKSLERL

Sequences:

>Translated_542_residues
MNWSTIWELIKINILYSNPQSLANLKKRQEKHPKENFKAYKSMIRQQALMIAMFLVIYLFMFIGVDFSHYPGLFSFDVAM
FFIMSTLTAFSSLYTIFYESNDLKLYIHLPVTSEELYIAKIVSSLGMGAVFLMPLISLLLIAYWQLLGNPLSILVAIVLF
LVLLVSSMVLAIYINAWVGKIIVRSRKRKLISTIMMFVSTFGAFVLIFAINISNNKRTMTDGVFTDYPTIPYFKGFYDVV
QAPFSTAALLNFWLPLLLILAMVYGIVTKVMPTYYREAFYISNENKVKQTKKPVNRPHQNQSLAQLLRKHHLLTLQNATL
LTQTYLMPLMYVMLFIGPSLSRGTGFFKHISPDYFGVALLFGVSLGVMCATPTSFIGVGISLEKDNFTFIKSLPITLKKF
LMDKFCLLVGLQLIVPMVIYLVFGLFVLHLHPLLTIAFCLGYALSLIVQGELMYRRDYRLLDLKWQDMTQLFTRGDGQWL
TMGLIFGNLIVAGVLGFGAVIIANIIQQPLLISILLSCLILMVLGLAQLWIQKTFWKSLERL
>Mature_542_residues
MNWSTIWELIKINILYSNPQSLANLKKRQEKHPKENFKAYKSMIRQQALMIAMFLVIYLFMFIGVDFSHYPGLFSFDVAM
FFIMSTLTAFSSLYTIFYESNDLKLYIHLPVTSEELYIAKIVSSLGMGAVFLMPLISLLLIAYWQLLGNPLSILVAIVLF
LVLLVSSMVLAIYINAWVGKIIVRSRKRKLISTIMMFVSTFGAFVLIFAINISNNKRTMTDGVFTDYPTIPYFKGFYDVV
QAPFSTAALLNFWLPLLLILAMVYGIVTKVMPTYYREAFYISNENKVKQTKKPVNRPHQNQSLAQLLRKHHLLTLQNATL
LTQTYLMPLMYVMLFIGPSLSRGTGFFKHISPDYFGVALLFGVSLGVMCATPTSFIGVGISLEKDNFTFIKSLPITLKKF
LMDKFCLLVGLQLIVPMVIYLVFGLFVLHLHPLLTIAFCLGYALSLIVQGELMYRRDYRLLDLKWQDMTQLFTRGDGQWL
TMGLIFGNLIVAGVLGFGAVIIANIIQQPLLISILLSCLILMVLGLAQLWIQKTFWKSLERL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 61775; Mature: 61775

Theoretical pI: Translated: 10.02; Mature: 10.02

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
4.6 %Met     (Translated Protein)
5.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
4.6 %Met     (Mature Protein)
5.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNWSTIWELIKINILYSNPQSLANLKKRQEKHPKENFKAYKSMIRQQALMIAMFLVIYLF
CCHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MFIGVDFSHYPGLFSFDVAMFFIMSTLTAFSSLYTIFYESNDLKLYIHLPVTSEELYIAK
HHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEEEEEECCCCCHHHHHH
IVSSLGMGAVFLMPLISLLLIAYWQLLGNPLSILVAIVLFLVLLVSSMVLAIYINAWVGK
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIVRSRKRKLISTIMMFVSTFGAFVLIFAINISNNKRTMTDGVFTDYPTIPYFKGFYDVV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
QAPFSTAALLNFWLPLLLILAMVYGIVTKVMPTYYREAFYISNENKVKQTKKPVNRPHQN
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHCCCCCCCC
QSLAQLLRKHHLLTLQNATLLTQTYLMPLMYVMLFIGPSLSRGTGFFKHISPDYFGVALL
HHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHH
FGVSLGVMCATPTSFIGVGISLEKDNFTFIKSLPITLKKFLMDKFCLLVGLQLIVPMVIY
HHHHHHHHHCCCHHHHEECEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVFGLFVLHLHPLLTIAFCLGYALSLIVQGELMYRRDYRLLDLKWQDMTQLFTRGDGQWL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCCCEE
TMGLIFGNLIVAGVLGFGAVIIANIIQQPLLISILLSCLILMVLGLAQLWIQKTFWKSLE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RL
CC
>Mature Secondary Structure
MNWSTIWELIKINILYSNPQSLANLKKRQEKHPKENFKAYKSMIRQQALMIAMFLVIYLF
CCHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MFIGVDFSHYPGLFSFDVAMFFIMSTLTAFSSLYTIFYESNDLKLYIHLPVTSEELYIAK
HHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEEEEEECCCCCHHHHHH
IVSSLGMGAVFLMPLISLLLIAYWQLLGNPLSILVAIVLFLVLLVSSMVLAIYINAWVGK
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIVRSRKRKLISTIMMFVSTFGAFVLIFAINISNNKRTMTDGVFTDYPTIPYFKGFYDVV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
QAPFSTAALLNFWLPLLLILAMVYGIVTKVMPTYYREAFYISNENKVKQTKKPVNRPHQN
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHCCCCCCCC
QSLAQLLRKHHLLTLQNATLLTQTYLMPLMYVMLFIGPSLSRGTGFFKHISPDYFGVALL
HHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHH
FGVSLGVMCATPTSFIGVGISLEKDNFTFIKSLPITLKKFLMDKFCLLVGLQLIVPMVIY
HHHHHHHHHCCCHHHHEECEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVFGLFVLHLHPLLTIAFCLGYALSLIVQGELMYRRDYRLLDLKWQDMTQLFTRGDGQWL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCCCEE
TMGLIFGNLIVAGVLGFGAVIIANIIQQPLLISILLSCLILMVLGLAQLWIQKTFWKSLE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RL
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA