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The map label for this gene is yddE [H]

Identifier: 57650490

GI number: 57650490

Start: 1614544

End: 1617039

Strand: Reverse

Name: yddE [H]

Synonym: SACOL1579

Alternate gene names: 57650490

Gene position: 1617039-1614544 (Counterclockwise)

Preceding gene: 57650491

Following gene: 57650489

Centisome position: 57.56

GC content: 30.85

Gene sequence:

>2496_bases
ATGAATTTAAAAGCACCGTATGCAGGTTTAAGAGATAATTTGTTATTAACGAAAACTGGCGAAGTTTGGGCGTATTATCG
TGTTCGTTCTGAGTCTATATCAACAGCAAATTATGATGCAAAAGAAGAATCAAAAAAGCGTATGCGTTATTTTTTAGAGT
CGATTAAAGGTTATCAAGATTTTCATTTTGAAATGTATGACCACGATTTAGATTTGCGAAATAAATTTAAAGAAATTAGT
AAAGATTTTGATGATGAAGCTTTTAATGTAGCTGAATATTATTCAAAAGAAACTATTGACGTATTAGAACAAGAATTACA
AATGATTACGCATAATTCTTTTGTTATGGGTGTTAAAATACGTGAATTAGCTGACGATGCAGTTACACTTAAAGAGATTT
TAAAAAGTACATTATCAGATACGGCTGAGCGTATTGTTTCGAATTTTGGTTTTGATGTGAATTTAGACGATAAAATTTTA
GATAAGTATAAAACATTTGAACGAGATTTGGCTGATAGTTTTCTAGGTATTGGAGGCGAGCGTTTAACTGAGAATGAATT
GGCTTATATTATTAGAAAGCCTTTTATTTCAAATGCAACACATGACGTACAGGAAGAATCTTCAAGAAGAGCTATTACAG
ATATTTATAATGCAGTAATTGACCCTACTCGCTTGAGTGTTTTAGAAGTTGAAAATGATAACGAGAAATTTTATACAACA
ACAGTTGTTGTTGATGATTTTCCGTTAGATATGGAATATACACATTTATTTGAGAAAGCTCAAAATATGCCTTTTCCGGT
TGAATGCCATGTAAAAGCAAAAATCATTAATAATGAGAAAGTTAAGAAAAAATTTGACCGTGCGAAAATAAATCATAAAC
AACAAGCAAAAGAAAAGCAAGATACTGGCGACAGTGCTTCGGAAGATGTTCAAGATAATTTGTTTGTATTGAATCAAATG
GAACGAGAAGTGACTGGCTCAGGTGTATTTATTGAGTGGGTATTTATGTTTGTAATTAAAAGTGATGATTATAGAGATTG
TAAACGTAAAGCAAAGCGTTTGATGAAACGATTAAAGGAAACTCAAATATATGCAGTTAATCCATTAGCTGACCAGTTAC
AATTGTTTTATCAATGTTTACATGGTAATGATTTATTTATTAATAAGTATTGGTTACAAAGAACAACGGCAACAGGTATA
GCAGAGAATTTATTTGGTGTGTCTCAAAGTTTGGGAACAAAAACGGGTTTTTATATAGGGCGTATTGATAAATTTATACG
TTCTGTTTCACGTGAGGAAGCTGTTGCAAGTTCAAGGGATATAATTTTGTTTAGTTTATTGTTGGCCGCAAAAGGTATTA
AGGGGGCTGTCAGTGATAGTCCGCATGTTTTAATTACTGGTCAAACTGGTAAAGGTAAATCATTTTTAGCAAAATTATTA
TGGATTTATACATCATTTTTTAAAGGTCAAATGTTGTACTGGGATCCAAAATCTGAGTTTGCAGAATGGTTTGACAGAGT
AACAGAAAGTAAGGAAATGCAAGAAAAGTATCCCCTATTTATTAATCATTTAAAAACATTTAAATATGTAACATTGAATT
ATGAAGATTCAACCAATTATGGTTGTCTAGACCCTATTGTATTTTTAGATGGTATTGAAGCTAATGAGATGTTGAAATCA
GTGTTTGATGAAATTAAATCTTTTGAAAATTATCATCATATTGAAACAGCAATTTATCAAGCTATTTCTGATACGGTTGA
AGAACGTGAAAATGGTAAAAAAGTTGGTTCATTAAATGTAATTGAAAAATTACAGAATAATGAAGATGAGCATGTAAAAA
ATGCAGGCGATTTATTATTTGAAAAAACGCAAAACAATATTTTAAAACTTGTTTTTAGTGATGGTACGAATCCAGCTTTA
AATATTCAAGAAAAAGCAACTATTTTACAGGTTAAAGGTTTAGATATGCCTAAAGCAGATGATGATACATCAAGTTATTC
AACAAGTGAGAAAAATGGGATTACATTAATGTTATTAATTGGTAAGTTTTTAGAGAAATTCGGTTCTCGTAGAGATGTTC
AAACGACTATATTTATTGATGAGGGTTGGGCTTTTAGTGCTTCAAGACAAGGTAAAAAAGTTGGTAAGCGTATAAAAAGA
ACGGGACGTTCTGAGAATAATTCACTTGTATTTATTACACAATCGGTAAAAGATAAAGCAGATGATGATGGTGGTAACTT
TGGTTGTCATTTTGCATTTGATGAAAAAGATGAACGTGAGGATATTTTAAAATCTTTAGGCTTAGAATATTCAAAAGAAT
CTCCTGAAAATATGGAGATGTTGAAAGATTTGAAGAAAGGTCAATGTATATTCAGTGATTTTTATGGACGTGTTGGAAAA
ATGGTTGTACATTGTCCATTTGAGGAAATGACTGAAGCATTTAGAACACAAGAAGATTCTGCAAGCTCTAAAGCTGAAGA
AAAATTTGCGATGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGAAAAGTTAAATTAAGTTATGATGAAGAAGTAGAATATCATGATAAAAAAATAACATTTAAATAGCCCCTATTGGGGTT
ATTTTTATTGGAGGGATGAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTAGCACATACAAAATTGTATGTGCTTTTTATTTTAAAGGAGTGGATTTGATGGCAATGAATGAAATTGCTTTATTT
AAAGGCGTACGTATACAGCC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 831; Mature: 831

Protein sequence:

>831_residues
MNLKAPYAGLRDNLLLTKTGEVWAYYRVRSESISTANYDAKEESKKRMRYFLESIKGYQDFHFEMYDHDLDLRNKFKEIS
KDFDDEAFNVAEYYSKETIDVLEQELQMITHNSFVMGVKIRELADDAVTLKEILKSTLSDTAERIVSNFGFDVNLDDKIL
DKYKTFERDLADSFLGIGGERLTENELAYIIRKPFISNATHDVQEESSRRAITDIYNAVIDPTRLSVLEVENDNEKFYTT
TVVVDDFPLDMEYTHLFEKAQNMPFPVECHVKAKIINNEKVKKKFDRAKINHKQQAKEKQDTGDSASEDVQDNLFVLNQM
EREVTGSGVFIEWVFMFVIKSDDYRDCKRKAKRLMKRLKETQIYAVNPLADQLQLFYQCLHGNDLFINKYWLQRTTATGI
AENLFGVSQSLGTKTGFYIGRIDKFIRSVSREEAVASSRDIILFSLLLAAKGIKGAVSDSPHVLITGQTGKGKSFLAKLL
WIYTSFFKGQMLYWDPKSEFAEWFDRVTESKEMQEKYPLFINHLKTFKYVTLNYEDSTNYGCLDPIVFLDGIEANEMLKS
VFDEIKSFENYHHIETAIYQAISDTVEERENGKKVGSLNVIEKLQNNEDEHVKNAGDLLFEKTQNNILKLVFSDGTNPAL
NIQEKATILQVKGLDMPKADDDTSSYSTSEKNGITLMLLIGKFLEKFGSRRDVQTTIFIDEGWAFSASRQGKKVGKRIKR
TGRSENNSLVFITQSVKDKADDDGGNFGCHFAFDEKDEREDILKSLGLEYSKESPENMEMLKDLKKGQCIFSDFYGRVGK
MVVHCPFEEMTEAFRTQEDSASSKAEEKFAM

Sequences:

>Translated_831_residues
MNLKAPYAGLRDNLLLTKTGEVWAYYRVRSESISTANYDAKEESKKRMRYFLESIKGYQDFHFEMYDHDLDLRNKFKEIS
KDFDDEAFNVAEYYSKETIDVLEQELQMITHNSFVMGVKIRELADDAVTLKEILKSTLSDTAERIVSNFGFDVNLDDKIL
DKYKTFERDLADSFLGIGGERLTENELAYIIRKPFISNATHDVQEESSRRAITDIYNAVIDPTRLSVLEVENDNEKFYTT
TVVVDDFPLDMEYTHLFEKAQNMPFPVECHVKAKIINNEKVKKKFDRAKINHKQQAKEKQDTGDSASEDVQDNLFVLNQM
EREVTGSGVFIEWVFMFVIKSDDYRDCKRKAKRLMKRLKETQIYAVNPLADQLQLFYQCLHGNDLFINKYWLQRTTATGI
AENLFGVSQSLGTKTGFYIGRIDKFIRSVSREEAVASSRDIILFSLLLAAKGIKGAVSDSPHVLITGQTGKGKSFLAKLL
WIYTSFFKGQMLYWDPKSEFAEWFDRVTESKEMQEKYPLFINHLKTFKYVTLNYEDSTNYGCLDPIVFLDGIEANEMLKS
VFDEIKSFENYHHIETAIYQAISDTVEERENGKKVGSLNVIEKLQNNEDEHVKNAGDLLFEKTQNNILKLVFSDGTNPAL
NIQEKATILQVKGLDMPKADDDTSSYSTSEKNGITLMLLIGKFLEKFGSRRDVQTTIFIDEGWAFSASRQGKKVGKRIKR
TGRSENNSLVFITQSVKDKADDDGGNFGCHFAFDEKDEREDILKSLGLEYSKESPENMEMLKDLKKGQCIFSDFYGRVGK
MVVHCPFEEMTEAFRTQEDSASSKAEEKFAM
>Mature_831_residues
MNLKAPYAGLRDNLLLTKTGEVWAYYRVRSESISTANYDAKEESKKRMRYFLESIKGYQDFHFEMYDHDLDLRNKFKEIS
KDFDDEAFNVAEYYSKETIDVLEQELQMITHNSFVMGVKIRELADDAVTLKEILKSTLSDTAERIVSNFGFDVNLDDKIL
DKYKTFERDLADSFLGIGGERLTENELAYIIRKPFISNATHDVQEESSRRAITDIYNAVIDPTRLSVLEVENDNEKFYTT
TVVVDDFPLDMEYTHLFEKAQNMPFPVECHVKAKIINNEKVKKKFDRAKINHKQQAKEKQDTGDSASEDVQDNLFVLNQM
EREVTGSGVFIEWVFMFVIKSDDYRDCKRKAKRLMKRLKETQIYAVNPLADQLQLFYQCLHGNDLFINKYWLQRTTATGI
AENLFGVSQSLGTKTGFYIGRIDKFIRSVSREEAVASSRDIILFSLLLAAKGIKGAVSDSPHVLITGQTGKGKSFLAKLL
WIYTSFFKGQMLYWDPKSEFAEWFDRVTESKEMQEKYPLFINHLKTFKYVTLNYEDSTNYGCLDPIVFLDGIEANEMLKS
VFDEIKSFENYHHIETAIYQAISDTVEERENGKKVGSLNVIEKLQNNEDEHVKNAGDLLFEKTQNNILKLVFSDGTNPAL
NIQEKATILQVKGLDMPKADDDTSSYSTSEKNGITLMLLIGKFLEKFGSRRDVQTTIFIDEGWAFSASRQGKKVGKRIKR
TGRSENNSLVFITQSVKDKADDDGGNFGCHFAFDEKDEREDILKSLGLEYSKESPENMEMLKDLKKGQCIFSDFYGRVGK
MVVHCPFEEMTEAFRTQEDSASSKAEEKFAM

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR016628
- InterPro:   IPR002789 [H]

Pfam domain/function: PF01935 DUF87 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 95594; Mature: 95594

Theoretical pI: Translated: 5.14; Mature: 5.14

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNLKAPYAGLRDNLLLTKTGEVWAYYRVRSESISTANYDAKEESKKRMRYFLESIKGYQD
CCCCCCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
FHFEMYDHDLDLRNKFKEISKDFDDEAFNVAEYYSKETIDVLEQELQMITHNSFVMGVKI
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEH
RELADDAVTLKEILKSTLSDTAERIVSNFGFDVNLDDKILDKYKTFERDLADSFLGIGGE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
RLTENELAYIIRKPFISNATHDVQEESSRRAITDIYNAVIDPTRLSVLEVENDNEKFYTT
CCCHHHHHHHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCEEEEE
TVVVDDFPLDMEYTHLFEKAQNMPFPVECHVKAKIINNEKVKKKFDRAKINHKQQAKEKQ
EEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
DTGDSASEDVQDNLFVLNQMEREVTGSGVFIEWVFMFVIKSDDYRDCKRKAKRLMKRLKE
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
TQIYAVNPLADQLQLFYQCLHGNDLFINKYWLQRTTATGIAENLFGVSQSLGTKTGFYIG
CEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
RIDKFIRSVSREEAVASSRDIILFSLLLAAKGIKGAVSDSPHVLITGQTGKGKSFLAKLL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHH
WIYTSFFKGQMLYWDPKSEFAEWFDRVTESKEMQEKYPLFINHLKTFKYVTLNYEDSTNY
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GCLDPIVFLDGIEANEMLKSVFDEIKSFENYHHIETAIYQAISDTVEERENGKKVGSLNV
CCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
IEKLQNNEDEHVKNAGDLLFEKTQNNILKLVFSDGTNPALNIQEKATILQVKGLDMPKAD
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCEEECCCEEEEEEECCCCCCCC
DDTSSYSTSEKNGITLMLLIGKFLEKFGSRRDVQTTIFIDEGWAFSASRQGKKVGKRIKR
CCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCEECCCCCHHHHHHHHHH
TGRSENNSLVFITQSVKDKADDDGGNFGCHFAFDEKDEREDILKSLGLEYSKESPENMEM
CCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH
LKDLKKGQCIFSDFYGRVGKMVVHCPFEEMTEAFRTQEDSASSKAEEKFAM
HHHHHCCCCHHHHHHHHHCCEEEECCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNLKAPYAGLRDNLLLTKTGEVWAYYRVRSESISTANYDAKEESKKRMRYFLESIKGYQD
CCCCCCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
FHFEMYDHDLDLRNKFKEISKDFDDEAFNVAEYYSKETIDVLEQELQMITHNSFVMGVKI
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CCCHHHHHHHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCEEEEE
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DTGDSASEDVQDNLFVLNQMEREVTGSGVFIEWVFMFVIKSDDYRDCKRKAKRLMKRLKE
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CEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
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GCLDPIVFLDGIEANEMLKSVFDEIKSFENYHHIETAIYQAISDTVEERENGKKVGSLNV
CCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
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CCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCEECCCCCHHHHHHHHHH
TGRSENNSLVFITQSVKDKADDDGGNFGCHFAFDEKDEREDILKSLGLEYSKESPENMEM
CCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH
LKDLKKGQCIFSDFYGRVGKMVVHCPFEEMTEAFRTQEDSASSKAEEKFAM
HHHHHCCCCHHHHHHHHHCCEEEECCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]