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The map label for this gene is 54293725

Identifier: 54293725

GI number: 54293725

Start: 884320

End: 885507

Strand: Direct

Name: 54293725

Synonym: lpl0778

Alternate gene names: NA

Gene position: 884320-885507 (Clockwise)

Preceding gene: 54293724

Following gene: 54293726

Centisome position: 26.43

GC content: 33.59

Gene sequence:

>1188_bases
ATGAAAACCATGAAGCAAATGATTCGATTGACAATGTTACTTCTGATGCTCAGTTTTAATTTATGGGCGATAAATTCTTC
ATCTCCCTGGTATACAGAAGAAAAAGGTAAAGGGCTTGTAATTAACGTTGAATTGTATCTTTCATCTACTTGTCCTCATT
GTCATAAGGCCGATGAATTTTTCAAAGAAATTGAAAAACATTATACCTGGCTTCATGTTGAACGTTATATTATTGATAAA
GACAAAAAGGCTTTGAAACGCTTTGGCGATTTATTAACAGAGCTTAACCGATATGATTTTGCGGTTCCATCCATATTTTT
TTGTAATTCTCGTTGGGTTGGGTTTGCTACTGCACAGACAACCGGAAAGGATCTGTTAAACGGCATAGAATATTGTAAAG
AAGAAATTGTGAAAAATGGAAGATTGACTCCTGCGACCGAGAGTGTTTTAAACAGATGGGGAAATGCTAATTTGTTTGAT
GCGAACATCACAGGAAGCCCTTCCACAAATACATTTATTTTTGTTGTAGCCTTAATCGATGCAATAAGTCCATGTGCTTT
ATTTACGATTGCTGCATTTTTAGGTCTTTTATTCATGATTGAAAAGAGAAAGCTGCAATTTATTAGCGGTTCCGTGTTTA
TTTTAACTGTTGCAGGTGTTCATTATTTTCAACAGGTTTATCCTACCCTGTTTTTTGAGTCGCTTTCATGGTTTCGTATT
CCGGCTGCATTGGTAGGCCTTTTTGCTTTTTATTTCGCTGGCCAATATTATAAGAAGCATTCTATCCAACCATTATTTAT
TGTTTTGGCTTTTTTATTGGCCCTTACAGTGCCAATGTTTCAACAAACCTGTTTGATGAATTGGTCTTATGTGTTTGAAC
AATGGTTACATAACCAAAATGTATCAGGAGTTCAGATGGGGCTATATCAATTTGCTTATCAGCTTATCTATATCTTTCCT
TTAATTATCCTGATGTTTCTCTATTGGATTTTAATGAAAATTCATTTTTTCAAAAAATTTAAGACAAAATTAACTACTAT
AGGTTTTTTATATATTTTAGCTATCGCACTCTTATTAATCATTTATCCCTATGCCTTGTCTAATTTGGCTTTATCATTAT
TTTTAATTGTCTCATTGGGTATCTCCGGTCTGTTACTGAATTGGTTTAATGCTTCTAAAATGACATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTATTTCAGATTTACATTTTATTGCTTTAAACGCGAGTGTCTGGCTATTTCATACAATCGATCCTAAGTGCTATAGTA
TTCATTTACAAAGAAATATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGGTTCAATCGGCATAAAATAATTATAAATTCTGAATATCTTTCATTTTATGGCATACAATTAAAAATGAGCCAGGCTTA
GAAGCTGATCGCTTATGGAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 395; Mature: 395

Protein sequence:

>395_residues
MKTMKQMIRLTMLLLMLSFNLWAINSSSPWYTEEKGKGLVINVELYLSSTCPHCHKADEFFKEIEKHYTWLHVERYIIDK
DKKALKRFGDLLTELNRYDFAVPSIFFCNSRWVGFATAQTTGKDLLNGIEYCKEEIVKNGRLTPATESVLNRWGNANLFD
ANITGSPSTNTFIFVVALIDAISPCALFTIAAFLGLLFMIEKRKLQFISGSVFILTVAGVHYFQQVYPTLFFESLSWFRI
PAALVGLFAFYFAGQYYKKHSIQPLFIVLAFLLALTVPMFQQTCLMNWSYVFEQWLHNQNVSGVQMGLYQFAYQLIYIFP
LIILMFLYWILMKIHFFKKFKTKLTTIGFLYILAIALLLIIYPYALSNLALSLFLIVSLGISGLLLNWFNASKMT

Sequences:

>Translated_395_residues
MKTMKQMIRLTMLLLMLSFNLWAINSSSPWYTEEKGKGLVINVELYLSSTCPHCHKADEFFKEIEKHYTWLHVERYIIDK
DKKALKRFGDLLTELNRYDFAVPSIFFCNSRWVGFATAQTTGKDLLNGIEYCKEEIVKNGRLTPATESVLNRWGNANLFD
ANITGSPSTNTFIFVVALIDAISPCALFTIAAFLGLLFMIEKRKLQFISGSVFILTVAGVHYFQQVYPTLFFESLSWFRI
PAALVGLFAFYFAGQYYKKHSIQPLFIVLAFLLALTVPMFQQTCLMNWSYVFEQWLHNQNVSGVQMGLYQFAYQLIYIFP
LIILMFLYWILMKIHFFKKFKTKLTTIGFLYILAIALLLIIYPYALSNLALSLFLIVSLGISGLLLNWFNASKMT
>Mature_395_residues
MKTMKQMIRLTMLLLMLSFNLWAINSSSPWYTEEKGKGLVINVELYLSSTCPHCHKADEFFKEIEKHYTWLHVERYIIDK
DKKALKRFGDLLTELNRYDFAVPSIFFCNSRWVGFATAQTTGKDLLNGIEYCKEEIVKNGRLTPATESVLNRWGNANLFD
ANITGSPSTNTFIFVVALIDAISPCALFTIAAFLGLLFMIEKRKLQFISGSVFILTVAGVHYFQQVYPTLFFESLSWFRI
PAALVGLFAFYFAGQYYKKHSIQPLFIVLAFLLALTVPMFQQTCLMNWSYVFEQWLHNQNVSGVQMGLYQFAYQLIYIFP
LIILMFLYWILMKIHFFKKFKTKLTTIGFLYILAIALLLIIYPYALSNLALSLFLIVSLGISGLLLNWFNASKMT

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45621; Mature: 45621

Theoretical pI: Translated: 9.37; Mature: 9.37

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
4.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKTMKQMIRLTMLLLMLSFNLWAINSSSPWYTEEKGKGLVINVELYLSSTCPHCHKADEF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCHHHHH
FKEIEKHYTWLHVERYIIDKDKKALKRFGDLLTELNRYDFAVPSIFFCNSRWVGFATAQT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCEEEEEEHHH
TGKDLLNGIEYCKEEIVKNGRLTPATESVLNRWGNANLFDANITGSPSTNTFIFVVALID
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
AISPCALFTIAAFLGLLFMIEKRKLQFISGSVFILTVAGVHYFQQVYPTLFFESLSWFRI
HHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PAALVGLFAFYFAGQYYKKHSIQPLFIVLAFLLALTVPMFQQTCLMNWSYVFEQWLHNQN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
VSGVQMGLYQFAYQLIYIFPLIILMFLYWILMKIHFFKKFKTKLTTIGFLYILAIALLLI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYPYALSNLALSLFLIVSLGISGLLLNWFNASKMT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKTMKQMIRLTMLLLMLSFNLWAINSSSPWYTEEKGKGLVINVELYLSSTCPHCHKADEF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCHHHHH
FKEIEKHYTWLHVERYIIDKDKKALKRFGDLLTELNRYDFAVPSIFFCNSRWVGFATAQT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCEEEEEEHHH
TGKDLLNGIEYCKEEIVKNGRLTPATESVLNRWGNANLFDANITGSPSTNTFIFVVALID
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
AISPCALFTIAAFLGLLFMIEKRKLQFISGSVFILTVAGVHYFQQVYPTLFFESLSWFRI
HHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PAALVGLFAFYFAGQYYKKHSIQPLFIVLAFLLALTVPMFQQTCLMNWSYVFEQWLHNQN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
VSGVQMGLYQFAYQLIYIFPLIILMFLYWILMKIHFFKKFKTKLTTIGFLYILAIALLLI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYPYALSNLALSLFLIVSLGISGLLLNWFNASKMT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA