Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 57651003

Identifier: 57651003

GI number: 57651003

Start: 2557643

End: 2558836

Strand: Reverse

Name: 57651003

Synonym: SACOL2504

Alternate gene names: NA

Gene position: 2558836-2557643 (Counterclockwise)

Preceding gene: 57651004

Following gene: 57650999

Centisome position: 91.08

GC content: 29.82

Gene sequence:

>1194_bases
ATGTTGTATTTAGAAGTTTTGAAAAATAGAAACTTTACATATTTATTGATTGGTAATTTCTTACGTCGGAGTTGTTTTGT
GCTGTTTTCGTTACAAATAATTTGGTTTACTGTTGAATTGACAAACCAATCATCTTTAAAATTATCAATGATGGTTATGA
GTCAAACACTTCCATTTATTATATTTGGTATTTTCGGTGGCGCATATTCTGATAAACATAATAAAAAGAAAATACTTTAT
CTATCTGATCTTATACTAAGTTTGATTATAATAATTATTCCTTTACTTGCAATAACATCAAATTTAAATTATCTGACGCT
TCTAACCATATCTACAGCTATCACCATTATTAACTGCTATACGGATCCTGCGTTTAGGGCAATTCTTCCTGAAATTATTG
ATGAGGAGCATTTAGCAACAAGTAATGCGTTAATCGATAGTTTGCAAAGAGGCTCAAATATTATTTTACCTGCTTTAATT
GGTGTCATTGTAATACTAGTTGGTAATGTTGGCGTCTTTTTTATTTGTAGTATATTGCTATTTTTAGGATTTATTTTTAA
TGCACTTTTAAAATATACAAATAACAACATGATTGATAGACACTCAAAAGAAGATTTTTCTGAAACTTGGGAATTCTTGA
AACAATCTAAAGAAATTCCATTTATTATAATCATCCAATTTGCCTGCATATTGATTAATACTGGCCTTTGGCGTGTTGTA
TTACCATTGTTTATTTCCAATATATTAAAAGAGGGCGTTGGTGTATATGGACTAGCTACATCATGTTTAGGTATAGCATC
TTTATTAATGTCATTGATTATGGGTTTGCTGTCAGAAAAGCGATTAATCTTTAAATTTAGTATTGGTGTTTTAGTTTGGG
GAATTGGCTTATCGATTATTAATGTGTTTCCAAGTGTGGCGATATTATATATAGGTGCAACATTATTGGGACTTGGACAA
TCTATAGAGGGACTAACAAGATCAGTTGCCATTCAAATAAAAACGCCAAATCATTTGATGGGGAAAGTATTTAGTATCTC
ATCTACATCGAATTATGCAGCGGATACATTGTCTTTAGGACTGATAAGTATAATTATACCTTTACTAAGCTTAAGTAATA
TATTTATATTAGGAGGTGTAATTATTTCAATACTTAGCTTAGCTGGGTTAAAGTTTGTTAAGAAGTCTATGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTATATTAGAATTAATTGCGCTTTGGATAAAGAGAGTTTAGAAGAAGGTCTAAAAAAGCTGGTGGATGCATTCAATTAT
TTTTATGAGAGGTGATAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACATTATAGAATTTTAATAAATGCTATTAAGGTGGGAATTGAAATGAAATATAAAATTAGTTTGGCTTATAATTTAGCAA
TTATAATAGGGTCGCTAATT

Product: permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 397; Mature: 397

Protein sequence:

>397_residues
MLYLEVLKNRNFTYLLIGNFLRRSCFVLFSLQIIWFTVELTNQSSLKLSMMVMSQTLPFIIFGIFGGAYSDKHNKKKILY
LSDLILSLIIIIIPLLAITSNLNYLTLLTISTAITIINCYTDPAFRAILPEIIDEEHLATSNALIDSLQRGSNIILPALI
GVIVILVGNVGVFFICSILLFLGFIFNALLKYTNNNMIDRHSKEDFSETWEFLKQSKEIPFIIIIQFACILINTGLWRVV
LPLFISNILKEGVGVYGLATSCLGIASLLMSLIMGLLSEKRLIFKFSIGVLVWGIGLSIINVFPSVAILYIGATLLGLGQ
SIEGLTRSVAIQIKTPNHLMGKVFSISSTSNYAADTLSLGLISIIIPLLSLSNIFILGGVIISILSLAGLKFVKKSM

Sequences:

>Translated_397_residues
MLYLEVLKNRNFTYLLIGNFLRRSCFVLFSLQIIWFTVELTNQSSLKLSMMVMSQTLPFIIFGIFGGAYSDKHNKKKILY
LSDLILSLIIIIIPLLAITSNLNYLTLLTISTAITIINCYTDPAFRAILPEIIDEEHLATSNALIDSLQRGSNIILPALI
GVIVILVGNVGVFFICSILLFLGFIFNALLKYTNNNMIDRHSKEDFSETWEFLKQSKEIPFIIIIQFACILINTGLWRVV
LPLFISNILKEGVGVYGLATSCLGIASLLMSLIMGLLSEKRLIFKFSIGVLVWGIGLSIINVFPSVAILYIGATLLGLGQ
SIEGLTRSVAIQIKTPNHLMGKVFSISSTSNYAADTLSLGLISIIIPLLSLSNIFILGGVIISILSLAGLKFVKKSM
>Mature_397_residues
MLYLEVLKNRNFTYLLIGNFLRRSCFVLFSLQIIWFTVELTNQSSLKLSMMVMSQTLPFIIFGIFGGAYSDKHNKKKILY
LSDLILSLIIIIIPLLAITSNLNYLTLLTISTAITIINCYTDPAFRAILPEIIDEEHLATSNALIDSLQRGSNIILPALI
GVIVILVGNVGVFFICSILLFLGFIFNALLKYTNNNMIDRHSKEDFSETWEFLKQSKEIPFIIIIQFACILINTGLWRVV
LPLFISNILKEGVGVYGLATSCLGIASLLMSLIMGLLSEKRLIFKFSIGVLVWGIGLSIINVFPSVAILYIGATLLGLGQ
SIEGLTRSVAIQIKTPNHLMGKVFSISSTSNYAADTLSLGLISIIIPLLSLSNIFILGGVIISILSLAGLKFVKKSM

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 43812; Mature: 43812

Theoretical pI: Translated: 9.29; Mature: 9.29

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLYLEVLKNRNFTYLLIGNFLRRSCFVLFSLQIIWFTVELTNQSSLKLSMMVMSQTLPFI
CEEHEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
IFGIFGGAYSDKHNKKKILYLSDLILSLIIIIIPLLAITSNLNYLTLLTISTAITIINCY
HHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHEEEC
TDPAFRAILPEIIDEEHLATSNALIDSLQRGSNIILPALIGVIVILVGNVGVFFICSILL
CCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
FLGFIFNALLKYTNNNMIDRHSKEDFSETWEFLKQSKEIPFIIIIQFACILINTGLWRVV
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCCHHHHH
LPLFISNILKEGVGVYGLATSCLGIASLLMSLIMGLLSEKRLIFKFSIGVLVWGIGLSII
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
NVFPSVAILYIGATLLGLGQSIEGLTRSVAIQIKTPNHLMGKVFSISSTSNYAADTLSLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCEEEEEEEECCCHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHH
LISIIIPLLSLSNIFILGGVIISILSLAGLKFVKKSM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MLYLEVLKNRNFTYLLIGNFLRRSCFVLFSLQIIWFTVELTNQSSLKLSMMVMSQTLPFI
CEEHEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
IFGIFGGAYSDKHNKKKILYLSDLILSLIIIIIPLLAITSNLNYLTLLTISTAITIINCY
HHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHEEEC
TDPAFRAILPEIIDEEHLATSNALIDSLQRGSNIILPALIGVIVILVGNVGVFFICSILL
CCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
FLGFIFNALLKYTNNNMIDRHSKEDFSETWEFLKQSKEIPFIIIIQFACILINTGLWRVV
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCCHHHHH
LPLFISNILKEGVGVYGLATSCLGIASLLMSLIMGLLSEKRLIFKFSIGVLVWGIGLSII
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
NVFPSVAILYIGATLLGLGQSIEGLTRSVAIQIKTPNHLMGKVFSISSTSNYAADTLSLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCEEEEEEEECCCHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHH
LISIIIPLLSLSNIFILGGVIISILSLAGLKFVKKSM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA