Definition | Mycoplasma hyopneumoniae 232, complete genome. |
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Accession | NC_006360 |
Length | 892,758 |
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The map label for this gene is 54020141
Identifier: 54020141
GI number: 54020141
Start: 369714
End: 375641
Strand: Direct
Name: 54020141
Synonym: mhp321
Alternate gene names: NA
Gene position: 369714-375641 (Clockwise)
Preceding gene: 54020140
Following gene: 54020142
Centisome position: 41.41
GC content: 26.82
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases CTAATTAAAATTGAAAAATATTTAGTTATTTGTTATATAATTGTATAATTGTATAATTATATAATTAAACAATTAAAACT CTCACAAAATAGGAAAAATA
Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1975; Mature: 1975
Protein sequence:
>1975_residues MYRKKAKTKPIFLLGVGIFSLVVASCSTSNSNPFHNYVDPNQSLPKNQIDNFFLQYPNFPEAIKNKIKDSLNISSQNFSN SEYLPKLSQFVEQYSSTLVLFQKFESNFKSKAIDKSFSVNEEKYNNLKGEIESFNQKILNSTNFGTKLDEFLTKISQLSA EITKTNNTLSQEFSTFSWFKTVLKHANLVNLKALSAQINNKITILYKNDNKEEIQNFTSNLLILENIIAQIKSIKNEYST ESNEIFNNLITNFNSNINSSSLINNVTDSIRNFKNIQNNLEKIVNKSAEKNQKLQELKKSAILDVEKAANLSQTVQSNFK EKINNSITESQISQIKTFISELEHVAPLLSSLKTEKTRLENEPNYLNSENKTELDDLMNSLNLLDQENKLALNDEISTNT KYFLSNVLTVNENVQSELARLNGDAQLKEAKKSLENQLLSNKFSPNFISNIKTLADSKKLVSDIKHISSNILKLADSLDL YSVEVKNFQSLLNNSSTSITNKQELEEKNNKIKQKLDQNHRLNGLDNENLDTFVDQFANLVTSFSQTILDSKTQNYQILQ EKRPAKIVENLSDFKQQAQNALKISLDDQGLDNHSIKKYLTSASFNLQNANLWLKKPQNNEINFKLLDLSLDTNNRNILV LKYQATSIKNPLHSTILSTQLLIPNDNVDINAIISSLKIDLLDDYFDIKYTSFLDFEKEGFLKQEVKKFILENFSQTKQT IEKFFHVVLPEQPELTFTSDNKISLNLDIKFNNQVIKTVSAKSKNQVNFKQKDNLPVKIGYTQNFKNTSFYNQTYLSDSE YIDYDYTRSDDSSSYFWGIEEPYGAGGLGSYWFYKYLLKPTLETLQQTGEIPKNKKFKTFEKHPKVVKVSEIGLEKPTQQ DELSKAELDKIFDKILKDQHFFTYEIPENATISFSTFDVGKEKRRVLTSSITQSISLKLLIKNDKHTREEILEFAPKNYL KPTLSPRDKADLSLIEEILSDSSGKKLFKNTIINDIDYTHGQISLAGKTNLEIIDSLNKLYTFGKIGKFEIFAKEVISTD ILKGEAKIFFWYKFNGLEFPLFFKGTKPIRTIKTEKAISFSNWLPPTYSDIKPKNGSNFTSEDFLPIPEETGQIPIRSQT LKSNQIPNDHKSIIDNINSRHFDYRRVSGEFYKKAQKHIKYRLIDPADIVEQKAESKLNYLLQIRANNDSVKNKDLDKFK NEEVKLEDENKKTEQNSENLPIIVEKQIFFNTDPEVRLDTSKILKNYFVYYYDVKTTDKPGEMTFKLGFINKNNTKIRYS SNKDIKLQNLENDYKNKLYPEIILNRIKYSDFVPKNNRSLITKVLNNSDFQNFFEIKEQALKYNNFKISRQNLQFLETKK HNNKLYFRLKYVNGPHIVEGSTWYFLTNINNQNNQANIDLDTQKPLVTLFDSEKEVTRSREIEPYYKDLFWNYNNSTKTA KWILKEKYFSQTFLKNNPKNRKIKLQLFANALVQNTQRLTRISGGVDLIKNKPIKGGYDFIFDFEKLVKGQTIAITEKTK NVFFEDARKKFEDFSFTLSAQYIKNQGIEFKLWLNNPNLGLIVDNVFNHVEKGLAFYNSPKFDTFDPKKAFILHNAGARV HIEYTNSLENEDFGSKTNQFDYKNIDYTNEEQPISFFTNSDVYNLEKYNPNQNVPYKLHEGYLQDLDFLHTSWDTNKFPL AKNLLARTFGFSFGSATMLAKVNDDPNDGKFYIITNNHVEGGGNFDLNSLFGKDLTKFLLNTRYMAIGSKYYSNSIQGGY SYWGGQNSVKKVPTWLVWTGTKQPDVNQKNPKFVDISVLIVDIKPLIQAAYESGEFKKAAWLLNWYKLPNLKLNSNGQSD LTFFGQNVKHFGMNGFPYAKQSGYIINRANSDQQSVSILNQKGYTPTYFNAGNSGTGVLGLNDEYISTINSGSPLTALQS WNYSTASHNYFGINWQNEKPLELKNKFSLSSMIMRLNAQNPREYNLPWFFKDFEK
Sequences:
>Translated_1975_residues MYRKKAKTKPIFLLGVGIFSLVVASCSTSNSNPFHNYVDPNQSLPKNQIDNFFLQYPNFPEAIKNKIKDSLNISSQNFSN SEYLPKLSQFVEQYSSTLVLFQKFESNFKSKAIDKSFSVNEEKYNNLKGEIESFNQKILNSTNFGTKLDEFLTKISQLSA EITKTNNTLSQEFSTFS*FKTVLKHANLVNLKALSAQINNKITILYKNDNKEEIQNFTSNLLILENIIAQIKSIKNEYST ESNEIFNNLITNFNSNINSSSLINNVTDSIRNFKNIQNNLEKIVNKSAEKNQKLQELKKSAILDVEKAANLSQTVQSNFK EKINNSITESQISQIKTFISELEHVAPLLSSLKTEKTRLENEPNYLNSENKTELDDLMNSLNLLDQENKLALNDEISTNT KYFLSNVLTVNENVQSELARLNGDAQLKEAKKSLENQLLSNKFSPNFISNIKTLADSKKLVSDIKHISSNILKLADSLDL YSVEVKNFQSLLNNSSTSITNKQELEEKNNKIKQKLDQNHRLNGLDNENLDTFVDQFANLVTSFSQTILDSKTQNYQILQ EKRPAKIVENLSDFKQQAQNALKISLDDQGLDNHSIKKYLTSASFNLQNANL*LKKPQNNEINFKLLDLSLDTNNRNILV LKYQATSIKNPLHSTILSTQLLIPNDNVDINAIISSLKIDLLDDYFDIKYTSFLDFEKEGFLKQEVKKFILENFSQTKQT IEKFFHVVLPEQPELTFTSDNKISLNLDIKFNNQVIKTVSAKSKNQVNFKQKDNLPVKIGYTQNFKNTSFYNQTYLSDSE YIDYDYTRSDDSSSYFWGIEEPYGAGGLGSY*FYKYLLKPTLETLQQTGEIPKNKKFKTFEKHPKVVKVSEIGLEKPTQQ DELSKAELDKIFDKILKDQHFFTYEIPENATISFSTFDVGKEKRRVLTSSITQSISLKLLIKNDKHTREEILEFAPKNYL KPTLSPRDKADLSLIEEILSDSSGKKLFKNTIINDIDYTHGQISLAGKTNLEIIDSLNKLYTFGKIGKFEIFAKEVISTD ILKGEAKIFF*YKFNGLEFPLFFKGTKPIRTIKTEKAISFSN*LPPTYSDIKPKNGSNFTSEDFLPIPEETGQIPIRSQT LKSNQIPNDHKSIIDNINSRHFDYRRVSGEFYKKAQKHIKYRLIDPADIVEQKAESKLNYLLQIRANNDSVKNKDLDKFK NEEVKLEDENKKTEQNSENLPIIVEKQIFFNTDPEVRLDTSKILKNYFVYYYDVKTTDKPGEMTFKLGFINKNNTKIRYS SNKDIKLQNLENDYKNKLYPEIILNRIKYSDFVPKNNRSLITKVLNNSDFQNFFEIKEQALKYNNFKISRQNLQFLETKK HNNKLYFRLKYVNGPHIVEGST*YFLTNINNQNNQANIDLDTQKPLVTLFDSEKEVTRSREIEPYYKDLF*NYNNSTKTA K*ILKEKYFSQTFLKNNPKNRKIKLQLFANALVQNTQRLTRISGGVDLIKNKPIKGGYDFIFDFEKLVKGQTIAITEKTK NVFFEDARKKFEDFSFTLSAQYIKNQGIEFKL*LNNPNLGLIVDNVFNHVEKGLAFYNSPKFDTFDPKKAFILHNAGARV HIEYTNSLENEDFGSKTNQFDYKNIDYTNEEQPISFFTNSDVYNLEKYNPNQNVPYKLHEGYLQDLDFLHTSWDTNKFPL AKNLLARTFGFSFGSATMLAKVNDDPNDGKFYIITNNHVEGGGNFDLNSLFGKDLTKFLLNTRYMAIGSKYYSNSIQGGY SY*GGQNSVKKVPT*LV*TGTKQPDVNQKNPKFVDISVLIVDIKPLIQAAYESGEFKKAA*LLN*YKLPNLKLNSNGQSD LTFFGQNVKHFGMNGFPYAKQSGYIINRANSDQQSVSILNQKGYTPTYFNAGNSGTGVLGLNDEYISTINSGSPLTALQS WNYSTASHNYFGIN*QNEKPLELKNKFSLSSMIMRLNAQNPREYNLPWFFKDFEK >Mature_1975_residues MYRKKAKTKPIFLLGVGIFSLVVASCSTSNSNPFHNYVDPNQSLPKNQIDNFFLQYPNFPEAIKNKIKDSLNISSQNFSN SEYLPKLSQFVEQYSSTLVLFQKFESNFKSKAIDKSFSVNEEKYNNLKGEIESFNQKILNSTNFGTKLDEFLTKISQLSA EITKTNNTLSQEFSTFS*FKTVLKHANLVNLKALSAQINNKITILYKNDNKEEIQNFTSNLLILENIIAQIKSIKNEYST ESNEIFNNLITNFNSNINSSSLINNVTDSIRNFKNIQNNLEKIVNKSAEKNQKLQELKKSAILDVEKAANLSQTVQSNFK EKINNSITESQISQIKTFISELEHVAPLLSSLKTEKTRLENEPNYLNSENKTELDDLMNSLNLLDQENKLALNDEISTNT KYFLSNVLTVNENVQSELARLNGDAQLKEAKKSLENQLLSNKFSPNFISNIKTLADSKKLVSDIKHISSNILKLADSLDL YSVEVKNFQSLLNNSSTSITNKQELEEKNNKIKQKLDQNHRLNGLDNENLDTFVDQFANLVTSFSQTILDSKTQNYQILQ EKRPAKIVENLSDFKQQAQNALKISLDDQGLDNHSIKKYLTSASFNLQNANL*LKKPQNNEINFKLLDLSLDTNNRNILV LKYQATSIKNPLHSTILSTQLLIPNDNVDINAIISSLKIDLLDDYFDIKYTSFLDFEKEGFLKQEVKKFILENFSQTKQT IEKFFHVVLPEQPELTFTSDNKISLNLDIKFNNQVIKTVSAKSKNQVNFKQKDNLPVKIGYTQNFKNTSFYNQTYLSDSE YIDYDYTRSDDSSSYFWGIEEPYGAGGLGSY*FYKYLLKPTLETLQQTGEIPKNKKFKTFEKHPKVVKVSEIGLEKPTQQ DELSKAELDKIFDKILKDQHFFTYEIPENATISFSTFDVGKEKRRVLTSSITQSISLKLLIKNDKHTREEILEFAPKNYL KPTLSPRDKADLSLIEEILSDSSGKKLFKNTIINDIDYTHGQISLAGKTNLEIIDSLNKLYTFGKIGKFEIFAKEVISTD ILKGEAKIFF*YKFNGLEFPLFFKGTKPIRTIKTEKAISFSN*LPPTYSDIKPKNGSNFTSEDFLPIPEETGQIPIRSQT LKSNQIPNDHKSIIDNINSRHFDYRRVSGEFYKKAQKHIKYRLIDPADIVEQKAESKLNYLLQIRANNDSVKNKDLDKFK NEEVKLEDENKKTEQNSENLPIIVEKQIFFNTDPEVRLDTSKILKNYFVYYYDVKTTDKPGEMTFKLGFINKNNTKIRYS SNKDIKLQNLENDYKNKLYPEIILNRIKYSDFVPKNNRSLITKVLNNSDFQNFFEIKEQALKYNNFKISRQNLQFLETKK HNNKLYFRLKYVNGPHIVEGST*YFLTNINNQNNQANIDLDTQKPLVTLFDSEKEVTRSREIEPYYKDLF*NYNNSTKTA K*ILKEKYFSQTFLKNNPKNRKIKLQLFANALVQNTQRLTRISGGVDLIKNKPIKGGYDFIFDFEKLVKGQTIAITEKTK NVFFEDARKKFEDFSFTLSAQYIKNQGIEFKL*LNNPNLGLIVDNVFNHVEKGLAFYNSPKFDTFDPKKAFILHNAGARV HIEYTNSLENEDFGSKTNQFDYKNIDYTNEEQPISFFTNSDVYNLEKYNPNQNVPYKLHEGYLQDLDFLHTSWDTNKFPL AKNLLARTFGFSFGSATMLAKVNDDPNDGKFYIITNNHVEGGGNFDLNSLFGKDLTKFLLNTRYMAIGSKYYSNSIQGGY SY*GGQNSVKKVPT*LV*TGTKQPDVNQKNPKFVDISVLIVDIKPLIQAAYESGEFKKAA*LLN*YKLPNLKLNSNGQSD LTFFGQNVKHFGMNGFPYAKQSGYIINRANSDQQSVSILNQKGYTPTYFNAGNSGTGVLGLNDEYISTINSGSPLTALQS WNYSTASHNYFGIN*QNEKPLELKNKFSLSSMIMRLNAQNPREYNLPWFFKDFEK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 224997; Mature: 224997
Theoretical pI: Translated: 9.48; Mature: 9.48
Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN ; PS00163 FUMARATE_LYASES
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 0.4 %Met (Translated Protein) 0.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 0.4 %Met (Mature Protein) 0.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MYRKKAKTKPIFLLGVGIFSLVVASCSTSNSNPFHNYVDPNQSLPKNQIDNFFLQYPNFP CCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHEEECCCCH EAIKNKIKDSLNISSQNFSNSEYLPKLSQFVEQYSSTLVLFQKFESNFKSKAIDKSFSVN HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC EEKYNNLKGEIESFNQKILNSTNFGTKLDEFLTKISQLSAEITKTNNTLSQEFSTFSFKT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH VLKHANLVNLKALSAQINNKITILYKNDNKEEIQNFTSNLLILENIIAQIKSIKNEYSTE HHHCCCEEEHHHHHHHHCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC SNEIFNNLITNFNSNINSSSLINNVTDSIRNFKNIQNNLEKIVNKSAEKNQKLQELKKSA HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH ILDVEKAANLSQTVQSNFKEKINNSITESQISQIKTFISELEHVAPLLSSLKTEKTRLEN HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC EPNYLNSENKTELDDLMNSLNLLDQENKLALNDEISTNTKYFLSNVLTVNENVQSELARL CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHC NGDAQLKEAKKSLENQLLSNKFSPNFISNIKTLADSKKLVSDIKHISSNILKLADSLDLY 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