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The map label for this gene is 49188262

Identifier: 49188262

GI number: 49188262

Start: 5160673

End: 5161986

Strand: Reverse

Name: 49188262

Synonym: BAS5277

Alternate gene names: NA

Gene position: 5161986-5160673 (Counterclockwise)

Preceding gene: 49188270

Following gene: 49188259

Centisome position: 98.72

GC content: 30.44

Gene sequence:

>1314_bases
ATGAATCATATACAAACAAATTTTTCGTCTTTTTTCAGTAAAATAATGATCGGTGCGATGCTCGCATTTTTTGTTTATAG
TTGTTGGTCTGCGTTTGAAACAAGTAAACAGTTTTTTGGAGGCAGTACAACAAGTGTAACAATTGTATTGATTATTTTTG
TTATTCTCATGCTGTTAGTAGCATCGATTTTACAGTATCGTTTTACAGATAAACAATTTCTTATTTTTCTTATTGGTACA
TCTATTGTCGTGAGACTGAGTATGGTTTTATTTGTAGATGTTCCGGTAATCGATGATATGAAAGCTATGTTTGAGTCTGC
AAAGCAGATTGCAATTGGTAATAGCGTAGAGAATGTTGCGCAGTTACCTTTTATTATTTATGAATCAATTATTATTCGTG
TATTTGGCGATACGGTATTCGCATTGCAGCTATTTAATATTTTATTTTGCACAGGGACTGCATTTTTCATTTATCGCATT
GCAGCAATGGTTTTTGGAGAAGAATGCGGCCGTATTGCTTCTGTATTTTACGCTTTATATATTCCAAATATATTTACGAG
TGCTTTATTAACATCAGAATCGCTTGCAATATTTTTATTTTATTTAGCTTGTTACATACTTCTATATAAAGGCTTAGATC
ATCCTTATATGTGGGTGCTTTCAGCAATTTTATTTGCATGTAGTAATATGATTTTTCCAATGGGATTATTTCTCCCTATT
TTTATTGCTGTATATGTGTTGTTAATTGAACTTTTTCAATCAGCAATGAAGCAAAAAGTATTACTAAAGATGATAGGGAT
ACTTATTCTATTTTATAGTGCCCATTTTGGTGTGAGTTATGGAATTCAGACAATGGGAATGTCACAATATACGGTTTCGA
ATGAGACGTATGTTCAATCTGTTTTAATTGGAAAAGGTAAAAATGAGGAGAAAGTAACAAAGAATCGAAGCGTAACAGAA
CATATTGATCAAAAGCAAAAAGAGATGGAAGAAGAAAGATTTAAACTTTTAAAACCAGTAATTAATCAATTCTCAGATGA
AGGAATACATTCTATTCTATTTAAATGTGAAAAACTTATATATATAGCGGTAACATTGTTTATGTCTATCGCCTTATTAC
ACTTTCTTATTAAGAAACAACAAAACGAAGGGTATATGTTATTCTTATTGTTAATTAGCGGGTACGTATTGTTAAGACTC
TTACAAGTAGATATGACCTATTACAATCTTATTGTGCCAGCATTGTTTATTTTGCAAAGCTTTGGTGTTTATATGAGTTA
TATGTACTGTCAAAAAATATTCTTTAGAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTAGGACCCTGTATTTGTCATAGAAATTCCCTATCAGCCGTGCACCTATTCATGATAGAATCGTTTTGTTATGAATGGA
AATAGAGGTGCAATGGACAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAGAATCCAAATTGGATTCTTTTTTTTTGAATGGAAGATGAAGACTAAGAGGCAGCGGAGATAAAGAATATGTACTGAC
ATGAGCTTCAATCTATCGGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 437; Mature: 437

Protein sequence:

>437_residues
MNHIQTNFSSFFSKIMIGAMLAFFVYSCWSAFETSKQFFGGSTTSVTIVLIIFVILMLLVASILQYRFTDKQFLIFLIGT
SIVVRLSMVLFVDVPVIDDMKAMFESAKQIAIGNSVENVAQLPFIIYESIIIRVFGDTVFALQLFNILFCTGTAFFIYRI
AAMVFGEECGRIASVFYALYIPNIFTSALLTSESLAIFLFYLACYILLYKGLDHPYMWVLSAILFACSNMIFPMGLFLPI
FIAVYVLLIELFQSAMKQKVLLKMIGILILFYSAHFGVSYGIQTMGMSQYTVSNETYVQSVLIGKGKNEEKVTKNRSVTE
HIDQKQKEMEEERFKLLKPVINQFSDEGIHSILFKCEKLIYIAVTLFMSIALLHFLIKKQQNEGYMLFLLLISGYVLLRL
LQVDMTYYNLIVPALFILQSFGVYMSYMYCQKIFFRK

Sequences:

>Translated_437_residues
MNHIQTNFSSFFSKIMIGAMLAFFVYSCWSAFETSKQFFGGSTTSVTIVLIIFVILMLLVASILQYRFTDKQFLIFLIGT
SIVVRLSMVLFVDVPVIDDMKAMFESAKQIAIGNSVENVAQLPFIIYESIIIRVFGDTVFALQLFNILFCTGTAFFIYRI
AAMVFGEECGRIASVFYALYIPNIFTSALLTSESLAIFLFYLACYILLYKGLDHPYMWVLSAILFACSNMIFPMGLFLPI
FIAVYVLLIELFQSAMKQKVLLKMIGILILFYSAHFGVSYGIQTMGMSQYTVSNETYVQSVLIGKGKNEEKVTKNRSVTE
HIDQKQKEMEEERFKLLKPVINQFSDEGIHSILFKCEKLIYIAVTLFMSIALLHFLIKKQQNEGYMLFLLLISGYVLLRL
LQVDMTYYNLIVPALFILQSFGVYMSYMYCQKIFFRK
>Mature_437_residues
MNHIQTNFSSFFSKIMIGAMLAFFVYSCWSAFETSKQFFGGSTTSVTIVLIIFVILMLLVASILQYRFTDKQFLIFLIGT
SIVVRLSMVLFVDVPVIDDMKAMFESAKQIAIGNSVENVAQLPFIIYESIIIRVFGDTVFALQLFNILFCTGTAFFIYRI
AAMVFGEECGRIASVFYALYIPNIFTSALLTSESLAIFLFYLACYILLYKGLDHPYMWVLSAILFACSNMIFPMGLFLPI
FIAVYVLLIELFQSAMKQKVLLKMIGILILFYSAHFGVSYGIQTMGMSQYTVSNETYVQSVLIGKGKNEEKVTKNRSVTE
HIDQKQKEMEEERFKLLKPVINQFSDEGIHSILFKCEKLIYIAVTLFMSIALLHFLIKKQQNEGYMLFLLLISGYVLLRL
LQVDMTYYNLIVPALFILQSFGVYMSYMYCQKIFFRK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50135; Mature: 50135

Theoretical pI: Translated: 8.41; Mature: 8.41

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
4.8 %Met     (Translated Protein)
6.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
4.8 %Met     (Mature Protein)
6.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA