Definition | Staphylococcus epidermidis RP62A, complete genome. |
---|---|
Accession | NC_002976 |
Length | 2,616,530 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is Not Available
Identifier: 57865675
GI number:
Start: 2376393
End: 2383556
Strand: Reverse
Name: Not Available
Synonym: SERP2338
Alternate gene names: NA
Gene position: NA
Preceding gene: 57865676
Following gene: 57865674
Centisome position: NA
GC content: NA
Gene sequence:
>7164_bases ATGAATATTGAAGCACTATATTTTCAAAAATATTTTTATTTTAAACATTTAAATCAATCAAGTTCAGAACACAGTGTGAC ATACTGGGTAAAGTTAAGTCGCGACATTGAGTTACATAGATTAATGTATGCATTAGTAGATGTCGTTCAAAATCAACCTG TGTTGCGTACACAGTTTGTGACAGATGATTTTAATCAACTCAAGATAAATTTAAGAGATTTTTTTCCATTTATTGAAATT AAAGAAGTTAATGAAATGTCGCAAAGCATAGATTTAGAAGCATTCTTTACACGTAATTTAAATTCCTACCATTTCAATCA ATTACCTCTGTTTAATTTTAAGATATATCAATTTCTAGATGACGCCTACTTACTTTTAGATTTCCATGCTACTATTTTTA ATGAAAGTCAATTAACTCCATTTTTACAACAATTAAATATCGCCTATACCCACTCTTTAAAAAGTGAATATAGTATCTCG GATTTTTATAATTGGATTAAAGAAATGAATCAAAAGATGGATCAAAATCAAGTTGTGTGTCCATCAAAGCACTTCAACGT ATTGAATGCAGACGGTGATAATTACGCTTACATACCTGTTAAGAATACATGTGAAAAGAAAAAAATGTGTTCTTTGCATG CAGAACTACCATCTTTAGACATTGATGTGTGGATTGTAAGTATTTACTTAGCGCATCATTTTATAAGTCAATCTTCTGAT GTGACGTTAGGCATCCATTTTTCGATAGATAATAAAAATACTGAGAATATGATGGTTTTAAACACAGACATTGCCCCACT TAATTTAAGTATTAGTCAAAGTGACGTCGTAAAAGATATGGTAGATGAGTGTTCCGCGCTACTTGAAGAGCTTCAAATGT GTGGTGCGTCTTTTGTTGTTCAACCTAAAGCAGTACAAACAGATGTAGAAACGATGATTCATATTGAAAAAGTACAAGAA CAATTTGAGCTTAATCATATATGTCATCATATACATCGTCTATACAATGAAGCATCATCATTCGCGGATTTAGAGTTTTA TCCTCATGTGCAGGATGGTTTTGATATAGTTTATAATGACAACGTTTATGATGATTTAACTGTACATACGTTAGTCAAAT TAATTAATGGGATTTATATGCAAATTACACAAAATCCATCATTATTAATTAAAGATATAAAACTCAGTGATCGCTCAGAT TTAGCTAAATATAATGACATCAATAATCAAAACAATGACATTAATTATAGTGAGGTCACTTATAAAACCGTGGTTGAAAG ATTCGAACGTCAAGTGCACCAACATCCCGATAGTATTGCGTTGCAATATGAACAACGATCGATGACATATCATCAATTAA ATCAATGTGCGAATCTTTTAGCATATAGATTGCGTTTAAATCATCAGATTGAACCTAATGATATGGTGGCATTAATAGCA GAACGCAGCTTAGAAATGATTATTGGAATGTTAGGGATCTTGAAAGCTGGTGCAGGCTACATACCAATTGATCCGGATTA TCCTGAAGAAAGAATGAATTATATTATTGAGGACGCAAAACCTAAAGCGGTTGTAACATATCGTACATCATTTCAATCAG GTTTACCTCAAATGGATATAGAATTGATAGTTGATTCAAGAGAACATGATATTGATAACCCGAGAGGCATTAATTGTTCA GAAGATATCGCTTATGTCATCTATACATCAGGAACGACTGGTAAACCTAAAGGGACACTGGTGCCACATAGAGGAATTGA TCGCTTAGTACACAATCCAAATTATGTCGAATTGAACGAAAATACAACCGTCTTATTATCAGGAACAGTAGCTTTTGATG CAGCAACCTTTGAAATATATGGTCCATTATTGAATGGTGGACGGTTAGTCATTACATCTAAAGATACGTTGTTAAATCCT CAATTGTTAGATCAAGCTATTACTGAAAATAAAGTCAACACGATGTGGTTAACGTCATCTTTATTTAATCAAATTGCTAG CGAACGTATCGAAGCACTAGAATCTTTAACTTATTTGCTTATTGGTGGGGAAGTGTTAAATGCTAAATGGGTTCACTTAT TAAATTCGCGTGAGTGTCATCCTCAAATAATCAATGGTTATGGACCGACAGAGAATACAACATTTACTACAACTTTTGCG ATTCCACAAGAGATGCCTTCACGTATACCTATTGGTTTACCTATTAGTGGAACGACAGTTTATGTCATGCAAGGTGATCG TATTTGTGGCGTAGGTGTTCCAGGTGAATTGTGCATTGGTGGTGCAGGTTTAGCAAAAGGTTATTTAAATCAACCTAAAC TTACTGCTGAACGTTTTATTCAGTCACCTTTTAATAATGAAATGCTTTATCGAAGCGGTGATTTAGTTCGCCTTCAAGAA GATGGCTATATTGATTATATTAGTCGTATCGATAAGCAAGTTAAAATACGTGGTTTTAGAATAGAATTATCAGAAATTGA AAAAGCATTAGAAGCTATACGTGATATTAATAAAGCTGTAGTCATCGTTCGAGAGCAAGACCAAGATAAACAAATAGTGG CATATTATGAAGCATCGCAATTAAAATCAACAGGTCAATTAAAAGATATTTTAAGTGAAACATTACCTGAATATATGATA CCTGTACATTTTATGAAGGTAGATCGTATACCTATCACGATGAATGGGAAATTAGATGTGCGTGCATTACCTGAAATTAA TCTAAAGAATAATAGAAATTATGTAGAACCACGTAACGATATTGAACGCACTGTTTGCCGTATTTTCGAAGAGATTTTAC ATGTTGATCAAGTAGGTGTTAAAGATAATTTCTTTGAACTAGGTGGACACTCTCTTAGAGCAACATTAGTTGTAAACCGT ATTGAAGAAAGGTTAAAAAAACGTCTTAAAGTAGGTGATTTAATGAAATCGCCTACTGTAGAGCAACTTGGACAACAAAT TGAAGAACTGCAAAATGATGTCTATGAAGTGATTCCCAAAGCAAATGAATCGTATCAATATGATTTAAGTGCGTCTCAAA AAAGTATGTATCTTTTATGGAAGGTCAATCCTAAAGACACAGTGTATAACATTCCATTCTTATGGAGATTATCTTCTGAA CTTAATGTTATGCAATTGCAACGTGCATTATCTAAGTTGATTGAACGTCATGAAATATTACGAACACAATATGTAATTGA TGACAATGAAGTTAAACAACGTATTGCGACACATGTTTCGCCTGATTTTGAAGAGGTAACGACATCTCTAACGAACGAGC AAGATATTATTCAATCATTTATGGAACCGTTTGATTTAGAACAATCAAGTCAGATGCGAGTTAAATATATACATGGACCA CAACAAGATTATTTATTTATGGATACTCATCATAGTATTAATGATGGTATGAGTAACACGATTTTACTATCTGATTTGAA CGCTTTATACCAAGATAAATCATTACCTGAACTTAAGCTTCAGTATAAAGATTATAGTGAGTGGATGGTGCACAGAGACT TATCTAAACAACGTCACTTTTGGTTACAACAATTTGAAAATCAGGTTCCAATATTAAATATGCCTACGGATTATCCTAGA CCAAGTATTAAAACAACCAACGGTAATATGTTGACATTTCATTACAATCGTCAAATCAAACAGCAATTGAAATCTTATGT AGAACAACATCAAGTGACAGACTTTATGTTCTTTGCTAGTGCAATCATGGTATTATTGCACAAATATACACGTCAGGACG ATATCGCTATTGGTAGTGTAATCAGTGCGCGTACTCATCGCGATACTGAAAATATGTTAGGTATGTTTGCTAATACACTT GTATATCGTGGTCGACCTCATGATCAAAAGACATGGGATCAATTGATGGCTGAGATGAAAGAAATGTGTCTAGGGGCATA TGAACATCAAGAATATCCTTTTGAAAGCTTAGTCAATGATCTTGTTGATGAAAGAGATGCTTCACATAATCCGTTATTTG