| Definition | Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007295 |
| Length | 897,405 |
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The map label for this gene is 71893832
Identifier: 71893832
GI number: 71893832
Start: 608131
End: 609711
Strand: Reverse
Name: 71893832
Synonym: MHJ_0481
Alternate gene names: NA
Gene position: 609711-608131 (Counterclockwise)
Preceding gene: 71893834
Following gene: 71893831
Centisome position: 67.94
GC content: 26.25
Gene sequence:
>1581_bases ATATATTTCATCTTTGAAAAAACTAGGAAAGGAGAAATAATGAAGGTTAGATCTAAAAAAGTCTTCAAGTTAGAAATAAA CCCATCAAAAAATGGCCAAAAGCAGTGGTTGTATTTTTTGCTTACTGTTTTATTCTTAACTAGTTTGGCTTTAGCCATTT TTTTTGATGGACCACGATCATTTCTAAATATTTCAAATACTGATCAGCCAGTCTCAAGTATTTCAACATTTTTCAATCCA ATTGAAGATGAAATGCGTGAGTTTCTTGCTGTTCGAATGACAAGATCAGTTTTGCTCTTATTTTTTAGTTTTGCCTTTTT CTTTAAAGGACTTAAATTTTTAAGCCTTAAGGAAAAATTGCAAAAATATCTTATTTTATCGGCATTTTTTGGTCTTTTTT TAGTTAATATTGTTATTTATTTTGCTTGACTTACAACAGAATGAACTTATATTCTTGTATTTTCAACACAAATTTTTGTC CTAATTTTCCTTGATTATAGTCTCTGGCTCTGAATTGGTCGGAAAAATGATAAAATAAATTATGATTATAAAAAGTTTTT TATTTTTCGTCACGTCAGTTTGGCAGCCTCATTAATTATTTTTGGGATTTTATTTGGACTTTTTGCATCAATGGTTTTCT CAAATGAGGAAGCTGATATTATCGCGACTGTAAGTTATGGTAACCCGGTTGCAGATTGGCTATATACTTTTATTGCCGAA GTTGGAAAAATTAGTAATTCTTTCATTTTAATTGCAATTTTGGTATTTTTACTAGTGCTTTCCTTACTTTATTTTAGTCC GCAAATTTACTTTTACCGTCAAAGTTTTTTCCGACTAAAAAAAATAGTGCCAAGTTTTTCACTGTTAATTTTTGCTAGTT TTGCACTTTTATTTTATAGTATTTATATAAATATTTTTGCAAGCACAAATTTTGTTCAATTCTTACCTTTTGGAAAGAAT TTAACAACAAATTATTTGCCAATGATTATCGGAATTTCGATTCATCTAGTTTTATTAGCTACTTATTTCCTTTTAAATTT TACAAAATTAGAAAAGAAAATTAAGGATTACAAGTTAAGTTTTTTTGCTTTTGTCCTATTGATATCTTTTATTTCCAGTT TTGTTAGTTCCTATTTATCTTATGTAGTTTTTGCCACTATTTGAATCAATTTAAGTCAAATAGTGTTTTTTATTATTACT TATTCATTATTGATTAGAACAAAGAAAGATTTTCCGTTATGATTAAAGCTCATTTTTAGCTTTTTTACTAGTTTATATAT TCTTTTTACTTTCATTTATTTATTAAATATTCATATTTATACAAATGCCGTTGTTGCACTTGAGGCCGAAAAAAGTCCTT TAGTATCGACATTTTATATTGACTATAGTTTCTATTTTTATGGAATTCTTAGTGTTTTAGTTGGAATTTTCGTTTTTGTT AATTTATTAGTATCAATTGGAAAAAATACTTTAATTTTAAAAACAAAAAAATCGCAATTAGATTACAAAGTGCTTGAAAA ACAAGTAAATACTAAAAATTCCCAGTCGGAAAATTTAAAAACACTTAAGTCAAAAAGTTAA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AAAAAATAGGAGTTAATTATGAAATTTTTTGGATCTTCTGCAAAAAAAGAAGCAAATTCAAATACTATTGATACAAAAAC CGAGTTCCGTGATTATTATG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 526; Mature: 526
Protein sequence:
>526_residues MYFIFEKTRKGEIMKVRSKKVFKLEINPSKNGQKQWLYFLLTVLFLTSLALAIFFDGPRSFLNISNTDQPVSSISTFFNP IEDEMREFLAVRMTRSVLLLFFSFAFFFKGLKFLSLKEKLQKYLILSAFFGLFLVNIVIYFAWLTTEWTYILVFSTQIFV LIFLDYSLWLWIGRKNDKINYDYKKFFIFRHVSLAASLIIFGILFGLFASMVFSNEEADIIATVSYGNPVADWLYTFIAE VGKISNSFILIAILVFLLVLSLLYFSPQIYFYRQSFFRLKKIVPSFSLLIFASFALLFYSIYINIFASTNFVQFLPFGKN LTTNYLPMIIGISIHLVLLATYFLLNFTKLEKKIKDYKLSFFAFVLLISFISSFVSSYLSYVVFATIWINLSQIVFFIIT YSLLIRTKKDFPLWLKLIFSFFTSLYILFTFIYLLNIHIYTNAVVALEAEKSPLVSTFYIDYSFYFYGILSVLVGIFVFV NLLVSIGKNTLILKTKKSQLDYKVLEKQVNTKNSQSENLKTLKSKS
Sequences:
>Translated_526_residues MYFIFEKTRKGEIMKVRSKKVFKLEINPSKNGQKQWLYFLLTVLFLTSLALAIFFDGPRSFLNISNTDQPVSSISTFFNP IEDEMREFLAVRMTRSVLLLFFSFAFFFKGLKFLSLKEKLQKYLILSAFFGLFLVNIVIYFA*LTTE*TYILVFSTQIFV LIFLDYSLWL*IGRKNDKINYDYKKFFIFRHVSLAASLIIFGILFGLFASMVFSNEEADIIATVSYGNPVADWLYTFIAE VGKISNSFILIAILVFLLVLSLLYFSPQIYFYRQSFFRLKKIVPSFSLLIFASFALLFYSIYINIFASTNFVQFLPFGKN LTTNYLPMIIGISIHLVLLATYFLLNFTKLEKKIKDYKLSFFAFVLLISFISSFVSSYLSYVVFATI*INLSQIVFFIIT YSLLIRTKKDFPL*LKLIFSFFTSLYILFTFIYLLNIHIYTNAVVALEAEKSPLVSTFYIDYSFYFYGILSVLVGIFVFV NLLVSIGKNTLILKTKKSQLDYKVLEKQVNTKNSQSENLKTLKSKS >Mature_526_residues MYFIFEKTRKGEIMKVRSKKVFKLEINPSKNGQKQWLYFLLTVLFLTSLALAIFFDGPRSFLNISNTDQPVSSISTFFNP IEDEMREFLAVRMTRSVLLLFFSFAFFFKGLKFLSLKEKLQKYLILSAFFGLFLVNIVIYFA*LTTE*TYILVFSTQIFV LIFLDYSLWL*IGRKNDKINYDYKKFFIFRHVSLAASLIIFGILFGLFASMVFSNEEADIIATVSYGNPVADWLYTFIAE VGKISNSFILIAILVFLLVLSLLYFSPQIYFYRQSFFRLKKIVPSFSLLIFASFALLFYSIYINIFASTNFVQFLPFGKN LTTNYLPMIIGISIHLVLLATYFLLNFTKLEKKIKDYKLSFFAFVLLISFISSFVSSYLSYVVFATI*INLSQIVFFIIT YSLLIRTKKDFPL*LKLIFSFFTSLYILFTFIYLLNIHIYTNAVVALEAEKSPLVSTFYIDYSFYFYGILSVLVGIFVFV NLLVSIGKNTLILKTKKSQLDYKVLEKQVNTKNSQSENLKTLKSKS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 60458; Mature: 60458
Theoretical pI: Translated: 10.13; Mature: 10.13
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.1 %Met (Translated Protein) 1.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.1 %Met (Mature Protein) 1.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MYFIFEKTRKGEIMKVRSKKVFKLEINPSKNGQKQWLYFLLTVLFLTSLALAIFFDGPRS CEEEEECCCCCCEEEECCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH FLNISNTDQPVSSISTFFNPIEDEMREFLAVRMTRSVLLLFFSFAFFFKGLKFLSLKEKL HEECCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QKYLILSAFFGLFLVNIVIYFALTTETYILVFSTQIFVLIFLDYSLWLIGRKNDKINYDY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCHH KKFFIFRHVSLAASLIIFGILFGLFASMVFSNEEADIIATVSYGNPVADWLYTFIAEVGK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH ISNSFILIAILVFLLVLSLLYFSPQIYFYRQSFFRLKKIVPSFSLLIFASFALLFYSIYI CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NIFASTNFVQFLPFGKNLTTNYLPMIIGISIHLVLLATYFLLNFTKLEKKIKDYKLSFFA HHHHCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVLLISFISSFVSSYLSYVVFATIINLSQIVFFIITYSLLIRTKKDFPLLKLIFSFFTSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH YILFTFIYLLNIHIYTNAVVALEAEKSPLVSTFYIDYSFYFYGILSVLVGIFVFVNLLVS HHHHHHHHHHHHHHEECEEEEEECCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGKNTLILKTKKSQLDYKVLEKQVNTKNSQSENLKTLKSKS CCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MYFIFEKTRKGEIMKVRSKKVFKLEINPSKNGQKQWLYFLLTVLFLTSLALAIFFDGPRS CEEEEECCCCCCEEEECCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH FLNISNTDQPVSSISTFFNPIEDEMREFLAVRMTRSVLLLFFSFAFFFKGLKFLSLKEKL HEECCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QKYLILSAFFGLFLVNIVIYFALTTETYILVFSTQIFVLIFLDYSLWLIGRKNDKINYDY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCHH KKFFIFRHVSLAASLIIFGILFGLFASMVFSNEEADIIATVSYGNPVADWLYTFIAEVGK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH ISNSFILIAILVFLLVLSLLYFSPQIYFYRQSFFRLKKIVPSFSLLIFASFALLFYSIYI CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NIFASTNFVQFLPFGKNLTTNYLPMIIGISIHLVLLATYFLLNFTKLEKKIKDYKLSFFA HHHHCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVLLISFISSFVSSYLSYVVFATIINLSQIVFFIITYSLLIRTKKDFPLLKLIFSFFTSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH YILFTFIYLLNIHIYTNAVVALEAEKSPLVSTFYIDYSFYFYGILSVLVGIFVFVNLLVS HHHHHHHHHHHHHHEECEEEEEECCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGKNTLILKTKKSQLDYKVLEKQVNTKNSQSENLKTLKSKS CCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA