Definition | Bacillus cereus E33L, complete genome. |
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Accession | NC_006274 |
Length | 5,300,915 |
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The map label for this gene is yhjX [H]
Identifier: 52142812
GI number: 52142812
Start: 2565457
End: 2566665
Strand: Direct
Name: yhjX [H]
Synonym: BCZK2428
Alternate gene names: 52142812
Gene position: 2565457-2566665 (Clockwise)
Preceding gene: 52142813
Following gene: 52142811
Centisome position: 48.4
GC content: 35.73
Gene sequence:
>1209_bases ATGAAACAAACTTCTATAAATCCGTTACTAATTGTTCTAGGTACAATCATTGTTCAAATTGGGCTTGGAACAATTTATAC ATGGAGTTTATTTAATCAGCCCCTTGTAAGTAAGTTTGGATGGAACCTTAATTCAGTTGCTATAACTTTCTCCATTACAA GCTTTTCTTTATCATTTTCAACCTTATTTGCAGGAAAGTTACAGCAAAAATTAGGACTTCGTAAGCTTATCGCTACTGCA GGGATTGTACTGGGACTTGGTTTAATACTTAGTTCGCAAGTTTCTTCCTTACCATTACTATATTTATTAGCTGGAGTCGT AGTTGGTTATGCAGATGGAACTGCTTATATTACATCATTATCTAATTTAATTAAATGGTTTCCGAATCGAAAAGGGCTTA TTTCAGGTATATCTGTATCAGCATATGGAATGGGTAGCTTAATCTTTAGATATATAAACGGAAGTCTTATCGATAGCCTT GGTGTATCACAAGCATTCCTATATTGGGGTATTATCGTATTACTTTTAGTGTTAATTGGATCGTTCTTCTTACGTGAAGC GATTGTAAGTAATGCTGTAACTGAGACATTACACAATGACTATAATCCGCGTGAAATGATGCGAACGAAACAAGTATATC TTTTGTTTTTTATGTTATTTACATCGTGTATGGGCGGTCTGTATTTAATCGGTATGGTAAAAGATATTGGGGTACAGCTA GTTGGACTTAGCGCAGTAACCGCTGCTAATGCCGTCGCCATGATTGCGATTTTTAACACTGTAGGTAGAATCGTTCTTGG AACGTTATCAGATAAAATTGGTCGAATGAAAATTGTCTCTGCAACGTTTGTAATTATAGGCTTATCAGTATTCACTCTAA GTTACATCCCTCTAAATTACGGAATTTATTTTGCTTGTGTAGCAAGTGTCGCCTTTTGCTTTGGCGGTAATATTACAATA TTCCCAGCTATTGTTGGAGATTACTTCGGGTTAAAAAATCATAGTACAAATTATGGGATTGTATACCAAGGTTTCGGATT CGGTGCGCTTGCAGGATCATTCATTGGAGCACTACTTGGTGGATTTCAACCGACCTTTATTACAATCGGCGTTTTAAGCG TTATTTCCTTTATCATTTCGATAGTAATTCGTCCACCAAAAACAGAGAAGAAAAAGGAATTAAAACATTTACACCGGAAA GTAGCGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TATGAACTTAATTACCATTTTCAGTACAGTATCTTGCAATTTATGATGGATATACTAACTGTGAAAATCTATGTCAAAAT AAAAGAAGGGGACAGTTAGT
Downstream 100 bases:
>100_bases TACTAAAAAGAGTCCTCATATAGGGCTCTTTTTTATATAGTAATGAAAGGTTAACGATTATTAACTTTGCTAAGAGCAGA TAAATGAAATACTCAATTAA
Product: oxalate:formate antiporter (permease)
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 402; Mature: 402
Protein sequence:
>402_residues MKQTSINPLLIVLGTIIVQIGLGTIYTWSLFNQPLVSKFGWNLNSVAITFSITSFSLSFSTLFAGKLQQKLGLRKLIATA GIVLGLGLILSSQVSSLPLLYLLAGVVVGYADGTAYITSLSNLIKWFPNRKGLISGISVSAYGMGSLIFRYINGSLIDSL GVSQAFLYWGIIVLLLVLIGSFFLREAIVSNAVTETLHNDYNPREMMRTKQVYLLFFMLFTSCMGGLYLIGMVKDIGVQL VGLSAVTAANAVAMIAIFNTVGRIVLGTLSDKIGRMKIVSATFVIIGLSVFTLSYIPLNYGIYFACVASVAFCFGGNITI FPAIVGDYFGLKNHSTNYGIVYQGFGFGALAGSFIGALLGGFQPTFITIGVLSVISFIISIVIRPPKTEKKKELKHLHRK VA
Sequences:
>Translated_402_residues MKQTSINPLLIVLGTIIVQIGLGTIYTWSLFNQPLVSKFGWNLNSVAITFSITSFSLSFSTLFAGKLQQKLGLRKLIATA GIVLGLGLILSSQVSSLPLLYLLAGVVVGYADGTAYITSLSNLIKWFPNRKGLISGISVSAYGMGSLIFRYINGSLIDSL GVSQAFLYWGIIVLLLVLIGSFFLREAIVSNAVTETLHNDYNPREMMRTKQVYLLFFMLFTSCMGGLYLIGMVKDIGVQL VGLSAVTAANAVAMIAIFNTVGRIVLGTLSDKIGRMKIVSATFVIIGLSVFTLSYIPLNYGIYFACVASVAFCFGGNITI FPAIVGDYFGLKNHSTNYGIVYQGFGFGALAGSFIGALLGGFQPTFITIGVLSVISFIISIVIRPPKTEKKKELKHLHRK VA >Mature_402_residues MKQTSINPLLIVLGTIIVQIGLGTIYTWSLFNQPLVSKFGWNLNSVAITFSITSFSLSFSTLFAGKLQQKLGLRKLIATA GIVLGLGLILSSQVSSLPLLYLLAGVVVGYADGTAYITSLSNLIKWFPNRKGLISGISVSAYGMGSLIFRYINGSLIDSL GVSQAFLYWGIIVLLLVLIGSFFLREAIVSNAVTETLHNDYNPREMMRTKQVYLLFFMLFTSCMGGLYLIGMVKDIGVQL VGLSAVTAANAVAMIAIFNTVGRIVLGTLSDKIGRMKIVSATFVIIGLSVFTLSYIPLNYGIYFACVASVAFCFGGNITI FPAIVGDYFGLKNHSTNYGIVYQGFGFGALAGSFIGALLGGFQPTFITIGVLSVISFIISIVIRPPKTEKKKELKHLHRK VA
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1789969, Length=394, Percent_Identity=44.1624365482233, Blast_Score=327, Evalue=8e-91,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR020846 - InterPro: IPR011701 - InterPro: IPR016196 - InterPro: IPR004741 [H]
Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 43381; Mature: 43381
Theoretical pI: Translated: 10.23; Mature: 10.23
Prosite motif: PS50850 MFS
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 3.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 3.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKQTSINPLLIVLGTIIVQIGLGTIYTWSLFNQPLVSKFGWNLNSVAITFSITSFSLSFS CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHHHHCCHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEHHHHH TLFAGKLQQKLGLRKLIATAGIVLGLGLILSSQVSSLPLLYLLAGVVVGYADGTAYITSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH SNLIKWFPNRKGLISGISVSAYGMGSLIFRYINGSLIDSLGVSQAFLYWGIIVLLLVLIG HHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SFFLREAIVSNAVTETLHNDYNPREMMRTKQVYLLFFMLFTSCMGGLYLIGMVKDIGVQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEE VGLSAVTAANAVAMIAIFNTVGRIVLGTLSDKIGRMKIVSATFVIIGLSVFTLSYIPLNY ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GIYFACVASVAFCFGGNITIFPAIVGDYFGLKNHSTNYGIVYQGFGFGALAGSFIGALLG HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHC GFQPTFITIGVLSVISFIISIVIRPPKTEKKKELKHLHRKVA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MKQTSINPLLIVLGTIIVQIGLGTIYTWSLFNQPLVSKFGWNLNSVAITFSITSFSLSFS CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHHHHCCHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEHHHHH TLFAGKLQQKLGLRKLIATAGIVLGLGLILSSQVSSLPLLYLLAGVVVGYADGTAYITSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH SNLIKWFPNRKGLISGISVSAYGMGSLIFRYINGSLIDSLGVSQAFLYWGIIVLLLVLIG HHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SFFLREAIVSNAVTETLHNDYNPREMMRTKQVYLLFFMLFTSCMGGLYLIGMVKDIGVQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEE VGLSAVTAANAVAMIAIFNTVGRIVLGTLSDKIGRMKIVSATFVIIGLSVFTLSYIPLNY ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GIYFACVASVAFCFGGNITIFPAIVGDYFGLKNHSTNYGIVYQGFGFGALAGSFIGALLG HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHC GFQPTFITIGVLSVISFIISIVIRPPKTEKKKELKHLHRKVA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8041620; 9278503 [H]