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The map label for this gene is 54294843

Identifier: 54294843

GI number: 54294843

Start: 2157659

End: 2159893

Strand: Reverse

Name: 54294843

Synonym: lpl1922

Alternate gene names: NA

Gene position: 2159893-2157659 (Counterclockwise)

Preceding gene: 54294844

Following gene: 54294839

Centisome position: 64.56

GC content: 36.51

Gene sequence:

>2235_bases
ATGAAACCCAATTTGTTTTACTTTGTATTGACACAGATTTTAGCTGAATCTCCAAATTTTAAATTATTAGATGAAGTTAG
GCCGATCCATGATATTACCTTAAAGGATAAGAAGTATTATCGTTTAGAATTACCCTTGGCTAATATTGCTGCAGAAGGTT
TTAGACTGCATGACGCGCATATTAGTCTTTATGAGAAGACAGATCCCCATAATCCAAATTTAGGACTTTCGCATTTTACT
GCAATCTTCCATGATCAAAATGGTCAAACCTATCGAATGCATTTGTTTTTGAATCGTTTCGATGCTCTGGCATGCCCAGC
TACCTGGGAGTTATTGGATGATGATGAGCAATATGTCAAAGTTTCTCCACCAGAAAATCTGGAATATTTCATTCATTCTG
TATGGCAGCTAGGCCTGCCTTGTTTGCAATTGTTGCGAAAAAAGCAAAAGGAAATAGAAGCTAAATTGCTTGCTGATTAC
CACAGATTAAACGAGGAAACGACTGCACTAAGTAAGGATTTAGATAAAAACAGAGCGGTCTATTTGGAAAAGCTTGATGA
ATTAATTAAGACGACTAAATCATTAAGCCAAATTTCTGAAAGTAATCATTGGTTGAGAGAAGCAATTTACCTGGGGAAAA
CATACAAGTACGTATCCTCTATGCCGGAATCAATTCTTGAGCCTGTTAAAAAAAGTGATGAAGAGCATAAAAAAGATGAC
AAAGCAGAGATTGTTGCCTTGTCTCCAAAGCAAGGGGCTAAGGAGCCCAAAATCAGCAGAGGAAATATCGGGCTTGCTCA
ATCGACCTTATTTTCCAAATCAGCCAACGCGAAACGCTCTGTGGATGTGAAAGTGGAGCGCGATATTAGCAAGATAAAAA
AATTGTTTGCTCAACTATTAAAGACGGAAGATAAAAAAATTAAAGCAGTTCTTTTAATTGATTTGCATTGGAAAATCAAA
GACATTAATTTGGAAACGGAAGAGTTACTGACAAAAGAGCAAACACAAGCCCTAAATGAAATCGAAGGCCATGCAAATAA
AGAAGCCAAGTCGCTCCTGGAAAGAGCTTTGTTTGCCGGAGAGTTTGAATACGCTCAAACCCTGTCGCCTTATTATCCTT
TGATTAATAATGATCTAATGGTTCTTGCGCTTACTCAGAGAAAAGCTGATCTTTTAAGCTTTTTAGTCACTAAAGTAGGT
TTGCCTATCAATAGTTATCCAATTAAAACAAAAGTGAAAACGTATTCCAATGCCGTTGAGTATTGCTTCTCAGAACATAG
TGAATCGTTGGTAGACTGCTTTAGCGTGTTAATAAAAAATGGCGCAAGTTTGATGCAGCCTGTTGGTTTATATAAATTAC
CTTTAGCTCATCTTCTTTTGTCTGAAATCCCCAGGCACCCTTTGCACGCCTCGTTAGAACAAAACAAAAATTTAACTCTC
AATAACAAGCAATTTTATGCTCATTTAATTAATGCACTAAAATCATGTTTATTATCTGGTGATATCGAAGGTGACCAGAA
AATTGCCCTGGAAGAGTCTATTGTGCGATACGAGCACTTAAAGACTAATGTAAAAAATTCATCCTCACTTCTGAGTCCTC
AAAACCAGGCATTGGCTGATGAAATAAGCGATATTACCAAAAAATTATTGCCTGAGGCTGTGGCTGAAGCAATTGAGAAT
GATGAGGAAATATCAAGAGAAAAAGCAATCGCTGATAAAGAATATAAAGAGTTGATTCGTAAGGTGAAGGCATTTTATCA
TAAAACTGGAAAGAACTTTGCTTTTCAATCCTTAATTAATTCAGCCAATCAGGAATTGAAGAAAGAATTATTAGAAATTG
ACTTTAATATCGACATTAGCTTTAGCGAGCTTAAGGAATCCATACTGGAAAACTTAAGCAAGGAAAGATTAATGTTCAGC
TATTGCAGTGAATTAATAGACGTTCAAAGAACAATCATGCAAATATCGCAGGGAGCGAGCAGAAAGAATAAAAACCTGAA
AAAACTCAATGCGCGACATGCTGAGCTTATCGAGTTGCTCACAGATTTAAGCCAAAATACGCCTCAATCTATGATAAAAG
AAGCCAATGAACTTCAAGATTCTTTTAGTCAGCTTCAAGATTTATTGAATGACTTGAATCAATTGGAGGGTCCTTTTGGC
ATGCTTGCTGGAGTATTAAATCAATTCCTGGAGGGCTCAACATCGGAATCAGAATCTTTTGGTATGAAGCTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCATGTTGTAGACAACAACATGTGGATTTAAAAAAAACATGTTGATCAAGTTTAATTCCCAATGTATCCTTGGCTCATT
TTAATGAGCAGTTTGAGATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GACAAATGGCATACTAGTGTTCTGACAAGCGAAATACAATGTAGTCTTGTGCATCAAGCATCATCTGTGACTGGATTCAG
GTGCTCAAATGACGCATTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 744; Mature: 744

Protein sequence:

>744_residues
MKPNLFYFVLTQILAESPNFKLLDEVRPIHDITLKDKKYYRLELPLANIAAEGFRLHDAHISLYEKTDPHNPNLGLSHFT
AIFHDQNGQTYRMHLFLNRFDALACPATWELLDDDEQYVKVSPPENLEYFIHSVWQLGLPCLQLLRKKQKEIEAKLLADY
HRLNEETTALSKDLDKNRAVYLEKLDELIKTTKSLSQISESNHWLREAIYLGKTYKYVSSMPESILEPVKKSDEEHKKDD
KAEIVALSPKQGAKEPKISRGNIGLAQSTLFSKSANAKRSVDVKVERDISKIKKLFAQLLKTEDKKIKAVLLIDLHWKIK
DINLETEELLTKEQTQALNEIEGHANKEAKSLLERALFAGEFEYAQTLSPYYPLINNDLMVLALTQRKADLLSFLVTKVG
LPINSYPIKTKVKTYSNAVEYCFSEHSESLVDCFSVLIKNGASLMQPVGLYKLPLAHLLLSEIPRHPLHASLEQNKNLTL
NNKQFYAHLINALKSCLLSGDIEGDQKIALEESIVRYEHLKTNVKNSSSLLSPQNQALADEISDITKKLLPEAVAEAIEN
DEEISREKAIADKEYKELIRKVKAFYHKTGKNFAFQSLINSANQELKKELLEIDFNIDISFSELKESILENLSKERLMFS
YCSELIDVQRTIMQISQGASRKNKNLKKLNARHAELIELLTDLSQNTPQSMIKEANELQDSFSQLQDLLNDLNQLEGPFG
MLAGVLNQFLEGSTSESESFGMKL

Sequences:

>Translated_744_residues
MKPNLFYFVLTQILAESPNFKLLDEVRPIHDITLKDKKYYRLELPLANIAAEGFRLHDAHISLYEKTDPHNPNLGLSHFT
AIFHDQNGQTYRMHLFLNRFDALACPATWELLDDDEQYVKVSPPENLEYFIHSVWQLGLPCLQLLRKKQKEIEAKLLADY
HRLNEETTALSKDLDKNRAVYLEKLDELIKTTKSLSQISESNHWLREAIYLGKTYKYVSSMPESILEPVKKSDEEHKKDD
KAEIVALSPKQGAKEPKISRGNIGLAQSTLFSKSANAKRSVDVKVERDISKIKKLFAQLLKTEDKKIKAVLLIDLHWKIK
DINLETEELLTKEQTQALNEIEGHANKEAKSLLERALFAGEFEYAQTLSPYYPLINNDLMVLALTQRKADLLSFLVTKVG
LPINSYPIKTKVKTYSNAVEYCFSEHSESLVDCFSVLIKNGASLMQPVGLYKLPLAHLLLSEIPRHPLHASLEQNKNLTL
NNKQFYAHLINALKSCLLSGDIEGDQKIALEESIVRYEHLKTNVKNSSSLLSPQNQALADEISDITKKLLPEAVAEAIEN
DEEISREKAIADKEYKELIRKVKAFYHKTGKNFAFQSLINSANQELKKELLEIDFNIDISFSELKESILENLSKERLMFS
YCSELIDVQRTIMQISQGASRKNKNLKKLNARHAELIELLTDLSQNTPQSMIKEANELQDSFSQLQDLLNDLNQLEGPFG
MLAGVLNQFLEGSTSESESFGMKL
>Mature_744_residues
MKPNLFYFVLTQILAESPNFKLLDEVRPIHDITLKDKKYYRLELPLANIAAEGFRLHDAHISLYEKTDPHNPNLGLSHFT
AIFHDQNGQTYRMHLFLNRFDALACPATWELLDDDEQYVKVSPPENLEYFIHSVWQLGLPCLQLLRKKQKEIEAKLLADY
HRLNEETTALSKDLDKNRAVYLEKLDELIKTTKSLSQISESNHWLREAIYLGKTYKYVSSMPESILEPVKKSDEEHKKDD
KAEIVALSPKQGAKEPKISRGNIGLAQSTLFSKSANAKRSVDVKVERDISKIKKLFAQLLKTEDKKIKAVLLIDLHWKIK
DINLETEELLTKEQTQALNEIEGHANKEAKSLLERALFAGEFEYAQTLSPYYPLINNDLMVLALTQRKADLLSFLVTKVG
LPINSYPIKTKVKTYSNAVEYCFSEHSESLVDCFSVLIKNGASLMQPVGLYKLPLAHLLLSEIPRHPLHASLEQNKNLTL
NNKQFYAHLINALKSCLLSGDIEGDQKIALEESIVRYEHLKTNVKNSSSLLSPQNQALADEISDITKKLLPEAVAEAIEN
DEEISREKAIADKEYKELIRKVKAFYHKTGKNFAFQSLINSANQELKKELLEIDFNIDISFSELKESILENLSKERLMFS
YCSELIDVQRTIMQISQGASRKNKNLKKLNARHAELIELLTDLSQNTPQSMIKEANELQDSFSQLQDLLNDLNQLEGPFG
MLAGVLNQFLEGSTSESESFGMKL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 84863; Mature: 84863

Theoretical pI: Translated: 6.41; Mature: 6.41

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKPNLFYFVLTQILAESPNFKLLDEVRPIHDITLKDKKYYRLELPLANIAAEGFRLHDAH
CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHCCCHHCCEECCCCEEEEECCHHHHHHCCCEEEHHH
ISLYEKTDPHNPNLGLSHFTAIFHDQNGQTYRMHLFLNRFDALACPATWELLDDDEQYVK
EEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCEEE
VSPPENLEYFIHSVWQLGLPCLQLLRKKQKEIEAKLLADYHRLNEETTALSKDLDKNRAV
CCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCHHH
YLEKLDELIKTTKSLSQISESNHWLREAIYLGKTYKYVSSMPESILEPVKKSDEEHKKDD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCHHHCCCC
KAEIVALSPKQGAKEPKISRGNIGLAQSTLFSKSANAKRSVDVKVERDISKIKKLFAQLL
CCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHH
KTEDKKIKAVLLIDLHWKIKDINLETEELLTKEQTQALNEIEGHANKEAKSLLERALFAG
HCCCCCEEEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHC
EFEYAQTLSPYYPLINNDLMVLALTQRKADLLSFLVTKVGLPINSYPIKTKVKTYSNAVE
CHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
YCFSEHSESLVDCFSVLIKNGASLMQPVGLYKLPLAHLLLSEIPRHPLHASLEQNKNLTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCEE
NNKQFYAHLINALKSCLLSGDIEGDQKIALEESIVRYEHLKTNVKNSSSLLSPQNQALAD
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCHHHHHH
EISDITKKLLPEAVAEAIENDEEISREKAIADKEYKELIRKVKAFYHKTGKNFAFQSLIN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
SANQELKKELLEIDFNIDISFSELKESILENLSKERLMFSYCSELIDVQRTIMQISQGAS
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
RKNKNLKKLNARHAELIELLTDLSQNTPQSMIKEANELQDSFSQLQDLLNDLNQLEGPFG
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
MLAGVLNQFLEGSTSESESFGMKL
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKPNLFYFVLTQILAESPNFKLLDEVRPIHDITLKDKKYYRLELPLANIAAEGFRLHDAH
CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHCCCHHCCEECCCCEEEEECCHHHHHHCCCEEEHHH
ISLYEKTDPHNPNLGLSHFTAIFHDQNGQTYRMHLFLNRFDALACPATWELLDDDEQYVK
EEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCEEE
VSPPENLEYFIHSVWQLGLPCLQLLRKKQKEIEAKLLADYHRLNEETTALSKDLDKNRAV
CCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCHHH
YLEKLDELIKTTKSLSQISESNHWLREAIYLGKTYKYVSSMPESILEPVKKSDEEHKKDD
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KAEIVALSPKQGAKEPKISRGNIGLAQSTLFSKSANAKRSVDVKVERDISKIKKLFAQLL
CCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHH
KTEDKKIKAVLLIDLHWKIKDINLETEELLTKEQTQALNEIEGHANKEAKSLLERALFAG
HCCCCCEEEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHC
EFEYAQTLSPYYPLINNDLMVLALTQRKADLLSFLVTKVGLPINSYPIKTKVKTYSNAVE
CHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
YCFSEHSESLVDCFSVLIKNGASLMQPVGLYKLPLAHLLLSEIPRHPLHASLEQNKNLTL
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NNKQFYAHLINALKSCLLSGDIEGDQKIALEESIVRYEHLKTNVKNSSSLLSPQNQALAD
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCHHHHHH
EISDITKKLLPEAVAEAIENDEEISREKAIADKEYKELIRKVKAFYHKTGKNFAFQSLIN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
SANQELKKELLEIDFNIDISFSELKESILENLSKERLMFSYCSELIDVQRTIMQISQGAS
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RKNKNLKKLNARHAELIELLTDLSQNTPQSMIKEANELQDSFSQLQDLLNDLNQLEGPFG
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
MLAGVLNQFLEGSTSESESFGMKL
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA