| Definition | Staphylococcus aureus subsp. aureus COL chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002951 |
| Length | 2,809,422 |
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The map label for this gene is yddG [H]
Identifier: 57650488
GI number: 57650488
Start: 1611280
End: 1613127
Strand: Reverse
Name: yddG [H]
Synonym: SACOL1577
Alternate gene names: 57650488
Gene position: 1613127-1611280 (Counterclockwise)
Preceding gene: 57650489
Following gene: 57650487
Centisome position: 57.42
GC content: 29.98
Gene sequence:
>1848_bases ATGAAGCATAAAAGTGTGTATCTTTTATGCTTTTTAATTTTGCCTATTCTGCTTTTAACATCTGTGAGTGCTTACGCTGT TTCTAATCCAGTTGGAGAGCCCTCACATGCAGTTAAGCCCAAAATTGAAAAGTATGATTTATCACATTATCGTTCAATAT ATAGTGAAAAAGGCGACTGGAATCCGTTTGGTCAAGAAGAAATTTCACGACAAATTAATAATGTGTCAGATTTTTTCTTT TCTATGACTAAGATTTTAGCAGGTGTTACAGATTATGCGATTGAAAATTTATTTCAACTAGATGTTATTAATGATTTTGC GGATAAAATCGGCGATTTTGTTGGCGATATATATCAAAAGTTATTGAGTAATTTGGCAATAACATTATTTATTATTGTTT GTTTTAACGCATTTATTATTTTTAGTGTACAAGGTAATGCAAGAGAAGCATTAAAGCGAGCGTTTTTAATTATGTGTTTG ATTGGTTTTGGTGTTGGTATACTTGCGAATGCAGGTAATATTATACGTGGTACAAACAATATTGGTAAGGATTTGAATAA TATAATTATGAATAGTACATCTTCTATTGATGGGAACATTGATTATATTCATGAGAATTCAGGTATGAATCATATACGTA ATCAATTATTTGATATGACGATATATAGAACATATTTAGTAATGAATTATGGAACTGTAGACGAAAAAGAGATAAAAGCA AAAGGTAAAGACCGTATTGATAACATTTTAAAACAAGATTTTTCAAAAAAAGGACAAGATGAGATTGATAAAATTGTAAA AAATGAGGTTGAGAAAAAAGATAATAAATATATGACGCAAGGTTATGTATTTCAAAAGTTGGCTATTTCAGTTATTGGCT TTATTATTACTGTTTTTATGTCAATTGTATTTTTATCAATTAGTTTTGCGAAGTTGATTTTTTCTACATTTGCTTTATTT TTATTCTTATTTTTAGTATTCAGTTGGATAGTGAGTTTTATACCAGGATTTGAATTATCTGTTTTCTCTGCGTTTGCAAA AACGTTAGGCTATATTATTTTAAGTGCCTGTATGACATTCTTATTTGTGATAGTTGGTTTGTGTATCAAGCTTGCAAATA GTTTTATTGAACCGGATAGTCAAAATGCTTATTTTTTAAATTCAATATTTATAATTGTAATATTGTTTGTAATGTATAAA AAACGGGCTCAAATTATCAATTTTGTAAGTCGTGGTAATATTAGTTTTTCTCCTAGTGCAATTGGTGCTGGTGTGATGAA TCGAACACAAGAACGTTTTAATAAGATTCGTCATGAACAAGCGCAAAATAAGAAAGCTAAACGAGAAAATCAAAGAGATG AACCCGCCCCACCACTTCAAAATGATAATGATTTAAGAAGAAGACAGCAGGATAAACCAATGCCTTTATTTATAAATAAA GATAATCAAAAAAATGGTAATAAGCGAAGAGAACAACAAGAGTCAATGAATGGTAATGATGTAAAATCTGCTTCTGTTGA ATCAAATGCAAATGATTATTCTAAACAACCACAAAAAGCATCACAGCAAGAGCATCAAGTACGAGAAACAAGACAGCGAA AAGATATACAAAGGTCGCCACAAGTGGTTAATCAGCCATTAAATAATGAGAATCATTCAATAAATCGTAAAGAACAGAAG TCAGTTCAAACTGCTTATGATACTGATGTTCAAAAACGACAAATACAAAATGCGACACAGAATCAACAAAGTAGACAATC TGGAAATCGTAATCAACCTATTACACGTAATTCTCAGTCAAAAGACCGTCTAAAAGAGCAAAAGGATATCAATAAGCATG GTAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CTTGGACAATATAATGAACCAATTTTATTTGATGCACCTTTAATGGAACAATATGATTTTGTGGAAGATGTGAAACAAAT ATTAAATAAGGAGTGATTTG
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAAGATATTGCTAAAAAAGTAATAGGTAAAACGCCAATAGGTGTTAAATTGAAATTAGCGAAAGTCATCATCATTTTGT GTGTGGTGGCTTTTTTTACA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 615; Mature: 615
Protein sequence:
>615_residues MKHKSVYLLCFLILPILLLTSVSAYAVSNPVGEPSHAVKPKIEKYDLSHYRSIYSEKGDWNPFGQEEISRQINNVSDFFF SMTKILAGVTDYAIENLFQLDVINDFADKIGDFVGDIYQKLLSNLAITLFIIVCFNAFIIFSVQGNAREALKRAFLIMCL IGFGVGILANAGNIIRGTNNIGKDLNNIIMNSTSSIDGNIDYIHENSGMNHIRNQLFDMTIYRTYLVMNYGTVDEKEIKA KGKDRIDNILKQDFSKKGQDEIDKIVKNEVEKKDNKYMTQGYVFQKLAISVIGFIITVFMSIVFLSISFAKLIFSTFALF LFLFLVFSWIVSFIPGFELSVFSAFAKTLGYIILSACMTFLFVIVGLCIKLANSFIEPDSQNAYFLNSIFIIVILFVMYK KRAQIINFVSRGNISFSPSAIGAGVMNRTQERFNKIRHEQAQNKKAKRENQRDEPAPPLQNDNDLRRRQQDKPMPLFINK DNQKNGNKRREQQESMNGNDVKSASVESNANDYSKQPQKASQQEHQVRETRQRKDIQRSPQVVNQPLNNENHSINRKEQK SVQTAYDTDVQKRQIQNATQNQQSRQSGNRNQPITRNSQSKDRLKEQKDINKHGK
Sequences:
>Translated_615_residues MKHKSVYLLCFLILPILLLTSVSAYAVSNPVGEPSHAVKPKIEKYDLSHYRSIYSEKGDWNPFGQEEISRQINNVSDFFF SMTKILAGVTDYAIENLFQLDVINDFADKIGDFVGDIYQKLLSNLAITLFIIVCFNAFIIFSVQGNAREALKRAFLIMCL IGFGVGILANAGNIIRGTNNIGKDLNNIIMNSTSSIDGNIDYIHENSGMNHIRNQLFDMTIYRTYLVMNYGTVDEKEIKA KGKDRIDNILKQDFSKKGQDEIDKIVKNEVEKKDNKYMTQGYVFQKLAISVIGFIITVFMSIVFLSISFAKLIFSTFALF LFLFLVFSWIVSFIPGFELSVFSAFAKTLGYIILSACMTFLFVIVGLCIKLANSFIEPDSQNAYFLNSIFIIVILFVMYK KRAQIINFVSRGNISFSPSAIGAGVMNRTQERFNKIRHEQAQNKKAKRENQRDEPAPPLQNDNDLRRRQQDKPMPLFINK DNQKNGNKRREQQESMNGNDVKSASVESNANDYSKQPQKASQQEHQVRETRQRKDIQRSPQVVNQPLNNENHSINRKEQK SVQTAYDTDVQKRQIQNATQNQQSRQSGNRNQPITRNSQSKDRLKEQKDINKHGK >Mature_615_residues MKHKSVYLLCFLILPILLLTSVSAYAVSNPVGEPSHAVKPKIEKYDLSHYRSIYSEKGDWNPFGQEEISRQINNVSDFFF SMTKILAGVTDYAIENLFQLDVINDFADKIGDFVGDIYQKLLSNLAITLFIIVCFNAFIIFSVQGNAREALKRAFLIMCL IGFGVGILANAGNIIRGTNNIGKDLNNIIMNSTSSIDGNIDYIHENSGMNHIRNQLFDMTIYRTYLVMNYGTVDEKEIKA KGKDRIDNILKQDFSKKGQDEIDKIVKNEVEKKDNKYMTQGYVFQKLAISVIGFIITVFMSIVFLSISFAKLIFSTFALF LFLFLVFSWIVSFIPGFELSVFSAFAKTLGYIILSACMTFLFVIVGLCIKLANSFIEPDSQNAYFLNSIFIIVILFVMYK KRAQIINFVSRGNISFSPSAIGAGVMNRTQERFNKIRHEQAQNKKAKRENQRDEPAPPLQNDNDLRRRQQDKPMPLFINK DNQKNGNKRREQQESMNGNDVKSASVESNANDYSKQPQKASQQEHQVRETRQRKDIQRSPQVVNQPLNNENHSINRKEQK SVQTAYDTDVQKRQIQNATQNQQSRQSGNRNQPITRNSQSKDRLKEQKDINKHGK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 70345; Mature: 70345
Theoretical pI: Translated: 9.93; Mature: 9.93
