Definition Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome, complete genome.
Accession NC_007295
Length 897,405

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The map label for this gene is 71893832

Identifier: 71893832

GI number: 71893832

Start: 608131

End: 609711

Strand: Reverse

Name: 71893832

Synonym: MHJ_0481

Alternate gene names: NA

Gene position: 609711-608131 (Counterclockwise)

Preceding gene: 71893834

Following gene: 71893831

Centisome position: 67.94

GC content: 26.25

Gene sequence:

>1581_bases
ATATATTTCATCTTTGAAAAAACTAGGAAAGGAGAAATAATGAAGGTTAGATCTAAAAAAGTCTTCAAGTTAGAAATAAA
CCCATCAAAAAATGGCCAAAAGCAGTGGTTGTATTTTTTGCTTACTGTTTTATTCTTAACTAGTTTGGCTTTAGCCATTT
TTTTTGATGGACCACGATCATTTCTAAATATTTCAAATACTGATCAGCCAGTCTCAAGTATTTCAACATTTTTCAATCCA
ATTGAAGATGAAATGCGTGAGTTTCTTGCTGTTCGAATGACAAGATCAGTTTTGCTCTTATTTTTTAGTTTTGCCTTTTT
CTTTAAAGGACTTAAATTTTTAAGCCTTAAGGAAAAATTGCAAAAATATCTTATTTTATCGGCATTTTTTGGTCTTTTTT
TAGTTAATATTGTTATTTATTTTGCTTGACTTACAACAGAATGAACTTATATTCTTGTATTTTCAACACAAATTTTTGTC
CTAATTTTCCTTGATTATAGTCTCTGGCTCTGAATTGGTCGGAAAAATGATAAAATAAATTATGATTATAAAAAGTTTTT
TATTTTTCGTCACGTCAGTTTGGCAGCCTCATTAATTATTTTTGGGATTTTATTTGGACTTTTTGCATCAATGGTTTTCT
CAAATGAGGAAGCTGATATTATCGCGACTGTAAGTTATGGTAACCCGGTTGCAGATTGGCTATATACTTTTATTGCCGAA
GTTGGAAAAATTAGTAATTCTTTCATTTTAATTGCAATTTTGGTATTTTTACTAGTGCTTTCCTTACTTTATTTTAGTCC
GCAAATTTACTTTTACCGTCAAAGTTTTTTCCGACTAAAAAAAATAGTGCCAAGTTTTTCACTGTTAATTTTTGCTAGTT
TTGCACTTTTATTTTATAGTATTTATATAAATATTTTTGCAAGCACAAATTTTGTTCAATTCTTACCTTTTGGAAAGAAT
TTAACAACAAATTATTTGCCAATGATTATCGGAATTTCGATTCATCTAGTTTTATTAGCTACTTATTTCCTTTTAAATTT
TACAAAATTAGAAAAGAAAATTAAGGATTACAAGTTAAGTTTTTTTGCTTTTGTCCTATTGATATCTTTTATTTCCAGTT
TTGTTAGTTCCTATTTATCTTATGTAGTTTTTGCCACTATTTGAATCAATTTAAGTCAAATAGTGTTTTTTATTATTACT
TATTCATTATTGATTAGAACAAAGAAAGATTTTCCGTTATGATTAAAGCTCATTTTTAGCTTTTTTACTAGTTTATATAT
TCTTTTTACTTTCATTTATTTATTAAATATTCATATTTATACAAATGCCGTTGTTGCACTTGAGGCCGAAAAAAGTCCTT
TAGTATCGACATTTTATATTGACTATAGTTTCTATTTTTATGGAATTCTTAGTGTTTTAGTTGGAATTTTCGTTTTTGTT
AATTTATTAGTATCAATTGGAAAAAATACTTTAATTTTAAAAACAAAAAAATCGCAATTAGATTACAAAGTGCTTGAAAA
ACAAGTAAATACTAAAAATTCCCAGTCGGAAAATTTAAAAACACTTAAGTCAAAAAGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAAATTAGAAAAAAAATAGTGATTCTCCTTGATTTTTTTAAGGTACCTTTATTTAATTTTCATTTTTTTGGCAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAGTTATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAATAGGAGTTAATTATGAAATTTTTTGGATCTTCTGCAAAAAAAGAAGCAAATTCAAATACTATTGATACAAAAAC
CGAGTTCCGTGATTATTATG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 526; Mature: 526

Protein sequence:

>526_residues
MYFIFEKTRKGEIMKVRSKKVFKLEINPSKNGQKQWLYFLLTVLFLTSLALAIFFDGPRSFLNISNTDQPVSSISTFFNP
IEDEMREFLAVRMTRSVLLLFFSFAFFFKGLKFLSLKEKLQKYLILSAFFGLFLVNIVIYFAWLTTEWTYILVFSTQIFV
LIFLDYSLWLWIGRKNDKINYDYKKFFIFRHVSLAASLIIFGILFGLFASMVFSNEEADIIATVSYGNPVADWLYTFIAE
VGKISNSFILIAILVFLLVLSLLYFSPQIYFYRQSFFRLKKIVPSFSLLIFASFALLFYSIYINIFASTNFVQFLPFGKN
LTTNYLPMIIGISIHLVLLATYFLLNFTKLEKKIKDYKLSFFAFVLLISFISSFVSSYLSYVVFATIWINLSQIVFFIIT
YSLLIRTKKDFPLWLKLIFSFFTSLYILFTFIYLLNIHIYTNAVVALEAEKSPLVSTFYIDYSFYFYGILSVLVGIFVFV
NLLVSIGKNTLILKTKKSQLDYKVLEKQVNTKNSQSENLKTLKSKS

Sequences:

>Translated_526_residues
MYFIFEKTRKGEIMKVRSKKVFKLEINPSKNGQKQWLYFLLTVLFLTSLALAIFFDGPRSFLNISNTDQPVSSISTFFNP
IEDEMREFLAVRMTRSVLLLFFSFAFFFKGLKFLSLKEKLQKYLILSAFFGLFLVNIVIYFA*LTTE*TYILVFSTQIFV
LIFLDYSLWL*IGRKNDKINYDYKKFFIFRHVSLAASLIIFGILFGLFASMVFSNEEADIIATVSYGNPVADWLYTFIAE
VGKISNSFILIAILVFLLVLSLLYFSPQIYFYRQSFFRLKKIVPSFSLLIFASFALLFYSIYINIFASTNFVQFLPFGKN
LTTNYLPMIIGISIHLVLLATYFLLNFTKLEKKIKDYKLSFFAFVLLISFISSFVSSYLSYVVFATI*INLSQIVFFIIT
YSLLIRTKKDFPL*LKLIFSFFTSLYILFTFIYLLNIHIYTNAVVALEAEKSPLVSTFYIDYSFYFYGILSVLVGIFVFV
NLLVSIGKNTLILKTKKSQLDYKVLEKQVNTKNSQSENLKTLKSKS
>Mature_526_residues
MYFIFEKTRKGEIMKVRSKKVFKLEINPSKNGQKQWLYFLLTVLFLTSLALAIFFDGPRSFLNISNTDQPVSSISTFFNP
IEDEMREFLAVRMTRSVLLLFFSFAFFFKGLKFLSLKEKLQKYLILSAFFGLFLVNIVIYFA*LTTE*TYILVFSTQIFV
LIFLDYSLWL*IGRKNDKINYDYKKFFIFRHVSLAASLIIFGILFGLFASMVFSNEEADIIATVSYGNPVADWLYTFIAE
VGKISNSFILIAILVFLLVLSLLYFSPQIYFYRQSFFRLKKIVPSFSLLIFASFALLFYSIYINIFASTNFVQFLPFGKN
LTTNYLPMIIGISIHLVLLATYFLLNFTKLEKKIKDYKLSFFAFVLLISFISSFVSSYLSYVVFATI*INLSQIVFFIIT
YSLLIRTKKDFPL*LKLIFSFFTSLYILFTFIYLLNIHIYTNAVVALEAEKSPLVSTFYIDYSFYFYGILSVLVGIFVFV
NLLVSIGKNTLILKTKKSQLDYKVLEKQVNTKNSQSENLKTLKSKS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 60458; Mature: 60458

Theoretical pI: Translated: 10.13; Mature: 10.13

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
1.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
1.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYFIFEKTRKGEIMKVRSKKVFKLEINPSKNGQKQWLYFLLTVLFLTSLALAIFFDGPRS
CEEEEECCCCCCEEEECCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
FLNISNTDQPVSSISTFFNPIEDEMREFLAVRMTRSVLLLFFSFAFFFKGLKFLSLKEKL
HEECCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QKYLILSAFFGLFLVNIVIYFALTTETYILVFSTQIFVLIFLDYSLWLIGRKNDKINYDY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCHH
KKFFIFRHVSLAASLIIFGILFGLFASMVFSNEEADIIATVSYGNPVADWLYTFIAEVGK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH
ISNSFILIAILVFLLVLSLLYFSPQIYFYRQSFFRLKKIVPSFSLLIFASFALLFYSIYI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIFASTNFVQFLPFGKNLTTNYLPMIIGISIHLVLLATYFLLNFTKLEKKIKDYKLSFFA
HHHHCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVLLISFISSFVSSYLSYVVFATIINLSQIVFFIITYSLLIRTKKDFPLLKLIFSFFTSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH
YILFTFIYLLNIHIYTNAVVALEAEKSPLVSTFYIDYSFYFYGILSVLVGIFVFVNLLVS
HHHHHHHHHHHHHHEECEEEEEECCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGKNTLILKTKKSQLDYKVLEKQVNTKNSQSENLKTLKSKS
CCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MYFIFEKTRKGEIMKVRSKKVFKLEINPSKNGQKQWLYFLLTVLFLTSLALAIFFDGPRS
CEEEEECCCCCCEEEECCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
FLNISNTDQPVSSISTFFNPIEDEMREFLAVRMTRSVLLLFFSFAFFFKGLKFLSLKEKL
HEECCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QKYLILSAFFGLFLVNIVIYFALTTETYILVFSTQIFVLIFLDYSLWLIGRKNDKINYDY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCHH
KKFFIFRHVSLAASLIIFGILFGLFASMVFSNEEADIIATVSYGNPVADWLYTFIAEVGK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH
ISNSFILIAILVFLLVLSLLYFSPQIYFYRQSFFRLKKIVPSFSLLIFASFALLFYSIYI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIFASTNFVQFLPFGKNLTTNYLPMIIGISIHLVLLATYFLLNFTKLEKKIKDYKLSFFA
HHHHCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVLLISFISSFVSSYLSYVVFATIINLSQIVFFIITYSLLIRTKKDFPLLKLIFSFFTSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH
YILFTFIYLLNIHIYTNAVVALEAEKSPLVSTFYIDYSFYFYGILSVLVGIFVFVNLLVS
HHHHHHHHHHHHHHEECEEEEEECCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGKNTLILKTKKSQLDYKVLEKQVNTKNSQSENLKTLKSKS
CCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA