Definition | Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_007295 |
Length | 897,405 |
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The map label for this gene is 71893619
Identifier: 71893619
GI number: 71893619
Start: 312028
End: 315012
Strand: Reverse
Name: 71893619
Synonym: MHJ_0263
Alternate gene names: NA
Gene position: 315012-312028 (Counterclockwise)
Preceding gene: 71893620
Following gene: 71893616
Centisome position: 35.1
GC content: 27.1
Gene sequence:
>2985_bases ATTGTAACTAGCATTTTGCTTCTAAGTGGTATTATAACTATTTCAACTGCAATTCCTTTAGGTATTTGGTCATATAATCG CGCTTATTATCAAAAATTAAATGAAAAATCACAAAATTTAAGTATTAGTCAAACTGAAAATCCCTTTGAAAATAATCTTG GAAAATTCTTTGATAATTTATTCATTAGTAATCAATTCAAAGAATTATCAGCTAGTACAGCATTTGAATTAGCAAAAAGC AAGATTTATAATCTTGACCTTTTAACGTTAATTAATCTTGATAAACTATACCAAAAAAATTACCAAATTAGTTATGATCT AAGTAATGCAACAGCAAGTGGAACTGCAATTAAAAATATTGTATTTTTTATAAGAACTAGCGATCAACGGCAAATTTTTT CAAAAGCAGTTGAAATTAAAGGTTTTTCTGATAAAAATATTGAAAAAAATCTTGCTAAATTTGAAATTGATGAAAAAAAA TCATCAATTTCAATTAAACCGCAAAATTTTTTAAGTTTTGCTGAGTTTAGCAAGGAATTACAAAATCAATTTATTAAAAC TAGCAAAACCCAAAAACAAACATTTATTGCTTTTGAAGAGGCGCTTATTCAACTTGGAGGTTCGTATAATTTAGTTAACA GTCTCGGCTTACCAACTTTTATTCATAAAGGGCAAATTTTAGAACCAAAAATTTTTGATAATAATCTTAATTTTACAAAC CAAGGGAATAAAAATTACCTTAATTTTATCTTCACAAATGAAGGAAAAAAAACAGAAATTCCCTTAGAAATTAACGGAAT AACCCCTGATTTAGAGATTAAAAATGAAATAATTAAGTGAATAAAAGCGGAACTAGAAGAAAAAATCAAGCTCAAGGAAA GTATTCAAGCTGAATTAATTAGGGAAAATTTATCACTTGCAAAATCATTTTATGTTGATAAAAATAATAATCCTTGGATA TCAACAACAAAAAATTTTGAAAACTTATTTGATTATGTACAAAGCGAGCATCTAATTAATACTAATAAAATAAAAAATTA TATCACAAACATAAATTTTAAAATCAAAAAAAATAGTGAAATACCTGCTTTAGAACTTAATAATTTGCTAAAAGATGATA AAATTCGGCTTGAAATAAATGTTGATATCTCAAAGTGAGTCCAACAAAAACTAATTAAAATTTTAAGTTTTAAGTTTGAT TGGGACCTAAAACCAGACCTGAATCAGTATGCCCGGATTTTTGCACAAAATCTACCCGAGCCAAAATCTGAGGTATTCTT ACTAAGAAAAGATGAAAATTCAGCAGCGTGAACTAGTAAAAAACTAGTAAATATAATAAATAAAATTAAGGAATTTAACA ATGAATTAGACCCAGAAAATCCTGATATAAAGTTAGTTAGCCAACTTTATTTACTTGATTTTGGCAAAATTGGTGATGAA ATTGCTATAGAAAATTATAAAAGAGAATTAATAAGAACTGCTAAAATCCTTAAAAATCAACTAGTTAAAGTCCAAGAATT TAGTGATGATCAGGTTAATAAAGCACAAAACAATGAAAAAAGTTTAGGAAAAGCAATTTGAAAAGTGCTTAATATTCAGC GTAATTTAATAAATGATGATATAAGCTCTGATTTTATCCTTGATAATAAGGAAGGTGATTTTACTATCAAATTTAGTCTA ATTTCAAATAAAAATAAGCAAAAATTAGCCACAAGAAAGATTAAAATTTCAAATATTGTCAGTTCTGAAATGAGCGCTTT TGATGATGCAGCTAAATTTTATCCAACTTTTTTTCTTGATGGCAAGTCATCTTTTTCAAAATCAGACAATAAAAAAGGCT ATGAAATTATAGATTTATCTGATAATAATATTCATTTTGAGGATGATTTAGATAGTAAAAATCAACTAACTCAAGAAGGT TTTAAACTAACAAATCCGATTAAATTTCAGCAAAACCAATCAAAAACAAAAGAAAATATTGCCAGAACAGTCAATATAAG TAGCCCAAGTTTCAAATCAGCACCATTTTCACGGCTTGATTCAGGGCTAATTTATTTAGCATTTAAACCAAAAAATATCA ATGACTATAAAAAACATTACCTACTTGCAGACTCAGATGGAAACGGTCTTTTTATTCAAAAGATTAAAAATTTTAAATTT ATAAATAAAAATACCACAATCCAAGGGATTGCAGGACTAAAAACTGAAAAAACTACGGAAAATTCGGATATTACCTTTAT CAAACCCGAAAATTTAGACCAAAAAAACAAAGATGAAACACAACAAAAACAAGTTGATGGTTATTTTATCGGACTTGACT TTAAACAGATAAAAAATTTTAAATCATTTCAGTCATATTTGTACCAGAACAAAAAAAGCCTTTATTCCTTAGCTAATTTA TTCCCACCTGAATTAATTGATAAGCAAGCAGTAATTCTTGGGCCTAATTCCTGAAAGCCAATAAAAAATTTTAGCGCTGA AATAAATCAAAATTTAGACAATCTAGCCATAGTTGAACTTGCAAATCGAACTGGCGAAAATCGTTTTTATCGCCAGGAAC TAAGAAATTCTAGTCCTTTTTTACTTGAAAAAAGTAAAGAAATAATCGAAGATGACCAAGATATTGTCCTTGAAATTATC AAAACTCCGTGATCAATTGAAATTAGTGCTTTTTCATCATCAAATTATCAGCTAAATTCAAAAACATCACTTAATTTAAA TGGAAAAACTATCTATAATATTAACCCAGTAAGTCAAAAATGGTCACCATTTCCGAATTATCTAAATCTTGACTGGGCCC AAATTGGGCCAAATCCAAAAAAAACAACGGATAAAAATGGTTCTAACAACGAAAAAATTAACAAAAATAGCAGCATAATT TTAAAAGGAATAGCAGTTTATAACGATCCAGAATTAACAACAAAGACAAGAAATTTTGCCCGCGATCAAATAAGAAACGC CTTTATTAAAGCATATATAAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AATAAAAAATTAATTTTTAGAAAAATAAAAATACAAAATTAAGAGGTCTAAAATGAAAAAAATACCTAATTTTAAAGGAT TTTTTAATAAACCAGCAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AATTTTTTCAAAAATTTATGAACTAATAACTTTGCTTTGTTAGACAAAATTATTAGTTCTATTTTTATAATTCTAATTTA AAAAACACTTGTTTTTATAG
Product: P102-like protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 994; Mature: 994
Protein sequence:
>994_residues MVTSILLLSGIITISTAIPLGIWSYNRAYYQKLNEKSQNLSISQTENPFENNLGKFFDNLFISNQFKELSASTAFELAKS KIYNLDLLTLINLDKLYQKNYQISYDLSNATASGTAIKNIVFFIRTSDQRQIFSKAVEIKGFSDKNIEKNLAKFEIDEKK SSISIKPQNFLSFAEFSKELQNQFIKTSKTQKQTFIAFEEALIQLGGSYNLVNSLGLPTFIHKGQILEPKIFDNNLNFTN QGNKNYLNFIFTNEGKKTEIPLEINGITPDLEIKNEIIKWIKAELEEKIKLKESIQAELIRENLSLAKSFYVDKNNNPWI STTKNFENLFDYVQSEHLINTNKIKNYITNINFKIKKNSEIPALELNNLLKDDKIRLEINVDISKWVQQKLIKILSFKFD WDLKPDLNQYARIFAQNLPEPKSEVFLLRKDENSAAWTSKKLVNIINKIKEFNNELDPENPDIKLVSQLYLLDFGKIGDE IAIENYKRELIRTAKILKNQLVKVQEFSDDQVNKAQNNEKSLGKAIWKVLNIQRNLINDDISSDFILDNKEGDFTIKFSL ISNKNKQKLATRKIKISNIVSSEMSAFDDAAKFYPTFFLDGKSSFSKSDNKKGYEIIDLSDNNIHFEDDLDSKNQLTQEG FKLTNPIKFQQNQSKTKENIARTVNISSPSFKSAPFSRLDSGLIYLAFKPKNINDYKKHYLLADSDGNGLFIQKIKNFKF INKNTTIQGIAGLKTEKTTENSDITFIKPENLDQKNKDETQQKQVDGYFIGLDFKQIKNFKSFQSYLYQNKKSLYSLANL FPPELIDKQAVILGPNSWKPIKNFSAEINQNLDNLAIVELANRTGENRFYRQELRNSSPFLLEKSKEIIEDDQDIVLEII KTPWSIEISAFSSSNYQLNSKTSLNLNGKTIYNINPVSQKWSPFPNYLNLDWAQIGPNPKKTTDKNGSNNEKINKNSSII LKGIAVYNDPELTTKTRNFARDQIRNAFIKAYIK
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 113221; Mature: 113221
Theoretical pI: Translated: 9.72; Mature: 9.72
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 0.2 %Met (Translated Protein) 0.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 0.2 %Met (Mature Protein) 0.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVTSILLLSGIITISTAIPLGIWSYNRAYYQKLNEKSQNLSISQTENPFENNLGKFFDNL CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH FISNQFKELSASTAFELAKSKIYNLDLLTLINLDKLYQKNYQISYDLSNATASGTAIKNI HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHCHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEE VFFIRTSDQRQIFSKAVEIKGFSDKNIEKNLAKFEIDEKKSSISIKPQNFLSFAEFSKEL EEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHEEECCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHH QNQFIKTSKTQKQTFIAFEEALIQLGGSYNLVNSLGLPTFIHKGQILEPKIFDNNLNFTN HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHCCCCCEECCEEECCCCCCCC QGNKNYLNFIFTNEGKKTEIPLEINGITPDLEIKNEIIKIKAELEEKIKLKESIQAELIR CCCCCEEEEEEECCCCCEECCEEECCCCCCCHHCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ENLSLAKSFYVDKNNNPWISTTKNFENLFDYVQSEHLINTNKIKNYITNINFKIKKNSEI HHHHHHHHEEEECCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCCC PALELNNLLKDDKIRLEINVDISKVQQKLIKILSFKFDWDLKPDLNQYARIFAQNLPEPK CHHHHHHCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC SEVFLLRKDENSAATSKKLVNIINKIKEFNNELDPENPDIKLVSQLYLLDFGKIGDEIAI HHEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH ENYKRELIRTAKILKNQLVKVQEFSDDQVNKAQNNEKSLGKAIKVLNIQRNLINDDISSD HHHHHHHHHHHHHHHHHCEEHHCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC FILDNKEGDFTIKFSLISNKNKQKLATRKIKISNIVSSEMSAFDDAAKFYPTFFLDGKSS EEEECCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCC FSKSDNKKGYEIIDLSDNNIHFEDDLDSKNQLTQEGFKLTNPIKFQQNQSKTKENIARTV CCCCCCCCCCEEEEECCCCEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHEEE NISSPSFKSAPFSRLDSGLIYLAFKPKNINDYKKHYLLADSDGNGLFIQKIKNFKFINKN ECCCCCCCCCCHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHEEEEEECCCCEEEEEEECCEEEECCC TTIQGIAGLKTEKTTENSDITFIKPENLDQKNKDETQQKQVDGYFIGLDFKQIKNFKSFQ CEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHH SYLYQNKKSLYSLANLFPPELIDKQAVILGPNSKPIKNFSAEINQNLDNLAIVELANRTG HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCC ENRFYRQELRNSSPFLLEKSKEIIEDDQDIVLEIIKTPSIEISAFSSSNYQLNSKTSLNL CCHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCEEECCCEEEEE NGKTIYNINPVSQKWSPFPNYLNLDWAQIGPNPKKTTDKNGSNNEKINKNSSIILKGIAV CCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEE YNDPELTTKTRNFARDQIRNAFIKAYIK ECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MVTSILLLSGIITISTAIPLGIWSYNRAYYQKLNEKSQNLSISQTENPFENNLGKFFDNL CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH FISNQFKELSASTAFELAKSKIYNLDLLTLINLDKLYQKNYQISYDLSNATASGTAIKNI HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHCHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEE VFFIRTSDQRQIFSKAVEIKGFSDKNIEKNLAKFEIDEKKSSISIKPQNFLSFAEFSKEL EEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHEEECCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHH QNQFIKTSKTQKQTFIAFEEALIQLGGSYNLVNSLGLPTFIHKGQILEPKIFDNNLNFTN HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHCCCCCEECCEEECCCCCCCC QGNKNYLNFIFTNEGKKTEIPLEINGITPDLEIKNEIIKIKAELEEKIKLKESIQAELIR CCCCCEEEEEEECCCCCEECCEEECCCCCCCHHCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ENLSLAKSFYVDKNNNPWISTTKNFENLFDYVQSEHLINTNKIKNYITNINFKIKKNSEI HHHHHHHHEEEECCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCCC PALELNNLLKDDKIRLEINVDISKVQQKLIKILSFKFDWDLKPDLNQYARIFAQNLPEPK CHHHHHHCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC SEVFLLRKDENSAATSKKLVNIINKIKEFNNELDPENPDIKLVSQLYLLDFGKIGDEIAI HHEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH ENYKRELIRTAKILKNQLVKVQEFSDDQVNKAQNNEKSLGKAIKVLNIQRNLINDDISSD HHHHHHHHHHHHHHHHHCEEHHCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC FILDNKEGDFTIKFSLISNKNKQKLATRKIKISNIVSSEMSAFDDAAKFYPTFFLDGKSS EEEECCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCC FSKSDNKKGYEIIDLSDNNIHFEDDLDSKNQLTQEGFKLTNPIKFQQNQSKTKENIARTV CCCCCCCCCCEEEEECCCCEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHEEE NISSPSFKSAPFSRLDSGLIYLAFKPKNINDYKKHYLLADSDGNGLFIQKIKNFKFINKN ECCCCCCCCCCHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHEEEEEECCCCEEEEEEECCEEEECCC TTIQGIAGLKTEKTTENSDITFIKPENLDQKNKDETQQKQVDGYFIGLDFKQIKNFKSFQ CEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHH SYLYQNKKSLYSLANLFPPELIDKQAVILGPNSKPIKNFSAEINQNLDNLAIVELANRTG HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCC ENRFYRQELRNSSPFLLEKSKEIIEDDQDIVLEIIKTPSIEISAFSSSNYQLNSKTSLNL CCHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCEEECCCEEEEE NGKTIYNINPVSQKWSPFPNYLNLDWAQIGPNPKKTTDKNGSNNEKINKNSSIILKGIAV CCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEE YNDPELTTKTRNFARDQIRNAFIKAYIK ECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific activity: NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA