Definition | Bacillus cereus E33L, complete genome. |
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Accession | NC_006274 |
Length | 5,300,915 |
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The map label for this gene is 52145233
Identifier: 52145233
GI number: 52145233
Start: 5230982
End: 5232295
Strand: Reverse
Name: 52145233
Synonym: BCZK5121
Alternate gene names: NA
Gene position: 5232295-5230982 (Counterclockwise)
Preceding gene: 52145240
Following gene: 52145230
Centisome position: 98.71
GC content: 29.98
Gene sequence:
>1314_bases ATGAATCATATACAAACAAATTTTTCGTCTTTTTTCAGTAAAATAATGATTGGTGCGATGCTCGCATTTTTTGTTTATAG TTGTTGGTCTGCGTTCGAAACAAGTAAACAGTTTTTTGGAGGCAGTACAACAAGTGTAACAATTGTATTGATTATTTTTG TTATTCTCATGCTGTTAGTAGCATCGATTTTACAGTACCGTTTTACAGATAAACAATTTCTTATTTTTCTTATCAGTACA TCTATAGTTGTGAAACTGAGTATGGTTTTATTTGTAGATGTTCCGGTAATCGATGATATGAAAGCTATGTTTGAGTCTGC AAAGCAGATTGCAATTGGTAATAGCGTAGAGAATGTTGCGCAGTTACCTTTTATTATTTATGAATCAATTATTATTCGTG TATTTGGCGATACGGTATTTGCATTGCAGCTATTTAATATTTTATTTTGCACAGGGACTGCATTTTTCATTTATCGTATT GCAGCAATGGTTTTTGGAGAAGAATGCGGCCGTATTGCTTCTGTATTTTACGCTTTATATATTCCAAATATATTTACGAG TGCTTTATTAACATCAGAATCGCTTGCAATATTTTTATTTTATTTAGCTTGTTACATACTTTTATATAAAGGCTTAGATC ATCCTTATATGTGGGTGCTTTCAGCAATTTTATTTGCATGTAGTAATATGATTTTTCCAATGGGGTTATTTCTCCCTATT TTTATTGCTGTATATGTGTTGTTAATTGAACTTTTTCAATCAGCAATGAAGCAAAAAGTATTACTAAAGATGATAGGGAT ACTTATTCTATTTTATAGTGCCCATTTTGGTGTGAGTTATGGAATTCAAACAATGGGAATGTCACAATATACGATTTCGA ATGAGACGTATGTTCAATCTGTTTTAATTGGAAAAGGTAAAAATGAGGGGAAAGTAACAAAGAATCGAAGCGTAACAGAA CATATTGATCAAAAGCAAAAAGAGATGGAAGAGGAAAGATTTAAACTTTTAAAACCAGTAATTAATCAATTCTCAGATGA AGGAATACATTCTATTCTATTTAAATGTGAAAAACTTATATATATAGCAGTAACATTGTTTATGTCTATCGCTTTATTAC ACTTTCTTATTAAGAAACAACAAAACGAAGGGTATATGTTATTCTTATTGTTAATTAGCGGATACGTATTGTTAAGACTT TTCCAAGTAGATATGACCTATTACAATCTTATTGTGCCAGCATTGTTTATTTTGCAAAGCTTTGGTGTTTATATGAGTTA TATGTACTGTCAAAAAATATTCTTTAGAAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTTATGACCCTGTATTTGTCATAGAAATTCCCTATCAGCTGTGTACCTATTCGTGATAGAATCGTTTTGTTATGAATGGA AATAGAGGTGCAATGGACAT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAGAATCCAAAATTGGATTCTTTTTTTTGAATGGAAGATGAAGACTAAGAGTCAGCGGAGATAAAGAATATGTACTGAC ATAAGCTTCAATCTATCGGT
Product: permease
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 437; Mature: 437
Protein sequence:
>437_residues MNHIQTNFSSFFSKIMIGAMLAFFVYSCWSAFETSKQFFGGSTTSVTIVLIIFVILMLLVASILQYRFTDKQFLIFLIST SIVVKLSMVLFVDVPVIDDMKAMFESAKQIAIGNSVENVAQLPFIIYESIIIRVFGDTVFALQLFNILFCTGTAFFIYRI AAMVFGEECGRIASVFYALYIPNIFTSALLTSESLAIFLFYLACYILLYKGLDHPYMWVLSAILFACSNMIFPMGLFLPI FIAVYVLLIELFQSAMKQKVLLKMIGILILFYSAHFGVSYGIQTMGMSQYTISNETYVQSVLIGKGKNEGKVTKNRSVTE HIDQKQKEMEEERFKLLKPVINQFSDEGIHSILFKCEKLIYIAVTLFMSIALLHFLIKKQQNEGYMLFLLLISGYVLLRL FQVDMTYYNLIVPALFILQSFGVYMSYMYCQKIFFRK
Sequences:
>Translated_437_residues MNHIQTNFSSFFSKIMIGAMLAFFVYSCWSAFETSKQFFGGSTTSVTIVLIIFVILMLLVASILQYRFTDKQFLIFLIST SIVVKLSMVLFVDVPVIDDMKAMFESAKQIAIGNSVENVAQLPFIIYESIIIRVFGDTVFALQLFNILFCTGTAFFIYRI AAMVFGEECGRIASVFYALYIPNIFTSALLTSESLAIFLFYLACYILLYKGLDHPYMWVLSAILFACSNMIFPMGLFLPI FIAVYVLLIELFQSAMKQKVLLKMIGILILFYSAHFGVSYGIQTMGMSQYTISNETYVQSVLIGKGKNEGKVTKNRSVTE HIDQKQKEMEEERFKLLKPVINQFSDEGIHSILFKCEKLIYIAVTLFMSIALLHFLIKKQQNEGYMLFLLLISGYVLLRL FQVDMTYYNLIVPALFILQSFGVYMSYMYCQKIFFRK >Mature_437_residues MNHIQTNFSSFFSKIMIGAMLAFFVYSCWSAFETSKQFFGGSTTSVTIVLIIFVILMLLVASILQYRFTDKQFLIFLIST SIVVKLSMVLFVDVPVIDDMKAMFESAKQIAIGNSVENVAQLPFIIYESIIIRVFGDTVFALQLFNILFCTGTAFFIYRI AAMVFGEECGRIASVFYALYIPNIFTSALLTSESLAIFLFYLACYILLYKGLDHPYMWVLSAILFACSNMIFPMGLFLPI FIAVYVLLIELFQSAMKQKVLLKMIGILILFYSAHFGVSYGIQTMGMSQYTISNETYVQSVLIGKGKNEGKVTKNRSVTE HIDQKQKEMEEERFKLLKPVINQFSDEGIHSILFKCEKLIYIAVTLFMSIALLHFLIKKQQNEGYMLFLLLISGYVLLRL FQVDMTYYNLIVPALFILQSFGVYMSYMYCQKIFFRK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 50113; Mature: 50113
Theoretical pI: Translated: 8.57; Mature: 8.57
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.6 %Cys (Translated Protein) 4.8 %Met (Translated Protein) 6.4 %Cys+Met (Translated Protein) 1.6 %Cys (Mature Protein) 4.8 %Met (Mature Protein) 6.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNHIQTNFSSFFSKIMIGAMLAFFVYSCWSAFETSKQFFGGSTTSVTIVLIIFVILMLLV CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH ASILQYRFTDKQFLIFLISTSIVVKLSMVLFVDVPVIDDMKAMFESAKQIAIGNSVENVA HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH QLPFIIYESIIIRVFGDTVFALQLFNILFCTGTAFFIYRIAAMVFGEECGRIASVFYALY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IPNIFTSALLTSESLAIFLFYLACYILLYKGLDHPYMWVLSAILFACSNMIFPMGLFLPI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIAVYVLLIELFQSAMKQKVLLKMIGILILFYSAHFGVSYGIQTMGMSQYTISNETYVQS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCEEECCHHHHHH VLIGKGKNEGKVTKNRSVTEHIDQKQKEMEEERFKLLKPVINQFSDEGIHSILFKCEKLI HHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH YIAVTLFMSIALLHFLIKKQQNEGYMLFLLLISGYVLLRLFQVDMTYYNLIVPALFILQS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGVYMSYMYCQKIFFRK HHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MNHIQTNFSSFFSKIMIGAMLAFFVYSCWSAFETSKQFFGGSTTSVTIVLIIFVILMLLV CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH ASILQYRFTDKQFLIFLISTSIVVKLSMVLFVDVPVIDDMKAMFESAKQIAIGNSVENVA HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH QLPFIIYESIIIRVFGDTVFALQLFNILFCTGTAFFIYRIAAMVFGEECGRIASVFYALY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IPNIFTSALLTSESLAIFLFYLACYILLYKGLDHPYMWVLSAILFACSNMIFPMGLFLPI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIAVYVLLIELFQSAMKQKVLLKMIGILILFYSAHFGVSYGIQTMGMSQYTISNETYVQS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCEEECCHHHHHH VLIGKGKNEGKVTKNRSVTEHIDQKQKEMEEERFKLLKPVINQFSDEGIHSILFKCEKLI HHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH YIAVTLFMSIALLHFLIKKQQNEGYMLFLLLISGYVLLRLFQVDMTYYNLIVPALFILQS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGVYMSYMYCQKIFFRK HHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA