Definition | Ehrlichia ruminantium str. Gardel, complete genome. |
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Accession | NC_006831 |
Length | 1,499,920 |
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The map label for this gene is 58617614
Identifier: 58617614
GI number: 58617614
Start: 1416066
End: 1417748
Strand: Reverse
Name: 58617614
Synonym: ERGA_CDS_08870
Alternate gene names: NA
Gene position: 1417748-1416066 (Counterclockwise)
Preceding gene: 58617615
Following gene: 58617613
Centisome position: 94.52
GC content: 31.08
Gene sequence:
>1683_bases ATGTATGATCCTGCTAAGTATAAGTTTTATAAGGAATGGTTTGACAATTTAAGATATACCATATTTTATAATCCAAGTAT TGGTATGTTTTGTTCAGGAAAGGTAATTAGAAATCTTACTCCTGCTGCTTTTGTTATTCAAAATAAAGATGATGCGCTAA ATGAATCTTTTTTACAAAGGGTATTAATACATACTTCTACTAATAAAGACGATATACGTAAGACTGTATCATTTATACGT TCGCTAGGGTTTTTGCCAGTAGTGCATTCCAGTTATGATATTGGTATTTCTGAATGTACTTATCGTGAAGGTAAAGCTTA TTCTAATCCTAAAACTGTTTTTATTATTTCTACATGTGATGGTGCTAAAGAGCACACTCCTGAAAGTGATATATATGATA TCATTTTAAAAAGTCAAAGAGATTTTGTTGATGAGTTAGAAATACAAGCTGGTACTGATCGAGTTTTTCGAGTTGAAAAA TATGATGTCAGTAGTAAACCATTAAGTCATGAAATATATGATTCTGTATTATATGCTGAAAGATGGTCTTTATTAACTAT ACGTGAGAAAATATTAAGATGTTGTTTTACTGTAGTATTTGCTCCTACTATTGTTATTCCTATTGTTCTTTTATTATCTT ATGTTGGGAATAGAAGTGTTCAAGAAGAAGCAAGTAGTATGAATTTACTTTCATGGCAGTATAGAGAGTATAATCAAGGT ATACGTACTGTTTCTGAGGATCTTCTAAATGATGATATTCCTTCTACGAAAAGAGAGAGAATTTTATCACATATAAAACA AGAAGCTGAAAAACAGAGTTTTATGGTCAATGATGGCAAAGGAAATTTACAGATTACTGAGTTAGGAAAGAAAGTAGGTA CAAAACACAATTTGTTTCTTATGGCAGGTAACAATGAGCTTACAAAAAGGCAATTACTGTTAAGATGTACTACTTTTCTA ATACTAGGATCTGTGTATCTTTTAAAACTTGTGGCTTTATCATGTCATTTCTTTAAATTTGATAGAATAGCTTTATACTG TTCTGTTGTATCGTATTTTATAATGTTTCTAGGAGGATTGTATTTACTATCGTATAAGAATAAAATCTCAAGAGTCTGTG CAGCGTTTATTATTGGATTTGCAGGTATTTTTATGGCCACAAATGTATTGATGTTGTGTTACGATGCTAAATTTGGTCAT GAGTTTGTATTATCTAGTGTAATAGCTGGAATAACTGGAACAATGATAGCTATTACTTTGATATGTCATTTTCTGCGTAG GAAAGATCGAAAAATAGTATCAAAATTAGATGGTCTTAGTACTACAGCTTACTTATCTATAAAAGATCACCTGAAAATGT TTGATGACATTGAATATATCAAAATTGGCAAATATGAATTTATGTTTGTTGAAAGTGTTAATATGCCTATTTATAATGCC TGTAAAGCTGGTGTGTTTGGTCAGCAGGCATTAGATAATCTACAAGAGGAAAAAAGTACTGAGGATATTGATACAGTTCC TAGGGTAGATGATGATACTTTATTACCTGATCCTGCTGTTCAAGATTCAAGAGTTAATGTAGGTGCTACAGGTTGTGAAA TTACTGAACTGCTAGATAGTGACATAGAAGATGCAGTTGTAACAGGCACTGCTAGTAATACATCTAGAGAAACATCACGT TAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTATTGTAGTAAAGCTTTTACTTATAATATTTAAAAAATTAATGTAAAATCAGTAATTATGTAGTATTGTGATTGTAAAT AGGTAATAAGTTAAAAACTA
Downstream 100 bases:
>100_bases AGTTTATGGAAAAACTTATTAATTTAGTGATATGTGATGTAATATCCAATAATAGAAAAAATGTTATTTGTGTTTATAAA ACATTTAGTATAGTTGGTGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 560; Mature: 560
Protein sequence:
>560_residues MYDPAKYKFYKEWFDNLRYTIFYNPSIGMFCSGKVIRNLTPAAFVIQNKDDALNESFLQRVLIHTSTNKDDIRKTVSFIR SLGFLPVVHSSYDIGISECTYREGKAYSNPKTVFIISTCDGAKEHTPESDIYDIILKSQRDFVDELEIQAGTDRVFRVEK YDVSSKPLSHEIYDSVLYAERWSLLTIREKILRCCFTVVFAPTIVIPIVLLLSYVGNRSVQEEASSMNLLSWQYREYNQG IRTVSEDLLNDDIPSTKRERILSHIKQEAEKQSFMVNDGKGNLQITELGKKVGTKHNLFLMAGNNELTKRQLLLRCTTFL ILGSVYLLKLVALSCHFFKFDRIALYCSVVSYFIMFLGGLYLLSYKNKISRVCAAFIIGFAGIFMATNVLMLCYDAKFGH EFVLSSVIAGITGTMIAITLICHFLRRKDRKIVSKLDGLSTTAYLSIKDHLKMFDDIEYIKIGKYEFMFVESVNMPIYNA CKAGVFGQQALDNLQEEKSTEDIDTVPRVDDDTLLPDPAVQDSRVNVGATGCEITELLDSDIEDAVVTGTASNTSRETSR
Sequences:
>Translated_560_residues MYDPAKYKFYKEWFDNLRYTIFYNPSIGMFCSGKVIRNLTPAAFVIQNKDDALNESFLQRVLIHTSTNKDDIRKTVSFIR SLGFLPVVHSSYDIGISECTYREGKAYSNPKTVFIISTCDGAKEHTPESDIYDIILKSQRDFVDELEIQAGTDRVFRVEK YDVSSKPLSHEIYDSVLYAERWSLLTIREKILRCCFTVVFAPTIVIPIVLLLSYVGNRSVQEEASSMNLLSWQYREYNQG IRTVSEDLLNDDIPSTKRERILSHIKQEAEKQSFMVNDGKGNLQITELGKKVGTKHNLFLMAGNNELTKRQLLLRCTTFL ILGSVYLLKLVALSCHFFKFDRIALYCSVVSYFIMFLGGLYLLSYKNKISRVCAAFIIGFAGIFMATNVLMLCYDAKFGH EFVLSSVIAGITGTMIAITLICHFLRRKDRKIVSKLDGLSTTAYLSIKDHLKMFDDIEYIKIGKYEFMFVESVNMPIYNA CKAGVFGQQALDNLQEEKSTEDIDTVPRVDDDTLLPDPAVQDSRVNVGATGCEITELLDSDIEDAVVTGTASNTSRETSR >Mature_560_residues MYDPAKYKFYKEWFDNLRYTIFYNPSIGMFCSGKVIRNLTPAAFVIQNKDDALNESFLQRVLIHTSTNKDDIRKTVSFIR SLGFLPVVHSSYDIGISECTYREGKAYSNPKTVFIISTCDGAKEHTPESDIYDIILKSQRDFVDELEIQAGTDRVFRVEK YDVSSKPLSHEIYDSVLYAERWSLLTIREKILRCCFTVVFAPTIVIPIVLLLSYVGNRSVQEEASSMNLLSWQYREYNQG IRTVSEDLLNDDIPSTKRERILSHIKQEAEKQSFMVNDGKGNLQITELGKKVGTKHNLFLMAGNNELTKRQLLLRCTTFL ILGSVYLLKLVALSCHFFKFDRIALYCSVVSYFIMFLGGLYLLSYKNKISRVCAAFIIGFAGIFMATNVLMLCYDAKFGH EFVLSSVIAGITGTMIAITLICHFLRRKDRKIVSKLDGLSTTAYLSIKDHLKMFDDIEYIKIGKYEFMFVESVNMPIYNA CKAGVFGQQALDNLQEEKSTEDIDTVPRVDDDTLLPDPAVQDSRVNVGATGCEITELLDSDIEDAVVTGTASNTSRETSR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 63583; Mature: 63583
Theoretical pI: Translated: 6.51; Mature: 6.51
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.3 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 4.5 %Cys+Met (Translated Protein) 2.3 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 4.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MYDPAKYKFYKEWFDNLRYTIFYNPSIGMFCSGKVIRNLTPAAFVIQNKDDALNESFLQR CCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCEECCHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHH VLIHTSTNKDDIRKTVSFIRSLGFLPVVHSSYDIGISECTYREGKAYSNPKTVFIISTCD HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCC GAKEHTPESDIYDIILKSQRDFVDELEIQAGTDRVFRVEKYDVSSKPLSHEIYDSVLYAE CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHH RWSLLTIREKILRCCFTVVFAPTIVIPIVLLLSYVGNRSVQEEASSMNLLSWQYREYNQG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH IRTVSEDLLNDDIPSTKRERILSHIKQEAEKQSFMVNDGKGNLQITELGKKVGTKHNLFL HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCEEHHHHHHHHCCCCCEEE MAGNNELTKRQLLLRCTTFLILGSVYLLKLVALSCHFFKFDRIALYCSVVSYFIMFLGGL EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLLSYKNKISRVCAAFIIGFAGIFMATNVLMLCYDAKFGHEFVLSSVIAGITGTMIAITL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ICHFLRRKDRKIVSKLDGLSTTAYLSIKDHLKMFDDIEYIKIGKYEFMFVESVNMPIYNA HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCCEEEECCEEEEEEEECCCCHHHH CKAGVFGQQALDNLQEEKSTEDIDTVPRVDDDTLLPDPAVQDSRVNVGATGCEITELLDS HHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHHHHHC DIEDAVVTGTASNTSRETSR CCCHHEEECCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MYDPAKYKFYKEWFDNLRYTIFYNPSIGMFCSGKVIRNLTPAAFVIQNKDDALNESFLQR CCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCEECCHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHH VLIHTSTNKDDIRKTVSFIRSLGFLPVVHSSYDIGISECTYREGKAYSNPKTVFIISTCD HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCC GAKEHTPESDIYDIILKSQRDFVDELEIQAGTDRVFRVEKYDVSSKPLSHEIYDSVLYAE CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHH RWSLLTIREKILRCCFTVVFAPTIVIPIVLLLSYVGNRSVQEEASSMNLLSWQYREYNQG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH IRTVSEDLLNDDIPSTKRERILSHIKQEAEKQSFMVNDGKGNLQITELGKKVGTKHNLFL HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCEEHHHHHHHHCCCCCEEE MAGNNELTKRQLLLRCTTFLILGSVYLLKLVALSCHFFKFDRIALYCSVVSYFIMFLGGL EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLLSYKNKISRVCAAFIIGFAGIFMATNVLMLCYDAKFGHEFVLSSVIAGITGTMIAITL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ICHFLRRKDRKIVSKLDGLSTTAYLSIKDHLKMFDDIEYIKIGKYEFMFVESVNMPIYNA HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCCEEEECCEEEEEEEECCCCHHHH CKAGVFGQQALDNLQEEKSTEDIDTVPRVDDDTLLPDPAVQDSRVNVGATGCEITELLDS HHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHHHHHC DIEDAVVTGTASNTSRETSR CCCHHEEECCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA