Definition Ehrlichia ruminantium str. Gardel, complete genome.
Accession NC_006831
Length 1,499,920

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The map label for this gene is 58617614

Identifier: 58617614

GI number: 58617614

Start: 1416066

End: 1417748

Strand: Reverse

Name: 58617614

Synonym: ERGA_CDS_08870

Alternate gene names: NA

Gene position: 1417748-1416066 (Counterclockwise)

Preceding gene: 58617615

Following gene: 58617613

Centisome position: 94.52

GC content: 31.08

Gene sequence:

>1683_bases
ATGTATGATCCTGCTAAGTATAAGTTTTATAAGGAATGGTTTGACAATTTAAGATATACCATATTTTATAATCCAAGTAT
TGGTATGTTTTGTTCAGGAAAGGTAATTAGAAATCTTACTCCTGCTGCTTTTGTTATTCAAAATAAAGATGATGCGCTAA
ATGAATCTTTTTTACAAAGGGTATTAATACATACTTCTACTAATAAAGACGATATACGTAAGACTGTATCATTTATACGT
TCGCTAGGGTTTTTGCCAGTAGTGCATTCCAGTTATGATATTGGTATTTCTGAATGTACTTATCGTGAAGGTAAAGCTTA
TTCTAATCCTAAAACTGTTTTTATTATTTCTACATGTGATGGTGCTAAAGAGCACACTCCTGAAAGTGATATATATGATA
TCATTTTAAAAAGTCAAAGAGATTTTGTTGATGAGTTAGAAATACAAGCTGGTACTGATCGAGTTTTTCGAGTTGAAAAA
TATGATGTCAGTAGTAAACCATTAAGTCATGAAATATATGATTCTGTATTATATGCTGAAAGATGGTCTTTATTAACTAT
ACGTGAGAAAATATTAAGATGTTGTTTTACTGTAGTATTTGCTCCTACTATTGTTATTCCTATTGTTCTTTTATTATCTT
ATGTTGGGAATAGAAGTGTTCAAGAAGAAGCAAGTAGTATGAATTTACTTTCATGGCAGTATAGAGAGTATAATCAAGGT
ATACGTACTGTTTCTGAGGATCTTCTAAATGATGATATTCCTTCTACGAAAAGAGAGAGAATTTTATCACATATAAAACA
AGAAGCTGAAAAACAGAGTTTTATGGTCAATGATGGCAAAGGAAATTTACAGATTACTGAGTTAGGAAAGAAAGTAGGTA
CAAAACACAATTTGTTTCTTATGGCAGGTAACAATGAGCTTACAAAAAGGCAATTACTGTTAAGATGTACTACTTTTCTA
ATACTAGGATCTGTGTATCTTTTAAAACTTGTGGCTTTATCATGTCATTTCTTTAAATTTGATAGAATAGCTTTATACTG
TTCTGTTGTATCGTATTTTATAATGTTTCTAGGAGGATTGTATTTACTATCGTATAAGAATAAAATCTCAAGAGTCTGTG
CAGCGTTTATTATTGGATTTGCAGGTATTTTTATGGCCACAAATGTATTGATGTTGTGTTACGATGCTAAATTTGGTCAT
GAGTTTGTATTATCTAGTGTAATAGCTGGAATAACTGGAACAATGATAGCTATTACTTTGATATGTCATTTTCTGCGTAG
GAAAGATCGAAAAATAGTATCAAAATTAGATGGTCTTAGTACTACAGCTTACTTATCTATAAAAGATCACCTGAAAATGT
TTGATGACATTGAATATATCAAAATTGGCAAATATGAATTTATGTTTGTTGAAAGTGTTAATATGCCTATTTATAATGCC
TGTAAAGCTGGTGTGTTTGGTCAGCAGGCATTAGATAATCTACAAGAGGAAAAAAGTACTGAGGATATTGATACAGTTCC
TAGGGTAGATGATGATACTTTATTACCTGATCCTGCTGTTCAAGATTCAAGAGTTAATGTAGGTGCTACAGGTTGTGAAA
TTACTGAACTGCTAGATAGTGACATAGAAGATGCAGTTGTAACAGGCACTGCTAGTAATACATCTAGAGAAACATCACGT
TAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATTGTAGTAAAGCTTTTACTTATAATATTTAAAAAATTAATGTAAAATCAGTAATTATGTAGTATTGTGATTGTAAAT
AGGTAATAAGTTAAAAACTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGTTTATGGAAAAACTTATTAATTTAGTGATATGTGATGTAATATCCAATAATAGAAAAAATGTTATTTGTGTTTATAAA
ACATTTAGTATAGTTGGTGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 560; Mature: 560

Protein sequence:

>560_residues
MYDPAKYKFYKEWFDNLRYTIFYNPSIGMFCSGKVIRNLTPAAFVIQNKDDALNESFLQRVLIHTSTNKDDIRKTVSFIR
SLGFLPVVHSSYDIGISECTYREGKAYSNPKTVFIISTCDGAKEHTPESDIYDIILKSQRDFVDELEIQAGTDRVFRVEK
YDVSSKPLSHEIYDSVLYAERWSLLTIREKILRCCFTVVFAPTIVIPIVLLLSYVGNRSVQEEASSMNLLSWQYREYNQG
IRTVSEDLLNDDIPSTKRERILSHIKQEAEKQSFMVNDGKGNLQITELGKKVGTKHNLFLMAGNNELTKRQLLLRCTTFL
ILGSVYLLKLVALSCHFFKFDRIALYCSVVSYFIMFLGGLYLLSYKNKISRVCAAFIIGFAGIFMATNVLMLCYDAKFGH
EFVLSSVIAGITGTMIAITLICHFLRRKDRKIVSKLDGLSTTAYLSIKDHLKMFDDIEYIKIGKYEFMFVESVNMPIYNA
CKAGVFGQQALDNLQEEKSTEDIDTVPRVDDDTLLPDPAVQDSRVNVGATGCEITELLDSDIEDAVVTGTASNTSRETSR

Sequences:

>Translated_560_residues
MYDPAKYKFYKEWFDNLRYTIFYNPSIGMFCSGKVIRNLTPAAFVIQNKDDALNESFLQRVLIHTSTNKDDIRKTVSFIR
SLGFLPVVHSSYDIGISECTYREGKAYSNPKTVFIISTCDGAKEHTPESDIYDIILKSQRDFVDELEIQAGTDRVFRVEK
YDVSSKPLSHEIYDSVLYAERWSLLTIREKILRCCFTVVFAPTIVIPIVLLLSYVGNRSVQEEASSMNLLSWQYREYNQG
IRTVSEDLLNDDIPSTKRERILSHIKQEAEKQSFMVNDGKGNLQITELGKKVGTKHNLFLMAGNNELTKRQLLLRCTTFL
ILGSVYLLKLVALSCHFFKFDRIALYCSVVSYFIMFLGGLYLLSYKNKISRVCAAFIIGFAGIFMATNVLMLCYDAKFGH
EFVLSSVIAGITGTMIAITLICHFLRRKDRKIVSKLDGLSTTAYLSIKDHLKMFDDIEYIKIGKYEFMFVESVNMPIYNA
CKAGVFGQQALDNLQEEKSTEDIDTVPRVDDDTLLPDPAVQDSRVNVGATGCEITELLDSDIEDAVVTGTASNTSRETSR
>Mature_560_residues
MYDPAKYKFYKEWFDNLRYTIFYNPSIGMFCSGKVIRNLTPAAFVIQNKDDALNESFLQRVLIHTSTNKDDIRKTVSFIR
SLGFLPVVHSSYDIGISECTYREGKAYSNPKTVFIISTCDGAKEHTPESDIYDIILKSQRDFVDELEIQAGTDRVFRVEK
YDVSSKPLSHEIYDSVLYAERWSLLTIREKILRCCFTVVFAPTIVIPIVLLLSYVGNRSVQEEASSMNLLSWQYREYNQG
IRTVSEDLLNDDIPSTKRERILSHIKQEAEKQSFMVNDGKGNLQITELGKKVGTKHNLFLMAGNNELTKRQLLLRCTTFL
ILGSVYLLKLVALSCHFFKFDRIALYCSVVSYFIMFLGGLYLLSYKNKISRVCAAFIIGFAGIFMATNVLMLCYDAKFGH
EFVLSSVIAGITGTMIAITLICHFLRRKDRKIVSKLDGLSTTAYLSIKDHLKMFDDIEYIKIGKYEFMFVESVNMPIYNA
CKAGVFGQQALDNLQEEKSTEDIDTVPRVDDDTLLPDPAVQDSRVNVGATGCEITELLDSDIEDAVVTGTASNTSRETSR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 63583; Mature: 63583

Theoretical pI: Translated: 6.51; Mature: 6.51

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.3 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
2.3 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
4.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYDPAKYKFYKEWFDNLRYTIFYNPSIGMFCSGKVIRNLTPAAFVIQNKDDALNESFLQR
CCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCEECCHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHH
VLIHTSTNKDDIRKTVSFIRSLGFLPVVHSSYDIGISECTYREGKAYSNPKTVFIISTCD
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCC
GAKEHTPESDIYDIILKSQRDFVDELEIQAGTDRVFRVEKYDVSSKPLSHEIYDSVLYAE
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
RWSLLTIREKILRCCFTVVFAPTIVIPIVLLLSYVGNRSVQEEASSMNLLSWQYREYNQG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
IRTVSEDLLNDDIPSTKRERILSHIKQEAEKQSFMVNDGKGNLQITELGKKVGTKHNLFL
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCEEHHHHHHHHCCCCCEEE
MAGNNELTKRQLLLRCTTFLILGSVYLLKLVALSCHFFKFDRIALYCSVVSYFIMFLGGL
EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YLLSYKNKISRVCAAFIIGFAGIFMATNVLMLCYDAKFGHEFVLSSVIAGITGTMIAITL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ICHFLRRKDRKIVSKLDGLSTTAYLSIKDHLKMFDDIEYIKIGKYEFMFVESVNMPIYNA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCCEEEECCEEEEEEEECCCCHHHH
CKAGVFGQQALDNLQEEKSTEDIDTVPRVDDDTLLPDPAVQDSRVNVGATGCEITELLDS
HHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHHHHHC
DIEDAVVTGTASNTSRETSR
CCCHHEEECCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MYDPAKYKFYKEWFDNLRYTIFYNPSIGMFCSGKVIRNLTPAAFVIQNKDDALNESFLQR
CCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCEECCHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHH
VLIHTSTNKDDIRKTVSFIRSLGFLPVVHSSYDIGISECTYREGKAYSNPKTVFIISTCD
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCC
GAKEHTPESDIYDIILKSQRDFVDELEIQAGTDRVFRVEKYDVSSKPLSHEIYDSVLYAE
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
RWSLLTIREKILRCCFTVVFAPTIVIPIVLLLSYVGNRSVQEEASSMNLLSWQYREYNQG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
IRTVSEDLLNDDIPSTKRERILSHIKQEAEKQSFMVNDGKGNLQITELGKKVGTKHNLFL
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MAGNNELTKRQLLLRCTTFLILGSVYLLKLVALSCHFFKFDRIALYCSVVSYFIMFLGGL
EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YLLSYKNKISRVCAAFIIGFAGIFMATNVLMLCYDAKFGHEFVLSSVIAGITGTMIAITL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ICHFLRRKDRKIVSKLDGLSTTAYLSIKDHLKMFDDIEYIKIGKYEFMFVESVNMPIYNA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCCEEEECCEEEEEEEECCCCHHHH
CKAGVFGQQALDNLQEEKSTEDIDTVPRVDDDTLLPDPAVQDSRVNVGATGCEITELLDS
HHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHHHHHC
DIEDAVVTGTASNTSRETSR
CCCHHEEECCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA