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The map label for this gene is pepF [H]

Identifier: 71893873

GI number: 71893873

Start: 667980

End: 669824

Strand: Reverse

Name: pepF [H]

Synonym: MHJ_0522

Alternate gene names: 71893873

Gene position: 669824-667980 (Counterclockwise)

Preceding gene: 71893875

Following gene: 71893872

Centisome position: 74.64

GC content: 28.24

Gene sequence:

>1845_bases
ATTTTTGAGAAGGTAAATAAAATGCAATATAAAAAATATTCTGAAATTCCTGAGAAATACCGTTTTGATTTAGATGTGCT
ACTTGAAGGTAAGACTATTGAGGAAAATTTTTCTAGTATTCAAGAAATTTCTAATGATTTAATATCAAAAAAAGATCAAC
AATTTGAAAATGTTGAAAATTTTCTTGAATATAAGGAACTAGAAGCTAATTTTGGGATAAAATACAATAAAATTCTTAAT
TATATTTCAAACAATATCAGCGTCAATGTAATTGATCCTGTTTTTAGTCAAATTAATGAACGTTTTAGTTTCTTGATGTC
TGAATTTGAGTCAAAATTAGGCTCAATTGATGTTATTTTTTATAAAAATGAGGATAAAATTCGTTCTTGAATCAACGATT
TAAGAGTAAAACCTTATCAAAAAGAGCTAAATTATCGACTTGATAATAAAAAACATAAACTTGCTGATGAGGTTGAAAGT
TATCTTACAAAATCATCTTTTGGTGAAATTTCGGTTTATAAAATTTTCTCAATTCTTTCAAATTCAGAAACAAAATTTCA
GGATGTTCTAAACGAAGAAAATAAGAAATTACCTCTTAATTCAACAAACTATTATAATTATTTAAAAACAGGGTCTCCTT
TAGTGCGAAAAAATGCATATATAAACTATCATAAAGCTTATCTTGAACATAAAAACACCTTTGCAAATTTGTTGTATCAG
CATATTAAGTCAAGTTCTGTGGATGCAAGAATGCGAAATTATCAATCACTGCTAGAGGCAAGTCTTAGTTCTGATCGTTT
TCCAGTTACAAGTTTAGAAAAATTATTTCAATTTGTCGCTAATTCAGCGCCTATTTTTGAAAAATTCAAAAAAGCAAAAG
AAAAATTTTATCAAGCAAAATTTGGGACTAAGATGAATAGTTGAGACCGTTTAGTTCCATTAGTTGAGACAAAAAATAAT
TATTCTGTTGAAGATGCACAAAAAATAGTGCTTGGGGCAATCAAACCATTAGGTCAAGAATATAAAGATGTTGTAGAAAA
AGCATTTAGCCAAAGATGAATTGACTATCATTATGTTGATTCAAAAAGATCTGGTGCTTATTCAATTGGGGGTTCATATG
GGCTTGAAAAAAAATATATTTTAATGAATTATGACTTTACTATAAACGCAGTTCATACTTTAGCACATGAATTAGGTCAT
TCGCTCCATTCTTATTATTCTGATAAAAACCAGAATTATCATAATAGCTCATATCCAATTTTCCTTGCAGAAATTGCCTC
AATTTTTAATGAGTTAATGCTCGATGACTACCTTTTGGAAAAACAAGGTGATGAAAATTTCAAATTTGAAATATTATCTC
AACAAATTTCAAATTTTATTGCGACTGTCCAACGTCAGGTAATTTGAGCGGATTATGAAGCAGTTTTATATAATAAAATT
GACAAGGGTGAACCAATTAGTTCTTATGAAGCTTTTGTGGGAATTTATAAGCAAATTCTACAAAAATATAATCCAAATGA
CCCACTTGATGATGAAAAACCGCTTGTTTATAGTGTAATTGTCCCACATTATTATTATGGATATTATGTTTATAAATATG
CAATTGGCTATCTTGTTGCTAATGCTTTCTTTCAAAAATATAAAAAAGAAGGTAAAAAAGCCCTTGACAATTACATTGAA
AACTTCCTTTCAAAAGGTGGCTCTGATTGACCAAGTAAAATTCTGGAAAAAGCCGGGATTGACCTTGGGGATTCTTTAAT
TTATACAGAAGCATTTTCACTTCTTGAAACCCAAATTGATGAATATATTCGGCTTGGTAAGAAAATTTTTAAAATTAATT
TCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTAAAATAATTATACTCGATTTTAAAATGTTTAAAGAATTTTAATCGTTTTATTTTACCGAGAAAAAATTATACCATAA
ATACTAAAAAATTATTTTCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATGCAAGAATTTTATATTAATTTATATCAAAAAAATATATCAATTTATTATTCCAAGATTTTTTAATTTCAACTAAATT
TAGGCGACTAAAAAATTTTA

Product: oligoendopeptidase F

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 614; Mature: 614

Protein sequence:

>614_residues
MFEKVNKMQYKKYSEIPEKYRFDLDVLLEGKTIEENFSSIQEISNDLISKKDQQFENVENFLEYKELEANFGIKYNKILN
YISNNISVNVIDPVFSQINERFSFLMSEFESKLGSIDVIFYKNEDKIRSWINDLRVKPYQKELNYRLDNKKHKLADEVES
YLTKSSFGEISVYKIFSILSNSETKFQDVLNEENKKLPLNSTNYYNYLKTGSPLVRKNAYINYHKAYLEHKNTFANLLYQ
HIKSSSVDARMRNYQSLLEASLSSDRFPVTSLEKLFQFVANSAPIFEKFKKAKEKFYQAKFGTKMNSWDRLVPLVETKNN
YSVEDAQKIVLGAIKPLGQEYKDVVEKAFSQRWIDYHYVDSKRSGAYSIGGSYGLEKKYILMNYDFTINAVHTLAHELGH
SLHSYYSDKNQNYHNSSYPIFLAEIASIFNELMLDDYLLEKQGDENFKFEILSQQISNFIATVQRQVIWADYEAVLYNKI
DKGEPISSYEAFVGIYKQILQKYNPNDPLDDEKPLVYSVIVPHYYYGYYVYKYAIGYLVANAFFQKYKKEGKKALDNYIE
NFLSKGGSDWPSKILEKAGIDLGDSLIYTEAFSLLETQIDEYIRLGKKIFKINF

Sequences:

>Translated_614_residues
MFEKVNKMQYKKYSEIPEKYRFDLDVLLEGKTIEENFSSIQEISNDLISKKDQQFENVENFLEYKELEANFGIKYNKILN
YISNNISVNVIDPVFSQINERFSFLMSEFESKLGSIDVIFYKNEDKIRS*INDLRVKPYQKELNYRLDNKKHKLADEVES
YLTKSSFGEISVYKIFSILSNSETKFQDVLNEENKKLPLNSTNYYNYLKTGSPLVRKNAYINYHKAYLEHKNTFANLLYQ
HIKSSSVDARMRNYQSLLEASLSSDRFPVTSLEKLFQFVANSAPIFEKFKKAKEKFYQAKFGTKMNS*DRLVPLVETKNN
YSVEDAQKIVLGAIKPLGQEYKDVVEKAFSQR*IDYHYVDSKRSGAYSIGGSYGLEKKYILMNYDFTINAVHTLAHELGH
SLHSYYSDKNQNYHNSSYPIFLAEIASIFNELMLDDYLLEKQGDENFKFEILSQQISNFIATVQRQVI*ADYEAVLYNKI
DKGEPISSYEAFVGIYKQILQKYNPNDPLDDEKPLVYSVIVPHYYYGYYVYKYAIGYLVANAFFQKYKKEGKKALDNYIE
NFLSKGGSD*PSKILEKAGIDLGDSLIYTEAFSLLETQIDEYIRLGKKIFKINF
>Mature_614_residues
MFEKVNKMQYKKYSEIPEKYRFDLDVLLEGKTIEENFSSIQEISNDLISKKDQQFENVENFLEYKELEANFGIKYNKILN
YISNNISVNVIDPVFSQINERFSFLMSEFESKLGSIDVIFYKNEDKIRS*INDLRVKPYQKELNYRLDNKKHKLADEVES
YLTKSSFGEISVYKIFSILSNSETKFQDVLNEENKKLPLNSTNYYNYLKTGSPLVRKNAYINYHKAYLEHKNTFANLLYQ
HIKSSSVDARMRNYQSLLEASLSSDRFPVTSLEKLFQFVANSAPIFEKFKKAKEKFYQAKFGTKMNS*DRLVPLVETKNN
YSVEDAQKIVLGAIKPLGQEYKDVVEKAFSQR*IDYHYVDSKRSGAYSIGGSYGLEKKYILMNYDFTINAVHTLAHELGH
SLHSYYSDKNQNYHNSSYPIFLAEIASIFNELMLDDYLLEKQGDENFKFEILSQQISNFIATVQRQVI*ADYEAVLYNKI
DKGEPISSYEAFVGIYKQILQKYNPNDPLDDEKPLVYSVIVPHYYYGYYVYKYAIGYLVANAFFQKYKKEGKKALDNYIE
NFLSKGGSD*PSKILEKAGIDLGDSLIYTEAFSLLETQIDEYIRLGKKIFKINF

Specific function: Unknown

COG id: COG1164

COG function: function code E; Oligoendopeptidase F

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the peptidase M3B family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001567
- InterPro:   IPR004438
- InterPro:   IPR013647 [H]

Pfam domain/function: PF01432 Peptidase_M3; PF08439 Peptidase_M3_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 70985; Mature: 70985

Theoretical pI: Translated: 6.93; Mature: 6.93

Prosite motif: PS00142 ZINC_PROTEASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
1.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
1.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFEKVNKMQYKKYSEIPEKYRFDLDVLLEGKTIEENFSSIQEISNDLISKKDQQFENVEN
CCCCHHHHHHHHHHHCHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
FLEYKELEANFGIKYNKILNYISNNISVNVIDPVFSQINERFSFLMSEFESKLGSIDVIF
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEE
YKNEDKIRSINDLRVKPYQKELNYRLDNKKHKLADEVESYLTKSSFGEISVYKIFSILSN
ECCCCHHHCCHHCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCC
SETKFQDVLNEENKKLPLNSTNYYNYLKTGSPLVRKNAYINYHKAYLEHKNTFANLLYQH
CCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKSSSVDARMRNYQSLLEASLSSDRFPVTSLEKLFQFVANSAPIFEKFKKAKEKFYQAKF
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GTKMNSDRLVPLVETKNNYSVEDAQKIVLGAIKPLGQEYKDVVEKAFSQRIDYHYVDSKR
CCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCC
SGAYSIGGSYGLEKKYILMNYDFTINAVHTLAHELGHSLHSYYSDKNQNYHNSSYPIFLA
CCCEECCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHH
EIASIFNELMLDDYLLEKQGDENFKFEILSQQISNFIATVQRQVIADYEAVLYNKIDKGE
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PISSYEAFVGIYKQILQKYNPNDPLDDEKPLVYSVIVPHYYYGYYVYKYAIGYLVANAFF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QKYKKEGKKALDNYIENFLSKGGSDPSKILEKAGIDLGDSLIYTEAFSLLETQIDEYIRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GKKIFKINF
HHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MFEKVNKMQYKKYSEIPEKYRFDLDVLLEGKTIEENFSSIQEISNDLISKKDQQFENVEN
CCCCHHHHHHHHHHHCHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
FLEYKELEANFGIKYNKILNYISNNISVNVIDPVFSQINERFSFLMSEFESKLGSIDVIF
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEE
YKNEDKIRSINDLRVKPYQKELNYRLDNKKHKLADEVESYLTKSSFGEISVYKIFSILSN
ECCCCHHHCCHHCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCC
SETKFQDVLNEENKKLPLNSTNYYNYLKTGSPLVRKNAYINYHKAYLEHKNTFANLLYQH
CCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKSSSVDARMRNYQSLLEASLSSDRFPVTSLEKLFQFVANSAPIFEKFKKAKEKFYQAKF
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GTKMNSDRLVPLVETKNNYSVEDAQKIVLGAIKPLGQEYKDVVEKAFSQRIDYHYVDSKR
CCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCC
SGAYSIGGSYGLEKKYILMNYDFTINAVHTLAHELGHSLHSYYSDKNQNYHNSSYPIFLA
CCCEECCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHH
EIASIFNELMLDDYLLEKQGDENFKFEILSQQISNFIATVQRQVIADYEAVLYNKIDKGE
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PISSYEAFVGIYKQILQKYNPNDPLDDEKPLVYSVIVPHYYYGYYVYKYAIGYLVANAFF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QKYKKEGKKALDNYIENFLSKGGSDPSKILEKAGIDLGDSLIYTEAFSLLETQIDEYIRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GKKIFKINF
HHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11353084 [H]