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The map label for this gene is yhgE [H]

Identifier: 52140347

GI number: 52140347

Start: 5001988

End: 5003979

Strand: Reverse

Name: yhgE [H]

Synonym: BCZK4913

Alternate gene names: 52140347

Gene position: 5003979-5001988 (Counterclockwise)

Preceding gene: 52140345

Following gene: 52140350

Centisome position: 94.4

GC content: 38.4

Gene sequence:

>1992_bases
ATGAAGGGAATTCAACTTATATTTAAAGATTGGAAAGCGATGTGGCACCATAAACATGGACGTATCGCTTTAATTTTTTT
ATTAATCGTTCCTTTAATTTATTCAGGATTCTTTTTAGCTGGATATTGGGATCCGTACGGACGATTAGATAAATTACCTG
TTGCGATTGTAAATTTAGATAAAGGTGCTGCGATGGATGAGAAAACAATTCATGCAGGAGACGATTTTGTAAAAAATTTA
AAAGAGAATAAAGAATTGGCTTTTCATTTCGTATCAGAAAAAAATGCTGATGAAGGGCTAAAAGAAGATAAGTATTATAT
GGTCGTTACGATCCCAGCGGATTTCTCTAAAAAGGTAAGCACACTTATGAATGAGAAACCAGAACCAGCGCAGCTGCAGT
ACAAAGTGAATCCAGGTAAAAACTTTGTAGCAGCGCAAATTGGAACGACGGCTGTTGAAAATATGAAAACAAAAATCTCA
AATAGTATTACGAAATCTTATACAGAAGGTGTCTTTTCAAAGTTTCAAGACTTAGCACAAGGGTTGCGTGATGCAAGTGA
TGGTGCTGGAAAGTTACATGAAGGAACGACAGATGCAAAAAATGGGGCAAATCAGCTTGCAGATGGTATTCATCGTTTAA
GTGACGGGACACCAAAAGTGAAAGAGGGAAGTGAAAAACTTGCTTCTAGCCAATCAGCTTTAACTGGCGGAGCCAATGAA
CTGAGTCAAGGAGCGACTTCACTTCATAGCGGTATGGAGTTATTGACGCAAGGTGAAAAAACTTTACAATCAGGGGTTAG
TGAATTAAGTGCTGGTACAAATGAATGGGTGAACGGAAGTGAGAAACTTGCTGATGGGCAAGTGAAAGCGGACAATGCAG
CAAATAGTGTAAAACAACAATTAGAAGAGTACGTGAAAAGTCATCCAGAAGTGCAGCAAGACCCTGCTTTTCAAAAAATC
GTTGCTACTTCTAATGGATTAGCTAAAGCAACAAACACCTTAAATAATAGCCAGCAACAATTGACGCAAGGTGCAAAGAA
GCTTGTGGATGGTCAACATAAGATTGAAGAAGGTATAAATACATTCGGAGTTAAGTTAAATGAAGCGACTGCTGGAACGA
AAAAGATAGCAGATGGTGCTTCGAATTTAGCTAGTGGATTTACGAAATGGGGAACTGGATTTGCATCATTACAAGAAGGT
GTCAATCAACTTGCGAGTGGCGGAACAGAGCTAAATCATGGTGTTGATCAGTTAACGAACGGACTTGTTAAACTTGACGA
TGGTGCGAAAGAACTTTCTACGAAATTAGGAGAGGGCGCAGCGAAGATAGCAGATGTTCGCAATGATGATGCACGCAATA
CGATGTTCTCAGAGCCGGTTCAATTAGTGAAGTCAACAGTTTCTGACGTACCTAATTATGGTTCAGGTATTGCACCATAT
TTCTTATCGCTTGCGTTTTATGTTGGCGGAATTATGGCGTCGAATATTTTACCGCTTGGCCGTAGACAAAATATGAAAGT
AAGTGGAACAGTACATTTTATTAACAAATTAGGATTGGTATATTTAATTGGACTTATTCAAGCATTGCTTGTAGATGTAG
TTGTGCTAGGAGTTATGAAATTAGAAGTTGCAAGTGTGCCACTCTTTGTTTTATCAAGTATCGTTATTTCCTTTACGTTT
ATGACGTTTATTCTTATGTTAGTAACAGTATTTGGTCTTGTTGGAAAGTTCTTAGCGGTAACGCTTCTTGTCCTGCAGTT
AGCGACGAGTGGGGGTACTTTCCCAGGAGAATTAAATATAGCTGTTCTTAGCAAAATTGGACAATTTCTCCCAATGTCTC
ATTCTCTTAGAGGATTGCAAGATGTGATTTCTTTAGGAGATTGGTCGCAATTACAAATGCAAATTTTAATATTGTTATGC
TATCTCGTTGTTGCTGGTGGAATTGCTTGGATCACGAGCCATATACAACATAGGGAAACGAATGCAGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGATAATTAAAGATGTATTATACAGTATGGAAGTGGACGTGTATAGTAAATCTGTTAAACCATTCTAATGGTGTTAAAT
TCGGAGAAGGAGTATGTTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTTTCTTAAAATGAAAGAAGCTATCCGACTTTTTCGGATAGCTTCTTTTTTATTTGCGTTCCATTACCGCAAAGTAATTG
TTTTCATTATCAGCAAAGTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: ORFB [H]