ATGTGATGCTCGTACTTCAAAATAATGAAACAAATCATGCGAATTTTGGACATAGTCAATTGACACATATTCCACCTCAG TCAACAACAGCTAAATTTGATTTGTCATTTATTATTGAAGAAGATCAAGATGACTATGTCATCAATATTGAATATAATAC AGATTTATATAAACAAGAGACCATTCATCATATTGCTGAACAACTTCAAATGATTATTAAACATGTAATATCTACCGAAA ACCTAAAAATTCAAGATATTGATGAAAATGATGACTTATTAATTTGGTTGGACAAGCATGTGAATGATTGTTCTTTAGAC TTGCCAAAAAATAAGTCAATACAGCAACTTTTACATGATGTCATGAAAGCGAAAGCAGATGATGTAGCACTTAAAATGAA TGGACAATCGATGACGTATCAAGAACTTGATGATTATTCTAATAGTATGGCTCAAACATTGATACAAAATGGAATTCAAA AAGGGGAACGTGTAGCCCTTTTAACTGAACGAAGTTTTGAAATGGTTGCTAGTATGATTGCTGTATTAAAAGTTGGAGGT TCTTATGTACCTATTGACGTCACTTATCCCAATAAACGCATTGAATTTATTATTGAAGACGCTGAAGTCGCAGCAGTGCT CACATATGGAAAAACAATATCCTCACATATACCAGTAATTAAAATTGAAGATATTGATAACACTGAAAATAATAAAAGGT TAAATATAGAATATGCAGGGAATTTGGAAGATGATATGTATCATATTTATACATCTGGAACAACAGGAAAGCCTAAAGCA GTATCAGTGAAACAACGTAATATATTAAATTTAGTATGTGCTTGGACAAAAAGACTCAATTTATCCGATGATGAAGTTTA TCTGCAGTACGCTAATTATGTGTTCGATGCTTCAGCAACTGATTTCTACTGTAGTTTATTAAATGGATATCCGCTTGTCA TTGCAACATCAGTTGAGCGGACCAATACAGATTTATTAGAAAAGGTAATTTCACAAGAAAATATCACCATCGCATCTATT CCACTACAGGTATATAATGTGATGCATCATTTCTATATTCCTAAAGTGATTACAGGAGGTGCGACAAGTACTCCAGCATT TGTTCAACATATTTCTAAGCATTGTGATATGTACGTTAATGCCTATGGGCCTTCTGAAAATACAGTTATCACATCTTGTT GGATATACGAAAAAGGTGACGCCATACCATCGACTATTCCGATTGGGAAACCGTTAGCTAATGTTGATATTTTTATTATG TCAGGCGGTAAACTATGTGGCGTTGGTATTCCAGGTGAATTATGTATTGCAGGAGAAAGTTTAACTTCAGGATATTTAAA CAGACCCGAACTTTCTGCTGAAAAATTTATAAATAATCCTTTTGGGCCAGGACAACTTTATCGAAGTGGTGATTTAGCAC GATTGATGCCAGATGGGCAAATTGAATTTCTTGGTAGAATAGACAAGCAAGTTAAAGTACATGGCTATCGCATTGAACTA GGTGAAATTGAAAATATCATTAATTCAGTAGATACTGTTACAGATAGCGTTGTTATTTTAGCTAAACAGGGTGAGCGTGA AGTGCTGCATGCTTATTATGTTGGAAGTCAAGAAGACGAAAATCATATTTCACAACATTTAAATCAATATTTGCCTAAAT ACATGATTCCTAAGACATTAACAGCTATTAGCGAAATTCCATTAACAGGAAATGATAAGGTGGATGAGTCAAGATTACCT GTACCTAATGTACACAAAAATAAATTTGTTGCACCACGTAATAATATCGAACGAGAAATAGCACAAATCGTTAGCGGAGT GTTGGACGTATCGTCTATGAGTATAGATGATGACTTCTTTGAAATGGGTGGTACATCACTAGATGCTATGGTGGTAGTAT CAAAACTAAAATCAAATGGCATACACATTACAATGCAAGATGTATATCAATTTAAAACTGTTCGTTATATAGCTAATCAC ACAGAAAAACGCCAAGCACTACCAGAAGTAGTATTACCAGATCATCTACCACAATTACAATCTTTGGTTGAAAGACGATA CCAACTAAAATCACAACACCTAACGCAATCATCTCTAGGTCATGTATTGCTAACTGGTGCAACAGGGTTCCTAGGCGCAT ATTTAATTGATGAAATGCAAGATGATGCTGATCAAATTACATGTATTGTCAGAGGTCATGATATCAATCAAGCTAAAACT AACTTGGAAAATAATTTAAATTGTTATTTTGATACGGCTCATGTGGATAAATTAATGAAGCACATTGATATTATTTTAGC GGATTTATCAGAACTTGACCATCTCATTATCGATTCAGCCATTGATACAATTATTCATGCTGGAGCTCGTACAGATCACT TTGGCGATGATGAAACATTTTTCGATGTCAATGTAAGAAGTACACAAGCATTAATTGATTTAGCTAAGGATAAAAAAGCG AAATTAATCTATATATCAACGATAAGTGTGGGTACGGTATTTGAAGTACATCAAGACGATATTACATTTTCTGAAAAAGA TTTATATAAAGGCCAGTTATTTACATCACCATACACTAAAAGTAAGTTTTATAGCGAGATTAAAGTGTTAGAAGCGGTTA ATGAAGGTTTAGCAGCTCAGATTATAAGATTAGGAAATCTGACAAGTGCTTCTACTGGACCATTAAATATGAAAAATTTA ACAACTAATCGTTTTAGTATTGTCATGCATGATTTATTAAAAATGCCGTTTATAGGAGAAAGTATATCGAAAGCTAAAGT TGAATTTTCATTTATCGATGTCACAGCGCGCCATATTATTAAATTGGCAAGATCCAATGCAATACCTATTATTTATCATG TATACGCACCATGTTCAATAACTATGAAACAAGTAATTGACAATGCCAAAGGGTCAGAAATGACTGTAGTAAGTGATAGT GAGTTTGAACAGAAATTACATGAATTAGGTATGCATGAATTGATTGGTCTTAATAGTAATGGAGATAATCAAATTTCAGG TGTGACAGATTCAAATATGACTCAAACAGTAATGAAAGAATTACAAGGTGAGTGGCCACATCTTTCTTACCAATGGTTGC AACAATGGTACCACTTATTGTTTGAAAAATTTGATGCCAACTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTTCTATAGTGAGAATATACTAATATAAATCATGGCTAGAAAATATGATGTAAGTTGTTTATGAGTTATTATGGGAATG AATATGAAAGAAGGACTCTA
Downstream 100 bases:
>100_bases AGGTGAATCATGTATTTGTATATTACTAAGATGACAGAAACTTTAGAGGAAGTAGAATTGCTTTTGAATAGAAGTTCTCG TCAGTTGAAAAAGCCAGAAC
Product: peptide synthetase
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: NA
Protein sequence:
>2387_residues MNIEALYFQKYFYFKHLNQSSSEHSVTYWVKLSRDIELHRLMYALVDVVQNQPVLRTQFVTDDFNQLKINLRDFFPFIEI KEVNEMSQSIDLEAFFTRNLNSYHFNQLPLFNFKIYQFLDDAYLLLDFHATIFNESQLTPFLQQLNIAYTHSLKSEYSIS DFYNWIKEMNQKMDQNQVVCPSKHFNVLNADGDNYAYIPVKNTCEKKKMCSLHAELPSLDIDVWIVSIYLAHHFISQSSD VTLGIHFSIDNKNTENMMVLNTDIAPLNLSISQSDVVKDMVDECSALLEELQMCGASFVVQPKAVQTDVETMIHIEKVQE QFELNHICHHIHRLYNEASSFADLEFYPHVQDGFDIVYNDNVYDDLTVHTLVKLINGIYMQITQNPSLLIKDIKLSDRSD LAKYNDINNQNNDINYSEVTYKTVVERFERQVHQHPDSIALQYEQRSMTYHQLNQCANLLAYRLRLNHQIEPNDMVALIA ERSLEMIIGMLGILKAGAGYIPIDPDYPEERMNYIIEDAKPKAVVTYRTSFQSGLPQMDIELIVDSREHDIDNPRGINCS EDIAYVIYTSGTTGKPKGTLVPHRGIDRLVHNPNYVELNENTTVLLSGTVAFDAATFEIYGPLLNGGRLVITSKDTLLNP QLLDQAITENKVNTMWLTSSLFNQIASERIEALESLTYLLIGGEVLNAKWVHLLNSRECHPQIINGYGPTENTTFTTTFA IPQEMPSRIPIGLPISGTTVYVMQGDRICGVGVPGELCIGGAGLAKGYLNQPKLTAERFIQSPFNNEMLYRSGDLVRLQE DGYIDYISRIDKQVKIRGFRIELSEIEKALEAIRDINKAVVIVREQDQDKQIVAYYEASQLKSTGQLKDILSETLPEYMI PVHFMKVDRIPITMNGKLDVRALPEINLKNNRNYVEPRNDIERTVCRIFEEILHVDQVGVKDNFFELGGHSLRATLVVNR IEERLKKRLKVGDLMKSPTVEQLGQQIEELQNDVYEVIPKANESYQYDLSASQKSMYLLWKVNPKDTVYNIPFLWRLSSE LNVMQLQRALSKLIERHEILRTQYVIDDNEVKQRIATHVSPDFEEVTTSLTNEQDIIQSFMEPFDLEQSSQMRVKYIHGP QQDYLFMDTHHSINDGMSNTILLSDLNALYQDKSLPELKLQYKDYSEWMVHRDLSKQRHFWLQQFENQVPILNMPTDYPR PSIKTTNGNMLTFHYNRQIKQQLKSYVEQHQVTDFMFFASAIMVLLHKYTRQDDIAIGSVISARTHRDTENMLGMFANTL VYRGRPHDQKTWDQLMAEMKEMCLGAYEHQEYPFESLVNDLVDERDASHNPLFDVMLVLQNNETNHANFGHSQLTHIPPQ STTAKFDLSFIIEEDQDDYVINIEYNTDLYKQETIHHIAEQLQMIIKHVISTENLKIQDIDENDDLLIWLDKHVNDCSLD LPKNKSIQQLLHDVMKAKADDVALKMNGQSMTYQELDDYSNSMAQTLIQNGIQKGERVALLTERSFEMVASMIAVLKVGG SYVPIDVTYPNKRIEFIIEDAEVAAVLTYGKTISSHIPVIKIEDIDNTENNKRLNIEYAGNLEDDMYHIYTSGTTGKPKA VSVKQRNILNLVCAWTKRLNLSDDEVYLQYANYVFDASATDFYCSLLNGYPLVIATSVERTNTDLLEKVISQENITIASI PLQVYNVMHHFYIPKVITGGATSTPAFVQHISKHCDMYVNAYGPSENTVITSCWIYEKGDAIPSTIPIGKPLANVDIFIM SGGKLCGVGIPGELCIAGESLTSGYLNRPELSAEKFINNPFGPGQLYRSGDLARLMPDGQIEFLGRIDKQVKVHGYRIEL GEIENIINSVDTVTDSVVILAKQGEREVLHAYYVGSQEDENHISQHLNQYLPKYMIPKTLTAISEIPLTGNDKVDESRLP VPNVHKNKFVAPRNNIEREIAQIVSGVLDVSSMSIDDDFFEMGGTSLDAMVVVSKLKSNGIHITMQDVYQFKTVRYIANH TEKRQALPEVVLPDHLPQLQSLVERRYQLKSQHLTQSSLGHVLLTGATGFLGAYLIDEMQDDADQITCIVRGHDINQAKT NLENNLNCYFDTAHVDKLMKHIDIILADLSELDHLIIDSAIDTIIHAGARTDHFGDDETFFDVNVRSTQALIDLAKDKKA KLIYISTISVGTVFEVHQDDITFSEKDLYKGQLFTSPYTKSKFYSEIKVLEAVNEGLAAQIIRLGNLTSASTGPLNMKNL TTNRFSIVMHDLLKMPFIGESISKAKVEFSFIDVTARHIIKLARSNAIPIIYHVYAPCSITMKQVIDNAKGSEMTVVSDS EFEQKLHELGMHELIGLNSNGDNQISGVTDSNMTQTVMKELQGEWPHLSYQWLQQWYHLLFEKFDAN
Sequences:
NA
Specific function: NA
COG id: COG1020
COG function: function code Q; Non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins
Gene ontology:
Cell location: NA
Metaboloic importance: NA
Operon status: NA
Operon components: NA
Similarity: NA
Homologues:
NA
Paralogues:
NA
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: NA
Theoretical pI: NA
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
NA
Transmembrane regions:
NA
Cys/Met content:
NA
Secondary structure: NA
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: NA
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: NA
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA