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The map label for this gene is 54293673

Identifier: 54293673

GI number: 54293673

Start: 814617

End: 816734

Strand: Direct

Name: 54293673

Synonym: lpl0726

Alternate gene names: NA

Gene position: 814617-816734 (Clockwise)

Preceding gene: 54293672

Following gene: 54293675

Centisome position: 24.35

GC content: 36.97

Gene sequence:

>2118_bases
GTGTTTCGATTTTTATTTCCAGTCAGTCTTTTTATAAGTTCCATTCTCCTATTCAGTATTCAACCCATGGTTGCAAAAGC
AATACTTCCAATTTATGGAGGTACACCGGGTGTGTGGACTGTTTGCGTGCTTTTTTTTCAATTTATTCTGCTCATTGCAT
ATGGCTACGTATGGCTTATAAGTGAGATTAAGAAACCTGCTGTTTGGCGTTTGATCCATATGGTTTTGGTTGTTTTAAGT
TTTACAGCACTTCCATTGCTGTTTCATCCTGCAGCCAGGGATGGACAGCCTGAATGGGTGATTCTGCATAATTTGTTAAT
TCAACTGGGTTTGCCTTTGTTAGTAATTGGTGCTTCTGCTCCTTTATTGCAATTTGCCTATAGCCAGACAACAAGCAAAG
GGGCCTCAGACCCTTATTATTTGTACATATCCAGTAATCTTGGAAGCTTGAGTGCCTTGCTTTTTTATCCATGGGTTATC
GAGCGATTTATTGGTTTGACTCGTCAATTTTATTTATGGAACTTTGGATTTGCTATTTATTTGTTACTGTTGGTAACAGT
CTTGTTTTTTACAAAATACCAACCTTTAATATTAACTGAAAAAAAAGAGGTGGATTTTTTGTCTTGGCGAGAGATAGCCT
ATTGGATTTTTTTGAGTTTTGTCCCTTGCAGTTTGATGCTGGGAGTTACTTTATATATCACAACTGATGTTGCTGCAACT
CCCTTATTTTGGGTTTTGCCTTTAGCGCTTTACCTTTTGTCATTTGTATTTACCTTCACAGCGACCCCCCTTATTTCACA
AAAATGGATTTCTCGTAATTGCCTGTTTTTCCTGGTTTTTACAATTCTTGGGTTCATTTTTGGGGTTAGTCAAATCAGAG
TGTGGCAATTGGTGTTATTTAATCTGTTAAGTTTTTTTATTTTGGCTTTACTGTGTCATGGCCAGTTATTTGCGCGAAGA
CCCAAGCCACATAAACTCACTTTGTTTTATTTTTGTTTGTCTATCGGAGGAGTTTTAGCAGGGATTTTTAATGGAATTTT
AGCACCAAATTGGTTTAATTATGTTTATGAATACCCATTAGCCATTTTATTAAGTTTATTTGCTCTTCAGCTGCCGAAAA
CTAACCAAGGATGGTGGGTGCCATTAGTTGTTTTGGGTTTGCTGTCGCTTCATTATTTCATTCCTACCGTTCCCTGGTTT
AAAAGTACTACCACTTTTCACATCCTTGCTATTTTGGCACTTGGAATTATTGTGATTTGGCATCGTAATAAAATCAATCT
TGTACTATCCATGCTCATTTTATTTGTTTTCCTTTACTTTCCTCCGTTGCAAGACAAACAGATTTTACTCAAGGAAAGAA
ATTTTTACGGCGTCAAGCAAGTCTTCAAAAAGGATGATGTGCATGCATTAATAAGCCAATCAACCCTTCATGGGATGCAG
GTAATGAATGGGGAAAAAGCAAGTTATGGAAGAAGCTCCTATTATGGGGCCATAGCTCCAATAGTTGATATTTTGAAGAA
GGAATTTCATCCGCTTTCTGCGACGATTATGGGGTTGGGTGCAGGAACACTACTGTGCCAATTTCGGGCAACTGATTCCA
TAAAGGTTATTGAGATTGATCAACAAGTAATTGATTTAGCTAAAAATAATAAATTATTCACATACATACGAGACTGTTCG
CCTTCAGCTGAGATTATTAAACAGGATGGTAGATTGGCCTTGGTTAATATGCCAGATGCTTCACAGGATTTGTTAATTCT
GGATGCGTTTAATTCAGATGCTATTCCTGTCCATCTGATGACACTTGAGGCTTTCACCTTATATAAGAAGAAAATTGTCG
AAGATGGAGTTATTTTGGTTAATCTAAGTAACAGACATCTGCAAATGCTCCCGGTAATTAATGCAATTGGACGTTCTTTG
GATATGATAACTTTATTTTTAGCGCATAAGGGAGATAAGAAATTGGGGCAATTTAACTCAGAATGGGCTATGCTGACCTC
GAATCAATCTTTGGCGTTTCAAGTCATGAAAGGAACAAACTGGAAATTTGTAGCAGATGATAATCAGTTTTTATGGACCG
ATGATTATTCTAATATTATTCCCTTACTGAAATGGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGTTTTGCAGAGTAATAATTCATCCTTGTATGAACGAGAGTGTAGTCGTAAAATGATCGATTCATTCATTTGGCAGCAC
CATTGGCTAAGGATTGCTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGTAAAAAGATAAGCTATCAAATTCAATTGTATCCTTGCTTTATCGTGATGCGGGCTATCCATAGCTCAAATTTCAGCAA
GGTTTCCTTTTGTTTCTAGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Spermine/Spermidine Synthase Protein; Integral Membrane Protein-Like; Ferrichrome ABC Transporter Permease; Integral Membrane Protein

Number of amino acids: Translated: 705; Mature: 705

Protein sequence:

>705_residues
MFRFLFPVSLFISSILLFSIQPMVAKAILPIYGGTPGVWTVCVLFFQFILLIAYGYVWLISEIKKPAVWRLIHMVLVVLS
FTALPLLFHPAARDGQPEWVILHNLLIQLGLPLLVIGASAPLLQFAYSQTTSKGASDPYYLYISSNLGSLSALLFYPWVI
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VMNGEKASYGRSSYYGAIAPIVDILKKEFHPLSATIMGLGAGTLLCQFRATDSIKVIEIDQQVIDLAKNNKLFTYIRDCS
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DMITLFLAHKGDKKLGQFNSEWAMLTSNQSLAFQVMKGTNWKFVADDNQFLWTDDYSNIIPLLKW

Sequences:

>Translated_705_residues
MFRFLFPVSLFISSILLFSIQPMVAKAILPIYGGTPGVWTVCVLFFQFILLIAYGYVWLISEIKKPAVWRLIHMVLVVLS
FTALPLLFHPAARDGQPEWVILHNLLIQLGLPLLVIGASAPLLQFAYSQTTSKGASDPYYLYISSNLGSLSALLFYPWVI
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PLFWVLPLALYLLSFVFTFTATPLISQKWISRNCLFFLVFTILGFIFGVSQIRVWQLVLFNLLSFFILALLCHGQLFARR
PKPHKLTLFYFCLSIGGVLAGIFNGILAPNWFNYVYEYPLAILLSLFALQLPKTNQGWWVPLVVLGLLSLHYFIPTVPWF
KSTTTFHILAILALGIIVIWHRNKINLVLSMLILFVFLYFPPLQDKQILLKERNFYGVKQVFKKDDVHALISQSTLHGMQ
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PSAEIIKQDGRLALVNMPDASQDLLILDAFNSDAIPVHLMTLEAFTLYKKKIVEDGVILVNLSNRHLQMLPVINAIGRSL
DMITLFLAHKGDKKLGQFNSEWAMLTSNQSLAFQVMKGTNWKFVADDNQFLWTDDYSNIIPLLKW
>Mature_705_residues
MFRFLFPVSLFISSILLFSIQPMVAKAILPIYGGTPGVWTVCVLFFQFILLIAYGYVWLISEIKKPAVWRLIHMVLVVLS
FTALPLLFHPAARDGQPEWVILHNLLIQLGLPLLVIGASAPLLQFAYSQTTSKGASDPYYLYISSNLGSLSALLFYPWVI
ERFIGLTRQFYLWNFGFAIYLLLLVTVLFFTKYQPLILTEKKEVDFLSWREIAYWIFLSFVPCSLMLGVTLYITTDVAAT
PLFWVLPLALYLLSFVFTFTATPLISQKWISRNCLFFLVFTILGFIFGVSQIRVWQLVLFNLLSFFILALLCHGQLFARR
PKPHKLTLFYFCLSIGGVLAGIFNGILAPNWFNYVYEYPLAILLSLFALQLPKTNQGWWVPLVVLGLLSLHYFIPTVPWF
KSTTTFHILAILALGIIVIWHRNKINLVLSMLILFVFLYFPPLQDKQILLKERNFYGVKQVFKKDDVHALISQSTLHGMQ
VMNGEKASYGRSSYYGAIAPIVDILKKEFHPLSATIMGLGAGTLLCQFRATDSIKVIEIDQQVIDLAKNNKLFTYIRDCS
PSAEIIKQDGRLALVNMPDASQDLLILDAFNSDAIPVHLMTLEAFTLYKKKIVEDGVILVNLSNRHLQMLPVINAIGRSL
DMITLFLAHKGDKKLGQFNSEWAMLTSNQSLAFQVMKGTNWKFVADDNQFLWTDDYSNIIPLLKW

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 80390; Mature: 80390

Theoretical pI: Translated: 9.41; Mature: 9.41

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFRFLFPVSLFISSILLFSIQPMVAKAILPIYGGTPGVWTVCVLFFQFILLIAYGYVWLI
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SEIKKPAVWRLIHMVLVVLSFTALPLLFHPAARDGQPEWVILHNLLIQLGLPLLVIGASA
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCEEEECCCC
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HHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLLVTVLFFTKYQPLILTEKKEVDFLSWREIAYWIFLSFVPCSLMLGVTLYITTDVAAT
HHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLLSFFILALLCHGQLFARRPKPHKLTLFYFCLSIGGVLAGIFNGILAPNWFNYVYEYPL
HHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
AILLSLFALQLPKTNQGWWVPLVVLGLLSLHYFIPTVPWFKSTTTFHILAILALGIIVIW
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEE
HRNKINLVLSMLILFVFLYFPPLQDKQILLKERNFYGVKQVFKKDDVHALISQSTLHGMQ
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
VMNGEKASYGRSSYYGAIAPIVDILKKEFHPLSATIMGLGAGTLLCQFRATDSIKVIEID
HHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEC
QQVIDLAKNNKLFTYIRDCSPSAEIIKQDGRLALVNMPDASQDLLILDAFNSDAIPVHLM
HHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEE
TLEAFTLYKKKIVEDGVILVNLSNRHLQMLPVINAIGRSLDMITLFLAHKGDKKLGQFNS
HHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCC
EWAMLTSNQSLAFQVMKGTNWKFVADDNQFLWTDDYSNIIPLLKW
CEEEEECCCCEEEEEEECCCEEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
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CCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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QQVIDLAKNNKLFTYIRDCSPSAEIIKQDGRLALVNMPDASQDLLILDAFNSDAIPVHLM
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CEEEEECCCCEEEEEEECCCEEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA