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The map label for this gene is 54020538

Identifier: 54020538

GI number: 54020538

Start: 596365

End: 597906

Strand: Reverse

Name: 54020538

Synonym: mhp482

Alternate gene names: NA

Gene position: 597906-596365 (Counterclockwise)

Preceding gene: 54020539

Following gene: 54020537

Centisome position: 66.97

GC content: 26.26

Gene sequence:

>1542_bases
ATGAAGGTTAGATCTAAAAAAGTCTTCAAGTTAGAAATAAACCCATCAAAAAATGGCCAAAAGCAGTGGTTGTATTTTTT
GCTTACTGTTTTATTCTTAACTAGTTTGGCTTTAGCCATTTTTTTTGATGGACCACGATCATTTCTAAATATTTCAAATA
CTGATCAGCCAGTCTCAAGTATTTCAACATTTTTCAATCCAATTGAAGATGAAATGCGTGAGTTTCTTGCTGTTCGAATG
ACAAGATCAGTTTTGCTCTTATTTTTTAGTTTTGCCTTTTTCTTTAAAGGACTTAAATTTTTAAGCCTTAAGGAAAAATT
GCAAAAATATCTTGTTTTATCGGCATTTTTTGGTCTTTTTTTAGTAAATATTGTTATTTATTTTGCTTGACTTACAACAG
AATGAACTTATATTCTTGTATTTTCAGCACAAATTTTTGTCCTAATTTTCCTTGATTATAGTCTCTGGCTCTGAATTGGT
CGGAAAAATGATAAAATAAATTATGATTATAAAAAATTTTTTATTTTTCGTCATATCAGTTTGGCAGCCTCATTAATTAT
TTTTGGGATTTTATTCGGACTTTTTGCATCAATGGTTTTCTCAAATGAGGAAGCTGATATTATCGCGACTGTAAGTTATG
GTAACCCGGTTGCAGATTGGTTATATACTTTTATTGCCGAAGTTGGAAAAATTAGTAATTCTTTCATTTTAATTGCAATT
TTGGTATTTGTATTAGTGCTTGCCTTACTTTATTTTAGTCCGCAAATTTACTTTTACCGTCAAAGTTTTTTCCGGCTAAA
AAAAATAGTGCCAAGTTTTTCACTGTTAATTTTTGCTATTTTTGCACTTTTTATTTATAGTATTTATATAAATATTTTTG
CAAGCACAAATTTTGTTCAATTCTTACCTTTTGGAAAGAATTTAACAACAAATTATTTGCCAATGATTATCGGAATTTCG
ATTCATCTAGTTTTATTAGCTACTTATTTCCTTTTAAATTTTACAAAATTAGAAAAGAAAATTAGCGATTATAAGTTAAG
TTTTTTTGCTTTTTTTCTATTGATATCTTTTATTTCCAGTTTTGTTAGTTCCTATTTATCTTATGTAGTTTTTGCCACTA
TTTGAATCAATTTAAGTCAAATAGTGTTTTTTATTATTACTTATTTATTATTGATTAGAACAAAGAAAGATTTTCCGTTA
TGATTAAAGCTCATTTTTAGCTTTTTTATTAGTTTATATATTCTTTTTACCTTCATTTATTTATTAAATATTCATATTTA
TACAAATGCCGTTGTTGCACTTGAGGCCGAAAAAAGTCCTTTAGTATCGACATTTTATATTGACTATAGTTTCTATTTTT
ATGGAATTCTTAGTGTCTTAGTTGGAATTTTCGTTTTTGTTAATTTATTTGTATCAATTGGAAAAAATACTTTAATTTTG
AAGACAAAAAAATCGCAATTAGATTACAAAGTGCTTGAAAAACAAGTAAATACTAAAAATTCCCAGTCGGAAAATTTAAA
AACACTTAAGTCAAAAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTTTAAGGTACTTTTATTTAATTTTCATTTTTTTGGCAAAAAAAAAAAAAAAGTTATAATATATTTCATCTTTGAAA
AAACTAGGAAAGGAGAAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAATAGGAGTTAATTATGAAATTTTTTGGATCTTCTGCAAAAAAAGAAGCAAATTCAAATACTATTGATACAAAAACC
GAGTTCCGTGATTATTATGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 513; Mature: 513

Protein sequence:

>513_residues
MKVRSKKVFKLEINPSKNGQKQWLYFLLTVLFLTSLALAIFFDGPRSFLNISNTDQPVSSISTFFNPIEDEMREFLAVRM
TRSVLLLFFSFAFFFKGLKFLSLKEKLQKYLVLSAFFGLFLVNIVIYFAWLTTEWTYILVFSAQIFVLIFLDYSLWLWIG
RKNDKINYDYKKFFIFRHISLAASLIIFGILFGLFASMVFSNEEADIIATVSYGNPVADWLYTFIAEVGKISNSFILIAI
LVFVLVLALLYFSPQIYFYRQSFFRLKKIVPSFSLLIFAIFALFIYSIYINIFASTNFVQFLPFGKNLTTNYLPMIIGIS
IHLVLLATYFLLNFTKLEKKISDYKLSFFAFFLLISFISSFVSSYLSYVVFATIWINLSQIVFFIITYLLLIRTKKDFPL
WLKLIFSFFISLYILFTFIYLLNIHIYTNAVVALEAEKSPLVSTFYIDYSFYFYGILSVLVGIFVFVNLFVSIGKNTLIL
KTKKSQLDYKVLEKQVNTKNSQSENLKTLKSKN

Sequences:

>Translated_513_residues
MKVRSKKVFKLEINPSKNGQKQWLYFLLTVLFLTSLALAIFFDGPRSFLNISNTDQPVSSISTFFNPIEDEMREFLAVRM
TRSVLLLFFSFAFFFKGLKFLSLKEKLQKYLVLSAFFGLFLVNIVIYFA*LTTE*TYILVFSAQIFVLIFLDYSLWL*IG
RKNDKINYDYKKFFIFRHISLAASLIIFGILFGLFASMVFSNEEADIIATVSYGNPVADWLYTFIAEVGKISNSFILIAI
LVFVLVLALLYFSPQIYFYRQSFFRLKKIVPSFSLLIFAIFALFIYSIYINIFASTNFVQFLPFGKNLTTNYLPMIIGIS
IHLVLLATYFLLNFTKLEKKISDYKLSFFAFFLLISFISSFVSSYLSYVVFATI*INLSQIVFFIITYLLLIRTKKDFPL
*LKLIFSFFISLYILFTFIYLLNIHIYTNAVVALEAEKSPLVSTFYIDYSFYFYGILSVLVGIFVFVNLFVSIGKNTLIL
KTKKSQLDYKVLEKQVNTKNSQSENLKTLKSKN
>Mature_513_residues
MKVRSKKVFKLEINPSKNGQKQWLYFLLTVLFLTSLALAIFFDGPRSFLNISNTDQPVSSISTFFNPIEDEMREFLAVRM
TRSVLLLFFSFAFFFKGLKFLSLKEKLQKYLVLSAFFGLFLVNIVIYFA*LTTE*TYILVFSAQIFVLIFLDYSLWL*IG
RKNDKINYDYKKFFIFRHISLAASLIIFGILFGLFASMVFSNEEADIIATVSYGNPVADWLYTFIAEVGKISNSFILIAI
LVFVLVLALLYFSPQIYFYRQSFFRLKKIVPSFSLLIFAIFALFIYSIYINIFASTNFVQFLPFGKNLTTNYLPMIIGIS
IHLVLLATYFLLNFTKLEKKISDYKLSFFAFFLLISFISSFVSSYLSYVVFATI*INLSQIVFFIITYLLLIRTKKDFPL
*LKLIFSFFISLYILFTFIYLLNIHIYTNAVVALEAEKSPLVSTFYIDYSFYFYGILSVLVGIFVFVNLFVSIGKNTLIL
KTKKSQLDYKVLEKQVNTKNSQSENLKTLKSKN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58886; Mature: 58886

Theoretical pI: Translated: 10.09; Mature: 10.09

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.0 %Met     (Translated Protein)
1.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.0 %Met     (Mature Protein)
1.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKVRSKKVFKLEINPSKNGQKQWLYFLLTVLFLTSLALAIFFDGPRSFLNISNTDQPVSS
CCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEECCCCCCHHHH
ISTFFNPIEDEMREFLAVRMTRSVLLLFFSFAFFFKGLKFLSLKEKLQKYLVLSAFFGLF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVNIVIYFALTTETYILVFSAQIFVLIFLDYSLWLIGRKNDKINYDYKKFFIFRHISLAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
SLIIFGILFGLFASMVFSNEEADIIATVSYGNPVADWLYTFIAEVGKISNSFILIAILVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
VLVLALLYFSPQIYFYRQSFFRLKKIVPSFSLLIFAIFALFIYSIYINIFASTNFVQFLP
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEC
FGKNLTTNYLPMIIGISIHLVLLATYFLLNFTKLEKKISDYKLSFFAFFLLISFISSFVS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYLSYVVFATIINLSQIVFFIITYLLLIRTKKDFPLLKLIFSFFISLYILFTFIYLLNIH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYTNAVVALEAEKSPLVSTFYIDYSFYFYGILSVLVGIFVFVNLFVSIGKNTLILKTKKS
HEECEEEEEECCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECHH
QLDYKVLEKQVNTKNSQSENLKTLKSKN
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKVRSKKVFKLEINPSKNGQKQWLYFLLTVLFLTSLALAIFFDGPRSFLNISNTDQPVSS
CCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEECCCCCCHHHH
ISTFFNPIEDEMREFLAVRMTRSVLLLFFSFAFFFKGLKFLSLKEKLQKYLVLSAFFGLF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVNIVIYFALTTETYILVFSAQIFVLIFLDYSLWLIGRKNDKINYDYKKFFIFRHISLAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
SLIIFGILFGLFASMVFSNEEADIIATVSYGNPVADWLYTFIAEVGKISNSFILIAILVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
VLVLALLYFSPQIYFYRQSFFRLKKIVPSFSLLIFAIFALFIYSIYINIFASTNFVQFLP
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEC
FGKNLTTNYLPMIIGISIHLVLLATYFLLNFTKLEKKISDYKLSFFAFFLLISFISSFVS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYLSYVVFATIINLSQIVFFIITYLLLIRTKKDFPLLKLIFSFFISLYILFTFIYLLNIH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYTNAVVALEAEKSPLVSTFYIDYSFYFYGILSVLVGIFVFVNLFVSIGKNTLILKTKKS
HEECEEEEEECCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECHH
QLDYKVLEKQVNTKNSQSENLKTLKSKN
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA