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The map label for this gene is 54295345

Identifier: 54295345

GI number: 54295345

Start: 2763914

End: 2766337

Strand: Reverse

Name: 54295345

Synonym: lpl2430

Alternate gene names: NA

Gene position: 2766337-2763914 (Counterclockwise)

Preceding gene: 54295346

Following gene: 54295344

Centisome position: 82.68

GC content: 37.95

Gene sequence:

>2424_bases
ATGTTTAGTTATCTGGATAAATTATTAGATGGAATATTTGGATACCAAAAGTCAGATACTAGTCAGTTAAGCACCTCAAC
GCCACCTACTCTAACTACTGTTCCCTTGAAACAAGAATATTTTGTAAAAATCGGGGAAAGTGAAACACAGGATCTAGGCT
TACTGCCAGTGGTTAGCAAGCGACATAATCAATCAGTTCCCTTGGAGGAAATTCCTTTTGAGGATACCAGACTTGAGTTG
ATTGAGTTTTATATTGCATTGTTAAAACAATGTGTTTTAGATGAAAAATTGAAGAGTATCCCTGCGCAGTATCTTATATC
CCATTATCTTTTTATAAAAACCTTAGCCGCAAACGAGGGAAATAAAGGTCGAAAAGATCTGTATCTTAATTTATCTCAAA
AAGTGGCTGATTATCTTGAAAAAAATGAATCTAAAATATGGAGTATGGCTGTTGCATGCACTAAAACCAGTGAGTATCCC
ATAGTTGACTGGATAAAAAAGCACCATCTTCATTTTAATTTTATAAGAGCTTTTATACTGGATTATAATAAAAAACCATT
GACTCATGATCAACGTGCGTTTATGCAGCAGTTTAGGGATTCTGCTGCTTTTTTCTTTCCTGATCAGGTTTACCTTGCTT
GGCTTACCCAATCCTATGAACCAGGCTCTATCTTGAATCCTATGTACAGGGAGAGCAGATCAACGCATTATTATCACGCG
AACATTACTGATAATCTCTTGTTAAGAACACGCCCCAAACAGGTCAATTTTGGTCCTCAACATTTTTTCCAAAAAGGAAA
AGGCTCCGTCAAGAATACTTATCGTTTCAATATCAATGACGGAAAATTAATGCGCATACAGGGAAGAACATTACTTTTTA
GCACGAATAAAGACAATGAAGTGATTGCTGTAAAGGTGCAAAAAAAAGGGGAACCGCAATCTGCTTTAAGTAATGAATTT
CAAATGGCAGATTATTTGTTGAAACATCAACGCCGTTTGAATTTGCAAAGTCAATTACCTACTCCTCTCAGTCAATATTC
AATTAATCGAACAGAGATTCTCAAAAAATGCAGTAAATCACTTGATTTTGAGAAGTTCAAGAATTTGATAAGTGATGCAA
AAAGCCTTGAAATTTATGTTTATAAAGCAACACCTTCTTATTTTACTTATCTGCATGATAGGCAGCAGAGCTTTAGTCAA
CTCACTTCCTCAGTGCAGAAAAATGTACATGATCTTTTTGTGCTCCTGAGAGAAGGCATAGTTTTTCCTTATCTGGCAGA
TATGTTTCACACCCATATTGATGAGAGTAAAAGGAGCGATAAGGGTCGATATCAGACGTTAGTCGAGCTTTTAAGTGCTT
TGCAATCACAAATGGGTCGTCTTGATAAATGGCAAAAAGCAGTCGAATTTGTTAACTTACGAGCCAGCGGTATCGCTGAT
TTGGGTGACAATCTTCCGTTGACCAGCTTCTTAACTGTTTCTGACTGGACGAAACATTATCATGCGGAATTGCTAACGGG
CGTTTACCATCCATCCTTTCTCTTCCTCGATAAATCCAGTGGCTCGGTTCGCTCCTTGTTTAACAGCCGGCGCAAAGTAT
TCGGCAATTATTTGTATCTGAATATCATCGCTGAGTATCTACTAGTTATTCAATTGGTAATTGGCTGTTATGGCGATAAA
GTGACTCGTAAAATGGATAGTAAAAGCAAAGCTAAGGTTTGGGAGCATTTAGCCGAATTGATGTTTTCCAGTTGCGCTGA
AGCGGTTAATTTGATAACTGGTATGCCCAAATCCAGGGCACTTGCTTTTTTAAAGCAAAGAGCCAATGTAAGAAAACATA
CTCAACAAACGTCTTTTTGGATGACTCCTGAGTATTCGAATCTGGATAGGCTGACTGTGCAGTCTCAACAATCCACTTTG
TACCCCGGCGAATCAGATTATGAAATAAACAGTGATTTAATTCCGGGGATAGGTCTGAGTCTTGATGGCATCAATCAGGA
TTTAGGTGATTATAACCAGGCAAGCCCTTTAAGGGAGCTAGAGAAATTATTGTATGCTACAGTGACCTTAATAGAGGGAA
CCCAGCAACTGGATAAGCAATTTTTTCAACAGTTGGATGAAACTGAGAAAATGATTTTGAGTGCTGCTGGAGTTGATAAA
TGCTATCAAGCTGTCGCAAAACTCCTGGATCTTGCTCGGCCTGGTTGTCAAATGCAGCGAAGATTGGCTTTTACTTATTA
TGAAATGATCAAACGAATATATCCCTGCTCAAATCCTGCAGATGTGAGATTTGAACTTGTTGCAAAAGAAGAGGCGATTA
TAAAAATTCAGCGTTTTTGGCGAGAGCATAAAAAAGAAAACCAATCGCTTGAAAAAGGGTTTGATTTTGACAGGAATACT
AGTTCATCGCAGTCGCCTTTATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCAACAACGGAGAAGACTAATAAACCTTAGCCTGTTTTATTTAAAGTAATAGAGAAACGGATTCTCCTAGGGAATTAAAA
CGCAATGAGGTGTTGTAACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAGTCATTTCAATTGTAAGAGATCACCCCAAGATCATTAGAGGATATTTCAACCTCAGGGCACTGACCTGTTATTTTT
AATTTTGGAAAATTAAAAGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 807; Mature: 807

Protein sequence:

>807_residues
MFSYLDKLLDGIFGYQKSDTSQLSTSTPPTLTTVPLKQEYFVKIGESETQDLGLLPVVSKRHNQSVPLEEIPFEDTRLEL
IEFYIALLKQCVLDEKLKSIPAQYLISHYLFIKTLAANEGNKGRKDLYLNLSQKVADYLEKNESKIWSMAVACTKTSEYP
IVDWIKKHHLHFNFIRAFILDYNKKPLTHDQRAFMQQFRDSAAFFFPDQVYLAWLTQSYEPGSILNPMYRESRSTHYYHA
NITDNLLLRTRPKQVNFGPQHFFQKGKGSVKNTYRFNINDGKLMRIQGRTLLFSTNKDNEVIAVKVQKKGEPQSALSNEF
QMADYLLKHQRRLNLQSQLPTPLSQYSINRTEILKKCSKSLDFEKFKNLISDAKSLEIYVYKATPSYFTYLHDRQQSFSQ
LTSSVQKNVHDLFVLLREGIVFPYLADMFHTHIDESKRSDKGRYQTLVELLSALQSQMGRLDKWQKAVEFVNLRASGIAD
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VTRKMDSKSKAKVWEHLAELMFSSCAEAVNLITGMPKSRALAFLKQRANVRKHTQQTSFWMTPEYSNLDRLTVQSQQSTL
YPGESDYEINSDLIPGIGLSLDGINQDLGDYNQASPLRELEKLLYATVTLIEGTQQLDKQFFQQLDETEKMILSAAGVDK
CYQAVAKLLDLARPGCQMQRRLAFTYYEMIKRIYPCSNPADVRFELVAKEEAIIKIQRFWREHKKENQSLEKGFDFDRNT
SSSQSPL

Sequences:

>Translated_807_residues
MFSYLDKLLDGIFGYQKSDTSQLSTSTPPTLTTVPLKQEYFVKIGESETQDLGLLPVVSKRHNQSVPLEEIPFEDTRLEL
IEFYIALLKQCVLDEKLKSIPAQYLISHYLFIKTLAANEGNKGRKDLYLNLSQKVADYLEKNESKIWSMAVACTKTSEYP
IVDWIKKHHLHFNFIRAFILDYNKKPLTHDQRAFMQQFRDSAAFFFPDQVYLAWLTQSYEPGSILNPMYRESRSTHYYHA
NITDNLLLRTRPKQVNFGPQHFFQKGKGSVKNTYRFNINDGKLMRIQGRTLLFSTNKDNEVIAVKVQKKGEPQSALSNEF
QMADYLLKHQRRLNLQSQLPTPLSQYSINRTEILKKCSKSLDFEKFKNLISDAKSLEIYVYKATPSYFTYLHDRQQSFSQ
LTSSVQKNVHDLFVLLREGIVFPYLADMFHTHIDESKRSDKGRYQTLVELLSALQSQMGRLDKWQKAVEFVNLRASGIAD
LGDNLPLTSFLTVSDWTKHYHAELLTGVYHPSFLFLDKSSGSVRSLFNSRRKVFGNYLYLNIIAEYLLVIQLVIGCYGDK
VTRKMDSKSKAKVWEHLAELMFSSCAEAVNLITGMPKSRALAFLKQRANVRKHTQQTSFWMTPEYSNLDRLTVQSQQSTL
YPGESDYEINSDLIPGIGLSLDGINQDLGDYNQASPLRELEKLLYATVTLIEGTQQLDKQFFQQLDETEKMILSAAGVDK
CYQAVAKLLDLARPGCQMQRRLAFTYYEMIKRIYPCSNPADVRFELVAKEEAIIKIQRFWREHKKENQSLEKGFDFDRNT
SSSQSPL
>Mature_807_residues
MFSYLDKLLDGIFGYQKSDTSQLSTSTPPTLTTVPLKQEYFVKIGESETQDLGLLPVVSKRHNQSVPLEEIPFEDTRLEL
IEFYIALLKQCVLDEKLKSIPAQYLISHYLFIKTLAANEGNKGRKDLYLNLSQKVADYLEKNESKIWSMAVACTKTSEYP
IVDWIKKHHLHFNFIRAFILDYNKKPLTHDQRAFMQQFRDSAAFFFPDQVYLAWLTQSYEPGSILNPMYRESRSTHYYHA
NITDNLLLRTRPKQVNFGPQHFFQKGKGSVKNTYRFNINDGKLMRIQGRTLLFSTNKDNEVIAVKVQKKGEPQSALSNEF
QMADYLLKHQRRLNLQSQLPTPLSQYSINRTEILKKCSKSLDFEKFKNLISDAKSLEIYVYKATPSYFTYLHDRQQSFSQ
LTSSVQKNVHDLFVLLREGIVFPYLADMFHTHIDESKRSDKGRYQTLVELLSALQSQMGRLDKWQKAVEFVNLRASGIAD
LGDNLPLTSFLTVSDWTKHYHAELLTGVYHPSFLFLDKSSGSVRSLFNSRRKVFGNYLYLNIIAEYLLVIQLVIGCYGDK
VTRKMDSKSKAKVWEHLAELMFSSCAEAVNLITGMPKSRALAFLKQRANVRKHTQQTSFWMTPEYSNLDRLTVQSQQSTL
YPGESDYEINSDLIPGIGLSLDGINQDLGDYNQASPLRELEKLLYATVTLIEGTQQLDKQFFQQLDETEKMILSAAGVDK
CYQAVAKLLDLARPGCQMQRRLAFTYYEMIKRIYPCSNPADVRFELVAKEEAIIKIQRFWREHKKENQSLEKGFDFDRNT
SSSQSPL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 93264; Mature: 93264

Theoretical pI: Translated: 9.18; Mature: 9.18

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFSYLDKLLDGIFGYQKSDTSQLSTSTPPTLTTVPLKQEYFVKIGESETQDLGLLPVVSK
CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHEEECCCCCCCCCCCHHHHC
RHNQSVPLEEIPFEDTRLELIEFYIALLKQCVLDEKLKSIPAQYLISHYLFIKTLAANEG
CCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
NKGRKDLYLNLSQKVADYLEKNESKIWSMAVACTKTSEYPIVDWIKKHHLHFNFIRAFIL
CCCCHHEEEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
DYNKKPLTHDQRAFMQQFRDSAAFFFPDQVYLAWLTQSYEPGSILNPMYRESRSTHYYHA
HCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCCEEEEC
NITDNLLLRTRPKQVNFGPQHFFQKGKGSVKNTYRFNINDGKLMRIQGRTLLFSTNKDNE
CCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCEEEEECCCCCC
VIAVKVQKKGEPQSALSNEFQMADYLLKHQRRLNLQSQLPTPLSQYSINRTEILKKCSKS
EEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHC
LDFEKFKNLISDAKSLEIYVYKATPSYFTYLHDRQQSFSQLTSSVQKNVHDLFVLLREGI
CCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VFPYLADMFHTHIDESKRSDKGRYQTLVELLSALQSQMGRLDKWQKAVEFVNLRASGIAD
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
LGDNLPLTSFLTVSDWTKHYHAELLTGVYHPSFLFLDKSSGSVRSLFNSRRKVFGNYLYL
CCCCCCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIIAEYLLVIQLVIGCYGDKVTRKMDSKSKAKVWEHLAELMFSSCAEAVNLITGMPKSRA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
LAFLKQRANVRKHTQQTSFWMTPEYSNLDRLTVQSQQSTLYPGESDYEINSDLIPGIGLS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
LDGINQDLGDYNQASPLRELEKLLYATVTLIEGTQQLDKQFFQQLDETEKMILSAAGVDK
CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
CYQAVAKLLDLARPGCQMQRRLAFTYYEMIKRIYPCSNPADVRFELVAKEEAIIKIQRFW
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHH
REHKKENQSLEKGFDFDRNTSSSQSPL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFSYLDKLLDGIFGYQKSDTSQLSTSTPPTLTTVPLKQEYFVKIGESETQDLGLLPVVSK
CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHEEECCCCCCCCCCCHHHHC
RHNQSVPLEEIPFEDTRLELIEFYIALLKQCVLDEKLKSIPAQYLISHYLFIKTLAANEG
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NKGRKDLYLNLSQKVADYLEKNESKIWSMAVACTKTSEYPIVDWIKKHHLHFNFIRAFIL
CCCCHHEEEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
DYNKKPLTHDQRAFMQQFRDSAAFFFPDQVYLAWLTQSYEPGSILNPMYRESRSTHYYHA
HCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCCEEEEC
NITDNLLLRTRPKQVNFGPQHFFQKGKGSVKNTYRFNINDGKLMRIQGRTLLFSTNKDNE
CCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCEEEEECCCCCC
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CCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VFPYLADMFHTHIDESKRSDKGRYQTLVELLSALQSQMGRLDKWQKAVEFVNLRASGIAD
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LGDNLPLTSFLTVSDWTKHYHAELLTGVYHPSFLFLDKSSGSVRSLFNSRRKVFGNYLYL
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NIIAEYLLVIQLVIGCYGDKVTRKMDSKSKAKVWEHLAELMFSSCAEAVNLITGMPKSRA
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LAFLKQRANVRKHTQQTSFWMTPEYSNLDRLTVQSQQSTLYPGESDYEINSDLIPGIGLS
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CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
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HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHH
REHKKENQSLEKGFDFDRNTSSSQSPL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA