Definition | Mycoplasma hyopneumoniae 232, complete genome. |
---|---|
Accession | NC_006360 |
Length | 892,758 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 54020164
Identifier: 54020164
GI number: 54020164
Start: 442803
End: 444524
Strand: Direct
Name: 54020164
Synonym: mhp373
Alternate gene names: NA
Gene position: 442803-444524 (Clockwise)
Preceding gene: 54020163
Following gene: 54020165
Centisome position: 49.6
GC content: 25.15
Gene sequence:
>1722_bases TTGGTGAGGAAAATAATGGCTAATTTATTCCCTAATAAACCTTATCAAAAGTTTAAAAAATCTAGAATCATCCTATTTTC GATCTTTATAATTTTATTTATTATTTCTTTTTATTCAATTTTTTCCAAAATTAATAATAACGGCTGAAAAATTTTTCAGA AGAACCTTAGTAATTTATTTAGTTTTTCAAATATTCACCCTTATTATAACGATTCAATTTTTGCTTTAAGTTTTAAATTT TTATGAATTACAATTAAATACACGCTTGCTGGAACGTTTTTTGGAACAATTTTTGCTTTTTTTACTGCAATTTTTAGCTC CCAATTTATTAAAAATAAATTAATAAAAATCCTTATTTGGTGAGTTATTATAATTTTAAAAAGCTTCCCAATTATTTTTG TAATCGACCCGATGCGCCTAATTTTCGCCCCAAAATTAGCAGCTTTTTTAATTATTTTCTGATTTAGTTGAATTTGACTA CACCGTTATTTTCATTCATTTTTAAATTCTCTTGACTTAACTAGTTATAAAAAAGCAGTTATGAGAGGCCAAAATTGGTT TATTTCCTTTAAAAATGAAATTTTTCCCTTTGTGGTTAACAAATTTTTTGGACTTTTTTTGTTTAGTTTTGAGGCAAATA TTCGTTGAACAACAATTATTTCGGCAACTGGGGTTATCGGAATCGGAATTTTGATCAATGATGGTATTCAAAATTCAGCT CTAGGCTGGAAAATTATTGGAATTCCCCTTTTAATCCTTTTATTTTTTACTATTATTTTTGATTTTTTAATTATTTTTTT TAATAAATTTATTTTACATAAAAAATCTGTTGACATCCGGCAAAAAAATTCTTTTATTTTATGAATCAAAGTCAATTATG ACCGAATTTTAAAGGCTTTTTTTATAATTTTTTTATTAATCTTAATCATTATTAGCCTTACGGATATTGAAAATTGATCG GTAAATACTTATCAAGTCAAACGTTTTTTTAATTCCTTGTTTGTTTTTGATTGAGAAGTTTTTTTACTTGGTAAACTAGA TAATCCTCTTTATATGATTTGACATTTTTTTTGCCAAATCATTGTTTGTTTGACAATAATTGCTTTTATTTCAATTTTTT TTGCAATTATGGCAAATGAAAAATTGAATAATTTACCAAAATGACTGATTTTTAAATTTTTTTTAAATCTCTTTCGAATC ATCCCTTCAATTATTATTTTCTATCTTTTTGTTAGTTTTACGGTTAGACCTATTTTGTGAGTTACCTGTTTAGTTGGTTT TAAAAATGGAATAACGATGGCAAAAAAGCTCAATGAGACGCTAAATTCGCTTGACTGAGAGAAATATCAACTTTTAAGAT TAAAGCAATGAAGCAAAAAAAAAGCAATAATTCATTATATTTTTCCTTCAATTTCTCGAGAATATTTTAAATATTTAACT ATTGAAATTGCTAATTCAGCACATGATTTACTCCTTTATGGAATTTTTGGTGGTTCAATGCTTGGGCTTAAAATTTCAAC ACTTTCACAGACAGGAATATCCGGTGACCGTGGTGGTTTTTTTACTTATTCATGGATTGCTTGATTTTTGATATTAATTA TTGAAGTTACTCTGGCTCTAATTGAAAAAAATTATTTCAAAAATTTTCTCTATTTGAATTCAAAATTTTGGAATATTTTA CTAAAAACAGTAAGACCGAAATTTTTCTCAAGATTTAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTAAAAAACTATAAAGAAAAAATATTACTTATTAATGAAGGTAGAGGAAAATTTTATAACTCATTTTCTGAAATTAATGA AAATATGATCGAATTAATTT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATATCTAGTTTAGTTTCTTGAAATTAATAAAAATAGGAAAAATATTTAATTTTTCCTATTTTTTTCTTTTTTTTCAAAAA AAAGCTTAAAAAATTTAATT
Product: putative transport system permease protein p69
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 573; Mature: 573
Protein sequence:
>573_residues MVRKIMANLFPNKPYQKFKKSRIILFSIFIILFIISFYSIFSKINNNGWKIFQKNLSNLFSFSNIHPYYNDSIFALSFKF LWITIKYTLAGTFFGTIFAFFTAIFSSQFIKNKLIKILIWWVIIILKSFPIIFVIDPMRLIFAPKLAAFLIIFWFSWIWL HRYFHSFLNSLDLTSYKKAVMRGQNWFISFKNEIFPFVVNKFFGLFLFSFEANIRWTTIISATGVIGIGILINDGIQNSA LGWKIIGIPLLILLFFTIIFDFLIIFFNKFILHKKSVDIRQKNSFILWIKVNYDRILKAFFIIFLLILIIISLTDIENWS VNTYQVKRFFNSLFVFDWEVFLLGKLDNPLYMIWHFFCQIIVCLTIIAFISIFFAIMANEKLNNLPKWLIFKFFLNLFRI IPSIIIFYLFVSFTVRPILWVTCLVGFKNGITMAKKLNETLNSLDWEKYQLLRLKQWSKKKAIIHYIFPSISREYFKYLT IEIANSAHDLLLYGIFGGSMLGLKISTLSQTGISGDRGGFFTYSWIAWFLILIIEVTLALIEKNYFKNFLYLNSKFWNIL LKTVRPKFFSRFK
Sequences:
>Translated_573_residues MVRKIMANLFPNKPYQKFKKSRIILFSIFIILFIISFYSIFSKINNNG*KIFQKNLSNLFSFSNIHPYYNDSIFALSFKF L*ITIKYTLAGTFFGTIFAFFTAIFSSQFIKNKLIKILIW*VIIILKSFPIIFVIDPMRLIFAPKLAAFLIIF*FS*I*L HRYFHSFLNSLDLTSYKKAVMRGQNWFISFKNEIFPFVVNKFFGLFLFSFEANIR*TTIISATGVIGIGILINDGIQNSA LGWKIIGIPLLILLFFTIIFDFLIIFFNKFILHKKSVDIRQKNSFIL*IKVNYDRILKAFFIIFLLILIIISLTDIEN*S VNTYQVKRFFNSLFVFD*EVFLLGKLDNPLYMI*HFFCQIIVCLTIIAFISIFFAIMANEKLNNLPK*LIFKFFLNLFRI IPSIIIFYLFVSFTVRPIL*VTCLVGFKNGITMAKKLNETLNSLD*EKYQLLRLKQ*SKKKAIIHYIFPSISREYFKYLT IEIANSAHDLLLYGIFGGSMLGLKISTLSQTGISGDRGGFFTYSWIA*FLILIIEVTLALIEKNYFKNFLYLNSKFWNIL LKTVRPKFFSRFK >Mature_573_residues MVRKIMANLFPNKPYQKFKKSRIILFSIFIILFIISFYSIFSKINNNG*KIFQKNLSNLFSFSNIHPYYNDSIFALSFKF L*ITIKYTLAGTFFGTIFAFFTAIFSSQFIKNKLIKILIW*VIIILKSFPIIFVIDPMRLIFAPKLAAFLIIF*FS*I*L HRYFHSFLNSLDLTSYKKAVMRGQNWFISFKNEIFPFVVNKFFGLFLFSFEANIR*TTIISATGVIGIGILINDGIQNSA LGWKIIGIPLLILLFFTIIFDFLIIFFNKFILHKKSVDIRQKNSFIL*IKVNYDRILKAFFIIFLLILIIISLTDIEN*S VNTYQVKRFFNSLFVFD*EVFLLGKLDNPLYMI*HFFCQIIVCLTIIAFISIFFAIMANEKLNNLPK*LIFKFFLNLFRI IPSIIIFYLFVSFTVRPIL*VTCLVGFKNGITMAKKLNETLNSLD*EKYQLLRLKQ*SKKKAIIHYIFPSISREYFKYLT IEIANSAHDLLLYGIFGGSMLGLKISTLSQTGISGDRGGFFTYSWIA*FLILIIEVTLALIEKNYFKNFLYLNSKFWNIL LKTVRPKFFSRFK
Specific function: Probably part of a high-affinity transport system [H]
COG id: COG3639
COG function: function code P; ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 2 ABC transmembrane type-1 domains [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR000515 [H]
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 64793; Mature: 64793
Theoretical pI: Translated: 10.66; Mature: 10.66
Prosite motif: PS50928 ABC_TM1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVRKIMANLFPNKPYQKFKKSRIILFSIFIILFIISFYSIFSKINNNGKIFQKNLSNLFS CHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH FSNIHPYYNDSIFALSFKFLITIKYTLAGTFFGTIFAFFTAIFSSQFIKNKLIKILIWVI HCCCCCCCCCCCHHEEEHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IILKSFPIIFVIDPMRLIFAPKLAAFLIIFFSILHRYFHSFLNSLDLTSYKKAVMRGQNW HHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCE FISFKNEIFPFVVNKFFGLFLFSFEANIRTTIISATGVIGIGILINDGIQNSALGWKIIG EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEECCCHHEEEEEEECCCCCCCCCEEHHH IPLLILLFFTIIFDFLIIFFNKFILHKKSVDIRQKNSFILIKVNYDRILKAFFIIFLLIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHH IIISLTDIENSVNTYQVKRFFNSLFVFDEVFLLGKLDNPLYMIHFFCQIIVCLTIIAFIS HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFFAIMANEKLNNLPKLIFKFFLNLFRIIPSIIIFYLFVSFTVRPILVTCLVGFKNGITM HHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH AKKLNETLNSLDEKYQLLRLKQSKKKAIIHYIFPSISREYFKYLTIEIANSAHDLLLYGI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEEE FGGSMLGLKISTLSQTGISGDRGGFFTYSWIAFLILIIEVTLALIEKNYFKNFLYLNSKF CCCCCCCEEEEHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WNILLKTVRPKFFSRFK HHHHHHHHCHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MVRKIMANLFPNKPYQKFKKSRIILFSIFIILFIISFYSIFSKINNNGKIFQKNLSNLFS CHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH FSNIHPYYNDSIFALSFKFLITIKYTLAGTFFGTIFAFFTAIFSSQFIKNKLIKILIWVI HCCCCCCCCCCCHHEEEHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IILKSFPIIFVIDPMRLIFAPKLAAFLIIFFSILHRYFHSFLNSLDLTSYKKAVMRGQNW HHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCE FISFKNEIFPFVVNKFFGLFLFSFEANIRTTIISATGVIGIGILINDGIQNSALGWKIIG EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEECCCHHEEEEEEECCCCCCCCCEEHHH IPLLILLFFTIIFDFLIIFFNKFILHKKSVDIRQKNSFILIKVNYDRILKAFFIIFLLIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHH IIISLTDIENSVNTYQVKRFFNSLFVFDEVFLLGKLDNPLYMIHFFCQIIVCLTIIAFIS HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFFAIMANEKLNNLPKLIFKFFLNLFRIIPSIIIFYLFVSFTVRPILVTCLVGFKNGITM HHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH AKKLNETLNSLDEKYQLLRLKQSKKKAIIHYIFPSISREYFKYLTIEIANSAHDLLLYGI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEEE FGGSMLGLKISTLSQTGISGDRGGFFTYSWIAFLILIIEVTLALIEKNYFKNFLYLNSKF CCCCCCCEEEEHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WNILLKTVRPKFFSRFK HHHHHHHHCHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 3208756 [H]