Number of amino acids: Translated: 663; Mature: 663

Protein sequence:

>663_residues
MKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVPLIYSGFFLAGYWDPYGRLDKLPVAIVNLDKGAAMDEKTIHAGDDFVKNL
KENKELAFHFVSEKNADEGLKEDKYYMVVTIPADFSKKVSTLMNEKPEPAQLQYKVNPGKNFVAAQIGTTAVENMKTKIS
NSITKSYTEGVFSKFQDLAQGLRDASDGAGKLHEGTTDAKNGANQLADGIHRLSDGTPKVKEGSEKLASSQSALTGGANE
LSQGATSLHSGMELLTQGEKTLQSGVSELSAGTNEWVNGSEKLADGQVKADNAANSVKQQLEEYVKSHPEVQQDPAFQKI
VATSNGLAKATNTLNNSQQQLTQGAKKLVDGQHKIEEGINTFGVKLNEATAGTKKIADGASNLASGFTKWGTGFASLQEG
VNQLASGGTELNHGVDQLTNGLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDARNTMFSEPVQLVKSTVSDVPNYGSGIAPY
FLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTVHFINKLGLVYLIGLIQALLVDVVVLGVMKLEVASVPLFVLSSIVISFTF
MTFILMLVTVFGLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNIAVLSKIGQFLPMSHSLRGLQDVISLGDWSQLQMQILILLC
YLVVAGGIAWITSHIQHRETNAE

Sequences:

>Translated_663_residues
MKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVPLIYSGFFLAGYWDPYGRLDKLPVAIVNLDKGAAMDEKTIHAGDDFVKNL
KENKELAFHFVSEKNADEGLKEDKYYMVVTIPADFSKKVSTLMNEKPEPAQLQYKVNPGKNFVAAQIGTTAVENMKTKIS
NSITKSYTEGVFSKFQDLAQGLRDASDGAGKLHEGTTDAKNGANQLADGIHRLSDGTPKVKEGSEKLASSQSALTGGANE
LSQGATSLHSGMELLTQGEKTLQSGVSELSAGTNEWVNGSEKLADGQVKADNAANSVKQQLEEYVKSHPEVQQDPAFQKI
VATSNGLAKATNTLNNSQQQLTQGAKKLVDGQHKIEEGINTFGVKLNEATAGTKKIADGASNLASGFTKWGTGFASLQEG
VNQLASGGTELNHGVDQLTNGLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDARNTMFSEPVQLVKSTVSDVPNYGSGIAPY
FLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTVHFINKLGLVYLIGLIQALLVDVVVLGVMKLEVASVPLFVLSSIVISFTF
MTFILMLVTVFGLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNIAVLSKIGQFLPMSHSLRGLQDVISLGDWSQLQMQILILLC
YLVVAGGIAWITSHIQHRETNAE
>Mature_663_residues
MKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVPLIYSGFFLAGYWDPYGRLDKLPVAIVNLDKGAAMDEKTIHAGDDFVKNL
KENKELAFHFVSEKNADEGLKEDKYYMVVTIPADFSKKVSTLMNEKPEPAQLQYKVNPGKNFVAAQIGTTAVENMKTKIS
NSITKSYTEGVFSKFQDLAQGLRDASDGAGKLHEGTTDAKNGANQLADGIHRLSDGTPKVKEGSEKLASSQSALTGGANE
LSQGATSLHSGMELLTQGEKTLQSGVSELSAGTNEWVNGSEKLADGQVKADNAANSVKQQLEEYVKSHPEVQQDPAFQKI
VATSNGLAKATNTLNNSQQQLTQGAKKLVDGQHKIEEGINTFGVKLNEATAGTKKIADGASNLASGFTKWGTGFASLQEG
VNQLASGGTELNHGVDQLTNGLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDARNTMFSEPVQLVKSTVSDVPNYGSGIAPY
FLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTVHFINKLGLVYLIGLIQALLVDVVVLGVMKLEVASVPLFVLSSIVISFTF
MTFILMLVTVFGLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNIAVLSKIGQFLPMSHSLRGLQDVISLGDWSQLQMQILILLC
YLVVAGGIAWITSHIQHRETNAE

Specific function: Unknown

COG id: COG1511

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To L.lactis phage infection protein (PIP) [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR013525
- InterPro:   IPR022703
- InterPro:   IPR017501
- InterPro:   IPR017500 [H]

Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane; PF12051 DUF3533 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71329; Mature: 71329

Theoretical pI: Translated: 6.94; Mature: 6.94

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVPLIYSGFFLAGYWDPYGRLDKLPVAIVNLD
CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECC
KGAAMDEKTIHAGDDFVKNLKENKELAFHFVSEKNADEGLKEDKYYMVVTIPADFSKKVS
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHH
TLMNEKPEPAQLQYKVNPGKNFVAAQIGTTAVENMKTKISNSITKSYTEGVFSKFQDLAQ
HHHCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLRDASDGAGKLHEGTTDAKNGANQLADGIHRLSDGTPKVKEGSEKLASSQSALTGGANE
HHHCCCCCCCCCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
LSQGATSLHSGMELLTQGEKTLQSGVSELSAGTNEWVNGSEKLADGQVKADNAANSVKQQ
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHH
LEEYVKSHPEVQQDPAFQKIVATSNGLAKATNTLNNSQQQLTQGAKKLVDGQHKIEEGIN
HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCHH
TFGVKLNEATAGTKKIADGASNLASGFTKWGTGFASLQEGVNQLASGGTELNHGVDQLTN
HHCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHC
GLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDARNTMFSEPVQLVKSTVSDVPNYGSGIAPY
CCEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH
FLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTVHFINKLGLVYLIGLIQALLVDVVVLGVMK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEVASVPLFVLSSIVISFTFMTFILMLVTVFGLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH
AVLSKIGQFLPMSHSLRGLQDVISLGDWSQLQMQILILLCYLVVAGGIAWITSHIQHRET
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NAE
CCC
>Mature Secondary Structure
MKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVPLIYSGFFLAGYWDPYGRLDKLPVAIVNLD
CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECC
KGAAMDEKTIHAGDDFVKNLKENKELAFHFVSEKNADEGLKEDKYYMVVTIPADFSKKVS
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHH
TLMNEKPEPAQLQYKVNPGKNFVAAQIGTTAVENMKTKISNSITKSYTEGVFSKFQDLAQ
HHHCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLRDASDGAGKLHEGTTDAKNGANQLADGIHRLSDGTPKVKEGSEKLASSQSALTGGANE
HHHCCCCCCCCCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
LSQGATSLHSGMELLTQGEKTLQSGVSELSAGTNEWVNGSEKLADGQVKADNAANSVKQQ
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHH
LEEYVKSHPEVQQDPAFQKIVATSNGLAKATNTLNNSQQQLTQGAKKLVDGQHKIEEGIN
HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCHH
TFGVKLNEATAGTKKIADGASNLASGFTKWGTGFASLQEGVNQLASGGTELNHGVDQLTN
HHCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHC
GLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDARNTMFSEPVQLVKSTVSDVPNYGSGIAPY
CCEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH
FLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTVHFINKLGLVYLIGLIQALLVDVVVLGVMK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEVASVPLFVLSSIVISFTFMTFILMLVTVFGLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH
AVLSKIGQFLPMSHSLRGLQDVISLGDWSQLQMQILILLCYLVVAGGIAWITSHIQHRET
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NAE
CCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9579061; 9384377; 1459957 [H]