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKHKSVYLLCFLILPILLLTSVSAYAVSNPVGEPSHAVKPKIEKYDLSHYRSIYSEKGDW CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NPFGQEEISRQINNVSDFFFSMTKILAGVTDYAIENLFQLDVINDFADKIGDFVGDIYQK CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLSNLAITLFIIVCFNAFIIFSVQGNAREALKRAFLIMCLIGFGVGILANAGNIIRGTNN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCH IGKDLNNIIMNSTSSIDGNIDYIHENSGMNHIRNQLFDMTIYRTYLVMNYGTVDEKEIKA HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH KGKDRIDNILKQDFSKKGQDEIDKIVKNEVEKKDNKYMTQGYVFQKLAISVIGFIITVFM CCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SIVFLSISFAKLIFSTFALFLFLFLVFSWIVSFIPGFELSVFSAFAKTLGYIILSACMTF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFVIVGLCIKLANSFIEPDSQNAYFLNSIFIIVILFVMYKKRAQIINFVSRGNISFSPSA HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHH IGAGVMNRTQERFNKIRHEQAQNKKAKRENQRDEPAPPLQNDNDLRRRQQDKPMPLFINK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCEEEEC DNQKNGNKRREQQESMNGNDVKSASVESNANDYSKQPQKASQQEHQVRETRQRKDIQRSP CCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH QVVNQPLNNENHSINRKEQKSVQTAYDTDVQKRQIQNATQNQQSRQSGNRNQPITRNSQS HHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCH KDRLKEQKDINKHGK HHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MKHKSVYLLCFLILPILLLTSVSAYAVSNPVGEPSHAVKPKIEKYDLSHYRSIYSEKGDW CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NPFGQEEISRQINNVSDFFFSMTKILAGVTDYAIENLFQLDVINDFADKIGDFVGDIYQK CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLSNLAITLFIIVCFNAFIIFSVQGNAREALKRAFLIMCLIGFGVGILANAGNIIRGTNN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCH IGKDLNNIIMNSTSSIDGNIDYIHENSGMNHIRNQLFDMTIYRTYLVMNYGTVDEKEIKA HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH KGKDRIDNILKQDFSKKGQDEIDKIVKNEVEKKDNKYMTQGYVFQKLAISVIGFIITVFM CCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SIVFLSISFAKLIFSTFALFLFLFLVFSWIVSFIPGFELSVFSAFAKTLGYIILSACMTF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFVIVGLCIKLANSFIEPDSQNAYFLNSIFIIVILFVMYKKRAQIINFVSRGNISFSPSA HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHH IGAGVMNRTQERFNKIRHEQAQNKKAKRENQRDEPAPPLQNDNDLRRRQQDKPMPLFINK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCEEEEC DNQKNGNKRREQQESMNGNDVKSASVESNANDYSKQPQKASQQEHQVRETRQRKDIQRSP CCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH QVVNQPLNNENHSINRKEQKSVQTAYDTDVQKRQIQNATQNQQSRQSGNRNQPITRNSQS HHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCH KDRLKEQKDINKHGK HHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9384377 [H]