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The map label for this gene is mepA

Identifier: 57652594

GI number: 57652594

Start: 411374

End: 412729

Strand: Direct

Name: mepA

Synonym: SACOL0405

Alternate gene names: 57652594

Gene position: 411374-412729 (Clockwise)

Preceding gene: 57652593

Following gene: 57652595

Centisome position: 14.64

GC content: 33.04

Gene sequence:

>1356_bases
ATGAAAGACGAACAATTATATTATTTTGAGAAATCGCCAGTATTTAAAGCGATGATGCATTTCTCATTGCCAATGATGAT
AGGGACTTTATTAAGCGTTATTTATGGCATATTAAATATTTACTTTATAGGATTTTTAGAAGATAGCCACATGATTTCTG
CTATCTCTCTAACACTGCCAGTATTTGCTATCTTAATGGGGTTAGGTAATTTATTTGGCGTTGGTGCAGGAACTTATATT
TCACGTTTATTAGGTGCGAAAGACTATAGTAAGAGTAAATTTGTAAGTAGTTTCTCTATTTATGGTGGTATTGCACTAGG
ACTTATCGTGATTTTAGTTACTTTACCATTCAGTGATCAAATCGCAGCAATTTTAGGGGCGAGAGGTGAAACGTTAGCTT
TAACAAGTAATTATTTGAAAGTAATGTTTTTAAGTGCACCTTTTGTAATTTTGTTCTTCATATTAGAACAATTTGCACGT
GCAATTGGGGCACCAATGGTTTCTATGATTGGTATGTTAGCTAGTGTAGGCTTAAATATTATTTTAGATCCAATTTTAAT
TTTTGGTTTTGATTTAAACGTTGTTGGTGCAGCTTTGGGTACTGCAATCAGTAATGTTGCTGCTGCTCTGTTCTTTATCA
TTTATTTTATGAAAAATAGTGACGTTGTGTCAGTTAATATTAAACTTGCGAAACCTAATAAAGAAATGCTTTCTGAAATC
TTTAAAATCGGTATTCCTGCATTTTTAATGAGTATCTTAATGGGATTCACAGGATTAGTTTTAAATTTATTTTTAGCACA
TTATGGAAACTTCGCGATTGCAAGTTATGGTATCTCATTTAGACTTGTGCAATTTCCAGAACTTATTATCATGGGATTAT
GTGAAGGTGTTGTACCACTAATTGCATATAACTTTATGGCAAATAAAGGCCGTATGAAAGACGTTATCAAAGCAGTTATC
ATGTCTATCGGCGTTATCTTTGTTGTATGTATGAGTGCTGTATTTACAATTGGACATCATATGGTCGGACTATTTACTAC
TGATCAAGCCATTGTTGAGATGGCGACATTTATTTTGAAAGTAACAATGGCATCATTATTATTAAATGGTATAGGTTTCT
TGTTTACTGGTATGCTTCAAGCGACTGGGCAAGGTCGTGGTGCTACAATTATGGCCATTTTACAAGGTGCAATTATCATT
CCAGTATTATTTATTATGAATGCTTTGTTTGGACTAACAGGTGTCATTTGGTCATTATTAATTGCTGAGTCACTTTGTGC
TTTAGCAGCAATGTTAATCGTCTATTTATTACGTGATCGTTTGACAGTTGATACATCTGAATTAATAGAAGGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGTGTGACTGGTAGAAATCAGTCACTTTGTCTTTAATATTATAGTTAGATATCTAATTGTTAGTAAGCTAATTATTGGAA
AAGACAAGGAGTATTGAACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATATTTCGTCCACTTCTGGCTGAGTATATTTCGGTCGGAAGTGTATTTTTCGAAAAAAATAAATATATGATACGATTATG
AAAAAATAAAGTGAGATTGG

Product: MATE efflux family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 451; Mature: 451

Protein sequence:

>451_residues
MKDEQLYYFEKSPVFKAMMHFSLPMMIGTLLSVIYGILNIYFIGFLEDSHMISAISLTLPVFAILMGLGNLFGVGAGTYI
SRLLGAKDYSKSKFVSSFSIYGGIALGLIVILVTLPFSDQIAAILGARGETLALTSNYLKVMFLSAPFVILFFILEQFAR
AIGAPMVSMIGMLASVGLNIILDPILIFGFDLNVVGAALGTAISNVAAALFFIIYFMKNSDVVSVNIKLAKPNKEMLSEI
FKIGIPAFLMSILMGFTGLVLNLFLAHYGNFAIASYGISFRLVQFPELIIMGLCEGVVPLIAYNFMANKGRMKDVIKAVI
MSIGVIFVVCMSAVFTIGHHMVGLFTTDQAIVEMATFILKVTMASLLLNGIGFLFTGMLQATGQGRGATIMAILQGAIII
PVLFIMNALFGLTGVIWSLLIAESLCALAAMLIVYLLRDRLTVDTSELIEG

Sequences:

>Translated_451_residues
MKDEQLYYFEKSPVFKAMMHFSLPMMIGTLLSVIYGILNIYFIGFLEDSHMISAISLTLPVFAILMGLGNLFGVGAGTYI
SRLLGAKDYSKSKFVSSFSIYGGIALGLIVILVTLPFSDQIAAILGARGETLALTSNYLKVMFLSAPFVILFFILEQFAR
AIGAPMVSMIGMLASVGLNIILDPILIFGFDLNVVGAALGTAISNVAAALFFIIYFMKNSDVVSVNIKLAKPNKEMLSEI
FKIGIPAFLMSILMGFTGLVLNLFLAHYGNFAIASYGISFRLVQFPELIIMGLCEGVVPLIAYNFMANKGRMKDVIKAVI
MSIGVIFVVCMSAVFTIGHHMVGLFTTDQAIVEMATFILKVTMASLLLNGIGFLFTGMLQATGQGRGATIMAILQGAIII
PVLFIMNALFGLTGVIWSLLIAESLCALAAMLIVYLLRDRLTVDTSELIEG
>Mature_451_residues
MKDEQLYYFEKSPVFKAMMHFSLPMMIGTLLSVIYGILNIYFIGFLEDSHMISAISLTLPVFAILMGLGNLFGVGAGTYI
SRLLGAKDYSKSKFVSSFSIYGGIALGLIVILVTLPFSDQIAAILGARGETLALTSNYLKVMFLSAPFVILFFILEQFAR
AIGAPMVSMIGMLASVGLNIILDPILIFGFDLNVVGAALGTAISNVAAALFFIIYFMKNSDVVSVNIKLAKPNKEMLSEI
FKIGIPAFLMSILMGFTGLVLNLFLAHYGNFAIASYGISFRLVQFPELIIMGLCEGVVPLIAYNFMANKGRMKDVIKAVI
MSIGVIFVVCMSAVFTIGHHMVGLFTTDQAIVEMATFILKVTMASLLLNGIGFLFTGMLQATGQGRGATIMAILQGAIII
PVLFIMNALFGLTGVIWSLLIAESLCALAAMLIVYLLRDRLTVDTSELIEG

Specific function: Multidrug resistance efflux protein

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential)

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family. MepA subfamily

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): MEPA_STAA3 (Q2FJS9)

Other databases:

- EMBL:   CP000255
- RefSeq:   YP_493049.1
- STRING:   Q2FJS9
- EnsemblBacteria:   EBSTAT00000037411
- GeneID:   3914369
- GenomeReviews:   CP000255_GR
- KEGG:   saa:SAUSA300_0335
- eggNOG:   COG0534
- GeneTree:   EBGT00050000025193
- HOGENOM:   HBG504134
- OMA:   GNIARFE
- ProtClustDB:   CLSK884563
- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522
- PANTHER:   PTHR11206
- PANTHER:   PTHR11206:SF6
- TIGRFAMs:   TIGR00797

Pfam domain/function: PF01554 MatE

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48777; Mature: 48777

Theoretical pI: Translated: 7.54; Mature: 7.54

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

HASH(0xc6d69e8)-; HASH(0xb240604)-; HASH(0xb24f048)-; HASH(0xc5a2298)-; HASH(0xbf76440)-; HASH(0xc6252b8)-; HASH(0xb35abfc)-; HASH(0xb15d790)-; HASH(0xb013870)-; HASH(0xc8c4038)-; HASH(0xce53af4)-; HASH(0xcaa0608)-;

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
6.0 %Met     (Translated Protein)
6.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
6.0 %Met     (Mature Protein)
6.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKDEQLYYFEKSPVFKAMMHFSLPMMIGTLLSVIYGILNIYFIGFLEDSHMISAISLTLP
CCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
VFAILMGLGNLFGVGAGTYISRLLGAKDYSKSKFVSSFSIYGGIALGLIVILVTLPFSDQ
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
IAAILGARGETLALTSNYLKVMFLSAPFVILFFILEQFARAIGAPMVSMIGMLASVGLNI
HHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHH
ILDPILIFGFDLNVVGAALGTAISNVAAALFFIIYFMKNSDVVSVNIKLAKPNKEMLSEI
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHH
FKIGIPAFLMSILMGFTGLVLNLFLAHYGNFAIASYGISFRLVQFPELIIMGLCEGVVPL
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAYNFMANKGRMKDVIKAVIMSIGVIFVVCMSAVFTIGHHMVGLFTTDQAIVEMATFILK
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHH
VTMASLLLNGIGFLFTGMLQATGQGRGATIMAILQGAIIIPVLFIMNALFGLTGVIWSLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAESLCALAAMLIVYLLRDRLTVDTSELIEG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCH
>Mature Secondary Structure
MKDEQLYYFEKSPVFKAMMHFSLPMMIGTLLSVIYGILNIYFIGFLEDSHMISAISLTLP
CCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
VFAILMGLGNLFGVGAGTYISRLLGAKDYSKSKFVSSFSIYGGIALGLIVILVTLPFSDQ
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
IAAILGARGETLALTSNYLKVMFLSAPFVILFFILEQFARAIGAPMVSMIGMLASVGLNI
HHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHH
ILDPILIFGFDLNVVGAALGTAISNVAAALFFIIYFMKNSDVVSVNIKLAKPNKEMLSEI
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHH
FKIGIPAFLMSILMGFTGLVLNLFLAHYGNFAIASYGISFRLVQFPELIIMGLCEGVVPL
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAYNFMANKGRMKDVIKAVIMSIGVIFVVCMSAVFTIGHHMVGLFTTDQAIVEMATFILK
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHH
VTMASLLLNGIGFLFTGMLQATGQGRGATIMAILQGAIIIPVLFIMNALFGLTGVIWSLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAESLCALAAMLIVYLLRDRLTVDTSELIEG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCH

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA