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The map label for this gene is 54293171

Identifier: 54293171

GI number: 54293171

Start: 243357

End: 245723

Strand: Direct

Name: 54293171

Synonym: lpl0217

Alternate gene names: NA

Gene position: 243357-245723 (Clockwise)

Preceding gene: 54293170

Following gene: 54293172

Centisome position: 7.27

GC content: 38.53

Gene sequence:

>2367_bases
ATGGTAACAGCATTAAACAAAAAATTGTGGCGTGATGTGTTCAAATTAAGAAGTCAAATCATCACGATCGCATTAGTCGT
TTGTAGTGGGGTCAGTGTTTTAATTGCATCAGTCAATACCTATGTTTCTTTAAGGAATGCACAACAAGAGTTTTATTCAA
AATATCATTTTGCAGATGTGTTTGCTTCATTGAAAAGAGCGCCTGACTATTTAGAAAAGCGAATAACAGAAATTTCAGGA
GTAACTCGAGTAGAGACCCGAATTGTAAAAGATGTTGTGCTTGATTTGCCTTGGATGCCAGAGCCCGCTGTAGGCCGCTT
TATATCGATATCGGATAAGAATAAATCGGGTCTTAATCAATTGTATTTACGCCAGGGAAGATGGCCTGACAGCAATCGAT
ATGATGAGATACTGGTGAATGAAAGTTTTGCAATCAGCCAGGATTTAAAACCAGGCGATAACATTATTGCATTATTAAAC
GGGCACAAAGAACAGCTAAAAGTTGTTGGGATTGCATTATCACCTGAGTATGTGTACGCCATTCGGGGAGAAGACTTACT
TCCGGACAACAGGCATTTCGGTGTTTTTTGGATGGATAGAAAGGCATTAAGCACCGCCTTTGGGATGCAGGGCGCTTTTA
ATGACATCATTATTAAGCTCGCGCCCAATGCGTCAGAGCAATTTGTGATGACTCAATTGGAAAGAATGTTTCGTTCTTAT
GGTTTGGCCATCGCGTATTCACGAAAAGATCAGGTATCCGATCGATTTGTAACCAATGAAATAAAACAGCAAAAAATTAT
TGCCACTTATATCCCGCCTGTTTTTCTGTTGGTGGCAGCGTTTTTATTGAATTTGGTGACAGGACGTTTGGTAAGTAAAG
AACGTGAACAAATAGCAACCTTGAAGGCATTAGGTTATGGTGATTTGGCGATTGCCTACCACTATATAAAAATAATTTTA
ATTATTATTGTTATTGGGTCACTTGCAGGTGTGTCATTAGGTGCCTGGTTTGGTAATTTGATGACCGAGCTCTATACCGA
GTATTTCAGGTTCCCCAGGTTCTCTTATTTTTTTTCCAATTTGGCGGCGTTTATAGGGATTCTGGTTTGCTTTTTGGCTG
CTCTTTTGGGTACATTGCGTGCGATTTACCAGGTCATAAATCTCATGCCCGCAGTAGCGATGAAACCGCCTGCCCCTATC
GTGTATCGAGCCACTTTGATTGAAAAAATTAAATTTTTTTCAAGACCTCCCAGTAGTGTCAAAATGGTTTATCGATATAT
TTTCCGTCATTTTTTACGCACGATGTTGACTTGTTTGGGTATTGCGTTGGCAATGGCTATCGTAATTCTGGGTTTGTTTT
GGCAAGATGCGATACGCTATCTCATCAATACCCAATTCATAATGGCACAACGTGAACATGCCATAGTCAGCTTTAATAAT
CCCGTTAATAAAATAGCGGTAACGGAGTTGAATAAAATTACTGGGGTTACGAGCAGTGAAGGTTATCGTATTGTTCCTGC
TCGATTAACTTACCAACATCGTAGTGAATTATCCTCGCTGTTTGGTATCGCTGAAAATGCGGAATTAAAAATTTTATTAG
ACAAGCATCTTAATCGAATGACCATTCCTGCACAGGGTTTATTAATCAGTGAGGGATTGGCAGAACGATTGCGCTTGGCT
GTTGGAGACAGGCTTGATATCGAACTGCTGGAAGGGAATAAAGCAAAAACTCAACTGAGGGTGCAAGGAATAATAAATGA
CTATGTAGGTATGTTCGCCTATATAGAAATTAAAGCACTTAACCGTTTATTAAATGAGGATCGGTTAATCAATTCAGCGG
CTATTACAGTAGACACCAAATACGTCAAACATTTATATAAAAAGGTAAAGGAAATACCCAAGATAGGCACTATTACTTTT
AAAACCTCCATCATTAGGACATTTGAGGAAACTTTTGCAAAACACATCCTTGTATTTACCACCATTCTTGCAAGTTTTGC
CATCATTATTGCGGTGAGTGTTGTTTATAATAATGCGAGCATCACCTTGGCAGAAAGAGCGAGAGAGTTAACGACACTCC
AAGTGTTAGGATTTACTCAGGGAGAAGTATCCACCTTGCTGTTTTTAAATCACATCTTTGAAATAATAATCTCTACCCCT
TTAGGATTGGTTACCGGGTATTTGTTGTCCTGGTCTATACTGCAATTAATGCAAACCGATTGGTTCAAGATTCCTTTTGT
TATAGAACTGAAAACCTATGTTATTTCGATTATGGTGATATTTTTTTCTAGTTTAATTAGTTTTTATATTATTCAGCGTA
AAGCAAGCCATCTGAATTTAACAGCTGTATTAAAGGTAGCAGACTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGTCATAAGCGAGATGGCTGATCGTGTGATCCATATTGCTGATGGTGTCATAAGCAACATATCCAAAAATAAATTCAAG
CGCAAACCAGAAGAATTAGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAAGATTATGAACCTGAATTTGAAAAAACTAATAGGGTATTTTCTGATAATAGTGATATTTTTCAGTGTTGTTCTCTGG
TTTCTTTCTCATCAAGGTAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Permease; Peptide ABC Transporter Permease; ABC Transporter Permease; Efflux ABC Transporter Permease Protein; ABC Transporter; Permease Domain Protein; ABC Transporter Inner Membrane Subunit; Antimicrobial Peptide ABC Transporter Permease; Permease Domain-Containing Protein; Efflux ABC Transporter Permease; ABC-Type Antimicrobial Peptide Transport System Protein; ABC-Type Transporter; ABC-Type Transport System Permease; ABC-Type Transport System

Number of amino acids: Translated: 788; Mature: 788

Protein sequence:

>788_residues
MVTALNKKLWRDVFKLRSQIITIALVVCSGVSVLIASVNTYVSLRNAQQEFYSKYHFADVFASLKRAPDYLEKRITEISG
VTRVETRIVKDVVLDLPWMPEPAVGRFISISDKNKSGLNQLYLRQGRWPDSNRYDEILVNESFAISQDLKPGDNIIALLN
GHKEQLKVVGIALSPEYVYAIRGEDLLPDNRHFGVFWMDRKALSTAFGMQGAFNDIIIKLAPNASEQFVMTQLERMFRSY
GLAIAYSRKDQVSDRFVTNEIKQQKIIATYIPPVFLLVAAFLLNLVTGRLVSKEREQIATLKALGYGDLAIAYHYIKIIL
IIIVIGSLAGVSLGAWFGNLMTELYTEYFRFPRFSYFFSNLAAFIGILVCFLAALLGTLRAIYQVINLMPAVAMKPPAPI
VYRATLIEKIKFFSRPPSSVKMVYRYIFRHFLRTMLTCLGIALAMAIVILGLFWQDAIRYLINTQFIMAQREHAIVSFNN
PVNKIAVTELNKITGVTSSEGYRIVPARLTYQHRSELSSLFGIAENAELKILLDKHLNRMTIPAQGLLISEGLAERLRLA
VGDRLDIELLEGNKAKTQLRVQGIINDYVGMFAYIEIKALNRLLNEDRLINSAAITVDTKYVKHLYKKVKEIPKIGTITF
KTSIIRTFEETFAKHILVFTTILASFAIIIAVSVVYNNASITLAERARELTTLQVLGFTQGEVSTLLFLNHIFEIIISTP
LGLVTGYLLSWSILQLMQTDWFKIPFVIELKTYVISIMVIFFSSLISFYIIQRKASHLNLTAVLKVAD

Sequences:

>Translated_788_residues
MVTALNKKLWRDVFKLRSQIITIALVVCSGVSVLIASVNTYVSLRNAQQEFYSKYHFADVFASLKRAPDYLEKRITEISG
VTRVETRIVKDVVLDLPWMPEPAVGRFISISDKNKSGLNQLYLRQGRWPDSNRYDEILVNESFAISQDLKPGDNIIALLN
GHKEQLKVVGIALSPEYVYAIRGEDLLPDNRHFGVFWMDRKALSTAFGMQGAFNDIIIKLAPNASEQFVMTQLERMFRSY
GLAIAYSRKDQVSDRFVTNEIKQQKIIATYIPPVFLLVAAFLLNLVTGRLVSKEREQIATLKALGYGDLAIAYHYIKIIL
IIIVIGSLAGVSLGAWFGNLMTELYTEYFRFPRFSYFFSNLAAFIGILVCFLAALLGTLRAIYQVINLMPAVAMKPPAPI
VYRATLIEKIKFFSRPPSSVKMVYRYIFRHFLRTMLTCLGIALAMAIVILGLFWQDAIRYLINTQFIMAQREHAIVSFNN
PVNKIAVTELNKITGVTSSEGYRIVPARLTYQHRSELSSLFGIAENAELKILLDKHLNRMTIPAQGLLISEGLAERLRLA
VGDRLDIELLEGNKAKTQLRVQGIINDYVGMFAYIEIKALNRLLNEDRLINSAAITVDTKYVKHLYKKVKEIPKIGTITF
KTSIIRTFEETFAKHILVFTTILASFAIIIAVSVVYNNASITLAERARELTTLQVLGFTQGEVSTLLFLNHIFEIIISTP
LGLVTGYLLSWSILQLMQTDWFKIPFVIELKTYVISIMVIFFSSLISFYIIQRKASHLNLTAVLKVAD
>Mature_788_residues
MVTALNKKLWRDVFKLRSQIITIALVVCSGVSVLIASVNTYVSLRNAQQEFYSKYHFADVFASLKRAPDYLEKRITEISG
VTRVETRIVKDVVLDLPWMPEPAVGRFISISDKNKSGLNQLYLRQGRWPDSNRYDEILVNESFAISQDLKPGDNIIALLN
GHKEQLKVVGIALSPEYVYAIRGEDLLPDNRHFGVFWMDRKALSTAFGMQGAFNDIIIKLAPNASEQFVMTQLERMFRSY
GLAIAYSRKDQVSDRFVTNEIKQQKIIATYIPPVFLLVAAFLLNLVTGRLVSKEREQIATLKALGYGDLAIAYHYIKIIL
IIIVIGSLAGVSLGAWFGNLMTELYTEYFRFPRFSYFFSNLAAFIGILVCFLAALLGTLRAIYQVINLMPAVAMKPPAPI
VYRATLIEKIKFFSRPPSSVKMVYRYIFRHFLRTMLTCLGIALAMAIVILGLFWQDAIRYLINTQFIMAQREHAIVSFNN
PVNKIAVTELNKITGVTSSEGYRIVPARLTYQHRSELSSLFGIAENAELKILLDKHLNRMTIPAQGLLISEGLAERLRLA
VGDRLDIELLEGNKAKTQLRVQGIINDYVGMFAYIEIKALNRLLNEDRLINSAAITVDTKYVKHLYKKVKEIPKIGTITF
KTSIIRTFEETFAKHILVFTTILASFAIIIAVSVVYNNASITLAERARELTTLQVLGFTQGEVSTLLFLNHIFEIIISTP
LGLVTGYLLSWSILQLMQTDWFKIPFVIELKTYVISIMVIFFSSLISFYIIQRKASHLNLTAVLKVAD

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 89211; Mature: 89211

Theoretical pI: Translated: 9.96; Mature: 9.96

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVTALNKKLWRDVFKLRSQIITIALVVCSGVSVLIASVNTYVSLRNAQQEFYSKYHFADV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FASLKRAPDYLEKRITEISGVTRVETRIVKDVVLDLPWMPEPAVGRFISISDKNKSGLNQ
HHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCHHH
LYLRQGRWPDSNRYDEILVNESFAISQDLKPGDNIIALLNGHKEQLKVVGIALSPEYVYA
HHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCEEECCCCCCCCCEEEEECCCCHHEEEEEEEECCCEEEE
IRGEDLLPDNRHFGVFWMDRKALSTAFGMQGAFNDIIIKLAPNASEQFVMTQLERMFRSY
ECCCCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHC
GLAIAYSRKDQVSDRFVTNEIKQQKIIATYIPPVFLLVAAFLLNLVTGRLVSKEREQIAT
CEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKALGYGDLAIAYHYIKIILIIIVIGSLAGVSLGAWFGNLMTELYTEYFRFPRFSYFFSN
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
LAAFIGILVCFLAALLGTLRAIYQVINLMPAVAMKPPAPIVYRATLIEKIKFFSRPPSSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
KMVYRYIFRHFLRTMLTCLGIALAMAIVILGLFWQDAIRYLINTQFIMAQREHAIVSFNN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEECCCEEEEECC
PVNKIAVTELNKITGVTSSEGYRIVPARLTYQHRSELSSLFGIAENAELKILLDKHLNRM
CCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHCCCCE
TIPAQGLLISEGLAERLRLAVGDRLDIELLEGNKAKTQLRVQGIINDYVGMFAYIEIKAL
ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NRLLNEDRLINSAAITVDTKYVKHLYKKVKEIPKIGTITFKTSIIRTFEETFAKHILVFT
HHHHHHHHEECCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TILASFAIIIAVSVVYNNASITLAERARELTTLQVLGFTQGEVSTLLFLNHIFEIIISTP
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LGLVTGYLLSWSILQLMQTDWFKIPFVIELKTYVISIMVIFFSSLISFYIIQRKASHLNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE
TAVLKVAD
EEEEEECC
>Mature Secondary Structure
MVTALNKKLWRDVFKLRSQIITIALVVCSGVSVLIASVNTYVSLRNAQQEFYSKYHFADV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FASLKRAPDYLEKRITEISGVTRVETRIVKDVVLDLPWMPEPAVGRFISISDKNKSGLNQ
HHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCHHH
LYLRQGRWPDSNRYDEILVNESFAISQDLKPGDNIIALLNGHKEQLKVVGIALSPEYVYA
HHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCEEECCCCCCCCCEEEEECCCCHHEEEEEEEECCCEEEE
IRGEDLLPDNRHFGVFWMDRKALSTAFGMQGAFNDIIIKLAPNASEQFVMTQLERMFRSY
ECCCCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHC
GLAIAYSRKDQVSDRFVTNEIKQQKIIATYIPPVFLLVAAFLLNLVTGRLVSKEREQIAT
CEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKALGYGDLAIAYHYIKIILIIIVIGSLAGVSLGAWFGNLMTELYTEYFRFPRFSYFFSN
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LAAFIGILVCFLAALLGTLRAIYQVINLMPAVAMKPPAPIVYRATLIEKIKFFSRPPSSV
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KMVYRYIFRHFLRTMLTCLGIALAMAIVILGLFWQDAIRYLINTQFIMAQREHAIVSFNN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEECCCEEEEECC
PVNKIAVTELNKITGVTSSEGYRIVPARLTYQHRSELSSLFGIAENAELKILLDKHLNRM
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TIPAQGLLISEGLAERLRLAVGDRLDIELLEGNKAKTQLRVQGIINDYVGMFAYIEIKAL
ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NRLLNEDRLINSAAITVDTKYVKHLYKKVKEIPKIGTITFKTSIIRTFEETFAKHILVFT
HHHHHHHHEECCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TILASFAIIIAVSVVYNNASITLAERARELTTLQVLGFTQGEVSTLLFLNHIFEIIISTP
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LGLVTGYLLSWSILQLMQTDWFKIPFVIELKTYVISIMVIFFSSLISFYIIQRKASHLNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE
TAVLKVAD
EEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA