Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 46447252

Identifier: 46447252

GI number: 46447252

Start: 1936373

End: 1939153

Strand: Reverse

Name: 46447252

Synonym: pc1618

Alternate gene names: NA

Gene position: 1939153-1936373 (Counterclockwise)

Preceding gene: 46447255

Following gene: 46447245

Centisome position: 80.31

GC content: 29.63

Gene sequence:

>2781_bases
ATGTATATTCCTACTGATGATTGTAAACCTTCTTTAACTGAAAGTACAAGTTCTCAAACTAGTGAAGTTCAAACATCTTC
ACAACAGGTCAAAAGTCCAACTGAAGTAAATATTGAAAAAATTGCCACTAAATCACTGCCAGCTATAGAAGAAGAGACGA
AGACAATATCTTTTTCCGAGAAATCAACTAAATTTTCTAAAGGAAGATTTTTATGTTCTTATAATAGGGGAGATTTAAAA
ACTTCAATTTTACAAACAAACGATTTACAAAAAAGGATTTATATTAAACTAAATGAAAAAATTGGGGATAAGTTCATTAA
TAAAACTAAAAAGTTATGGATAAAAGTATGTAGCCAAAGTGAGTCGGAAAGTTTAGTTAAGCTAACTCTATCTTGTGAAA
ATAAAACCGTCGACATTCTAAATGACAAAACATTAAGCAAAAAAAGTCAGGATTATCAAGAAGTAAAAATAGAATTAGAT
AAAAATAAAATGAAATTAGATGGTTTAAATAAACTCTTAACAAATATAAAAAAAAGAACCTATGCAGATAAAATAAAGGA
ATTAGAATTATTAAAAGAATTAGACAAACCGATAATAAATATTGATAATTTTTTACTAAGTTTTGAGCAATTTTTAGAAA
AATATCAAGAAATTGATGTAGAAAAACTAACAACAGAGGACATCGAATTTTTAAAAAAAGAACATAGTGAATTAGAAAAG
GGCTATAACGATCTTAAAAAGATACTACCAGGCACTATTCAAAGACTAAATCAGAATGTGAAATTAACTAAGGGTGGTTT
ACAAAAAAACATTGAAACGGTTTTAAAAGGTATTAATACTGCTCTTCAAGGGCAAGAAGTCAAAAATTTAGATGATTCTA
TAAATCAATTCAAAGTGATTAAAACATCTATCAAAGAAGCTTCAGAGGCTTATCCCGGCAAATTGAATCAAGTTCAGCAA
GAGGTCGATGAAATTTGTCCTCGTTATATGAAACTTTTCCAGGAAATTGAAGAGGGAAATTTAGAAAGATACCCTGATTT
TATTCATGAGATTAAAGAAATTTTACTTAATGTTAGCCATGATCCTGTCGCTTATAAAGACGCTTTGCAAACACTATCAG
ATAAGGTTATTCCTTCTATTCAATCTCAGGTACTGGGAATAACTAATGAACTCAGAGAGAGGCTAAACAGAAAAAAAGAT
GTAGAAATTATTACTATAGATGATTGTATTGCTCTAAAAACATATATTGAAGACTATTTAAAACCTCTTTTGGCGTTGAC
AGAACCAATGGCAACCGAAAAAGCACCCGTATTCGAAGACCAATTTAAAAATTTATTTAATCTGCTTCCTAATTCTGGTA
AAGAGATGACTGCCCAAGAAATTGTATCAAAGATTAATTCATTTTCTTCCCCAGAGGGTTCTTTGAGAGTTTATCGAAAT
TTTATCAATAAAAATTTGGCTGGAATAAAAAAAGAATTAAACCAAGAAACTAAGATTAAAAAAGAGATTGAAGACCTAAC
AAATTTATTAAAAGAATTAAAAGGAAAAAAGGCTGATATTTTAGAAAGTTTTTTTAACGAACTTATGGAAAAAGAAAAAA
ACAAAATCTCTGAATTATTAACTGGTGGTGTTGAGCAAGTTCAAAATTTTGTAGATATTTTTTTAGGCCATTACCTTGTT
CATTCTCAAGAACGTTTTCCCAAACTTTTAGAAAGCCATCGAGACTTTGCTGTTAGAGTTTCTGACATGTTTGAACTAGT
AAAGGATCATTTATCTGAGGAGCAATTAGGTGAAATCAAATTAGTTTTAAATGACTTTTTAACTCATCATATTACAAATC
AAACAGGTGAGATTGAAGAAAGTTTAGGTACATCTCTTCATCAAAATCAAAAAAGTTCGGAAAAGGTTACTAAACCTGCA
AAGCCTTTATATAGAAAGGTTCAGGGTGCGCATGAATTTGGAGATGATTTTTCAATAAAATGCCAACATGTTTGCAAACA
AGTTGAAGCCCTTCTGCCTTGGTTATTCGGGAAAGGATTTGTTGCCTCGCCTCAAGCCGCGCATTTAGTCCCTTTCCCTG
GAATAGTTTCTTGGGATGTTAGCTATCTATCCACACTTTTTAAGACAAGGCTTGGATTAGATCTAAGCCAAAAAGAAATA
GAAAATCGTTTAGAATTATTCAATAAAAATGTTGAACCTTTTTTAAAGACAGTCCAAGCAAATGAGAAAGTTGATCAAGA
AATGGTTAAAAATTTATTACAGGAAAAATTTGATAATAAAGAAATAAATGATAACTTTTATTTCATTTATACAAACCTTA
TTCTTTTAAGCCATCTTTCTTCTTTAGAAATGTCAGAAACAAGGCACTTACCAGAGTTTTTTAATCAAACAATGGATAAG
TTTTCGGAATCTGAAATAAAATATAATTCAGATGGCAGTAGAGGATATAAAGTCTTATTAGGAGAAGCTTTCATTGATCT
TCTTACTTATCCAAAAGAAAGTCTATTAAATCCTCAGTCAGCTTTAAGTAAGAAACATATAGAATATTTACAAGCTACTC
TTGATACTGTTTCTGAACGACTAAAACAATTGGCTGACGAAAAACTGCAAAATCGAGCATTAAAACCAATCGAACTTGTA
GAATGTCACGCACTACATAGTATTTATTTAGGGGTGAAAAATTTATATACTCAAATAAAATTGGCTGATTCGGATGAGGA
TTTTTTAAATAAAGAAAGAAATATTATTAAAAATACTGAAGCTATTTTAAGTAGAGATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATTTTTTTATTAATTAATAAATAAATAATTAATATGTTACAGTTAATTATATAGTGATATTGTATTTAATATAATAAT
ATAATTGTTAAGGAGTAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATGCAATATATTTTATATATTTACTTGATTTTATATTAATTTAAATTAATTTTTTTAAAAATTATAAAATACCAGTGCA
AATTTAATTTTTATAAATTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 926; Mature: 926

Protein sequence:

>926_residues
MYIPTDDCKPSLTESTSSQTSEVQTSSQQVKSPTEVNIEKIATKSLPAIEEETKTISFSEKSTKFSKGRFLCSYNRGDLK
TSILQTNDLQKRIYIKLNEKIGDKFINKTKKLWIKVCSQSESESLVKLTLSCENKTVDILNDKTLSKKSQDYQEVKIELD
KNKMKLDGLNKLLTNIKKRTYADKIKELELLKELDKPIINIDNFLLSFEQFLEKYQEIDVEKLTTEDIEFLKKEHSELEK
GYNDLKKILPGTIQRLNQNVKLTKGGLQKNIETVLKGINTALQGQEVKNLDDSINQFKVIKTSIKEASEAYPGKLNQVQQ
EVDEICPRYMKLFQEIEEGNLERYPDFIHEIKEILLNVSHDPVAYKDALQTLSDKVIPSIQSQVLGITNELRERLNRKKD
VEIITIDDCIALKTYIEDYLKPLLALTEPMATEKAPVFEDQFKNLFNLLPNSGKEMTAQEIVSKINSFSSPEGSLRVYRN
FINKNLAGIKKELNQETKIKKEIEDLTNLLKELKGKKADILESFFNELMEKEKNKISELLTGGVEQVQNFVDIFLGHYLV
HSQERFPKLLESHRDFAVRVSDMFELVKDHLSEEQLGEIKLVLNDFLTHHITNQTGEIEESLGTSLHQNQKSSEKVTKPA
KPLYRKVQGAHEFGDDFSIKCQHVCKQVEALLPWLFGKGFVASPQAAHLVPFPGIVSWDVSYLSTLFKTRLGLDLSQKEI
ENRLELFNKNVEPFLKTVQANEKVDQEMVKNLLQEKFDNKEINDNFYFIYTNLILLSHLSSLEMSETRHLPEFFNQTMDK
FSESEIKYNSDGSRGYKVLLGEAFIDLLTYPKESLLNPQSALSKKHIEYLQATLDTVSERLKQLADEKLQNRALKPIELV
ECHALHSIYLGVKNLYTQIKLADSDEDFLNKERNIIKNTEAILSRD

Sequences:

>Translated_926_residues
MYIPTDDCKPSLTESTSSQTSEVQTSSQQVKSPTEVNIEKIATKSLPAIEEETKTISFSEKSTKFSKGRFLCSYNRGDLK
TSILQTNDLQKRIYIKLNEKIGDKFINKTKKLWIKVCSQSESESLVKLTLSCENKTVDILNDKTLSKKSQDYQEVKIELD
KNKMKLDGLNKLLTNIKKRTYADKIKELELLKELDKPIINIDNFLLSFEQFLEKYQEIDVEKLTTEDIEFLKKEHSELEK
GYNDLKKILPGTIQRLNQNVKLTKGGLQKNIETVLKGINTALQGQEVKNLDDSINQFKVIKTSIKEASEAYPGKLNQVQQ
EVDEICPRYMKLFQEIEEGNLERYPDFIHEIKEILLNVSHDPVAYKDALQTLSDKVIPSIQSQVLGITNELRERLNRKKD
VEIITIDDCIALKTYIEDYLKPLLALTEPMATEKAPVFEDQFKNLFNLLPNSGKEMTAQEIVSKINSFSSPEGSLRVYRN
FINKNLAGIKKELNQETKIKKEIEDLTNLLKELKGKKADILESFFNELMEKEKNKISELLTGGVEQVQNFVDIFLGHYLV
HSQERFPKLLESHRDFAVRVSDMFELVKDHLSEEQLGEIKLVLNDFLTHHITNQTGEIEESLGTSLHQNQKSSEKVTKPA
KPLYRKVQGAHEFGDDFSIKCQHVCKQVEALLPWLFGKGFVASPQAAHLVPFPGIVSWDVSYLSTLFKTRLGLDLSQKEI
ENRLELFNKNVEPFLKTVQANEKVDQEMVKNLLQEKFDNKEINDNFYFIYTNLILLSHLSSLEMSETRHLPEFFNQTMDK
FSESEIKYNSDGSRGYKVLLGEAFIDLLTYPKESLLNPQSALSKKHIEYLQATLDTVSERLKQLADEKLQNRALKPIELV
ECHALHSIYLGVKNLYTQIKLADSDEDFLNKERNIIKNTEAILSRD
>Mature_926_residues
MYIPTDDCKPSLTESTSSQTSEVQTSSQQVKSPTEVNIEKIATKSLPAIEEETKTISFSEKSTKFSKGRFLCSYNRGDLK
TSILQTNDLQKRIYIKLNEKIGDKFINKTKKLWIKVCSQSESESLVKLTLSCENKTVDILNDKTLSKKSQDYQEVKIELD
KNKMKLDGLNKLLTNIKKRTYADKIKELELLKELDKPIINIDNFLLSFEQFLEKYQEIDVEKLTTEDIEFLKKEHSELEK
GYNDLKKILPGTIQRLNQNVKLTKGGLQKNIETVLKGINTALQGQEVKNLDDSINQFKVIKTSIKEASEAYPGKLNQVQQ
EVDEICPRYMKLFQEIEEGNLERYPDFIHEIKEILLNVSHDPVAYKDALQTLSDKVIPSIQSQVLGITNELRERLNRKKD
VEIITIDDCIALKTYIEDYLKPLLALTEPMATEKAPVFEDQFKNLFNLLPNSGKEMTAQEIVSKINSFSSPEGSLRVYRN
FINKNLAGIKKELNQETKIKKEIEDLTNLLKELKGKKADILESFFNELMEKEKNKISELLTGGVEQVQNFVDIFLGHYLV
HSQERFPKLLESHRDFAVRVSDMFELVKDHLSEEQLGEIKLVLNDFLTHHITNQTGEIEESLGTSLHQNQKSSEKVTKPA
KPLYRKVQGAHEFGDDFSIKCQHVCKQVEALLPWLFGKGFVASPQAAHLVPFPGIVSWDVSYLSTLFKTRLGLDLSQKEI
ENRLELFNKNVEPFLKTVQANEKVDQEMVKNLLQEKFDNKEINDNFYFIYTNLILLSHLSSLEMSETRHLPEFFNQTMDK
FSESEIKYNSDGSRGYKVLLGEAFIDLLTYPKESLLNPQSALSKKHIEYLQATLDTVSERLKQLADEKLQNRALKPIELV
ECHALHSIYLGVKNLYTQIKLADSDEDFLNKERNIIKNTEAILSRD

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 106512; Mature: 106512

Theoretical pI: Translated: 6.02; Mature: 6.02

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYIPTDDCKPSLTESTSSQTSEVQTSSQQVKSPTEVNIEKIATKSLPAIEEETKTISFSE
CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHCEEECCH
KSTKFSKGRFLCSYNRGDLKTSILQTNDLQKRIYIKLNEKIGDKFINKTKKLWIKVCSQS
HHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ESESLVKLTLSCENKTVDILNDKTLSKKSQDYQEVKIELDKNKMKLDGLNKLLTNIKKRT
CCCCCEEEEEECCCCEEEHHCCCHHHHHCCCHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YADKIKELELLKELDKPIINIDNFLLSFEQFLEKYQEIDVEKLTTEDIEFLKKEHSELEK
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GYNDLKKILPGTIQRLNQNVKLTKGGLQKNIETVLKGINTALQGQEVKNLDDSINQFKVI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
KTSIKEASEAYPGKLNQVQQEVDEICPRYMKLFQEIEEGNLERYPDFIHEIKEILLNVSH
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC
DPVAYKDALQTLSDKVIPSIQSQVLGITNELRERLNRKKDVEIITIDDCIALKTYIEDYL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHH
KPLLALTEPMATEKAPVFEDQFKNLFNLLPNSGKEMTAQEIVSKINSFSSPEGSLRVYRN
HHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
FINKNLAGIKKELNQETKIKKEIEDLTNLLKELKGKKADILESFFNELMEKEKNKISELL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TGGVEQVQNFVDIFLGHYLVHSQERFPKLLESHRDFAVRVSDMFELVKDHLSEEQLGEIK
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH
LVLNDFLTHHITNQTGEIEESLGTSLHQNQKSSEKVTKPAKPLYRKVQGAHEFGDDFSIK
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
CQHVCKQVEALLPWLFGKGFVASPQAAHLVPFPGIVSWDVSYLSTLFKTRLGLDLSQKEI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
ENRLELFNKNVEPFLKTVQANEKVDQEMVKNLLQEKFDNKEINDNFYFIYTNLILLSHLS
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHH
SLEMSETRHLPEFFNQTMDKFSESEIKYNSDGSRGYKVLLGEAFIDLLTYPKESLLNPQS
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHH
ALSKKHIEYLQATLDTVSERLKQLADEKLQNRALKPIELVECHALHSIYLGVKNLYTQIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE
LADSDEDFLNKERNIIKNTEAILSRD
ECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MYIPTDDCKPSLTESTSSQTSEVQTSSQQVKSPTEVNIEKIATKSLPAIEEETKTISFSE
CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHCEEECCH
KSTKFSKGRFLCSYNRGDLKTSILQTNDLQKRIYIKLNEKIGDKFINKTKKLWIKVCSQS
HHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ESESLVKLTLSCENKTVDILNDKTLSKKSQDYQEVKIELDKNKMKLDGLNKLLTNIKKRT
CCCCCEEEEEECCCCEEEHHCCCHHHHHCCCHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YADKIKELELLKELDKPIINIDNFLLSFEQFLEKYQEIDVEKLTTEDIEFLKKEHSELEK
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GYNDLKKILPGTIQRLNQNVKLTKGGLQKNIETVLKGINTALQGQEVKNLDDSINQFKVI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
KTSIKEASEAYPGKLNQVQQEVDEICPRYMKLFQEIEEGNLERYPDFIHEIKEILLNVSH
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC
DPVAYKDALQTLSDKVIPSIQSQVLGITNELRERLNRKKDVEIITIDDCIALKTYIEDYL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHH
KPLLALTEPMATEKAPVFEDQFKNLFNLLPNSGKEMTAQEIVSKINSFSSPEGSLRVYRN
HHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
FINKNLAGIKKELNQETKIKKEIEDLTNLLKELKGKKADILESFFNELMEKEKNKISELL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TGGVEQVQNFVDIFLGHYLVHSQERFPKLLESHRDFAVRVSDMFELVKDHLSEEQLGEIK
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH
LVLNDFLTHHITNQTGEIEESLGTSLHQNQKSSEKVTKPAKPLYRKVQGAHEFGDDFSIK
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
CQHVCKQVEALLPWLFGKGFVASPQAAHLVPFPGIVSWDVSYLSTLFKTRLGLDLSQKEI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
ENRLELFNKNVEPFLKTVQANEKVDQEMVKNLLQEKFDNKEINDNFYFIYTNLILLSHLS
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHH
SLEMSETRHLPEFFNQTMDKFSESEIKYNSDGSRGYKVLLGEAFIDLLTYPKESLLNPQS
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHH
ALSKKHIEYLQATLDTVSERLKQLADEKLQNRALKPIELVECHALHSIYLGVKNLYTQIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE
LADSDEDFLNKERNIIKNTEAILSRD
ECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA